Merge branch 'develop' into bug/JAL-2255_seq-fetcher-broken-on-linux
[jalview.git] / help / html / features / jmol.html
index 2f10196..0cd6168 100644 (file)
       based structure superposition was added in Jalview 2.6</em>
   </p>
   <p>
-    <strong>Controls</strong><br> The structure is by default
-    rendered as a ribbon diagram. Moving the mouse over the structure
-    brings up tooltips giving the residue name, PDB residue number and
-    chain code, atom name and number
-    ([RES]Num:Chain.AtomName#AtomNumber). If a mapping exists to a
-    residue in any associated sequences, then this will be highlighted
-    in each one's alignment window. The converse also occurs - moving
-    the mouse over an associated residue in an alignment window
-    highlights the associated atoms in the displayed structures.
+    <strong>Controls</strong><br> The structure is by default rendered
+    as a ribbon diagram. Moving the mouse over the structure brings up
+    tooltips giving the residue name, PDB residue number and chain code,
+    atom name and number ([RES]Num:Chain.AtomName#AtomNumber). If a
+    mapping exists to a residue in any associated sequences, then this
+    will be highlighted in each one's alignment window. The converse
+    also occurs - moving the mouse over an associated residue in an
+    alignment window highlights the associated atoms in the displayed
+    structures. Press B or use
+    <em>Select&#8594;Select Highlighted columns</em> from any linked
+    alignment window to mark the columns highlighted after mousing over
+    the structure.
   </p>
   <p>Selecting a residue highlights its associated sequence residue
     and alpha carbon location. Double clicking an atom allows distances