JAL-3210 Barebones gradle/buildship/eclipse. See README
[jalview.git] / unused / javajs / img / GifEncoder.java
diff --git a/unused/javajs/img/GifEncoder.java b/unused/javajs/img/GifEncoder.java
deleted file mode 100644 (file)
index 287f9c3..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,1142 +0,0 @@
-/* $RCSfile$
- * $Author: hansonr $
- * $Date: 2007-06-02 12:14:13 -0500 (Sat, 02 Jun 2007) $
- * $Revision: 7831 $
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- *  License along with this library; if not, write to the Free Software
- *  Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301 USA.
- */
-
-//  Final encoding code from http://acme.com/resources/classes/Acme/JPM/Encoders/GifEncoder.java
-//
-//  GifEncoder - write out an image as a GIF
-// 
-// 
-//  Transparency handling and variable bit size courtesy of Jack Palevich.
-//  
-//  Copyright (C)1996,1998 by Jef Poskanzer <jef@mail.acme.com>. All rights reserved.
-//  
-//  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
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-//  are met:
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-//     notice, this list of conditions and the following disclaimer.
-//  2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
-//     notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
-//     documentation and/or other materials provided with the distribution.
-// 
-//  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
-//  ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
-//  IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
-//  ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
-//  FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
-//  DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
-//  OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
-//  HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
-//  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
-//  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
-//  SUCH DAMAGE.
-// 
-//  Visit the ACME Labs Java page for up-to-date versions of this and other
-//  fine Java utilities: http://www.acme.com/java/
-// 
-/// Write out an image as a GIF.
-// <P>
-// <A HREF="/resources/classes/Acme/JPM/Encoders/GifEncoder.java">Fetch the software.</A><BR>
-// <A HREF="/resources/classes/Acme.tar.gz">Fetch the entire Acme package.</A>
-// <P>
-// @see ToGif
-
-package javajs.img;
-
-import javajs.util.CU;
-import javajs.util.Lst;
-import javajs.util.M3;
-import javajs.util.P3;
-
-import java.util.Hashtable;
-import java.util.Map;
-import java.io.IOException;
-
-/**
- * 
- * GifEncoder extensively adapted for Jmol by Bob Hanson
- * 
- * Color quantization roughly follows the GIMP method
- * "dither Floyd-Steinberg (normal)" but with some twists. (For example, we
- * exclude the background color.)
- * 
- * Note that although GIMP code annotation refers to "median-cut", it is really
- * using MEAN-cut. That is what I use here as well.
- * 
- * -- commented code allows visualization of the color space using Jmol. Very
- * enlightening!
- * 
- * -- much simplified interface with ImageEncoder
- * 
- * -- uses simple Hashtable with Integer() to catalog colors
- * 
- * -- allows progressive production of animated GIF via Jmol CAPTURE command
- * 
- * -- uses general purpose javajs.util.OutputChannel for byte-handling options
- * such as posting to a server, writing to disk, and retrieving bytes.
- * 
- * -- allows JavaScript port
- * 
- * -- Bob Hanson, first try: 24 Sep 2013; final coding: 9 Nov 2014
- * 
- * 
- * @author Bob Hanson hansonr@stolaf.edu
- */
-
-public class GifEncoder extends ImageEncoder {
-
-  private Map<String, Object> params;
-  private P3[] palette;
-  private int backgroundColor;
-
-  private boolean interlaced;
-  private boolean addHeader = true;
-  private boolean addImage = true;
-  private boolean addTrailer = true;
-  private boolean isTransparent;
-  private boolean floydSteinberg = true;
-  private boolean capturing;
-  private boolean looping;
-
-  private int delayTime100ths = -1;
-  private int bitsPerPixel = 1;
-
-  private int byteCount;
-
-  /**
-   * we allow for animated GIF by being able to re-enter the code with different
-   * parameters held in params
-   * 
-   * 
-   */
-  @Override
-  protected void setParams(Map<String, Object> params) {
-    this.params = params;
-    Integer ic = (Integer) params.get("transparentColor");
-    if (ic == null) {
-      ic = (Integer) params.get("backgroundColor");
-      if (ic != null)
-        backgroundColor = ic.intValue();
-    } else {
-      backgroundColor = ic.intValue();
-      isTransparent = true;
-    }
-
-    interlaced = (Boolean.TRUE == params.get("interlaced"));
-    if (params.containsKey("captureRootExt") // file0000.gif 
-        || !params.containsKey("captureMode")) // animated gif
-      return;
-    interlaced = false;
-    capturing = true;
-    try {
-      byteCount = ((Integer) params.get("captureByteCount")).intValue();
-    } catch (Exception e) {
-      // ignore
-    }
-    switch ("maec"
