Merge commit 'alpha/update_2_12_for_2_11_2_series_merge^2' into HEAD
[jalview.git] / src / jalview / jbgui / GStructureChooser.java
index b9c9267..70d99c1 100644 (file)
@@ -39,6 +39,7 @@ import java.awt.Dimension;
 import java.awt.FlowLayout;
 import java.awt.Font;
 import java.awt.GridLayout;
+import java.awt.Point;
 import java.awt.event.ActionEvent;
 import java.awt.event.ActionListener;
 import java.awt.event.ItemEvent;
@@ -67,6 +68,7 @@ import javax.swing.JTable;
 import javax.swing.JTextField;
 import javax.swing.ListCellRenderer;
 import javax.swing.Timer;
+import javax.swing.UIManager;
 import javax.swing.event.ChangeEvent;
 import javax.swing.event.ChangeListener;
 import javax.swing.event.DocumentEvent;
@@ -88,7 +90,7 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
 {
   private static final Font VERDANA_12 = new Font("Verdana", 0, 12);
 
-  protected static final String VIEWS_FILTER = "VIEWS_FILTER";
+  public static final String VIEWS_FILTER = "VIEWS_FILTER";
 
   protected static final String VIEWS_FROM_FILE = "VIEWS_FROM_FILE";
 
@@ -119,6 +121,8 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
   protected JButton btn_newView;
 
   protected JButton btn_pdbFromFile = new JButton();
+  
+  protected JButton btn_queryTDB = new JButton();
 
   protected JCheckBox chk_superpose = new JCheckBox(
           MessageManager.getString("label.superpose_structures"));
@@ -145,6 +149,9 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(
           getClass().getResource("/images/warning.gif"));
 
+  protected ImageIcon tdbImage = new ImageIcon(
+          getClass().getResource("/images/3d-beacons-logo-transparent.png"));
+
   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 
   protected JLabel lbl_pdbManualFetchStatus = new JLabel(errorImage);
@@ -161,9 +168,9 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
 
   protected JTabbedPane pnl_filter = new JTabbedPane();
 
-  protected FTSDataColumnPreferences pdbDocFieldPrefs = new FTSDataColumnPreferences(
-          PreferenceSource.STRUCTURE_CHOOSER,
-          PDBFTSRestClient.getInstance());
+  protected abstract FTSDataColumnPreferences getFTSDocFieldPrefs();
+  protected abstract void setFTSDocFieldPrefs(FTSDataColumnPreferences newPrefs);
+
 
   protected FTSDataColumnI[] previousWantedFields;
 
@@ -244,11 +251,15 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
                                       + "...\"")
                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
       return toolTipText;
-    }
+    }    
   };
 
   public GStructureChooser()
   {
+  }
+  protected void initDialog()
+  {
+
     try
     {
       jbInit();
@@ -261,7 +272,7 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
       e.printStackTrace();
     }
   }
-
+  
   // BH SwingJS optimization
   // (a) 100-ms interruptable timer for text entry -- BH 1/10/2019
   // (b) two-character minimum, at least for JavaScript.
@@ -302,15 +313,42 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
     {
       @Override
+      public void mousePressed(MouseEvent e)
+      {
+        if (!popupAction(e))
+        {
+          super.mousePressed(e);
+        }
+      }
+      @Override
       public void mouseClicked(MouseEvent e)
       {
-        validateSelections();
+        if (!popupAction(e))
+        {
+          validateSelections();
+        }
       }
 
       @Override
       public void mouseReleased(MouseEvent e)
       {
+        if (!popupAction(e))
+        {
         validateSelections();
+        }
+      }
+      boolean popupAction(MouseEvent e)
+      {
+       if (e.isPopupTrigger())
+       {
+         Point pt = e.getPoint();
+         int selectedRow = tbl_summary.rowAtPoint(pt);
+         if (showPopupFor(selectedRow,pt.x,pt.y))
+         {
+           return true;
+         }
+       }
+       return false;
       }
     });
     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
@@ -427,7 +465,9 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
       }
     });
 
-    btn_newView = new JButton(MessageManager.getString("action.new_view"));
+    btn_newView = new JButton(
+            MessageManager.formatMessage("action.new_structure_view_with",
+                    StructureViewer.getViewerType().toString()));
     btn_newView.setFont(VERDANA_12);
     btn_newView.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
     {
@@ -448,6 +488,8 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
         }
       }
     });
+    
+    // TODO: JAL-3898 - get list of available external programs to view structures with
 
     btn_add = new JButton(MessageManager.getString("action.add"));
     btn_add.setFont(VERDANA_12);
@@ -543,6 +585,12 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
     });
 
     chk_invertFilter.addItemListener(this);
+    btn_queryTDB.setFont(VERDANA_12);
+    //btn_queryTDB.setPreferredSize(new Dimension(200,22));
+    btn_queryTDB.setText(MessageManager.getString("label.search_3dbeacons"));
+    btn_queryTDB.setToolTipText(MessageManager.getString("label.find_models_from_3dbeacons"));
+    btn_queryTDB.setIcon(tdbImage);
+    btn_queryTDB.setVisible(false);
 
     targetView.setVisible(false);
 
