JAL-2988 if selected file is null (On Java 10/OSX - happens if user has entered text...
[jalview.git] / src / jalview / io / JalviewFileChooser.java
index 08b99c2..1294e89 100755 (executable)
-/*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
- * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- *\r
- * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
- * of the License, or (at your option) any later version.\r
- *\r
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
- * GNU General Public License for more details.\r
- *\r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
- * along with this program; if not, write to the Free Software\r
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
- */\r
-/*///////////////////////////////////////////////////////////////////\r
-// This file was taken from java forum\r
-// Re: JFileChooser functioning like normal Windows Apps FileChooser\r
-// Author: ddanimal\r
-// http://forum.java.sun.com/thread.jspa?forumID=57&threadID=327712\r
-*/\r
-\r
-//////////////////////////////////////////////////////////////////\r
-package jalview.io;\r
-\r
-import java.io.*;\r
-import java.util.*;\r
-\r
-import java.awt.*;\r
-import java.awt.event.*;\r
-import javax.swing.*;\r
-import javax.swing.plaf.*;\r
-import javax.swing.plaf.basic.*;\r
-import javax.swing.plaf.metal.*;\r
-import javax.swing.table.*;\r
-\r
-public class JalviewFileChooser\r
-    extends JFileChooser\r
-{\r
-\r
-\r
-  public JalviewFileChooser(String dir, String[] suffix, String[] desc,\r
-                            String selected)\r
-  {\r
-    super(dir);\r
-\r
-    JalviewFileFilter chosen = null;\r
-\r
-    for (int i = 0; i < suffix.length; i++)\r
-    {\r
-      JalviewFileFilter jvf = new JalviewFileFilter(suffix[i], desc[i]);\r
-      addChoosableFileFilter(jvf);\r
-\r
-      if ( (selected != null) && selected.equalsIgnoreCase(desc[i]))\r
-      {\r
-        chosen = jvf;\r
-      }\r
-    }\r
-\r
-    if (chosen != null)\r
-    {\r
-      setFileFilter(chosen);\r
-    }\r
-\r
-  }\r
-\r
-\r
-  public void setFileFilter(javax.swing.filechooser.FileFilter filter)\r
- {\r
-   super.setFileFilter(filter);\r
-\r
-   if (!(getUI() instanceof BasicFileChooserUI)) {\r
-           return;\r
-   }\r
-\r
-   final BasicFileChooserUI ui = (BasicFileChooserUI) getUI();\r
-   final String name = ui.getFileName().trim();\r
-\r
-   if ((name == null) || (name.length() == 0)) {\r
-           return;\r
-   }\r
-\r
-   EventQueue.invokeLater(new Thread() {\r
-           public void run() {\r
-                   String currentName = ui.getFileName();\r
-                   if ((currentName == null) || (currentName.length() == 0)) {\r
-                           ui.setFileName(name);\r
-                   }\r
-           }\r
-       });\r
- }\r
-\r
-\r
-  public JalviewFileChooser(String dir)\r
-  {\r
-    super(dir);\r
-  }\r
-\r
-  public String getSelectedFormat()\r
-  {\r
-    String format = getFileFilter().getDescription();\r
-\r
-    if (format.toUpperCase().startsWith("JALVIEW"))\r
-    {\r
-      format = "Jalview";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("FASTA"))\r
-    {\r
-      format = "FASTA";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("MSF"))\r
-    {\r
-      format = "MSF";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("CLUSTAL"))\r
-    {\r
-      format = "CLUSTAL";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("BLC"))\r
-    {\r
-      format = "BLC";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("PIR"))\r
-    {\r
-      format = "PIR";\r
-    }\r
-    else if (format.toUpperCase().startsWith("PFAM"))\r
-    {\r
-      format = "PFAM";\r
-    }\r
-\r
-    return format;\r
-  }\r
-\r
-  public int showSaveDialog(Component parent)\r
-      throws HeadlessException\r
-  {\r
-    setDialogType(SAVE_DIALOG);\r
-\r
-    int ret = showDialog(parent, null);\r
-\r
-    if (getFileFilter() instanceof JalviewFileFilter)\r
-    {\r
-      JalviewFileFilter jvf = (JalviewFileFilter) getFileFilter();\r
-\r
-      if (!jvf.accept(getSelectedFile()))\r
-      {\r
-        String withExtension = getSelectedFile() + "." +\r
-            jvf.getAcceptableExtension();\r
-        setSelectedFile(new File(withExtension));\r
-      }\r
-    }\r
-\r
-    if ( (ret == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION) &&\r
-        getSelectedFile().exists())\r
-    {\r
-      int confirm = JOptionPane.showConfirmDialog(parent,\r
-                                                  "Overwrite existing file?",\r
-                                                  "File exists",\r
-                                                  JOptionPane.YES_NO_OPTION);\r
