git://source.jalview.org / jpred.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JPRED-2 Add alscript to the Git repository
[jpred.git] / sources / alscript / doc / alscript / subsection3_16_6.html
diff --git a/sources/alscript/doc/alscript/subsection3_16_6.html b/sources/alscript/doc/alscript/subsection3_16_6.html
new file mode 100644 (file)
index 0000000..302ea94
--- /dev/null
+++ b/sources/alscript/doc/alscript/subsection3_16_6.html
@@ -0,0 +1,45 @@
+<HEAD>
+<TITLE> Unix Installation</TITLE>
+</HEAD>
+<BODY><P>
+ <HR> <A NAME=tex2html448 HREF=subsection3_16_7.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/next_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html446 HREF=section3_16.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/up_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html440 HREF=subsection3_16_5.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/previous_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html450 HREF=tableofcontents3_1.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/contents_motif.gif"></A> <BR>
+<B> Next:</B> <A NAME=tex2html449 HREF=subsection3_16_7.html> VAX/VMS Installation</A>
+<B>Up:</B> <A NAME=tex2html447 HREF=section3_16.html> Appendices</A>
+<B> Previous:</B> <A NAME=tex2html441 HREF=subsection3_16_5.html> TECHNICAL NOTES</A>
+<HR> <P>
+<H2><A NAME=SECTION00016600000000000000> Unix Installation</A></H2>
+<P>
+<A NAME=app5><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/invis_anchor.xbm"></A>
+<P>
+ALSCRIPT is distributed with executables for Sun (SunOS 4.1.3), Silicon
+Graphics (IRIX 5.3), DEC ALPHA OSF/1 and Sun Solaris (2.4).  The executables
+are stored in the subdirectories bin/sun, bin/sgi, bin/osf and bin/sol.  If
+these are OK for your system, then just add the apporpriate directory to your
+path, or put links to /usr/local/bin or somewhere that is on all users paths.
+<P>
+The source code for ALSCRIPT is contained in a directory hierarchy.
+The top directory contains a README file and the BUILD script.
+Subdirectories are: <b>examples</b> which contains example command and
+alignment files, <b>doc</b> which contains <IMG ALIGN=BOTTOM ALT="" SRC="_19723_tex2html_wrap672.xbm"> and PostScript copies
+of the manual - a subdirectory of this contains an HTML version of the
+manual, and <b>src</b> which contains the source code and Makefiles for
+the package.  There may also be a directory called <b>bin</b>.  If
+present this will contain subdirectories with executables for the
+programs in the package.  Makefiles to build alscript, msf2blc,
+clus2blc and alsnum are included in the <b>src</b> directory.  Versions
+for Sun (acc compiler .sun), Silicon Graphics (.sgi), DEC OSF/1 (.osf)
+are included.
+<P>
+There is a utility csh script called BUILD.  Simply type ./BUILD sun to
+compile alscript on the Sun, ./BUILD sgi for Silicon Graphics or BUILD
+gcc for use with gcc compiler.  See instructions in the file BUILD.
+The BUILD script will create a /bin directory and subdirecotry 
+if not already present.  You can create makefiles for different computers
+and the BUILD script should still function.
+<P>
+<HR>
+
+</BODY>
+<P><ADDRESS>
+gjb@bioch.ox.ac.uk
+</ADDRESS>
\ No newline at end of file