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[jalview.git] / help / html / features / commandline.html
index e393701..dd6c0de 100644 (file)
  <p><strong>Running Jalview from the command line</strong></p>
  <p>Jalview is most easily run from the command line if you have built
  it from source, or via the 'Jalview' executable created from the
- InstallAnywhere jalview installation. Both of these mechanisms allow
- true command line execution of jalview - allowing you to provide
+ InstallAnywhere Jalview installation. Both of these mechanisms allow
+ true command line execution of Jalview - allowing you to provide
  additional options.</p><p>
 The Java Webstart version of
- jalview can be executed from the command line using something like
+ Jalview can be executed from the command line using something like
  :
  <pre>javaws http://www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp -open
  <em>yourFileName</em></pre>
  But, this is not guaranteed to work on all versions of webstart on all
  operating systems, and doesn't let you execute Jalview with any
  additional parameters.
- <p><strong>Running jalview from the InstallAnywhere
+ <p><strong>Running Jalview from the InstallAnywhere
  installation</strong></p>
  <p>If you install with InstallAnywhere you can use several more commands. 
  However, if you call the application with the link provided by InstallAnywhere 
  any output from the application will be sent to output.txt, not standard 
  out.<br>
- The jalview application also requires a number of additional
+ The Jalview application also requires a number of additional
  libraries on the class path. The command line below adds the Jalview
  installation's 'lib' directory to the list of directories that are
  searched for jars to be added to the classpath:</p>