-\r
-      if (confirm != JOptionPane.YES_OPTION)\r
-      {\r
-        ret = this.CANCEL_OPTION;\r
-      }\r
-    }\r
-\r
-    return ret;\r
-  }\r
-\r
-\r
-\r
-  /**************************************************************************\r
-   * Always create the local UI\r
-   * @param comp\r
-   *************************************************************************/\r
-  public final void setUI(ComponentUI comp)\r
-  {\r
-    UI ui = new UI(this);\r
-\r
-    super.setUI(ui);\r
-  }\r
-\r
-  /**************************************************************************\r
-   * Internal implementation of Metal LookAndFeel to create the table sorting\r
-   * ability.\r
-   *************************************************************************/\r
-  private class UI\r
-      extends MetalFileChooserUI\r
-  {\r
-    private DirectoryModel model;\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Must be overridden to extend\r
-     * @param e\r
-     *************************************************************************/\r
-    public UI(JFileChooser e)\r
-    {\r
-      super(e);\r
-      try{\r
-        this.installIcons(e);\r
-      }catch(Exception ex)\r
-      { System.out.println(ex+"\nProblem installing icons, FileChooser");}\r
-    }\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Overridden to create our own model\r
-     *************************************************************************/\r
-    protected final void createModel()\r
-    {\r
-      model = new DirectoryModel(getFileChooser());\r
-    }\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Overridden to get our own model\r
-     * @return\r
-     *************************************************************************/\r
-    public final BasicDirectoryModel getModel()\r
-    {\r
-      return model;\r
-    }\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Calls the default method then adds a MouseListener to the JTable\r
-     * @param chooser\r
-     * @return\r
-     *************************************************************************/\r
-    protected final JPanel createDetailsView(JFileChooser chooser)\r
-    {\r
-      final JPanel panel = super.createDetailsView(chooser);\r
-\r
-      //Since we can't access MetalFileChooserUI's private member detailsTable\r
-      //directly, we have to find it in the JPanel\r
-      final JTable tbl = findJTable(panel.getComponents());\r
-\r
-      if (tbl != null)\r
-      {\r
-        //Add a mouselistener to listen for presses on column headers\r
-        tbl.getTableHeader().addMouseListener(new MouseAdapter()\r
-        {\r
-          public void mousePressed(MouseEvent e)\r
-          {\r
-\r
-            e.consume();\r
-\r
-            final int col = tbl.getTableHeader().columnAtPoint(e.getPoint());\r
-            model.sort(col, tbl);\r
-\r
-          }\r
-        });\r
-      }\r
-\r
-      return panel;\r
-    }\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Finds the JTable in the panel so we can add MouseListener\r
-     * @param comp\r
-     * @return\r
-     *************************************************************************/\r
-    private JTable findJTable(Component[] comp)\r
-    {\r
-      for (int i = 0; i < comp.length; i++)\r
-      {\r
-        if (comp[i] instanceof JTable)\r
-        {\r
-          return (JTable) comp[i];\r
-        }\r
-\r
-        if (comp[i] instanceof Container)\r
-        {\r
-          JTable tbl = findJTable( ( (Container) comp[i]).getComponents());\r
-\r
-          if (tbl != null)\r
-          {\r
-            return tbl;\r
-          }\r
-        }\r
-      }\r
-\r
-      return null;\r
-    }\r
-  }\r
-\r
-  /***************************************************************************\r
-   * Implementation of BasicDirectoryModel that sorts the Files by column\r
-   **************************************************************************/\r
-  private final  class DirectoryModel\r
-      extends BasicDirectoryModel\r
-  {\r
-    String sortingColumnName=null;\r
-    int col = 0;\r
-    boolean ascending;\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Must be overridden to extend BasicDirectoryModel\r
-     * @param chooser\r
-     *************************************************************************/\r
-    DirectoryModel(JFileChooser chooser)\r
-    {\r
-      super(chooser);\r
-    }\r
-\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Resorts the JFileChooser table based on new column\r
-     * @param c\r
-     *************************************************************************/\r
-    protected final void sort(int c, JTable tbl)\r
