JAL-3127 pass reference to AlignViewportI when creating an instance of ColourSchemeI
[jalview.git] / examples / groovy / colourConserved.groovy
index 4a15922..35c54d5 100644 (file)
@@ -24,6 +24,7 @@ import jalview.schemes.ColourSchemes
 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI
 import jalview.datamodel.SequenceI
 import jalview.datamodel.SequenceCollectionI
+import jalview.api.AlignViewportI
 import jalview.util.Comparison
 
 /*
@@ -42,7 +43,7 @@ conserved = { ->
     /*
      * to make a new instance for each alignment view
      */
-    getInstance: { AnnotatedCollectionI coll, Map<SequenceI, SequenceCollectionI> map -> conserved() },
+    getInstance: { AlignViewportI view, AnnotatedCollectionI coll, Map<SequenceI, SequenceCollectionI> map -> conserved() },
     
     /*
      * method only needed if colour scheme has to recalculate