Merge branch 'develop' into trialMerge
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / descriptors / AlcodonDescriptor.java
diff --git a/src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java b/src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java
deleted file mode 100644 (file)
index c1a0eab..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,313 +0,0 @@
-/*
- * This class was automatically generated with 
- * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
- * Schema.
- * $Id$
- */
-
-package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
-
-//---------------------------------/
-//- Imported classes and packages -/
-//---------------------------------/
-
-import jalview.schemabinding.version2.Alcodon;
-
-/**
- * Class AlcodonDescriptor.
- * 
- * @version $Revision$ $Date$
- */
-public class AlcodonDescriptor extends
-        org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
-{
-
-  // --------------------------/
-  // - Class/Member Variables -/
-  // --------------------------/
-
-  /**
-   * Field _elementDefinition.
-   */
-  private boolean _elementDefinition;
-
-  /**
-   * Field _nsPrefix.
-   */
-  private java.lang.String _nsPrefix;
-
-  /**
-   * Field _nsURI.
-   */
-  private java.lang.String _nsURI;
-
-  /**
-   * Field _xmlName.
-   */
-  private java.lang.String _xmlName;
-
-  // ----------------/
-  // - Constructors -/
-  // ----------------/
-
-  public AlcodonDescriptor()
-  {
-    super();
-    _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
-    _xmlName = "alcodon";
-    _elementDefinition = true;
-    org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
-    org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
-    org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
-    // -- initialize attribute descriptors
-
-    // -- _pos1
-    desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
-            java.lang.Long.TYPE, "_pos1", "pos1",
-            org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
-    handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
-    {
-      public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
-              throws IllegalStateException
-      {
-        Alcodon target = (Alcodon) object;
-        if (!target.hasPos1())
-        {
-          return null;
-        }
-        return new java.lang.Long(target.getPos1());
-      }
-
-      public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
-              throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
-      {
-        try
-        {
-          Alcodon target = (Alcodon) object;
-          // if null, use delete method for optional primitives
-          if (value == null)
-          {
-            target.deletePos1();
-            return;
-          }
-          target.setPos1(((java.lang.Long) value).longValue());
-        } catch (java.lang.Exception ex)
-        {
-          throw new IllegalStateException(ex.toString());
-        }
-      }
-
-      public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
-      {
-        return null;
-      }
-    };
-    desc.setHandler(handler);
-    desc.setMultivalued(false);
-    addFieldDescriptor(desc);
-
-    // -- validation code for: _pos1
-    fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
-    { // -- local scope
-      org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
-      typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
-      fieldValidator.setValidator(typeValidator);
-    }
-    desc.setValidator(fieldValidator);
-    // -- _pos2
-    desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
-            java.lang.Long.TYPE, "_pos2", "pos2",
-            org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
-    handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
-    {
-      public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
-              throws IllegalStateException
-      {
-        Alcodon target = (Alcodon) object;
-        if (!target.hasPos2())
-        {
-          return null;
-        }
-        return new java.lang.Long(target.getPos2());
-      }
-
-      public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
-              throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
-      {
-        try
-        {
-          Alcodon target = (Alcodon) object;
-          // if null, use delete method for optional primitives
-          if (value == null)
-          {
-            target.deletePos2();
-            return;
-          }
-          target.setPos2(((java.lang.Long) value).longValue());
-        } catch (java.lang.Exception ex)
-        {
-          throw new IllegalStateException(ex.toString());
-        }
-      }
-
-      public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
-      {
-        return null;
-      }
-    };
-    desc.setHandler(handler);
-    desc.setMultivalued(false);
-    addFieldDescriptor(desc);
-
-    // -- validation code for: _pos2
-    fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
-    { // -- local scope
-      org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
-      typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
-      fieldValidator.setValidator(typeValidator);
-    }
-    desc.setValidator(fieldValidator);
-    // -- _pos3
-    desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
-            java.lang.Long.TYPE, "_pos3", "pos3",
-            org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
-    handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
-    {
-      public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
-              throws IllegalStateException
-      {
-        Alcodon target = (Alcodon) object;
-        if (!target.hasPos3())
-        {
-          return null;
-        }
-        return new java.lang.Long(target.getPos3());
-      }
-
-      public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
-              throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
-      {
-        try
-        {
-          Alcodon target = (Alcodon) object;
-          // if null, use delete method for optional primitives
-          if (value == null)
-          {
-            target.deletePos3();
-            return;
-          }
-          target.setPos3(((java.lang.Long) value).longValue());
-        } catch (java.lang.Exception ex)
-        {
-          throw new IllegalStateException(ex.toString());
-        }
-      }
-
-      public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
-      {
-        return null;
-      }
-    };
-    desc.setHandler(handler);
-    desc.setMultivalued(false);
-    addFieldDescriptor(desc);
-
-    // -- validation code for: _pos3
-    fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
-    { // -- local scope
-      org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
-      typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
-      fieldValidator.setValidator(typeValidator);
-    }
-    desc.setValidator(fieldValidator);
-    // -- initialize element descriptors
-
-  }
-
-  // -----------/
-  // - Methods -/
-  // -----------/
-
-  /**
-   * Method getAccessMode.
-   * 
-   * @return the access mode specified for this class.
-   */
-  public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
-  {
-    return null;
-  }
-
-  /**
-   * Method getIdentity.
-   * 
-   * @return the identity field, null if this class has no identity.
-   */
-  public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
-  {
-    return super.getIdentity();
-  }
-
-  /**
-   * Method getJavaClass.
-   * 
-   * @return the Java class represented by this descriptor.
-   */
-  public java.lang.Class getJavaClass()
-  {
-    return jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class;
-  }
-
-  /**
-   * Method getNameSpacePrefix.
-   * 
-   * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
-   */
-  public java.lang.String getNameSpacePrefix()
-  {
-    return _nsPrefix;
-  }
-
-  /**
-   * Method getNameSpaceURI.
-   * 
-   * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
-   */
-  public java.lang.String getNameSpaceURI()
-  {
-    return _nsURI;
-  }
-
-  /**
-   * Method getValidator.
-   * 
-   * @return a specific validator for the class described by this
-   *         ClassDescriptor.
-   */
-  public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
-  {
-    return this;
-  }
-
-  /**
-   * Method getXMLName.
-   * 
-   * @return the XML Name for the Class being described.
-   */
-  public java.lang.String getXMLName()
-  {
-    return _xmlName;
-  }
-
-  /**
-   * Method isElementDefinition.
-   * 
-   * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
-   *         element or element with anonymous type definition.
-   */
-  public boolean isElementDefinition()
-  {
-    return _elementDefinition;
-  }
-
-}