-    {\r
-\r
-\r
-      //Set column and order\r
-      col = c;\r
-      ascending = !ascending;\r
-\r
-      String indicator = " (^)";\r
-\r
-      if (ascending)\r
-      {\r
-        indicator = " (v)";\r
-      }\r
-\r
-      final JTableHeader th = tbl.getTableHeader();\r
-      final TableColumnModel tcm = th.getColumnModel();\r
-      TableColumn tc = null;\r
-      String title = null;\r
-\r
-\r
-      //Remove indicator from old sort, and add to new\r
-      for(int i=0; i<tcm.getColumnCount(); i++)\r
-      {\r
-        tc = tcm.getColumn(i);\r
-        title = tc.getHeaderValue().toString();\r
-        if (title.endsWith(" (^)") || title.endsWith(" (v)"))\r
-        {\r
-          title = title.substring(0, title.length() - 4);\r
-        }\r
-\r
-        if(i==col)\r
-        {\r
-          sortingColumnName = title;\r
-          title = title + indicator;\r
-        }\r
-\r
-        tc.setHeaderValue(title);\r
-      }\r
-\r
-      //Requery the file listing\r
-      validateFileCache();\r
-    }\r
-\r
-    /**************************************************************************\r
-     * Sorts the data based on current column setting\r
-     * @param data\r
-     *************************************************************************/\r
-    protected final void sort(Vector data)\r
-    {\r
-        /*\r
-                        UIManager.getString("FileChooser.fileTypeHeaderText", l),\r
-                        UIManager.getString("FileChooser.fileAttrHeaderText", l)\r
-*/\r
-    if(sortingColumnName==null)\r
-      return;\r
-\r
-\r
-    if(sortingColumnName.equals(UIManager.getString("FileChooser.fileDateHeaderText")))\r
-    {\r
-      Collections.sort(data,\r
-                           new Comparator()\r
-          {\r
-\r
-            public int compare(Object o1, Object o2)\r
-            {\r
-              int ret = 1;\r
-              final File a = (File) o1;\r
-              final File b = (File) o2;\r
-\r
-              if (a.lastModified() > b.lastModified())\r
-              {\r
-                ret = -1;\r
-              }\r
-              else if (a.lastModified() == b.lastModified())\r
-              {\r
-                ret = 0;\r
-              }\r
-\r
-              if (ascending)\r
-              {\r
-                ret *= -1;\r
-              }\r
-\r
-              return ret;\r
-            }\r
-          });\r
-    }\r
-    else if(sortingColumnName.equals(UIManager.getString("FileChooser.fileSizeHeaderText")))\r
-    {\r
-\r
-         Collections.sort(data,\r
-                           new Comparator()\r
-          {\r
-\r
-            public int compare(Object o1, Object o2)\r
-            {\r
-              int ret = 1;\r
-              final File a = (File) o1;\r
-              final File b = (File) o2;\r
-\r
-              if (a.length() > b.length())\r
-              {\r
-                ret = -1;\r
-              }\r
-              else if (a.length() == b.length())\r
-              {\r
-                ret = 0;\r
-              }\r
-\r
-              if (ascending)\r
-              {\r
-                ret *= -1;\r
-              }\r
-\r
-              return ret;\r
-            }\r
-          });\r
-    }\r
-    else if(sortingColumnName.equals(UIManager.getString("FileChooser.fileTypeHeaderText")))\r
-    {\r
-          Collections.sort(data,\r
-                           new Comparator()\r
-          {\r
-            public int compare(Object o1, Object o2)\r
-            {\r
-              final String a = getFileSystemView().getSystemTypeDescription( (File)o1 );\r
-              final String b = getFileSystemView().getSystemTypeDescription( (File)o2 );\r
-              if (ascending)\r
-              {\r
-                return a.compareToIgnoreCase(b);\r
-              }\r
-              else\r
-              {\r
-                return -1 * a.compareToIgnoreCase(b);\r
-              }\r
-            }\r
-          });\r
-      }\r
-      else if(sortingColumnName.equals(UIManager.getString("FileChooser.fileNameHeaderText")))\r
-{\r
-      Collections.sort(data,\r
-                       new Comparator()\r
-      {\r
-        public int compare(Object o1, Object o2)\r
-        {\r
-          final String a = ((File) o1).getName();\r
-          final String b = ((File) o2).getName();\r
-\r
-          if (ascending)\r
-          {\r
-            return a.compareToIgnoreCase(b);\r
-          }\r
-          else\r
-          {\r
-            return -1 * a.compareToIgnoreCase(b);\r
-          }\r
-        }\r
-      });\r
-  }\r
-\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ * This file is part of Jalview.
