JPRED-2 Add alscript to the Git repository
[jpred.git] / sources / alscript / examples / demo / example.blc
diff --git a/sources/alscript/examples/demo/example.blc b/sources/alscript/examples/demo/example.blc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..30cfdd3
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,33 @@
+A simple example block file.  The important parts are the lines that
+start with the greater than character - these are identifer lines for the
+sequences.  The first star is above the position of the first sequence 
+in the alingmnet which is written VERTICALLY down the page.  The second 
+star shows the end of the alignment.
+
+Anything else can be written here, except greater than signs and stars.
+
+This is the format produced by the AMPS package for multiple 
+sequence alignment.
+
+
+>one
+>two
+>three
+>four
+>five
+*
+ABCDE
+EDFTD
+AAAAA
+LLL  
+PPPPP
+GGGGG
+SSSSS
+KLMNT
+TTLPQ
+SLNST
+TTLSN
+LQPPL
+LLLLL
+TTTTT
+*