+ }, //
+ { //
+ "--open=alignment.fa --wrap --colour=gecose-flower"
+ // structure0
+ + " --structure=structure0.pdb"
+ + " --structureimage=image0a.png --bgcolour=bg0a --scale=3"
+ + " --structureimage=image0b.png --imagecolour=col0b --scale=4"
+ + " --structureviewer=sv0 --paematrix=pae0" //
+ + " --structureimage=image0c.png"
+ // structure1
+ + " --structure=structure1.pdb"
+ + " --structureviewer=sv1 --paematrix=pae1"
+ + " --structureimage=image1a.png"
+ + " --structureimage=image1b.png --bgcolour=bg1b --imagecolour=col1b"
+ + " --structureimage=image1c.png --bgcolour=bg1c --imagecolour=col1c --scale=5"
+ + " --structureimage=image1d.png --imagecolour=col1d --scale=6"
+ + " --structureimage=image1e.png --bgcolour=bg1e"
+ // structure2
+ + " --structure=structure2.pdb"
+ + " --structureimage=image2a.png --bgcolour=bg2a --scale=23"
+ + " --all --bgcolour=pineapple --imagecolour=banana --scale=2" //
+ ,
+ // stuff
+ new Object[]
+ { av(Arg.STRUCTURE, "structure0.pdb", "structure1.pdb",
+ "structure2.pdb"),
+ new ArgAndValues[][]
+ { //
+ { av(Arg.STRUCTUREVIEWER, "sv0"),
+ av(Arg.PAEMATRIX, "pae0") },
+ { av(Arg.STRUCTUREVIEWER, "sv1"),
+ av(Arg.PAEMATRIX, "pae1") },
+ { av(Arg.STRUCTUREVIEWER), av(Arg.PAEMATRIX) } //
+ }, //
+ new Object[][]
+ { //
+ { //
+ av(Arg.STRUCTUREIMAGE, "image0a.png", "image0b.png",
+ "image0c.png"), //
+ new ArgAndValues[][]
+ { //
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "bg0a"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "banana"),
+ av(Arg.SCALE, "3") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "pineapple"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "col0b"),
+ av(Arg.SCALE, "4") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "pineapple"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "banana"),
+ av(Arg.SCALE, "2") }, //
+ }, //
+ }, //
+ { //
+ av(Arg.STRUCTUREIMAGE, "image1a.png", "image1b.png",
+ "image1c.png", "image1d.png",
+ "image1e.png"),
+ new ArgAndValues[][]
+ { //
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "pineapple"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "banana"),
+ av(Arg.SCALE, "2") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "bg1b"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "col1b"),
+ av(Arg.SCALE, "2") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "bg1c"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "col1c"),
+ av(Arg.SCALE, "5") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "pineapple"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "col1d"),
+ av(Arg.SCALE, "6") },
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "bg1e"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "banana"),
+ av(Arg.SCALE, "2") } //
+ }, //
+ }, //
+ { //
+ av(Arg.STRUCTUREIMAGE, "image2a.png"),
+ new ArgAndValues[][]
+ { //
+ { av(Arg.BGCOLOUR, "bg2a"),
+ av(Arg.IMAGECOLOUR, "banana"),
+ av(Arg.SCALE, "23") }, //
+ }, //
+ }, //
+ } //
+ } //