+ *
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
+//////////////////////////////////////////////////////////////////
+package jalview.io;
+
+import jalview.bin.Cache;
+import jalview.gui.JvOptionPane;
+import jalview.util.MessageManager;
+import jalview.util.Platform;
+
+import java.awt.Component;
+import java.awt.Dimension;
+import java.awt.EventQueue;
+import java.awt.HeadlessException;
+import java.awt.event.MouseAdapter;
+import java.awt.event.MouseEvent;
+import java.io.File;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.List;
+import java.util.StringTokenizer;
+import java.util.Vector;
+
+import javax.swing.DefaultListCellRenderer;
+import javax.swing.JFileChooser;
+import javax.swing.JList;
+import javax.swing.JPanel;
+import javax.swing.JScrollPane;
+import javax.swing.SpringLayout;
+import javax.swing.plaf.basic.BasicFileChooserUI;
+
+/**
+ * Enhanced file chooser dialog box.
+ *
+ * NOTE: bug on Windows systems when filechooser opened on directory to view
+ * files with colons in title.
+ *
+ * @author AMW
+ *
+ */
+public class JalviewFileChooser extends JFileChooser
+{
+  /**
+   * Factory method to return a file chooser that offers readable alignment file
+   * formats
+   * 
+   * @param directory
+   * @param selected
+   * @return
+   */
+  public static JalviewFileChooser forRead(String directory,
+          String selected)
+  {
+    List<String> extensions = new ArrayList<String>();
+    List<String> descs = new ArrayList<String>();
+    for (FileFormatI format : FileFormats.getInstance().getFormats())
+    {
+      if (format.isReadable())
+      {
+        extensions.add(format.getExtensions());
+        descs.add(format.getName());
+      }
+    }
+    return new JalviewFileChooser(directory,
+            extensions.toArray(new String[extensions.size()]),
+            descs.toArray(new String[descs.size()]), selected, true);
+  }
+
+  /**
+   * Factory method to return a file chooser that offers writable alignment file
+   * formats
+   * 
+   * @param directory
+   * @param selected
+   * @return
+   */
+  public static JalviewFileChooser forWrite(String directory,
+          String selected)
+  {
+    // TODO in Java 8, forRead and forWrite can be a single method
+    // with a lambda expression parameter for isReadable/isWritable
+    List<String> extensions = new ArrayList<String>();
+    List<String> descs = new ArrayList<String>();
+    for (FileFormatI format : FileFormats.getInstance().getFormats())
+    {
+      if (format.isWritable())
+      {
+        extensions.add(format.getExtensions());
+        descs.add(format.getName());
+      }
+    }
+    return new JalviewFileChooser(directory,
+            extensions.toArray(new String[extensions.size()]),
+            descs.toArray(new String[descs.size()]), selected, false);
+  }
+
+  public JalviewFileChooser(String dir)
+  {
+    super(safePath(dir));
+    setAccessory(new RecentlyOpened());
+  }
+
+  public JalviewFileChooser(String dir, String[] suffix, String[] desc,
+          String selected)
+  {
+    this(dir, suffix, desc, selected, true);
+  }
+
+  /**
+   * Constructor for a single choice of file extension and description
+   * 
+   * @param extension
+   * @param desc
+   */
+  public JalviewFileChooser(String extension, String desc)
+  {
+    this(Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"), new String[] { extension },
+            new String[]
+            { desc }, desc, true);
+  }
+
+  JalviewFileChooser(String dir, String[] extensions, String[] descs,
+          String selected, boolean allFiles)
+  {
+    super(safePath(dir));
+    if (extensions.length == descs.length)
+    {
+      List<String[]> formats = new ArrayList<String[]>();
+      for (int i = 0; i < extensions.length; i++)
+      {
+        formats.add(new String[] { extensions[i], descs[i] });
+      }
+      init(formats, selected, allFiles);
+    }
+    else
+    {
+      System.err.println("JalviewFileChooser arguments mismatch: "
+              + extensions + ", " + descs);
+    }
+  }
+
+  private static File safePath(String dir)
+  {
+    if (dir == null)
+    {
+      return null;
+    }
+
+    File f = new File(dir);
+    if (f.getName().indexOf(':') > -1)
