JAL-2344 FileFormats singleton for formats, FileFormatI simplified
[jalview.git] / test / jalview / ws / jabaws / JpredJabaStructExportImport.java
index b8fe0a3..d5b6ed1 100644 (file)
@@ -188,7 +188,7 @@ public class JpredJabaStructExportImport
     try
     {
       // what format would be appropriate for RNAalifold annotations?
-      String aligfileout = FileFormat.Pfam.getAlignmentFile().print(
+      String aligfileout = FileFormat.Pfam.getWriter(null).print(
               al.getSequencesArray(), true);
 
       String anfileout = new AnnotationFile()