Merge branch 'master' of https://source.jalview.org/git/jalviewjs.git
[jalviewjs.git] / src / javajs / util / CompoundDocHeader.java
index 6828ef1..e81c79e 100644 (file)
-/* $RCSfile$\r
- * $Author$\r
- * $Date$\r
- * $Revision$\r
- *\r
- * Copyright (C) 2011  The Jmol Development Team\r
- *\r
- * Contact: jmol-developers@lists.sf.net\r
- *\r
- *  This library is free software; you can redistribute it and/or\r
- *  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public\r
- *  License as published by the Free Software Foundation; either\r
- *  version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.\r
- *\r
- *  This library is distributed in the hope that it will be useful,\r
- *  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- *  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU\r
- *  Lesser General Public License for more details.\r
- *\r
- *  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public\r
- *  License along with this library; if not, write to the Free Software\r
- *  Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA\r
- *  02110-1301, USA.\r
- */\r
-\r
-package javajs.util;\r
-\r
-\r
-class CompoundDocHeader {\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   */\r
-  private final CompoundDocument cd;\r
-\r
-  /**\r
-   * @param compoundDocument\r
-   */\r
-  CompoundDocHeader(CompoundDocument compoundDocument) {\r
-    cd = compoundDocument;\r
-  }\r
-\r
-  //512 bytes\r
-  //offset 0:\r
-  byte[] magicNumbers = new byte[8]; // D0CF11E0A1B11AE1\r
-  byte[] uniqueID16 = new byte[16];\r
-  byte revNumber; // 3E = 62\r
-  //byte unusedb1;\r
-  byte verNumber; // 3\r
-  //byte unusedb2;\r
-  //short byteOrder; // -2 littleEndian\r
-  short sectorPower; // 2^sectorPower = sector size; 512 = 2^9\r
-  short shortSectorPower; // 2^shortSectorPower = short sector size; 64 = 2^6\r
-  byte[] unused = new byte[10];\r
-  int nSATsectors; // number of sectors for sector allocation table\r
-  int SID_DIR_start; // sector identifier of start of directory sector\r
-  //offset 56:\r
-  int minBytesStandardStream; // less than this (and not DIR) will be "short"\r
-  int SID_SSAT_start; // start of short sector allocation table (SSAT)\r
-  int nSSATsectors; // number of sectors allocated to SSAT\r
-  int SID_MSAT_next; // pointer to next master sector allocation table sector\r
-  int nAdditionalMATsectors; // number of sectors allocated to more MSAT sectors\r
-  //offset 76; 436 bytes:      \r
-  int[] MSAT0 = new int[109]; // beginning of master allocation table \r
-\r
-  /*\r
-   *  Sector 0 is first sector AFTER this header\r
-   *  \r
-   *  If sectorPower = 9, then this allows for 109 PAGES\r
-   *  of sector allocation tables, with 127 pointers per\r
-   *  page (plus 1 pointer to the next SAT page), each \r
-   *  pointing to a sector of 512 bytes. Thus, with no additional\r
-   *  MSAT pages, the header allows for 109*128*512 = 7.1 Mb file\r
-   *  \r
-   */\r
-\r
-  final boolean readData() {\r
-    try {\r
-      cd.readByteArray(magicNumbers, 0, 8);\r
-      if (magicNumbers[0] != (byte) 0xD0 || magicNumbers[1] != (byte) 0xCF\r
-          || magicNumbers[2] != (byte) 0x11 || magicNumbers[3] != (byte) 0xE0\r
-          || magicNumbers[4] != (byte) 0xA1 || magicNumbers[5] != (byte) 0xB1\r
-          || magicNumbers[6] != (byte) 0x1A || magicNumbers[7] != (byte) 0xE1)\r
-        return false;\r
-      cd.readByteArray(uniqueID16, 0, 16);\r
-      revNumber = cd.readByte();\r
-      cd.readByte();\r
-      verNumber = cd.readByte();\r
-      cd.readByte();\r
-      byte b1 = cd.readByte();\r
-      byte b2 = cd.readByte();\r
-      cd.isBigEndian = (b1 == -1 && b2 == -2);\r
-      sectorPower = cd.readShort();\r
-      shortSectorPower = cd.readShort();\r
-      cd.readByteArray(unused, 0, 10);\r
-      nSATsectors = cd.readInt();\r
-      SID_DIR_start = cd.readInt();\r
-      cd.readByteArray(unused, 0, 4);\r
-      minBytesStandardStream = cd.readInt();\r
-      SID_SSAT_start = cd.readInt();\r
-      nSSATsectors = cd.readInt();\r
-      SID_MSAT_next = cd.readInt();\r
-      nAdditionalMATsectors = cd.readInt();\r
-      for (int i = 0; i < 109; i++)\r
-        MSAT0[i] = cd.readInt();\r
-    } catch (Exception e) {\r
-      System.out.println(e.toString());\r
-      return false;\r
-    }\r
-    return true;\r
-  }\r
+/* $RCSfile$
+ * $Author$
+ * $Date$
+ * $Revision$
+ *
+ * Copyright (C) 2011  The Jmol Development Team
+ *
+ * Contact: jmol-developers@lists.sf.net
+ *
+ *  This library is free software; you can redistribute it and/or
+ *  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+ *  License as published by the Free Software Foundation; either
+ *  version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+ *
+ *  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+ *  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ *  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+ *  Lesser General Public License for more details.