+    {
+      return null;
+    }
+    return f;
+  }
+
+  /**
+   * 
+   * @param formats
+   *          a list of {extensions, description} for each file format
+   * @param selected
+   * @param allFiles
+   *          if true, 'any format' option is included
+   */
+  void init(List<String[]> formats, String selected, boolean allFiles)
+  {
+
+    JalviewFileFilter chosen = null;
+
+    // SelectAllFilter needs to be set first before adding further
+    // file filters to fix bug on Mac OSX
+    setAcceptAllFileFilterUsed(allFiles);
+
+    for (String[] format : formats)
+    {
+      JalviewFileFilter jvf = new JalviewFileFilter(format[0], format[1]);
+      addChoosableFileFilter(jvf);
+      if ((selected != null) && selected.equalsIgnoreCase(format[1]))
+      {
+        chosen = jvf;
+      }
+    }
+
+    if (chosen != null)
+    {
+      setFileFilter(chosen);
+    }
+
+    setAccessory(new RecentlyOpened());
+  }
+
+  @Override
+  public void setFileFilter(javax.swing.filechooser.FileFilter filter)
+  {
+    super.setFileFilter(filter);
+
+    try
+    {
+      if (getUI() instanceof BasicFileChooserUI)
+      {
+        final BasicFileChooserUI fcui = (BasicFileChooserUI) getUI();
+        final String name = fcui.getFileName().trim();
+
+        if ((name == null) || (name.length() == 0))
+        {
+          return;
+        }
+
+        EventQueue.invokeLater(new Thread()
+        {
+          @Override
+          public void run()
+          {
+            String currentName = fcui.getFileName();
+            if ((currentName == null) || (currentName.length() == 0))
+            {
+              fcui.setFileName(name);
+            }
+          }
+        });
+      }
+    } catch (Exception ex)
+    {
+      ex.printStackTrace();
+      // Some platforms do not have BasicFileChooserUI
+    }
+  }
+
+  /**
+   * Returns the selected file format, or null if none selected
+   * 
+   * @return
+   */
+  public FileFormatI getSelectedFormat()
+  {
+    if (getFileFilter() == null)
+    {
+      return null;
+    }
+
+    /*
+     * logic here depends on option description being formatted as 
+     * formatName (extension, extension...)
+     * or the 'no option selected' value
+     * All Files
+     * @see JalviewFileFilter.getDescription
+     */
+    String format = getFileFilter().getDescription();
+    int parenPos = format.indexOf("(");
+    if (parenPos > 0)
+    {
+      format = format.substring(0, parenPos).trim();
+      try
+      {
+        return FileFormats.getInstance().forName(format);
+      } catch (IllegalArgumentException e)
+      {
+        System.err.println("Unexpected format: " + format);
+      }
+    }
+    return null;
+  }
+
+  File ourselectedFile = null;
+
+  @Override
+  public File getSelectedFile()
+  {
+    File selfile = super.getSelectedFile();
+    if (selfile == null && ourselectedFile != null)
+    {
+      return ourselectedFile;
+    }
+    return selfile;
+  }
+
+  @Override
+  public int showSaveDialog(Component parent) throws HeadlessException
+  {
+    this.setAccessory(null);
+
+    setDialogType(SAVE_DIALOG);
+
+    this.setSelectedFile(null);
+    int ret = showDialog(parent, MessageManager.getString("action.save"));
+    ourselectedFile = getSelectedFile();
+
+    if (getSelectedFile() == null)
+    {
+      // Workaround for Java 9,10 on OSX - no selected file, but there is a
+      // filename typed in
+      try
+      {
+        String filename = ((BasicFileChooserUI) getUI()).getFileName();
+        if (filename != null && filename.length() > 0)
+        {
+          ourselectedFile = new File(getCurrentDirectory(), filename);
+        }
+      } catch (Throwable x)
+      {
+        System.err.println(
+                "Unexpected exception when trying to get filename.");
+        x.printStackTrace();
+      }
+    }
+    if (ourselectedFile == null)
+    {
+      return JalviewFileChooser.CANCEL_OPTION;
+    }
+    if (getFileFilter() instanceof JalviewFileFilter)
+    {
+      JalviewFileFilter jvf = (JalviewFileFilter) getFileFilter();
+
+      if (!jvf.accept(ourselectedFile))
+      {
+        String withExtension = getSelectedFile().getName() + "."
