JAL-3181 refactor: extracted buildLinkMenu() for testability
[jalview.git] / THIRDPARTYLIBS
index 40d0f6c..afa99d2 100644 (file)
@@ -51,13 +51,19 @@ quaqua: v.8.0 (latest stable) by Randel S Hofer. LGPL and BSD Modified license:
 
 vaqua5-patch: This is a patched version of VAqua v5 (latest stable) by Alan Snyder et al. GPLv3 with Classpath exception, also includes contributions from Quaqua: http://violetlib.org/vaqua/overview.html - see doc/patching-vaqua.txt for patch details, and http://issues.jalview.org/browse/JAL-2988 for details of the bug that the patch addresses.
 
-lib/htsjdk-1.120-SNAPSHOT.jar: (currently not required for 2.10) built from maven master at https://github.com/samtools/htsjdk MIT License to Broad Institute
+lib/htsjdk-2.12.jar: built from maven master at https://github.com/samtools/htsjdk MIT License to Broad Institute
 
 lib/biojava-core-4.1.0.jar LGPLv2.1 - latest license at https://github.com/biojava/biojava/blob/master/LICENSE
 
 lib/biojava-ontology-4.1.0.jar LGPLv2.1 - latest license at https://github.com/biojava/biojava/blob/master/LICENSE
 
 
+Libraries for Test Suite
+
+utils/classgraph-4.1.6.jar: BSD License - allows recovery of classpath for programmatic construction of a Java command line to launch Jalview
+                      version 4.1.6 downloaded from https://mvnrepository.com/artifact/io.github.classgraph/classgraph/4.1.6
+
+
 Additional dependencies
 
 examples/javascript/deployJava.js : http://java.com/js/deployJava.js