JAL-3106 use .jvp as default
[jalview.git] / src / jalview / io / JalviewFileFilter.java
index d6c6d4b..21f5b0f 100755 (executable)
-/*\r
-* Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
-*\r
-* This program is free software; you can redistribute it and/or\r
-* modify it under the terms of the GNU General Public License\r
-* as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
-* of the License, or (at your option) any later version.\r
-*\r
-* This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
-* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
-* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
-* GNU General Public License for more details.\r
-*\r
-* You should have received a copy of the GNU General Public License\r
-* along with this program; if not, write to the Free Software\r
-* Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
-*/\r
-\r
-package jalview.io;\r
-\r
-import javax.swing.filechooser.*;\r
-import java.io.File;\r
-import java.util.*;\r
-\r
-public class JalviewFileFilter extends FileFilter\r
-{\r
-      private static String TYPE_UNKNOWN = "Type Unknown";\r
-      private static String HIDDEN_FILE = "Hidden File";\r
-      public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();\r
-\r
-      private Hashtable filters = null;\r
-      private String description = "no description";\r
-      private String fullDescription = "full description";\r
-      private boolean useExtensionsInDescription = true;\r
-\r
-\r
-      public JalviewFileFilter(String extension, String description) {\r
-\r
-       StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");\r
-       while(st.hasMoreElements())\r
-       {\r
-         addExtension(st.nextToken().trim());\r
-       }\r
-       setDescription(description);\r
-      }\r
-\r
-      public JalviewFileFilter(String[] filts) {\r
-          this(filts, null);\r
-      }\r
-\r
-      public String getAcceptableExtension()\r
-      {\r
-        return filters.keys().nextElement().toString();\r
-      }\r
-\r
-      public JalviewFileFilter(String[] filts, String description) {\r
-          for (int i = 0; i < filts.length; i++) {\r
-              // add filters one by one\r
-              addExtension(filts[i]);\r
-          }\r
-           if(description!=null) setDescription(description);\r
-      }\r
-\r
-      // takes account of the fact that database is a directory\r
-      public boolean accept(File f) {\r
-          if(f != null) {\r
-              String extension = getExtension(f);\r
-              if(f.isDirectory()) {\r
-                 if(extension == null || extension.equals("")) {\r
-                    return true;\r
-                 } else {\r
-                    if(filters.get(getExtension(f)) != null) {\r
-                       return true;\r
-                    }\r
-                 }\r
-              }\r
-              if(extension != null && filters.get(getExtension(f)) != null) {\r
-                  return true;\r
-              }\r
-          }\r
-          return false;\r
-      }\r
-\r
-       public String getExtension(File f) {\r
-          if(f != null) {\r
-              String filename = f.getName();\r
-              int i = filename.lastIndexOf('.');\r
-              if(i>0 && i<filename.length()-1) {\r
-                  return filename.substring(i+1).toLowerCase();\r
-              };\r
-          }\r
-          return "";\r
-      }\r
-\r
-      public void addExtension(String extension) {\r
-          if(filters == null) {\r
-              filters = new Hashtable(5);\r
-          }\r
-          filters.put(extension.toLowerCase(), this);\r
-          fullDescription = null;\r
-      }\r
-\r
-\r
-      public String getDescription() {\r
-          if(fullDescription == null) {\r
-              if(description == null || isExtensionListInDescription()) {\r
-                   fullDescription = description==null ? "(" : description + " (";\r
-                  // build the description from the extension list\r
-                  Enumeration extensions = filters.keys();\r
-                  if(extensions != null) {\r
-                      fullDescription += "." + (String) extensions.nextElement();\r
-                      while (extensions.hasMoreElements()) {\r
-                          fullDescription += ", " + (String) extensions.nextElement();\r
-                      }\r
-                  }\r
-                  fullDescription += ")";\r
-              } else {\r
-                  fullDescription = description;\r
-              }\r
-          }\r
-          return fullDescription;\r
-      }\r
-\r
-      public void setDescription(String description) {\r
-          this.description = description;\r
-          fullDescription = null;\r
-      }\r
-\r
-      public void setExtensionListInDescription(boolean b) {\r
-          useExtensionsInDescription = b;\r
-          fullDescription = null;\r
-      }\r
-\r
-      public boolean isExtensionListInDescription() {\r
-          return useExtensionsInDescription;\r
-      }\r
-  }\r
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
+package jalview.io;
+
+import java.io.File;
+import java.util.Hashtable;
+import java.util.Iterator;
+import java.util.LinkedHashMap;
+import java.util.Map;
+import java.util.StringTokenizer;
+
+import javax.swing.filechooser.FileFilter;
+
+public class JalviewFileFilter extends FileFilter
+{
+  public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();
+
+  private Map<String, JalviewFileFilter> filters = null;
+
+  private String description = "no description";
+
+  private String fullDescription = "full description";
+
+  private boolean useExtensionsInDescription = true;
+
+  public JalviewFileFilter(String extension, String description)
+  {
+    StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");
+
+    while (st.hasMoreElements())
+    {
+      addExtension(st.nextToken().trim());
+    }
+
+    setDescription(description);
+  }
+
+  public JalviewFileFilter(String[] filts)
+  {
+    this(filts, null);
+  }
+
+  public JalviewFileFilter(String[] filts, String description)
+  {
+    for (int i = 0; i < filts.length; i++)
+    {
+      // add filters one by one
+      addExtension(filts[i]);
+    }
+
+    if (description != null)
+    {
+      setDescription(description);
+    }
+  }
+
+  public String getAcceptableExtension()
+  {
+    return filters.keySet().iterator().next().toString();
+  }
+
+  // takes account of the fact that database is a directory
+  @Override
+  public boolean accept(File f)
+  {
+    if (f != null)
+    {
+      String extension = getExtension(f);
+
+      if (f.isDirectory())
+      {
+        return true;
+      }
+
+      if ((extension != null) && (filters.get(extension) != null))
+      {
+        return true;
+      }
+    }
+
+    return false;
+  }
+
+  public String getExtension(File f)
+  {
+    if (f != null)
+    {
+      String filename = f.getName();
+      int i = filename.lastIndexOf('.');
+
+      if ((i > 0) && (i < (filename.length() - 1)))
+      {
+        return filename.substring(i + 1).toLowerCase();
+      }
+
+      ;
+    }
+
+    return "";
+  }
+
+  public void addExtension(String extension)
+  {
+    if (filters == null)
+    {
+      filters = new LinkedHashMap<>(5);
+    }
+
+    filters.put(extension.toLowerCase(), this);
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  @Override
+  public String getDescription()
+  {
+    if (fullDescription == null)
+    {
+      if ((description == null) || isExtensionListInDescription())
+      {
+        fullDescription = (description == null) ? "("
+                : (description + " (");
+
+        // build the description from the extension list
+        Iterator<String> extensions = filters.keySet().iterator();
+
+        if (extensions != null)
+        {
+          fullDescription += ("." + extensions.next());
+
+          while (extensions.hasNext())
+          {
+            fullDescription += (", " + extensions.next());
+          }
+        }
+
+        fullDescription += ")";
+      }
+      else
+      {
+        fullDescription = description;
+      }
+    }
+
+    return fullDescription;
+  }
+
+  public void setDescription(String description)
+  {
+    this.description = description;
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  public void setExtensionListInDescription(boolean b)
+  {
+    useExtensionsInDescription = b;
+    fullDescription = null;
+  }
+
+  public boolean isExtensionListInDescription()
+  {
+    return useExtensionsInDescription;
+  }
+}