+                + jvf.getAcceptableExtension();
+        ourselectedFile = (new File(getCurrentDirectory(), withExtension));
+        setSelectedFile(ourselectedFile);
+      }
+    }
+    // TODO: ENSURE THAT FILES SAVED WITH A ':' IN THE NAME ARE REFUSED AND THE
+    // USER PROMPTED FOR A NEW FILENAME
+    if ((ret == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
+            && ourselectedFile.exists())
+    {
+      int confirm = JvOptionPane.showConfirmDialog(parent,
+              MessageManager.getString("label.overwrite_existing_file"),
+              MessageManager.getString("label.file_already_exists"),
+              JvOptionPane.YES_NO_OPTION);
+
+      if (confirm != JvOptionPane.YES_OPTION)
+      {
+        ret = JalviewFileChooser.CANCEL_OPTION;
+      }
+    }
+
+    return ret;
+  }
+
+  void recentListSelectionChanged(Object selection)
+  {
+    setSelectedFile(null);
+    if (selection != null)
+    {
+      File file = new File((String) selection);
+      if (getFileFilter() instanceof JalviewFileFilter)
+      {
+        JalviewFileFilter jvf = (JalviewFileFilter) this.getFileFilter();
+
+        if (!jvf.accept(file))
+        {
+          setFileFilter(getChoosableFileFilters()[0]);
+        }
+      }
+
+      setSelectedFile(file);
+    }
+  }
+
+  class RecentlyOpened extends JPanel
+  {
+    JList list;
+
+    public RecentlyOpened()
+    {
+
+      String historyItems = jalview.bin.Cache.getProperty("RECENT_FILE");
+      StringTokenizer st;
+      Vector recent = new Vector();
+
+      if (historyItems != null)
+      {
+        st = new StringTokenizer(historyItems, "\t");
+
+        while (st.hasMoreTokens())
+        {
+          recent.addElement(st.nextElement());
+        }
+      }
+
+      list = new JList(recent);
+
+      DefaultListCellRenderer dlcr = new DefaultListCellRenderer();
+      dlcr.setHorizontalAlignment(DefaultListCellRenderer.RIGHT);
+      list.setCellRenderer(dlcr);
+
+      list.addMouseListener(new MouseAdapter()
+      {
+        @Override
+        public void mousePressed(MouseEvent evt)
+        {
+          recentListSelectionChanged(list.getSelectedValue());
+        }
+      });
+
+      this.setBorder(new javax.swing.border.TitledBorder(
+              MessageManager.getString("label.recently_opened")));
+
+      final JScrollPane scroller = new JScrollPane(list);
+
+      SpringLayout layout = new SpringLayout();
+      layout.putConstraint(SpringLayout.WEST, scroller, 5,
+              SpringLayout.WEST, this);
+      layout.putConstraint(SpringLayout.NORTH, scroller, 5,
+              SpringLayout.NORTH, this);
+
+      if (new Platform().isAMac())
+      {
+        scroller.setPreferredSize(new Dimension(500, 100));
+      }
+      else
+      {
+        scroller.setPreferredSize(new Dimension(130, 200));
+      }
+
+      this.add(scroller);
+
+      javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
+      {
+        @Override
+        public void run()
+        {
+          scroller.getHorizontalScrollBar()
+                  .setValue(scroller.getHorizontalScrollBar().getMaximum());
+        }
+      });
+
+    }
+
+  }
+}