Merge branch 'develop' into trialMerge
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / FeatureMatcher.java
diff --git a/src/jalview/schemabinding/version2/FeatureMatcher.java b/src/jalview/schemabinding/version2/FeatureMatcher.java
deleted file mode 100644 (file)
index 4d29cab..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,383 +0,0 @@
-/*
- * This class was automatically generated with 
- * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
- * Schema.
- * $Id$
- */
-
-package jalview.schemabinding.version2;
-
-//---------------------------------/
-//- Imported classes and packages -/
-//---------------------------------/
-
-import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
-import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
-
-/**
- * Class FeatureMatcher.
- * 
- * @version $Revision$ $Date$
- */
-public class FeatureMatcher implements java.io.Serializable
-{
-
-  // --------------------------/
-  // - Class/Member Variables -/
-  // --------------------------/
-
-  /**
-   * Field _by.
-   */
-  private jalview.schemabinding.version2.types.FeatureMatcherByType _by;
-
-  /**
-   * name of feature attribute to filter on, or attribute and sub-attribute
-   */
-  private java.util.Vector _attributeNameList;
-
-  /**
-   * Field _condition.
-   */
-  private java.lang.String _condition;
-
-  /**
-   * Field _value.
-   */
-  private java.lang.String _value;
-
-  // ----------------/
-  // - Constructors -/
-  // ----------------/
-
-  public FeatureMatcher()
-  {
-    super();
-    this._attributeNameList = new java.util.Vector();
-  }
-
-  // -----------/
-  // - Methods -/
-  // -----------/
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param vAttributeName
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void addAttributeName(final java.lang.String vAttributeName)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check for the maximum size
-    if (this._attributeNameList.size() >= 2)
-    {
-      throw new IndexOutOfBoundsException(
-              "addAttributeName has a maximum of 2");
-    }
-
-    this._attributeNameList.addElement(vAttributeName);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param index
-   * @param vAttributeName
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void addAttributeName(final int index,
-          final java.lang.String vAttributeName)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check for the maximum size
-    if (this._attributeNameList.size() >= 2)
-    {
-      throw new IndexOutOfBoundsException(
-              "addAttributeName has a maximum of 2");
-    }
-
-    this._attributeNameList.add(index, vAttributeName);
-  }
-
-  /**
-   * Method enumerateAttributeName.
-   * 
-   * @return an Enumeration over all java.lang.String elements
-   */
-  public java.util.Enumeration enumerateAttributeName()
-  {
-    return this._attributeNameList.elements();
-  }
-
-  /**
-   * Method getAttributeName.
-   * 
-   * @param index
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   * @return the value of the java.lang.String at the given index
-   */
-  public java.lang.String getAttributeName(final int index)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check bounds for index
-    if (index < 0 || index >= this._attributeNameList.size())
-    {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("getAttributeName: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._attributeNameList.size() - 1) + "]");
-    }
-
-    return (java.lang.String) _attributeNameList.get(index);
-  }
-
-  /**
-   * Method getAttributeName.Returns the contents of the collection in an Array.
-   * <p>
-   * Note: Just in case the collection contents are changing in another thread,
-   * we pass a 0-length Array of the correct type into the API call. This way we
-   * <i>know</i> that the Array returned is of exactly the correct length.
-   * 
-   * @return this collection as an Array
-   */
-  public java.lang.String[] getAttributeName()
-  {
-    java.lang.String[] array = new java.lang.String[0];
-    return (java.lang.String[]) this._attributeNameList.toArray(array);
-  }
-
-  /**
-   * Method getAttributeNameCount.
-   * 
-   * @return the size of this collection
-   */
-  public int getAttributeNameCount()
-  {
-    return this._attributeNameList.size();
-  }
-
-  /**
-   * Returns the value of field 'by'.
-   * 
-   * @return the value of field 'By'.
-   */
-  public jalview.schemabinding.version2.types.FeatureMatcherByType getBy()
-  {
-    return this._by;
-  }
-
-  /**
-   * Returns the value of field 'condition'.
