JAL-3210 Barebones gradle/buildship/eclipse. See README
[jalview.git] / help / html / misc / aaproperties.html
diff --git a/help/html/misc/aaproperties.html b/help/html/misc/aaproperties.html
deleted file mode 100755 (executable)
index b53f6ef..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,66 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3
- * of the License, or (at your option) any later version.
- *  
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
- -->
-<head>
-<style>
-body {
-    font-size: 100%;
-}
-table {
-    border: solid;
-    border-collapse: separate;
-}
-th, td {
-    border-style:none;
-    font-family: "Courier New", Courier, mono;
-    font-size: large;
-}
-</style><title>Amino Acid Properties</title>
-</head>
-<body>
-  <div align="center">
-    <h1>Amino Acid Properties</h1>
-    <img src="properties.gif"> <br>
-    <table>
-    <tr><th>ILVCA</th><th>GMFYW</th><th>HKREQ</th><th>DNSTP</th><th>BZX-</th><th></th></tr>
-      <tr><td>XXXXX</td><td>XXXXX</td><td>XX&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;X&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Hydrophobic</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;XX</td><td>XXXXX</td><td>XXXX&middot;</td><td>XXXX</td><td>Polar</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;XXX</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXXXX</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Small</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;X</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Proline</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;X</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;X&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Tiny</td></tr>
-<tr><td>XXX&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Aliphatic</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XXX</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Aromatic</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXX&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Positive</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;X&middot;</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Negative</td></tr>
-<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXXX&middot;</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Charged</td></tr>
-    </table>
-    </font>
-  </div>
-  <p>
-    <br> From Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993), <br>
-    "Protein Sequence Alignments: A Strategy for the Hierarchical
-    Analysis of Residue Conservation", Comp. Appl. Bio. Sci., 9,
-    745-756.
-  </p>
-  <br>
-  </div>
-</body>
-</html>