+ *
+ *  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+ *  License along with this library; if not, write to the Free Software
+ *  Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA
+ *  02110-1301, USA.
+ */
+
+package javajs.util;
+
+
+class CompoundDocHeader {
+
+  /**
+   * 
+   */
+  private final CompoundDocument cd;
+
+  /**
+   * @param compoundDocument
+   */
+  CompoundDocHeader(CompoundDocument compoundDocument) {
+    cd = compoundDocument;
+  }
+
+  //512 bytes
+  //offset 0:
+  byte[] magicNumbers = new byte[8]; // D0CF11E0A1B11AE1
+  byte[] uniqueID16 = new byte[16];
+  byte revNumber; // 3E = 62
+  //byte unusedb1;
+  byte verNumber; // 3
+  //byte unusedb2;
+  //short byteOrder; // -2 littleEndian
+  short sectorPower; // 2^sectorPower = sector size; 512 = 2^9
+  short shortSectorPower; // 2^shortSectorPower = short sector size; 64 = 2^6
+  byte[] unused = new byte[10];
+  int nSATsectors; // number of sectors for sector allocation table
+  int SID_DIR_start; // sector identifier of start of directory sector
+  //offset 56:
+  int minBytesStandardStream; // less than this (and not DIR) will be "short"
+  int SID_SSAT_start; // start of short sector allocation table (SSAT)
+  int nSSATsectors; // number of sectors allocated to SSAT
+  int SID_MSAT_next; // pointer to next master sector allocation table sector
+  int nAdditionalMATsectors; // number of sectors allocated to more MSAT sectors
+  //offset 76; 436 bytes:      
+  int[] MSAT0 = new int[109]; // beginning of master allocation table 
+
+  /*
+   *  Sector 0 is first sector AFTER this header
+   *  
+   *  If sectorPower = 9, then this allows for 109 PAGES
+   *  of sector allocation tables, with 127 pointers per
+   *  page (plus 1 pointer to the next SAT page), each 
+   *  pointing to a sector of 512 bytes. Thus, with no additional
+   *  MSAT pages, the header allows for 109*128*512 = 7.1 Mb file
+   *  
+   */
+
+  final boolean readData() {
+    try {
+      cd.readByteArray(magicNumbers, 0, 8);
+      if (magicNumbers[0] != (byte) 0xD0 || magicNumbers[1] != (byte) 0xCF
+          || magicNumbers[2] != (byte) 0x11 || magicNumbers[3] != (byte) 0xE0
+          || magicNumbers[4] != (byte) 0xA1 || magicNumbers[5] != (byte) 0xB1
+          || magicNumbers[6] != (byte) 0x1A || magicNumbers[7] != (byte) 0xE1)
+        return false;
+      cd.readByteArray(uniqueID16, 0, 16);
+      revNumber = cd.readByte();
+      cd.readByte();
+      verNumber = cd.readByte();
+      cd.readByte();
+      byte b1 = cd.readByte();
+      byte b2 = cd.readByte();
+      cd.isBigEndian = (b1 == -1 && b2 == -2);
+      sectorPower = cd.readShort();
+      shortSectorPower = cd.readShort();
+      cd.readByteArray(unused, 0, 10);
+      nSATsectors = cd.readInt();
+      SID_DIR_start = cd.readInt();
+      cd.readByteArray(unused, 0, 4);
+      minBytesStandardStream = cd.readInt();
+      SID_SSAT_start = cd.readInt();
+      nSSATsectors = cd.readInt();
+      SID_MSAT_next = cd.readInt();
+      nAdditionalMATsectors = cd.readInt();
+      for (int i = 0; i < 109; i++)
+        MSAT0[i] = cd.readInt();
+    } catch (Exception e) {
+      System.out.println(e.toString());
+      return false;
+    }
+    return true;
+  }
 }
\ No newline at end of file