-        .indexOf(((String) params.get("captureMode")).substring(0, 1))) {
-    case 0: //"movie"
-      params.put("captureMode", "add");
-      addImage = false;
-      addTrailer = false;
-      break;
-    case 1: // add 
-      addHeader = false;
-      addTrailer = false;
-      int fps = Math.abs(((Integer) params.get("captureFps")).intValue());
-      delayTime100ths = (fps == 0 ? 0 : 100 / fps);
-      looping = (Boolean.FALSE != params.get("captureLooping"));
-      break;
-    case 2: // end
-      addHeader = false;
-      addImage = false;
-      break;
-    case 3: // cancel
-      addHeader = false;
-      addImage = false;
-      out.cancel();
-      break;
-    }
-  }
-
-  @Override
-  protected void generate() throws IOException {
-    if (addHeader)
-      writeHeader();
-    addHeader = false; // only one header
-    if (addImage) {
-      createPalette();
-      writeGraphicControlExtension();
-      if (delayTime100ths >= 0 && looping)
-        writeNetscapeLoopExtension();
-      writeImage();
-    }
-  }
-
-  @Override
-  protected void close() {
-    if (addTrailer) {
-      writeTrailer();
-    } else {
-      doClose = false;
-    }
-    if (capturing)
-      params.put("captureByteCount", Integer.valueOf(byteCount));
-  }
-
-  //////////////  256-color quantization  //////////////
-
-  /**
-   * a color point in normalized L*a*b space with a flag indicating whether it
-   * is the background color
-   */
-  private class ColorItem extends P3 {
-    /**
-        * 
-        */
-       protected boolean isBackground;
-
-    ColorItem(int rgb, boolean isBackground) {
-      this.isBackground = isBackground;
-      setT(toLABnorm(rgb));
-    }
-  }
-
-  /**
-   * A list of normalized L*a*b points with an index and a center and volume
-   * 
-   */
-  private class ColorCell extends Lst<P3> {
-
-    /**
-        * 
-        */
-       private static final long serialVersionUID = 1L;
-       protected int index;
-    protected P3 center;
-
-    private float volume;
-
-    ColorCell(int index) {
-      this.index = index;
-    }
-
-    /**
-     * @param doVisualize
-     *        debugging only
-     * @return volume in normalized L*a*b space
-     */
-    public float getVolume(boolean doVisualize) {
-      if (volume != 0)
-        return volume;
-      if (size() < 2)
-        return -1;
-      //if (true)
-      //return lst.size();
-      //float d;
-      float maxx = -Integer.MAX_VALUE;
-      float minx = Integer.MAX_VALUE;
-      float maxy = -Integer.MAX_VALUE;
-      float miny = Integer.MAX_VALUE;
-      float maxz = -Integer.MAX_VALUE;
-      float minz = Integer.MAX_VALUE;
-      int n = size();
-      for (int i = n; --i >= 0;) {
-        P3 xyz = get(i);
-        if (xyz.x < minx)
-          minx = xyz.x;
-        if (xyz.y < miny)
-          miny = xyz.y;
-        if (xyz.z < minz)
-          minz = xyz.z;
-        if (xyz.x > maxx)
-          maxx = xyz.x;
-        if (xyz.y > maxy)
-          maxy = xyz.y;
-        if (xyz.z > maxz)
-          maxz = xyz.z;
-      }
-      float dx = (maxx - minx);
-      float dy = (maxy - miny);
-      float dz = (maxz - minz);
-      // Jmol visualization only
-      //      if (doVisualize) {
-      //        P3 ptRGB = toRGB(center);
-      //        drawPt(index, -size(), ptRGB);
-      //        //for (int i = n; --i >= 0;)
-      //        //drawPt(index, i, toRGB(get(i)));
-      //        P3 pt0 = toRGB(P3.new3(Math.max(minx, 0), Math.max(miny, 0),
-      //            Math.max(minz, 0)));
-      //        P3 pt1 = toRGB(P3.new3(Math.min(maxx, 100), Math.min(maxy, 100),
-      //            Math.min(maxz, 100)));
-      //        rgbToXyz(pt0, pt0);
-      //        xyzToLab(pt0, pt0);
-      //        rgbToXyz(pt1, pt1);
-      //        xyzToLab(pt1, pt1);
-      //        System.out.println("boundbox corners " + pt0 + " " + pt1);
-      //        System.out.println("draw d" + index + " boundbox color " + ptRGB
-      //            + " mesh nofill");
-      //      }
-      return volume = dx * dx + dy * dy + dz * dz;
-    }
-
-    //    // Jmol visualization only
-    //      private void drawPt(int index, int i, P3 rgb) {
-    //        boolean isMain = (i < 0);
-    //      P3 lab = rgbToXyz(rgb, null);
-    //      xyzToLab(lab, lab);
-    //      System.out.println("draw d" + index + (isMain ? "_" : "_" + i) + " width "
-    //          + (isMain ? 1.0 : 0.2) + " " + lab
-    //          + " color " + rgb + (isMain ? " '" + -i + "'" : ""));
-    //      }
-
-    /**
-     * Set the average normalized L*a*b value for this cell and return its RGB point
-     * 
-     * @return RGB point
-     * 
-     */
-    protected P3 setColor() {
-      int count = size();
-      center = new P3();
-      for (int i = count; --i >= 0;)
-        center.add(get(i));
-      center.scale(1f / count);
-      // Jmol visualization only
-      //volume = 0;
-      //getVolume(true); 
-      return toRGB(center);
-    }
-
-    /**
-     * use median_cut algorithm to split the cell, creating a doubly linked
-     * list.
