JAL-2089 Merge branch releases/Release_2_10_Branch to master
[jalview.git] / src / jalview / bin / JalviewLiteURLRetrieve.java
index 65ec11a..b42e413 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b2)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -20,7 +20,7 @@
  */
 package jalview.bin;
 
-import jalview.datamodel.Alignment;
+import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.io.AppletFormatAdapter;
 import jalview.io.FileParse;
 
@@ -113,14 +113,14 @@ public class JalviewLiteURLRetrieve extends Applet
       String format = getParameter("format");
       if (format == null || format.length() == 0)
       {
-        format = new jalview.io.IdentifyFile().Identify(file, protocol);
+        format = new jalview.io.IdentifyFile().identify(file, protocol);
         System.out.println("Format is " + format);
       }
       else
       {
         System.out.println("User specified Format is " + format);
       }
-      Alignment al = null;
+      AlignmentI al = null;
       try
       {
         al = new AppletFormatAdapter().readFile(file, protocol, format);