websoft/data/blast/KShopp.flt

   1 ;Antigenicity    ; 16 character descriptor
   2 ;2               ; 1=Nucleic  2=Protein
   3 1                ; 1=Filter   2-64=No. Pos. in Matrix
   4 6                ; 3-256=Filter Window  0-100=Percent Cutoff Matrix Output
   5   -0.500   A  Ala
   6    1.600   BB Asx
   7   -1.000   C  Cys   Note: Columns 1-8 must contain 1 numeric value only
   8    3.000   D  Asp
   9    3.000   E  Glu
  10   -2.500   F  Phe
  11    0.000   G  Gly
  12   -0.500   H  His
  13   -1.800   I  Ile
  14    3.000   K  Lys
  15   -1.800   L  Leu
  16   -1.300   M  Met
  17    0.200   N  Asn
  18    0.000   P  Pro
  19    0.200   Q  Gln
  20    3.000   R  Arg
  21    0.300   S  Ser
  22   -0.400   T  Thr
  23   -1.500   V  Val
  24   -3.400   W  Trp
  25   -0.200   X- Unk
  26   -2.300   Y  Tyr
  27    1.600   ZZ Glx
  28   -0.200   ** ***
  29 ;Antigenicity - Hopp and Woods (Hydrophilicity Index)
  30 ;A window of 6 residues is the published (and recomended)
  31 ;value for calculating the moving average