JAL-1975 updated image export pipeline to produce more informative messages.
[jalview.git] / src / jalview / gui / AppJmol.java
index e497d1a..a1846bc 100644 (file)
@@ -398,6 +398,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
             MessageManager.getString("label.all"));
     menuItem.addActionListener(new ActionListener()
     {
+      @Override
       public void actionPerformed(ActionEvent evt)
       {
         allChainsSelected = true;
@@ -420,6 +421,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
       menuItem = new JCheckBoxMenuItem(chain, true);
       menuItem.addItemListener(new ItemListener()
       {
+        @Override
         public void itemStateChanged(ItemEvent evt)
         {
           if (!allChainsSelected)
@@ -452,6 +454,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
     jmb.centerViewer(toshow);
   }
 
+  @Override
   public void closeViewer(boolean closeExternalViewer)
   {
     // Jmol does not use an external viewer
@@ -468,6 +471,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
     jmb = null;
   }
 
+  @Override
   public void run()
   {
     _started = true;
@@ -631,6 +635,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
       {
         javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
         {
+          @Override
           public void run()
           {
             if (jmb.viewer.isScriptExecuting())
@@ -753,20 +758,20 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
     {
       im = new jalview.util.ImageMaker(this,
               jalview.util.ImageMaker.TYPE.PNG, "Make PNG image from view",
-              width, height, null, null);
+              width, height, null, null, null, 0, false);
     }
     else if (type == jalview.util.ImageMaker.TYPE.EPS)
     {
       im = new jalview.util.ImageMaker(this,
               jalview.util.ImageMaker.TYPE.EPS, "Make EPS file from view",
-              width, height, null, this.getTitle());
+              width, height, null, this.getTitle(), null, 0, false);
     }
     else
     {
 
       im = new jalview.util.ImageMaker(this,
               jalview.util.ImageMaker.TYPE.SVG, "Make SVG file from PCA",
-              width, height, null, this.getTitle());
+              width, height, null, this.getTitle(), null, 0, false);
     }
 
     if (im.getGraphics() != null)
@@ -1070,6 +1075,7 @@ public class AppJmol extends StructureViewerBase
 
   }
 
+  @Override
   public void setJalviewColourScheme(ColourSchemeI ucs)
   {
     jmb.setJalviewColourScheme(ucs);