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[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / uniprot / FeatureType.java
index f818e2e..791aa0e 100644 (file)
@@ -2,10 +2,9 @@
 // This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802 
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+// Generated on: 2023.05.13 at 06:58:42 PM BST 
 //
 
-
 package jalview.xml.binding.uniprot;
 
 import java.util.ArrayList;
@@ -16,14 +15,16 @@ import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
 
-
 /**
- * Describes different types of sequence annotations.
- *             Equivalent to the flat file FT-line.
+ * Describes different types of sequence annotations. Equivalent to the flat
+ * file FT-line.
  * 
- * <p>Java class for featureType complex type.
+ * <p>
+ * Java class for featureType complex type.
  * 
- * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
+ * <p>
+ * The following schema fragment specifies the expected content contained within
+ * this class.
  * 
  * <pre>
  * &lt;complexType name="featureType">
@@ -100,254 +101,259 @@ import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  * 
  */
 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
-@XmlType(name = "featureType", propOrder = {
-    "original",
-    "variation",
-    "location"
-})
-public class FeatureType {
+@XmlType(
+  name = "featureType",
+  propOrder =
+  { "original", "variation", "location" })
+public class FeatureType
+{
 
-    protected String original;
-    protected List<String> variation;
-    @XmlElement(required = true)
-    protected LocationType location;
-    @XmlAttribute(name = "type", required = true)
-    protected String type;
-    @XmlAttribute(name = "status")
-    protected String status;
-    @XmlAttribute(name = "id")
-    protected String id;
-    @XmlAttribute(name = "description")
-    protected String description;
-    @XmlAttribute(name = "evidence")
-    protected List<Integer> evidence;
-    @XmlAttribute(name = "ref")
-    protected String ref;
+  protected String original;
 
-    /**
-     * Gets the value of the original property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getOriginal() {
-        return original;
-    }
+  protected List<String> variation;
 
-    /**
-     * Sets the value of the original property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setOriginal(String value) {
-        this.original = value;
-    }
+  @XmlElement(required = true)
+  protected LocationType location;
 
-    /**
-     * Gets the value of the variation property.
-     * 
-     * <p>
-     * This accessor method returns a reference to the live list,
-     * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
-     * returned list will be present inside the JAXB object.
-     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the variation property.
-     * 
-     * <p>
-     * For example, to add a new item, do as follows:
-     * <pre>
-     *    getVariation().add(newItem);
-     * </pre>
-     * 
-     * 
-     * <p>
-     * Objects of the following type(s) are allowed in the list
-     * {@link String }
-     * 
-     * 
-     */
-    public List<String> getVariation() {
-        if (variation == null) {
-            variation = new ArrayList<String>();
-        }
-        return this.variation;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "type", required = true)
+  protected String type;
 
-    /**
-     * Gets the value of the location property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link LocationType }
-     *     
-     */
-    public LocationType getLocation() {
-        return location;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "status")
+  protected String status;
 
-    /**
-     * Sets the value of the location property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link LocationType }
-     *     
-     */
-    public void setLocation(LocationType value) {
-        this.location = value;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "id")
+  protected String id;
 
-    /**
-     * Gets the value of the type property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getType() {
-        return type;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "description")
+  protected String description;
 
-    /**
-     * Sets the value of the type property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setType(String value) {
-        this.type = value;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "evidence")
+  protected List<Integer> evidence;
 
-    /**
-     * Gets the value of the status property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getStatus() {
-        return status;
-    }
+  @XmlAttribute(name = "ref")
+  protected String ref;
 
-    /**
-     * Sets the value of the status property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setStatus(String value) {
-        this.status = value;
-    }
+  /**
+   * Gets the value of the original property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getOriginal()
+  {
+    return original;
+  }
 
-    /**
-     * Gets the value of the id property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getId() {
-        return id;
-    }
+  /**
+   * Sets the value of the original property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setOriginal(String value)
+  {
+    this.original = value;
+  }
 
