src/uk/ac/vamsas/objects/IDocumentUpdater.java

   1 /*\r
   2  * This file is part of the Vamsas Client version 0.1. \r
   3  * Copyright 2009 by Jim Procter, Iain Milne, Pierre Marguerite, \r
   4  *  Andrew Waterhouse and Dominik Lindner.\r
   5  * \r
   6  * Earlier versions have also been incorporated into Jalview version 2.4 \r
   7  * since 2008, and TOPALi version 2 since 2007.\r
   8  * \r
   9  * The Vamsas Client is free software: you can redistribute it and/or modify\r
  10  * it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by\r
  11  * the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or\r
  12  * (at your option) any later version.\r
  13  *  \r
  14  * The Vamsas Client is distributed in the hope that it will be useful,\r
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  17  * GNU Lesser General Public License for more details.\r
  18  * \r
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License\r
  20  * along with the Vamsas Client.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  21  */\r
  22 package uk.ac.vamsas.objects;\r
  23 \r
  24 import uk.ac.vamsas.objects.core.*;\r
  25 \r
  26 public interface IDocumentUpdater {\r
  27   public void update(Alignment vobj);\r
  28 \r
  29   public void update(AlignmentAnnotation vobj);\r
  30 \r
  31   public void update(AlignmentSequence vobj);\r
  32 \r
  33   public void update(AlignmentSequenceAnnotation vobj);\r
  34 \r
  35   public void update(AnnotationElement vobj);\r
  36 \r
  37   public void update(AppData vobj);\r
  38 \r
  39   public void update(ApplicationData vobj);\r
  40 \r
  41   public void update(Common vobj);\r
  42 \r
  43   public void update(DataSet vobj);\r
  44 \r
  45   public void update(DataSetAnnotations vobj);\r
  46 \r
  47   public void update(DbRef vobj);\r
  48 \r
  49   public void update(Entry vobj);\r
  50 \r
  51   public void update(Glyph vobj);\r
  52 \r
  53   public void update(Input vobj);\r
  54 \r
  55   public void update(Instance vobj);\r
  56 \r
  57   public void update(Link vobj);\r
  58 \r
  59   public void update(LockFile vobj);\r
  60 \r
  61   public void update(Map vobj);\r
  62 \r
  63   // TODO: replace with mapRangeType handler public void update(MapList vobj) {}\r
  64 \r
  65   public void update(SequenceMapping vobj);\r
  66 \r
  67   public void update(Newick vobj);\r
  68 \r
  69   public void update(Param vobj);\r
  70 \r
  71   public void update(Pos vobj);\r
  72 \r
  73   public void update(Property vobj);\r
  74 \r
  75   public void update(Provenance vobj);\r
  76 \r
  77   public void update(RangeAnnotation vobj);\r
  78 \r
  79   public void update(RangeType vobj);\r
  80 \r
  81   public void update(Score vobj);\r
  82 \r
  83   public void update(Seg vobj);\r
  84 \r
  85   public void update(Sequence vobj);\r
  86 \r
  87   public void update(SequenceType vobj);\r
  88 \r
  89   public void update(Tree vobj);\r
  90 \r
  91   public void update(User vobj);\r
  92 \r
  93   public void update(VAMSAS vobj);\r
  94 \r
  95   public void update(VamsasDocument vobj);\r
  96 }\r