@@ -553,10 +601,13 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
     actionsPanel.add(btn_newView);
     actionsPanel.add(btn_cancel, "right");
 
-    JPanel pnl_main = new JPanel();
-    pnl_main.add(cmb_filterOption);
-    pnl_main.add(lbl_loading);
-    pnl_main.add(chk_invertFilter);
+    JPanel pnl_main = new JPanel(new BorderLayout());
+    JPanel pnl_controls = new JPanel();
+    pnl_main.add(btn_queryTDB,BorderLayout.NORTH);
+    pnl_controls.add(cmb_filterOption);
+    pnl_controls.add(lbl_loading);
+    pnl_controls.add(chk_invertFilter);
+    pnl_main.add(pnl_controls,BorderLayout.CENTER);
     lbl_loading.setVisible(false);
 
     JPanel pnl_fileChooser = new JPanel(new FlowLayout());
@@ -596,7 +647,7 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
           btn_add.setVisible(false);
           btn_newView.setEnabled(false);
           btn_cancel.setVisible(false);
-          previousWantedFields = pdbDocFieldPrefs
+          previousWantedFields = getFTSDocFieldPrefs()
                   .getStructureSummaryFields()
                   .toArray(new FTSDataColumnI[0]);
         }
@@ -618,7 +669,7 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
     pnl_filter.addChangeListener(changeListener);
     pnl_filter.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
     pnl_filter.add(foundStructureSummary, scrl_foundStructures);
-    pnl_filter.add(configureCols, pdbDocFieldPrefs);
+    pnl_filter.add(configureCols, getFTSDocFieldPrefs());
 
     JPanel pnl_locPDB = new JPanel(new BorderLayout());
     pnl_locPDB.add(scrl_localPDB);
@@ -662,6 +713,7 @@ public abstract class GStructureChooser extends JPanel
   }
 
 
+protected abstract boolean showPopupFor(int selectedRow, int x, int y);
 protected void closeAction(int preferredHeight)
   {
     // System.out.println(">>>>>>>>>> closing internal frame!!!");
@@ -683,7 +735,7 @@ protected void closeAction(int preferredHeight)
       return true;
     }
 
-    FTSDataColumnI[] currentWantedFields = pdbDocFieldPrefs
+    FTSDataColumnI[] currentWantedFields = getFTSDocFieldPrefs()
             .getStructureSummaryFields().toArray(new FTSDataColumnI[0]);
     return Arrays.equals(currentWantedFields, previousWantedFields) ? false
             : true;
@@ -700,91 +752,6 @@ protected void closeAction(int preferredHeight)
   }
 
   /**
-   * This inner class provides the data model for the structure filter combo-box
-   * 
-   * @author tcnofoegbu
-   *
-   */
-  public class FilterOption
-  {
-    private String name;
-
-    private String value;
-
-    private String view;
-
-    private boolean addSeparatorAfter;
-
-    /**
-     * Model for structure filter option
-     * 
-     * @param name
-     *          - the name of the Option
-     * @param value
-     *          - the value of the option
-     * @param view
-     *          - the category of the filter option
-     * @param addSeparatorAfter
-     *          - if true, a horizontal separator is rendered immediately after
-     *          this filter option, otherwise
-     */
-    public FilterOption(String name, String value, String view,
-            boolean addSeparatorAfter)
-    {
-      this.name = name;
-      this.value = value;
-      this.view = view;
-      this.addSeparatorAfter = addSeparatorAfter;
-    }
-
-    public String getName()
-    {
-      return name;
-    }
-
-    public void setName(String name)
-    {
-      this.name = name;
-    }
-
-    public String getValue()
-    {
-      return value;
-    }
-
-    public void setValue(String value)
-    {
-      this.value = value;
-    }
-
-    public String getView()
-    {
-      return view;
-    }
-
-    public void setView(String view)
-    {
-      this.view = view;
-    }
-
-    @Override
-    public String toString()
-    {
-      return this.name;
-    }
-
-    public boolean isAddSeparatorAfter()
-    {
-      return addSeparatorAfter;
-    }
-
-    public void setAddSeparatorAfter(boolean addSeparatorAfter)
-    {
-      this.addSeparatorAfter = addSeparatorAfter;
-    }
-  }
-
-  /**
    * This inner class provides the provides the data model for associate
    * sequence combo-box - cmb_assSeq
    *