JAL-2759 Rename findColumnPosition and adjustForHiddenColumns (yay!)
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / AlignmentPanel.java
index 270b2f7..83d8ade 100644 (file)
@@ -421,8 +421,8 @@ public class AlignmentPanel extends Panel
     if (av.hasHiddenColumns())
     {
       AlignmentI al = av.getAlignment();
-      start = al.getHiddenColumns().findColumnPosition(ostart);
-      end = al.getHiddenColumns().findColumnPosition(end);
+      start = al.getHiddenColumns().absoluteToVisibleColumn(ostart);
+      end = al.getHiddenColumns().absoluteToVisibleColumn(end);
       if (start == end)
       {
         if (!scrollToNearest && !al.getHiddenColumns().isVisible(ostart))
@@ -675,7 +675,7 @@ public class AlignmentPanel extends Panel
       if (av.hasHiddenColumns())
       {
         width = av.getAlignment().getHiddenColumns()
-                .findColumnPosition(width);
+                .absoluteToVisibleColumn(width);
       }
       if (x < 0)
       {