-   * 
-   * @return the value of field 'Condition'.
-   */
-  public java.lang.String getCondition()
-  {
-    return this._condition;
-  }
-
-  /**
-   * Returns the value of field 'value'.
-   * 
-   * @return the value of field 'Value'.
-   */
-  public java.lang.String getValue()
-  {
-    return this._value;
-  }
-
-  /**
-   * Method isValid.
-   * 
-   * @return true if this object is valid according to the schema
-   */
-  public boolean isValid()
-  {
-    try
-    {
-      validate();
-    } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
-    {
-      return false;
-    }
-    return true;
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param out
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during
-   *           marshaling
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema
-   */
-  public void marshal(final java.io.Writer out)
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException
-  {
-    Marshaller.marshal(this, out);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param handler
-   * @throws java.io.IOException
-   *           if an IOException occurs during marshaling
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during
-   *           marshaling
-   */
-  public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
-          throws java.io.IOException,
-          org.exolab.castor.xml.MarshalException,
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException
-  {
-    Marshaller.marshal(this, handler);
-  }
-
-  /**
-   */
-  public void removeAllAttributeName()
-  {
-    this._attributeNameList.clear();
-  }
-
-  /**
-   * Method removeAttributeName.
-   * 
-   * @param vAttributeName
-   * @return true if the object was removed from the collection.
-   */
-  public boolean removeAttributeName(final java.lang.String vAttributeName)
-  {
-    boolean removed = _attributeNameList.remove(vAttributeName);
-    return removed;
-  }
-
-  /**
-   * Method removeAttributeNameAt.
-   * 
-   * @param index
-   * @return the element removed from the collection
-   */
-  public java.lang.String removeAttributeNameAt(final int index)
-  {
-    java.lang.Object obj = this._attributeNameList.remove(index);
-    return (java.lang.String) obj;
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param index
-   * @param vAttributeName
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void setAttributeName(final int index,
-          final java.lang.String vAttributeName)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check bounds for index
-    if (index < 0 || index >= this._attributeNameList.size())
-    {
-      throw new IndexOutOfBoundsException("setAttributeName: Index value '"
-              + index + "' not in range [0.."
-              + (this._attributeNameList.size() - 1) + "]");
-    }
-
-    this._attributeNameList.set(index, vAttributeName);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param vAttributeNameArray
-   */
-  public void setAttributeName(final java.lang.String[] vAttributeNameArray)
-  {
-    // -- copy array
-    _attributeNameList.clear();
-
-    for (int i = 0; i < vAttributeNameArray.length; i++)
-    {
-      this._attributeNameList.add(vAttributeNameArray[i]);
-    }
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of field 'by'.
-   * 
-   * @param by
-   *          the value of field 'by'.
-   */
-  public void setBy(
-          final jalview.schemabinding.version2.types.FeatureMatcherByType by)
-  {
-    this._by = by;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of field 'condition'.
-   * 
-   * @param condition
-   *          the value of field 'condition'.
-   */
-  public void setCondition(final java.lang.String condition)
-  {
-    this._condition = condition;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of field 'value'.
-   * 
-   * @param value
-   *          the value of field 'value'.
-   */
-  public void setValue(final java.lang.String value)
-  {
-    this._value = value;
-  }
-
-  /**
-   * Method unmarshal.
-   * 
-   * @param reader
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
-   *           if object is null or if any SAXException is thrown during
-   *           marshaling
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema
-   * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.FeatureMatcher
-   */
-  public static jalview.schemabinding.version2.FeatureMatcher unmarshal(
-          final java.io.Reader reader)
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException
-  {
-    return (jalview.schemabinding.version2.FeatureMatcher) Unmarshaller
-            .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.FeatureMatcher.class,
-                    reader);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
-   *           if this object is an invalid instance according to the schema
-   */
-  public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
-  {
-    org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
-    validator.validate(this);
-  }
-
-}