-     * 
-     * Paul Heckbert, MIT thesis COLOR IMAGE QUANTIZATION FOR FRAME BUFFER
-     * DISPLAY https://www.cs.cmu.edu/~ph/ciq_thesis
-     * 
-     * except, as in GIMP, we use center (not median) here.
-     * 
-     * @param cells
-     * @return true if split
-     */
-    protected boolean splitCell(Lst<ColorCell> cells) {
-      int n = size();
-      if (n < 2)
-        return false;
-      int newIndex = cells.size();
-      ColorCell newCell = new ColorCell(newIndex);
-      cells.addLast(newCell);
-      float[][] ranges = new float[3][3];
-      for (int ic = 0; ic < 3; ic++) {
-        float low = Float.MAX_VALUE;
-        float high = -Float.MAX_VALUE;
-        for (int i = n; --i >= 0;) {
-          P3 lab = get(i);
-          float v = (ic == 0 ? lab.x : ic == 1 ? lab.y : lab.z);
-          if (low > v)
-            low = v;
-          if (high < v)
-            high = v;
-        }
-        ranges[0][ic] = low;
-        ranges[1][ic] = high;
-        ranges[2][ic] = high - low;
-      }
-      float[] r = ranges[2];
-      int mode = (r[0] >= r[1] ? (r[0] >= r[2] ? 0 : 2) : r[1] >= r[2] ? 1 : 2);
-      float val = ranges[0][mode] + ranges[2][mode] / 2;
-      volume = 0; // recalculate volume if needed
-      switch (mode) {
-      case 0:
-        for (int i = n; --i >= 0;)
-          if (get(i).x >= val)
-            newCell.addLast(removeItemAt(i));
-        break;
-      case 1:
-        for (int i = n; --i >= 0;)
-          if (get(i).y >= val)
-            newCell.addLast(removeItemAt(i));
-        break;
-      case 2:
-        for (int i = size(); --i >= 0;)
-          if (get(i).z >= val)
-            newCell.addLast(removeItemAt(i));
-        break;
-      }
-      return true;
-    }
-  }
-
-  /**
-   * Quantize all colors and create the final palette;
-   * replace pixels[] with an array of color indices.
-   * 
-   */
-  private void createPalette() {
-
-    // catalog all pixel colors
-
-    Lst<ColorItem> tempColors = new Lst<ColorItem>();
-    Map<Integer, ColorItem> ciHash = new Hashtable<Integer, ColorItem>();
-    for (int i = 0, n = pixels.length; i < n; i++) {
-      int rgb = pixels[i];
-      Integer key = Integer.valueOf(rgb);
-      ColorItem item = ciHash.get(key);
-      if (item == null) {
-        item = new ColorItem(rgb, rgb == backgroundColor);
-        ciHash.put(key, item);
-        tempColors.addLast(item);
-      }
-    }
-    int nColors = tempColors.size();
-    System.out.println("GIF total image colors: " + nColors);
-    ciHash = null;
-
-    // create a set of <= 256 color cells
-
-    Lst<ColorCell> cells = quantizeColors(tempColors);
-    nColors = cells.size();
-    System.out.println("GIF final color count: " + nColors);
-
-    // generate the palette and map each cell's rgb color to itself
-
-    Map<Integer, ColorCell> colorMap = new Hashtable<Integer, ColorCell>();
-    bitsPerPixel = (nColors <= 2 ? 1 : nColors <= 4 ? 2 : nColors <= 16 ? 4 : 8);
-    palette = new P3[1 << bitsPerPixel];
-    for (int i = 0; i < nColors; i++) {
-      ColorCell c = cells.get(i);
-      colorMap.put(
-          Integer.valueOf(CU.colorPtToFFRGB(palette[i] = c.setColor())), c);
-    }
-
-    // index all pixels to a pallete color
-
-    pixels = indexPixels(cells, colorMap);
-  }
-
-  /**
-   * Quantize colors by generating a set of cells in normalized L*a*b space
-   * containing all colors. Start with just two cells -- fixed background color
-   * and all others. Keep splitting cells while there are fewer than 256 and
-   * some with multiple colors in them.
-   * 
-   * It is possible that we will end up with fewer than 256 colors.
