FileFormatI further tweaks, clean compile
[jalview.git] / src / jalview / io / AMSAFile.java
index 798249f..34eace4 100644 (file)
@@ -24,6 +24,8 @@ import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 
+import java.io.IOException;
+
 public class AMSAFile extends jalview.io.FastaFile
 {
 
@@ -37,11 +39,23 @@ public class AMSAFile extends jalview.io.FastaFile
     this.al = al;
   }
 
+  public AMSAFile(String inFile, DataSourceType sourceType)
+          throws IOException
+  {
+    super(inFile, sourceType);
+  }
+
+  public AMSAFile(FileParse source) throws IOException
+  {
+    super(source);
+  }
+
   /**
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
+  @Override
   public String print(SequenceI[] sqs, boolean jvsuffix)
   {
     super.print(sqs, jvsuffix);