utils/getdown/jalviewc

   1 #!/usr/bin/env bash
   2
   3 ARG1=$1
   4 DIR="$(dirname "$(readlink -f "$0")")"
   5
   6 # check to see if $1 is set and is not start of other cli set args
   7 OPEN=""
   8 if [ -n "${ARG1}" -a "${ARG1}" = "${ARG1#-}" -a "${ARG1}" != "open" ]; then
   9  # first argument exists and does not start with a "-" and is not "open"
  10  OPEN="-open"
  11 fi
  12
  13 APPDIR="${DIR}"
  14 JAVA="${APPDIR}/jre/bin/java"
  15 GETDOWNTXT="${APPDIR}/getdown.txt"
  16 CLASSPATH=""
  17 if [ -e "${GETDOWNTXT}" ]; then
  18   for JAR in $(grep -e '^code\s*=\s*' "${GETDOWNTXT}" | sed -e 's/^code\s*=\s*//;'); do
  19     [ -n "${CLASSPATH}" ] && CLASSPATH="${CLASSPATH}:"
  20     CLASSPATH="${CLASSPATH}${APPDIR}/${JAR}"
  21   done
  22 else
  23   echo "Cannot find getdown.txt" >&2
  24   exit 3
  25 fi
  26
  27 if [ \! -e "${JAVA}" ]; then
  28   echo "Cannot find bundled java, using system and hoping for the best!" >&2
  29   JAVA=java
  30 fi
  31
  32 # don't quote $OPEN
  33 "${JAVA}" -cp "${CLASSPATH}" jalview.bin.Launcher ${OPEN} "$@"