-   * 
-   * @param tempColors
-   * @return final list of colors
-   */
-  private Lst<ColorCell> quantizeColors(Lst<ColorItem> tempColors) {
-    int n = tempColors.size();
-    Lst<ColorCell> cells = new Lst<ColorCell>();
-    ColorCell cc = new ColorCell(0);
-    cc.addLast(new ColorItem(backgroundColor, true));
-    cells.addLast(cc);
-    cc = new ColorCell(1);
-    if (n > 256)
-      cells.addLast(cc);
-    for (int i = 0; i < n; i++) {
-      ColorItem c = tempColors.get(i);
-      if (c.isBackground)
-        continue;
-      cc.addLast(c);
-      if (n <= 256) {
-        cells.addLast(cc);
-        cc = new ColorCell(cells.size());
-      }
-    }
-    tempColors.clear();
-    if (n > 256)
-      while ((n = cells.size()) < 256) {
-        float maxVol = 0;
-        ColorCell maxCell = null;
-        for (int i = n; --i >= 1;) {
-          ColorCell c = cells.get(i);
-          float v = c.getVolume(false);
-          if (v > maxVol) {
-            maxVol = v;
-            maxCell = c;
-          }
-        }
-        if (maxCell == null || !maxCell.splitCell(cells))
-          break;
-      }
-    return cells;
-  }
-
-  /**
-   * 
-   * Assign all colors to their closest approximation and return an array of
-   * color indexes.
-   * 
-   * Uses Floyd-Steinberg dithering, finding the closest known color and then
-   * spreading out the error over four leading pixels. Limits error to +/- 75
-   * percent in normalized L*a*b space.
-   * 
-   * @param cells
-   *        quantized color cells
-   * @param colorMap
-   *        map of quantized rgb to its cell
-   * @return array of color indexes, one for each pixel
-   * 
-   */
-  private int[] indexPixels(Lst<ColorCell> cells,
-                            Map<Integer, ColorCell> colorMap) {
-    // We need a strip only width+2 wide to process all the errors.
-    // Errors are added to the next pixel and the next row's pixels 
-    // only through p + width + 1:
-    //         p  +1
-    //   +w-1 +w  +w+1
-    // so including p as well, we need a total of width + 2 errors.
-    //
-    // as p moves through the pixels, we just use mod to cycle through
-    // this strip.
-    //
-    int w2 = width + 2;
-    P3[] errors = new P3[w2];
-    // We should replace, not overwrite, pixels 
-    // as this may be the raw canvas.buf32.
-    int[] newPixels = new int[pixels.length];
-    P3 err = new P3();
-    P3 lab;
-    int rgb;
-    Map<Integer, ColorCell> nearestCell = new Hashtable<Integer, ColorCell>();
-    for (int i = 0, p = 0; i < height; ++i) {
-      boolean notLastRow = (i != height - 1);
-      for (int j = 0; j < width; ++j, p++) {
-        if (pixels[p] == backgroundColor) {
-          // leave as 0
-          continue;
-        }
-        P3 pe = errors[p % w2];
-        if (pe == null || pe.x == Float.MAX_VALUE) {
-          lab = null;
-          rgb = pixels[p];
-        } else {
-          lab = toLABnorm(pixels[p]);
-          err = pe;
-          // important not to round the clamp here -- full floating precision
-          err.x = clamp(err.x, -75, 75);
-          err.y = clamp(err.y, -75, 75);
-          err.z = clamp(err.z, -75, 75);
-          lab.add(err);
-          rgb = CU.colorPtToFFRGB(toRGB(lab));
-        }
-        Integer key = Integer.valueOf(rgb);
-        ColorCell cell = colorMap.get(key);
-        if (cell == null) {
-          // critical to generate normalized L*a*b from RGB here for nearestCell mapping.
-          // otherwise future RGB keys may match the wrong cell
-          lab = toLABnorm(rgb);
-          cell = nearestCell.get(key);
-          if (cell == null) {
-            // find nearest cell
-            float maxerr = Float.MAX_VALUE;
-            // skip 0 0 0
-            for (int ib = cells.size(); --ib >= 1;) {
-              ColorCell c = cells.get(ib);
-              err.sub2(lab, c.center);
-              float d = err.lengthSquared();
-              if (d < maxerr) {
-                maxerr = d;
-                cell = c;
-              }
-            }
-            nearestCell.put(key, cell);
-          }
-          if (floydSteinberg) {
-            // dither
-            err.sub2(lab, cell.center);
-            boolean notLastCol = (j < width - 1);
-            if (notLastCol)
-              addError(err, 7, errors, p + 1, w2);
-            if (notLastRow) {
-              if (j > 0)
-                addError(err, 3, errors, p + width - 1, w2);
-              addError(err, 5, errors, p + width, w2);
-              if (notLastCol)
-                addError(err, 1, errors, p + width + 1, w2);
-            }
-          }
-          err.x = Float.MAX_VALUE; // used; flag for resetting to 0
-        }
-        newPixels[p] = cell.index;
-      }
-    }
-    return newPixels;
-  }
-
-  private void addError(P3 err, int f, P3[] errors, int p, int w2) {
-    // GIMP will allow changing the background color.
