Merge branch 'develop' into trial_merge/JAL-1950
[jalview.git] / src / jalview / binding / SequenceSet.java
index c12934d..3d81bae 100644 (file)
@@ -173,9 +173,9 @@ public class SequenceSet implements java.io.Serializable
     // check bounds for index
     if (index < 0 || index >= this._annotationList.size())
     {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("getAnnotation: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._annotationList.size() - 1) + "]");
+      throw new IndexOutOfBoundsException(
+              "getAnnotation: Index value '" + index + "' not in range [0.."
+                      + (this._annotationList.size() - 1) + "]");
     }
 
     return (jalview.binding.Annotation) _annotationList.get(index);
@@ -231,9 +231,9 @@ public class SequenceSet implements java.io.Serializable
     // check bounds for index
     if (index < 0 || index >= this._sequenceList.size())
     {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("getSequence: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._sequenceList.size() - 1) + "]");
+      throw new IndexOutOfBoundsException(
+              "getSequence: Index value '" + index + "' not in range [0.."
+                      + (this._sequenceList.size() - 1) + "]");
     }
 
     return (jalview.binding.Sequence) _sequenceList.get(index);
@@ -428,9 +428,9 @@ public class SequenceSet implements java.io.Serializable
     // check bounds for index
     if (index < 0 || index >= this._annotationList.size())
     {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("setAnnotation: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._annotationList.size() - 1) + "]");
+      throw new IndexOutOfBoundsException(
+              "setAnnotation: Index value '" + index + "' not in range [0.."
+                      + (this._annotationList.size() - 1) + "]");
     }
 
     this._annotationList.set(index, vAnnotation);
@@ -479,9 +479,9 @@ public class SequenceSet implements java.io.Serializable
     // check bounds for index
     if (index < 0 || index >= this._sequenceList.size())
     {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("setSequence: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._sequenceList.size() - 1) + "]");
+      throw new IndexOutOfBoundsException(
+              "setSequence: Index value '" + index + "' not in range [0.."
+                      + (this._sequenceList.size() - 1) + "]");
     }
 
     this._sequenceList.set(index, vSequence);
@@ -519,8 +519,8 @@ public class SequenceSet implements java.io.Serializable
           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
           org.exolab.castor.xml.ValidationException
   {
-    return (jalview.binding.SequenceSet) Unmarshaller.unmarshal(
-            jalview.binding.SequenceSet.class, reader);
+    return (jalview.binding.SequenceSet) Unmarshaller
+            .unmarshal(jalview.binding.SequenceSet.class, reader);
   }
 
   /**