JAL-2403 JAL-1483 changes to ScoreModelI hierarchy and signatures to
[jalview.git] / test / jalview / analysis / scoremodels / ScoreMatrixTest.java
index b234d48..01de741 100644 (file)
@@ -171,7 +171,7 @@ public class ScoreMatrixTest
     String[] seqs = new String[] { "FKL", "R D", "QIA", "GWC" };
     ScoreMatrix sm = ScoreModels.getInstance().getBlosum62();
 
-    MatrixI pairwise = sm.computePairwiseScores(seqs);
+    MatrixI pairwise = sm.findSimilarities(seqs);
 
     /*
      * should be NxN where N = number of sequences