-    if (pixels[p] == backgroundColor)
-      return;
-    p %= w2;
-    P3 errp = errors[p];
-    if (errp == null)
-      errp = errors[p] = new P3();
-    else if (errp.x == Float.MAX_VALUE) // reuse
-      errp.set(0, 0, 0);
-    errp.scaleAdd2(f / 16f, err, errp);
-  }
-
-  ///////////////////////// CIE L*a*b / XYZ / sRGB conversion methods /////////
-
-  // these could be static, but that just makes for more JavaScript code
-
-  protected P3 toLABnorm(int rgb) {
-    P3 lab = CU.colorPtFromInt(rgb, null);
-    rgbToXyz(lab, lab);
-    xyzToLab(lab, lab);
-    // normalize to 0-100
-    lab.y = (lab.y + 86.185f) / (98.254f + 86.185f) * 100f;
-    lab.z = (lab.z + 107.863f) / (94.482f + 107.863f) * 100f;
-    return lab;
-  }
-
-  protected P3 toRGB(P3 lab) {
-    P3 xyz = P3.newP(lab);
-    // normalized to 0-100
-    xyz.y = xyz.y / 100f * (98.254f + 86.185f) - 86.185f;
-    xyz.z = xyz.z / 100f * (94.482f + 107.863f) - 107.863f;
-    labToXyz(xyz, xyz);
-    return xyzToRgb(xyz, xyz);
-  }
-
-  private static M3 xyz2rgb;
-  private static M3 rgb2xyz;
-
-  static {
-    rgb2xyz = M3.newA9(new float[] { 0.4124f, 0.3576f, 0.1805f, 0.2126f,
-        0.7152f, 0.0722f, 0.0193f, 0.1192f, 0.9505f });
-
-    xyz2rgb = M3.newA9(new float[] { 3.2406f, -1.5372f, -0.4986f, -0.9689f,
-        1.8758f, 0.0415f, 0.0557f, -0.2040f, 1.0570f });
-  }
-
-  public P3 rgbToXyz(P3 rgb, P3 xyz) {
-    // http://en.wikipedia.org/wiki/CIE_1931_color_space
-    // http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/download/Color_Space_Converter.java
-    if (xyz == null)
-      xyz = new P3();
-    xyz.x = sxyz(rgb.x);
-    xyz.y = sxyz(rgb.y);
-    xyz.z = sxyz(rgb.z);
-    rgb2xyz.rotate(xyz);
-    return xyz;
-  }
-
-  private float sxyz(float x) {
-    x /= 255;
-    return (float) (x <= 0.04045 ? x / 12.92 : Math.pow(((x + 0.055) / 1.055),
-        2.4)) * 100;
-  }
-
-  public P3 xyzToRgb(P3 xyz, P3 rgb) {
-    // http://en.wikipedia.org/wiki/CIE_1931_color_space
-    // http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/download/Color_Space_Converter.java
-    if (rgb == null)
-      rgb = new P3();
-    rgb.setT(xyz);
-    rgb.scale(0.01f);
-    xyz2rgb.rotate(rgb);
-    rgb.x = clamp(srgb(rgb.x), 0, 255);
-    rgb.y = clamp(srgb(rgb.y), 0, 255);
-    rgb.z = clamp(srgb(rgb.z), 0, 255);
-    return rgb;
-  }
-
-  private float srgb(float x) {
-    return (float) (x > 0.0031308f ? (1.055 * Math.pow(x, 1.0 / 2.4)) - 0.055
-        : x * 12.92) * 255;
-  }
-
-  public P3 xyzToLab(P3 xyz, P3 lab) {
-    // http://en.wikipedia.org/wiki/Lab_color_space
-    // http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/download/Color_Space_Converter.java
-    // Lab([0..100], [-86.185..98.254], [-107.863..94.482])
-    // XYZn = D65 = {95.0429, 100.0, 108.8900};
-    if (lab == null)
-      lab = new P3();
-    float x = flab(xyz.x / 95.0429f);
-    float y = flab(xyz.y / 100);
-    float z = flab(xyz.z / 108.89f);
-    lab.x = (116 * y) - 16;
-    lab.y = 500 * (x - y);
-    lab.z = 200 * (y - z);
-    return lab;
-  }
-
-  private float flab(float t) {
-    return (float) (t > 8.85645168E-3 /* (24/116)^3 */? Math.pow(t,
-        0.333333333) : 7.78703704 /* 1/3*116/24*116/24 */* t + 0.137931034 /* 16/116 */
-    );
-  }
-
-  public P3 labToXyz(P3 lab, P3 xyz) {
-    // http://en.wikipedia.org/wiki/Lab_color_space
-    // http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/download/Color_Space_Converter.java
-    // XYZn = D65 = {95.0429, 100.0, 108.8900};
-    if (xyz == null)
-      xyz = new P3();
-
-    xyz.setT(lab);
-    float y = (xyz.x + 16) / 116;
-    float x = xyz.y / 500 + y;
-    float z = y - xyz.z / 200;
-    xyz.x = fxyz(x) * 95.0429f;
-    xyz.y = fxyz(y) * 100;
-    xyz.z = fxyz(z) * 108.89f;
-
-    return xyz;
-  }
-
-  private float fxyz(float t) {
-    return (float) (t > 0.206896552 /* (24/116) */? t * t * t
-        : 0.128418549 /* 3*24/116*24/116 */* (t - 0.137931034 /* 16/116 */));
-  }
-
-  private float clamp(float c, float min, float max) {
-    c = (c < min ? min : c > max ? max : c);
-    return (min == 0 ? Math.round(c) : c);
-  }
-
-  ///////////////////////// GifEncoder writing methods ////////////////////////
-
-  /**
