JAL-2388 Renamed column and row subtraction functions
[jalview.git] / test / jalview / datamodel / HiddenSequencesTest.java
index a556458..7795988 100644 (file)
@@ -219,15 +219,15 @@ public class HiddenSequencesTest
 
     // test that without hidden rows, findIndexNFromRow returns
     // position n above provided position
-    int pos = hs.findIndexNAboveRow(3, 10);
+    int pos = hs.subtractVisibleRows(3, 10);
     assertEquals(7, pos);
 
     // 0 returns same position
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(0, 10);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(0, 10);
     assertEquals(10, pos);
 
     // overflow to top returns negative number
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(3, 0);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(3, 0);
     assertEquals(-3, pos);
 
     // test that with hidden rows above result row
@@ -237,11 +237,11 @@ public class HiddenSequencesTest
     hs.hideSequence(seqs[3]);
 
     // position n above provided position
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(3, 10);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(3, 10);
     assertEquals(7, pos);
 
     // 0 returns same position
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(0, 10);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(0, 10);
     assertEquals(10, pos);
 
     // test with one set of hidden rows between start and required position
@@ -249,13 +249,13 @@ public class HiddenSequencesTest
     hs.hideSequence(seqs[13]);
     hs.hideSequence(seqs[14]);
     hs.hideSequence(seqs[15]);
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(8, 17);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(8, 17);
     assertEquals(5, pos);
 
     // test with two sets of hidden rows between start and required position
     hs.hideSequence(seqs[20]);
     hs.hideSequence(seqs[21]);
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(8, 23);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(8, 23);
     assertEquals(9, pos);
 
     // repeat last 2 tests with no hidden columns to left of required position
@@ -266,13 +266,13 @@ public class HiddenSequencesTest
     hs.hideSequence(seqs[13]);
     hs.hideSequence(seqs[14]);
     hs.hideSequence(seqs[15]);
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(8, 17);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(8, 17);
     assertEquals(5, pos);
 
     // test with two sets of hidden rows between start and required position
     hs.hideSequence(seqs[20]);
     hs.hideSequence(seqs[21]);
-    pos = hs.findIndexNAboveRow(8, 23);
+    pos = hs.subtractVisibleRows(8, 23);
     assertEquals(9, pos);
 
   }