Merge branch 'develop' into features/JAL-653_gffalignments
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / PdbentryItem.java
index aa7078a..129bcc7 100644 (file)
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3
- * of the License, or (at your option) any later version.
- *  
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ * This class was automatically generated with 
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
+ * Schema.
+ * $Id$
  */
-package jalview.schemabinding.version2;
 
-import jalview.util.MessageManager;
+package jalview.schemabinding.version2;
 
 /**
  * Class PdbentryItem.
  * 
  * @version $Revision$ $Date$
  */
-public class PdbentryItem implements java.io.Serializable
-{
-
-  // --------------------------/
-  // - Class/Member Variables -/
-  // --------------------------/
-
-  /**
-   * Field _propertyList.
-   */
-  private java.util.Vector _propertyList;
-
-  // ----------------/
-  // - Constructors -/
-  // ----------------/
-
-  public PdbentryItem()
-  {
-    super();
-    this._propertyList = new java.util.Vector();
-  }
-
-  // -----------/
-  // - Methods -/
-  // -----------/
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param vProperty
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void addProperty(
-          final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    this._propertyList.addElement(vProperty);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param index
-   * @param vProperty
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void addProperty(final int index,
-          final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    this._propertyList.add(index, vProperty);
-  }
-
-  /**
-   * Method enumerateProperty.
-   * 
-   * @return an Enumeration over all jalview.schemabinding.version2.Property
-   *         elements
-   */
-  public java.util.Enumeration enumerateProperty()
-  {
-    return this._propertyList.elements();
-  }
-
-  /**
-   * Method getProperty.
-   * 
-   * @param index
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   * @return the value of the jalview.schemabinding.version2.Property at the
-   *         given index
-   */
-  public jalview.schemabinding.version2.Property getProperty(final int index)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check bounds for index
-    if (index < 0 || index >= this._propertyList.size())
-    {
-        throw new IndexOutOfBoundsException(MessageManager.formatMessage("exception.index_value_not_in_range", new String[]{
-                         "getProperty",
-                         Integer.valueOf(index).toString(),
-                         Integer.valueOf((this._propertyList.size() - 1)).toString()
-          })); 
+public class PdbentryItem implements java.io.Serializable {
+
+
+      //--------------------------/
+     //- Class/Member Variables -/
+    //--------------------------/
+
+    /**
+     * Field _propertyList.
+     */
+    private java.util.Vector _propertyList;
+
+
+      //----------------/
+     //- Constructors -/
+    //----------------/
+
+    public PdbentryItem() {
+        super();
+        this._propertyList = new java.util.Vector();
+    }
+
+
+      //-----------/
+     //- Methods -/
+    //-----------/
+
+    /**
+     * 
+     * 
+     * @param vProperty
+     * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException if the index
+     * given is outside the bounds of the collection
+     */
+    public void addProperty(
+            final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
+    throws java.lang.IndexOutOfBoundsException {
+        this._propertyList.addElement(vProperty);
+    }
+
+    /**
+     * 
+     * 
+     * @param index
+     * @param vProperty
+     * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException if the index
+     * given is outside the bounds of the collection
+     */
+    public void addProperty(
+            final int index,
+            final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
+    throws java.lang.IndexOutOfBoundsException {
+        this._propertyList.add(index, vProperty);
+    }
+
+    /**
+     * Method enumerateProperty.
+     * 
+     * @return an Enumeration over all
+     * jalview.schemabinding.version2.Property elements
+     */
+    public java.util.Enumeration enumerateProperty(
+    ) {
+        return this._propertyList.elements();
+    }
+
+    /**
+     * Method getProperty.
+     * 
+     * @param index
+     * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException if the index
+     * given is outside the bounds of the collection
+     * @return the value of the
+     * jalview.schemabinding.version2.Property at the given index
+     */
+    public jalview.schemabinding.version2.Property getProperty(
+            final int index)
+    throws java.lang.IndexOutOfBoundsException {
+        // check bounds for index
+        if (index < 0 || index >= this._propertyList.size()) {
+            throw new IndexOutOfBoundsException("getProperty: Index value '" + index + "' not in range [0.." + (this._propertyList.size() - 1) + "]");
+        }
+        
+        return (jalview.schemabinding.version2.Property) _propertyList.get(index);
+    }
+
+    /**
+     * Method getProperty.Returns the contents of the collection in
+     * an Array.  <p>Note:  Just in case the collection contents
+     * are changing in another thread, we pass a 0-length Array of
+     * the correct type into the API call.  This way we <i>know</i>
+     * that the Array returned is of exactly the correct length.
+     * 
+     * @return this collection as an Array
+     */
+    public jalview.schemabinding.version2.Property[] getProperty(
+    ) {
+        jalview.schemabinding.version2.Property[] array = new jalview.schemabinding.version2.Property[0];
+        return (jalview.schemabinding.version2.Property[]) this._propertyList.toArray(array);
+    }
+
+    /**
+     * Method getPropertyCount.
+     * 
+     * @return the size of this collection
+     */
+    public int getPropertyCount(
+    ) {
+        return this._propertyList.size();
     }
 