-   * includes logical screen descriptor
-   * 
-   * @throws IOException
-   */
-  private void writeHeader() throws IOException {
-    putString("GIF89a");
-    putWord(width);
-    putWord(height);
-    putByte(0); // no global color table -- using local instead
-    putByte(0); // no background
-    putByte(0); // no pixel aspect ratio given
-  }
-
-  private void writeGraphicControlExtension() {
-    if (isTransparent || delayTime100ths >= 0) {
-      putByte(0x21); // graphic control extension
-      putByte(0xf9); // graphic control label
-      putByte(4); // block size
-      putByte((isTransparent ? 9 : 0) | (delayTime100ths > 0 ? 2 : 0)); // packed bytes 
-      putWord(delayTime100ths > 0 ? delayTime100ths : 0);
-      putByte(0); // transparent index
-      putByte(0); // end-of-block
-    }
-  }
-
-  // see  http://www.vurdalakov.net/misc/gif/netscape-looping-application-extension
-  //      +---------------+
-  //   0  |     0x21      |  Extension Label
-  //      +---------------+
-  //   1  |     0xFF      |  Application Extension Label
-  //      +---------------+
-  //   2  |     0x0B      |  Block Size
-  //      +---------------+
-  //   3  |               | 
-  //      +-             -+
-  //   4  |               | 
-  //      +-             -+
-  //   5  |               | 
-  //      +-             -+
-  //   6  |               | 
-  //      +-  NETSCAPE   -+  Application Identifier (8 bytes)
-  //   7  |               | 
-  //      +-             -+
-  //   8  |               | 
-  //      +-             -+
-  //   9  |               | 
-  //      +-             -+
-  //  10  |               | 
-  //      +---------------+
-  //  11  |               | 
-  //      +-             -+
-  //  12  |      2.0      |  Application Authentication Code (3 bytes)
-  //      +-             -+
-  //  13  |               | 
-  //      +===============+                      --+
-  //  14  |     0x03      |  Sub-block Data Size   |
-  //      +---------------+                        |
-  //  15  |     0x01      |  Sub-block ID          |
-  //      +---------------+                        | Application Data Sub-block
-  //  16  |               |                        |
-  //      +-             -+  Loop Count (2 bytes)  |
-  //  17  |               |                        |
-  //      +===============+                      --+
-  //  18  |     0x00      |  Block Terminator
-  //      +---------------+
-
-  private void writeNetscapeLoopExtension() {
-    putByte(0x21); // graphic control extension
-    putByte(0xff); // netscape loop extension
-    putByte(0x0B); // block size
-    putString("NETSCAPE2.0");
-    putByte(3);
-    putByte(1);
-    putWord(0); // loop indefinitely
-    putByte(0); // end-of-block
-
-  }
-
-  private int initCodeSize;
-  private int curpt;
-
-  private void writeImage() {
-    putByte(0x2C);
-    putWord(0); //left
-    putWord(0); //top
-    putWord(width);
-    putWord(height);
-
-    //    <Packed Fields>  =      LISx xZZZ
-
-    //    L Local Color Table Flag
-    //    I Interlace Flag
-    //    S Sort Flag
-    //    x Reserved
-    //    ZZZ Size of Local Color Table
-
-    int packedFields = 0x80 | (interlaced ? 0x40 : 0) | (bitsPerPixel - 1);
-    putByte(packedFields);
-    int colorMapSize = 1 << bitsPerPixel;
-    P3 p = new P3();
-    for (int i = 0; i < colorMapSize; i++) {
-      if (palette[i] != null)
-        p = palette[i];
-      putByte((int) p.x);
-      putByte((int) p.y);
-      putByte((int) p.z);
-    }
-    putByte(initCodeSize = (bitsPerPixel <= 1 ? 2 : bitsPerPixel));
-    compress();
-    putByte(0);
-  }
-
-  private void writeTrailer() {
-    // Write the GIF file terminator
-    putByte(0x3B);
-  }
-
-  ///// compression routines /////
-
-  private static final int EOF = -1;
-
-  // Return the next pixel from the image
-  private int nextPixel() {
-    if (countDown-- == 0)
-      return EOF;
-    int colorIndex = pixels[curpt];
-    // Bump the current X position
-    ++curx;
-    if (curx == width) {
-      // If we are at the end of a scan line, set curx back to the beginning
-      // If we are interlaced, bump the cury to the appropriate spot,
-      // otherwise, just increment it.