-    /**
-     * Sets the value of the id property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setId(String value) {
-        this.id = value;
+  /**
+   * Gets the value of the variation property.
+   * 
+   * <p>
+   * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
+   * Therefore any modification you make to the returned list will be present
+   * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
+   * for the variation property.
+   * 
+   * <p>
+   * For example, to add a new item, do as follows:
+   * 
+   * <pre>
+   * getVariation().add(newItem);
+   * </pre>
+   * 
+   * 
+   * <p>
+   * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
+   * 
+   * 
+   */
+  public List<String> getVariation()
+  {
+    if (variation == null)
+    {
+      variation = new ArrayList<String>();
     }
+    return this.variation;
+  }
 
-    /**
-     * Gets the value of the description property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getDescription() {
-        return description;
-    }
+  /**
+   * Gets the value of the location property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link LocationType }
+   * 
+   */
+  public LocationType getLocation()
+  {
+    return location;
+  }
 
-    /**
-     * Sets the value of the description property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setDescription(String value) {
-        this.description = value;
-    }
+  /**
+   * Sets the value of the location property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link LocationType }
+   * 
+   */
+  public void setLocation(LocationType value)
+  {
+    this.location = value;
+  }
 
-    /**
-     * Gets the value of the evidence property.
-     * 
-     * <p>
-     * This accessor method returns a reference to the live list,
-     * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
-     * returned list will be present inside the JAXB object.
-     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
-     * 
-     * <p>
-     * For example, to add a new item, do as follows:
-     * <pre>
-     *    getEvidence().add(newItem);
-     * </pre>
-     * 
-     * 
-     * <p>
-     * Objects of the following type(s) are allowed in the list
-     * {@link Integer }
-     * 
-     * 
-     */
-    public List<Integer> getEvidence() {
-        if (evidence == null) {
-            evidence = new ArrayList<Integer>();
-        }
-        return this.evidence;
-    }
+  /**
+   * Gets the value of the type property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getType()
+  {
+    return type;
+  }
 
-    /**
-     * Gets the value of the ref property.
-     * 
-     * @return
-     *     possible object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public String getRef() {
-        return ref;
-    }
+  /**
+   * Sets the value of the type property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setType(String value)
+  {
+    this.type = value;
+  }
+
+  /**
+   * Gets the value of the status property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getStatus()
+  {
+    return status;
+  }
+
+  /**
+   * Sets the value of the status property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setStatus(String value)
+  {
+    this.status = value;
+  }
 
-    /**
-     * Sets the value of the ref property.
-     * 
-     * @param value
-     *     allowed object is
-     *     {@link String }
-     *     
-     */
-    public void setRef(String value) {
-        this.ref = value;
+  /**
+   * Gets the value of the id property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getId()
+  {
+    return id;
+  }
+
+  /**
+   * Sets the value of the id property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setId(String value)
+  {
+    this.id = value;
+  }
+
+  /**
+   * Gets the value of the description property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getDescription()
+  {
+    return description;
+  }
+
+  /**
+   * Sets the value of the description property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setDescription(String value)
+  {
+    this.description = value;
+  }
+
+  /**
+   * Gets the value of the evidence property.
+   * 
+   * <p>
+   * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
+   * Therefore any modification you make to the returned list will be present
+   * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
+   * for the evidence property.
+   * 
+   * <p>
+   * For example, to add a new item, do as follows:
+   * 
+   * <pre>
+   * getEvidence().add(newItem);
+   * </pre>
+   * 
+   * 
+   * <p>
+   * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
+   * 
+   * 
+   */
+  public List<Integer> getEvidence()
+  {
+    if (evidence == null)
+    {
+      evidence = new ArrayList<Integer>();
     }
+    return this.evidence;
+  }
+
+  /**
+   * Gets the value of the ref property.
+   * 
+   * @return possible object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public String getRef()
+  {
+    return ref;
+  }
+
+  /**
+   * Sets the value of the ref property.
+   * 
+   * @param value
+   *          allowed object is {@link String }
+   * 
+   */
+  public void setRef(String value)
+  {
+    this.ref = value;
+  }
 
 }