-    return (jalview.schemabinding.version2.Property) _propertyList
-            .get(index);
-  }
-
-  /**
-   * Method getProperty.Returns the contents of the collection in an Array.
-   * <p>
-   * Note: Just in case the collection contents are changing in another thread,
-   * we pass a 0-length Array of the correct type into the API call. This way we
-   * <i>know</i> that the Array returned is of exactly the correct length.
-   * 
-   * @return this collection as an Array
-   */
-  public jalview.schemabinding.version2.Property[] getProperty()
-  {
-    jalview.schemabinding.version2.Property[] array = new jalview.schemabinding.version2.Property[0];
-    return (jalview.schemabinding.version2.Property[]) this._propertyList
-            .toArray(array);
-  }
-
-  /**
-   * Method getPropertyCount.
-   * 
-   * @return the size of this collection
-   */
-  public int getPropertyCount()
-  {
-    return this._propertyList.size();
-  }
-
-  /**
+    /**
      */
-  public void removeAllProperty()
-  {
-    this._propertyList.clear();
-  }
-
-  /**
-   * Method removeProperty.
-   * 
-   * @param vProperty
-   * @return true if the object was removed from the collection.
-   */
-  public boolean removeProperty(
-          final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
-  {
-    boolean removed = _propertyList.remove(vProperty);
-    return removed;
-  }
-
-  /**
-   * Method removePropertyAt.
-   * 
-   * @param index
-   * @return the element removed from the collection
-   */
-  public jalview.schemabinding.version2.Property removePropertyAt(
-          final int index)
-  {
-    java.lang.Object obj = this._propertyList.remove(index);
-    return (jalview.schemabinding.version2.Property) obj;
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param index
-   * @param vProperty
-   * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-   *           if the index given is outside the bounds of the collection
-   */
-  public void setProperty(final int index,
-          final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
-          throws java.lang.IndexOutOfBoundsException
-  {
-    // check bounds for index
-    if (index < 0 || index >= this._propertyList.size())
-    {
-        throw new IndexOutOfBoundsException(MessageManager.formatMessage("exception.index_value_not_in_range", new String[]{
-                 "setProperty",
-                 Integer.valueOf(index).toString(),
-                 Integer.valueOf((this._propertyList.size() - 1)).toString()
-        })); 
+    public void removeAllProperty(
+    ) {
+        this._propertyList.clear();
     }
 
-    this._propertyList.set(index, vProperty);
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * 
-   * @param vPropertyArray
-   */
-  public void setProperty(
-          final jalview.schemabinding.version2.Property[] vPropertyArray)
-  {
-    // -- copy array
-    _propertyList.clear();
-
-    for (int i = 0; i < vPropertyArray.length; i++)
-    {
-      this._propertyList.add(vPropertyArray[i]);
+    /**
+     * Method removeProperty.
+     * 
+     * @param vProperty
+     * @return true if the object was removed from the collection.
+     */
+    public boolean removeProperty(
+            final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty) {
+        boolean removed = _propertyList.remove(vProperty);
+        return removed;
+    }
+
+    /**
+     * Method removePropertyAt.
+     * 
+     * @param index
+     * @return the element removed from the collection
+     */
+    public jalview.schemabinding.version2.Property removePropertyAt(
+            final int index) {
+        java.lang.Object obj = this._propertyList.remove(index);
+        return (jalview.schemabinding.version2.Property) obj;
+    }
+
+    /**
+     * 
+     * 
+     * @param index
+     * @param vProperty
+     * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException if the index
+     * given is outside the bounds of the collection
+     */
+    public void setProperty(
+            final int index,
+            final jalview.schemabinding.version2.Property vProperty)
+    throws java.lang.IndexOutOfBoundsException {
+        // check bounds for index
+        if (index < 0 || index >= this._propertyList.size()) {
+            throw new IndexOutOfBoundsException("setProperty: Index value '" + index + "' not in range [0.." + (this._propertyList.size() - 1) + "]");
+        }
+        
+        this._propertyList.set(index, vProperty);
+    }
+
+    /**
+     * 
+     * 
+     * @param vPropertyArray
+     */
+    public void setProperty(
+            final jalview.schemabinding.version2.Property[] vPropertyArray) {
+        //-- copy array
+        _propertyList.clear();
+        
+        for (int i = 0; i < vPropertyArray.length; i++) {
+                this._propertyList.add(vPropertyArray[i]);
+        }
     }
-  }
 
 }