JAL-2859 release notes
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index 359238a..0382f22 100755 (executable)
@@ -1,48 +1,66 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>What's new ?</title>
 </head>
 <body>
-<p><strong>What's new ?</strong></p>
-<p>Jalview 2.6 introduces new web services, and includes an updated version of the Jmol molecular graphics visualization system.  See the <a href="releases.html#Jalview2.6">release
-history</a> for the full details.</p>
-<p><strong>Highlights in Jalview Version 2.5</strong></p>
-<ul>
-</ul>
-<em>Jalview Desktop:</em>
-<ul>
-</ul>
-<em>JalviewLite:</em>
-<ul>
-</ul>
-<p><strong>Issues Resolved (a select list)</strong></p>
-<ul>
-       <ul>
-       </ul>
-       <em>Desktop Issues</em>
-       <ul>
-               </ul>
-</ul>
-
-<p>&nbsp;</p>
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for
-details of all new features and resolved issues.</p>
+  <p>
+    <strong>What's new in Jalview 2.10.3b1 ?</strong>
+  </p>
+  <p>
+    This release - Jalview 2.10.3b1 is the January 2018 patch release for Version 2.10.3 was released in November 2017. The major focus was to
+    improve Jalview's sequence features datamodel and the scalability of
+    the alignment rendering system. The bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.3b1">2.10.3b1
+      Release Notes</a>.
+  </p>
+  <p>The highlights for Jalview 2.10.3 include:
+  </p>
+  <ul>
+    <li>Faster and more responsive UI when importing and working
+      with wide alignments and handling hundreds and thousands of
+      sequence features</li>
+    <li>Improved usability with <a
+      href="features/pdbsequencefetcher.html">PDB</a> and <a
+      href="features/uniprotsequencefetcher.html">UniProt</a> Free Text
+      Search dialog, and new tab for retrieval of sequences for lists of
+      IDs.
+    </li>
+    <li>Short names assigned to sequences retrieved from UniProt</li>
+    <li>Groovy console upgraded to 2.4.12 (improved support for Java 9)</li>
+  </ul>
+  <p>
+    <strong><a name="experimental">Experimental Features</a></strong>
+  </p>
+  <p>
+    Remember, please enable the <em>Experimental Features</em> option in
+    the Jalview Desktop's <em>Tools</em> menu, and then restart Jalview
+    if you want to try out features below:
+  </p>
+  <ul>
+    <li><em>Annotation transfer between Chimera and Jalview</em><br />Two
+      <a href="features/chimera.html#experimental">new entries in
+        the Chimera viewer's Chimera menu</a> allow positional annotation to
+      be exchanged between Chimera and Jalview.</li>
+  </ul>
+  
 </body>
 </html>