-      curx = 0;
-      if (interlaced)
-        updateY(INTERLACE_PARAMS[pass], INTERLACE_PARAMS[pass + 4]);
-      else
-        ++cury;
-    }
-    curpt = cury * width + curx;
-    return colorIndex & 0xff;
-  }
-
-  private static final int[] INTERLACE_PARAMS = { 8, 8, 4, 2, 4, 2, 1, 0 };
-
-  /**
-   * 
-   * Group 1 : Every 8th. row, starting with row 0. (Pass 1)
-   * 
-   * Group 2 : Every 8th. row, starting with row 4. (Pass 2)
-   * 
-   * Group 3 : Every 4th. row, starting with row 2. (Pass 3)
-   * 
-   * Group 4 : Every 2nd. row, starting with row 1. (Pass 4)
-   * 
-   * @param yNext
-   * @param yNew
-   */
-  private void updateY(int yNext, int yNew) {
-    cury += yNext;
-    if (yNew >= 0 && cury >= height) {
-      cury = yNew;
-      ++pass;
-    }
-  }
-
-  // Write out a word to the GIF file
-  private void putWord(int w) {
-    putByte(w);
-    putByte(w >> 8);
-  }
-
-  // GIFCOMPR.C       - GIF Image compression routines
-  //
-  // Lempel-Ziv compression based on 'compress'.  GIF modifications by
-  // David Rowley (mgardi@watdcsu.waterloo.edu)
-
-  // General DEFINEs
-
-  private static final int BITS = 12;
-
-  private static final int HSIZE = 5003; // 80% occupancy
-
-  // GIF Image compression - modified 'compress'
-  //
-  // Based on: compress.c - File compression ala IEEE Computer, June 1984.
-  //
-  // By Authors:  Spencer W. Thomas      (decvax!harpo!utah-cs!utah-gr!thomas)
-  //              Jim McKie              (decvax!mcvax!jim)
-  //              Steve Davies           (decvax!vax135!petsd!peora!srd)
-  //              Ken Turkowski          (decvax!decwrl!turtlevax!ken)
-  //              James A. Woods         (decvax!ihnp4!ames!jaw)
-  //              Joe Orost              (decvax!vax135!petsd!joe)
-
-  private int nBits; // number of bits/code
-  private int maxbits = BITS; // user settable max # bits/code
-  private int maxcode; // maximum code, given n_bits
-  private int maxmaxcode = 1 << BITS; // should NEVER generate this code
-
-  private final static int MAXCODE(int nBits) {
-    return (1 << nBits) - 1;
-  }
-
-  private int[] htab = new int[HSIZE];
-  private int[] codetab = new int[HSIZE];
-
-  private int hsize = HSIZE; // for dynamic table sizing
-
-  private int freeEnt = 0; // first unused entry
-
-  // block compression parameters -- after all codes are used up,
-  // and compression rate changes, start over.
-  private boolean clearFlag = false;
-
-  // Algorithm:  use open addressing double hashing (no chaining) on the
-  // prefix code / next character combination.  We do a variant of Knuth's
-  // algorithm D (vol. 3, sec. 6.4) along with G. Knott's relatively-prime
-  // secondary probe.  Here, the modular division first probe is gives way
-  // to a faster exclusive-or manipulation.  Also do block compression with
-  // an adaptive reset, whereby the code table is cleared when the compression
-  // ratio decreases, but after the table fills.  The variable-length output
-  // codes are re-sized at this point, and a special CLEAR code is generated
-  // for the decompressor.  Late addition:  construct the table according to
-  // file size for noticeable speed improvement on small files.  Please direct
-  // questions about this implementation to ames!jaw.
-
-  private int clearCode;
-  private int EOFCode;
-
-  private int countDown;
-  private int pass = 0;
-  private int curx, cury;
-
-  private void compress() {
-
-    // Calculate number of bits we are expecting
-    countDown = width * height;
-
-    // Indicate which pass we are on (if interlace)
-    pass = 0;
-    // Set up the current x and y position
-    curx = 0;
-    cury = 0;
-
-    // Set up the necessary values
-    clearFlag = false;
-    nBits = initCodeSize + 1;
-    maxcode = MAXCODE(nBits);
-
-    clearCode = 1 << initCodeSize;
-    EOFCode = clearCode + 1;
-    freeEnt = clearCode + 2;
-
-    // Set up the 'byte output' routine
-    bufPt = 0;
-
-    int ent = nextPixel();
-
-    int hshift = 0;
-    int fcode;
-    for (fcode = hsize; fcode < 65536; fcode *= 2)
-      ++hshift;
-    hshift = 8 - hshift; // set hash code range bound
-
-    int hsizeReg = hsize;
-    clearHash(hsizeReg); // clear hash table
-
-    output(clearCode);
-
-    int c;
-    outer_loop: while ((c = nextPixel()) != EOF) {
-      fcode = (c << maxbits) + ent;
-      int i = (c << hshift) ^ ent; // xor hashing
-
-      if (htab[i] == fcode) {
-        ent = codetab[i];
-        continue;
-      } else if (htab[i] >= 0) // non-empty slot
-      {
-        int disp = hsizeReg - i; // secondary hash (after G. Knott)
-        if (i == 0)
-          disp = 1;
-        do {
-          if ((i -= disp) < 0)
-            i += hsizeReg;
-
-          if (htab[i] == fcode) {
-            ent = codetab[i];
-            continue outer_loop;
-          }
-        } while (htab[i] >= 0);
-      }
-      output(ent);
-      ent = c;
-      if (freeEnt < maxmaxcode) {
-        codetab[i] = freeEnt++; // code -> hashtable
-        htab[i] = fcode;
-      } else {
-        clearBlock();
-      }
-    }
-    // Put out the final code.
-    output(ent);
-    output(EOFCode);
-  }
-
-  // output
-  //
-  // Output the given code.
-  // Inputs:
-  //      code:   A n_bits-bit integer.  If == -1, then EOF.  This assumes
-  //              that n_bits =< wordsize - 1.
-  // Outputs:
-  //      Outputs code to the file.
-  // Assumptions:
-  //      Chars are 8 bits long.
-  // Algorithm:
-  //      Maintain a BITS character long buffer (so that 8 codes will
-  // fit in it exactly).  Use the VAX insv instruction to insert each
-  // code in turn.  When the buffer fills up empty it and start over.
-
-  private int curAccum = 0;
-  private int curBits = 0;
-
-  private int masks[] = { 0x0000, 0x0001, 0x0003, 0x0007, 0x000F, 0x001F,
-      0x003F, 0x007F, 0x00FF, 0x01FF, 0x03FF, 0x07FF, 0x0FFF, 0x1FFF, 0x3FFF,
-      0x7FFF, 0xFFFF };
-
-  private void output(int code) {
-    curAccum &= masks[curBits];
-
-    if (curBits > 0)
-      curAccum |= (code << curBits);
-    else
-      curAccum = code;
-
-    curBits += nBits;
-
-    while (curBits >= 8) {
-      byteOut((byte) (curAccum & 0xff));
-      curAccum >>= 8;
-      curBits -= 8;
-    }
-
-    // If the next entry is going to be too big for the code size,
-    // then increase it, if possible.
-    if (freeEnt > maxcode || clearFlag) {
-      if (clearFlag) {
-        maxcode = MAXCODE(nBits = initCodeSize + 1);
-        clearFlag = false;
-      } else {
-        ++nBits;
-        if (nBits == maxbits)
-          maxcode = maxmaxcode;
-        else
-          maxcode = MAXCODE(nBits);
-      }
-    }
-
-    if (code == EOFCode) {
-      // At EOF, write the rest of the buffer.
-      while (curBits > 0) {
-        byteOut((byte) (curAccum & 0xff));
-        curAccum >>= 8;
-        curBits -= 8;
-      }
-      flushBytes();
-    }
-  }
-
-  // Clear out the hash table
-
-  // table clear for block compress
-  private void clearBlock() {
-    clearHash(hsize);
-    freeEnt = clearCode + 2;
-    clearFlag = true;
-
-    output(clearCode);
-  }
-
-  // reset code table
-  private void clearHash(int hsize) {
-    for (int i = 0; i < hsize; ++i)
-      htab[i] = -1;
-  }
-
-  // GIF-specific routines (byte array buffer)
-
-  // Number of bytes so far in this 'packet'
-  private int bufPt;
-
-  // Define the storage for the packet accumulator
-  final private byte[] buf = new byte[256];
-
-  // Add a byte to the end of the current packet, and if it is 254
-  // byte, flush the packet to disk.
-  private void byteOut(byte c) {
-    buf[bufPt++] = c;
-    if (bufPt >= 254)
-      flushBytes();
-  }
-
-  // Flush the packet to disk, and reset the accumulator
-  protected void flushBytes() {
-    if (bufPt > 0) {
-      putByte(bufPt);
-      out.write(buf, 0, bufPt);
-      byteCount += bufPt;
-      bufPt = 0;
-    }
-  }
-
-}