src/uk/ac/vamsas/objects/core/descriptors/AlignmentAnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class AlignmentAnnotationDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class AlignmentAnnotationDescriptor extends uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48 \r
  49       //----------------/\r
  50      //- Constructors -/\r
  51     //----------------/\r
  52 \r
  53     public AlignmentAnnotationDescriptor() {\r
  54         super();\r
  55         setExtendsWithoutFlatten(new uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor());\r
  56         _nsURI = "http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes";\r
  57         _xmlName = "AlignmentAnnotation";\r
  58         _elementDefinition = true;\r
  59         \r
  60         //-- set grouping compositor\r
  61         setCompositorAsSequence();\r
  62         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  63         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  64         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  65         //-- initialize attribute descriptors\r
  66         \r
  67         //-- _graph\r
  68         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  69         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  70             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  71                 throws IllegalStateException\r
  72             {\r
  73                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
  74                 if (!target.hasGraph()) { return null; }\r
  75                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  76             }\r
  77             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  78                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  79             {\r
  80                 try {\r
  81                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
  82                     // ignore null values for non optional primitives\r
  83                     if (value == null) { return; }\r
  84                     \r
  85                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
  86                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  87                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  88                 }\r
  89             }\r
  90             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  91                 return null;\r
  92             }\r
  93         };\r
  94         desc.setHandler(handler);\r
  95         desc.setRequired(true);\r
  96         desc.setMultivalued(false);\r
  97         addFieldDescriptor(desc);\r
  98         \r
  99         //-- validation code for: _graph\r
 100         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 101         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 102         { //-- local scope\r
 103             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 104             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 105             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 106         }\r
 107         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 108         //-- _seqrefs\r
 109         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Object.class, "_seqrefs", "seqrefs", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 110         desc.setReference(true);\r
 111         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 113                 throws IllegalStateException\r
 114             {\r
 115                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 116                 return target.getSeqrefs();\r
 117             }\r
 118             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 119                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 120             {\r
 121                 try {\r
 122                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 123                     target.addSeqrefs( (java.lang.Object) value);\r
 124                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 125                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 126                 }\r
 127             }\r
 128             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 129                 try {\r
 130                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 131                     target.removeAllSeqrefs();\r
 132                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 133                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 134                 }\r
 135             }\r
 136             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 137                 return new java.lang.Object();\r
 138             }\r
 139         };\r
 140         desc.setMultivalued(true);\r
 141         desc.setHandler(handler);\r
 142         desc.setMultivalued(true);\r
 143         addFieldDescriptor(desc);\r
 144         \r
 145         //-- validation code for: _seqrefs\r
 146         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 147         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 148         { //-- local scope\r
 149             org.exolab.castor.xml.validators.IdRefsValidator typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IdRefsValidator();\r
 150             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 151             desc.setValidator(fieldValidator);\r
 152         }\r
 153         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 154         //-- initialize element descriptors\r
 155         \r
 156         //-- _provenance\r
 157         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 158         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 159             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 160                 throws IllegalStateException\r
 161             {\r
 162                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 163                 return target.getProvenance();\r
 164             }\r
 165             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 166                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 167             {\r
 168                 try {\r
 169                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 170                     target.setProvenance( (uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
 171                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 172                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 173                 }\r
 174             }\r
 175             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 176                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance();\r
 177             }\r
 178         };\r
 179         desc.setHandler(handler);\r
 180         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 181         desc.setRequired(true);\r
 182         desc.setMultivalued(false);\r
 183         addFieldDescriptor(desc);\r
 184         \r
 185         //-- validation code for: _provenance\r
 186         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 187         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 188         { //-- local scope\r
 189         }\r
 190         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 191     }\r
 192 \r
 193 \r
 194       //-----------/\r
 195      //- Methods -/\r
 196     //-----------/\r
 197 \r
 198     /**\r
 199      * Method getAccessMode.\r
 200      * \r
 201      * @return the access mode specified for this class.\r
 202      */\r
 203     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 204     ) {\r
 205         return null;\r
 206     }\r
 207 \r
 208     /**\r
 209      * Method getIdentity.\r
 210      * \r
 211      * @return the identity field, null if this class has no\r
 212      * identity.\r
 213      */\r
 214     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 215     ) {\r
 216         return super.getIdentity();\r
 217     }\r
 218 \r
 219     /**\r
 220      * Method getJavaClass.\r
 221      * \r
 222      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 223      */\r
 224     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 225     ) {\r
 226         return uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation.class;\r
 227     }\r
 228 \r
 229     /**\r
 230      * Method getNameSpacePrefix.\r
 231      * \r
 232      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 233      */\r
 234     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 235     ) {\r
 236         return _nsPrefix;\r
 237     }\r
 238 \r
 239     /**\r
 240      * Method getNameSpaceURI.\r
 241      * \r
 242      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 243      * unmarshaling as XML.\r
 244      */\r
 245     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 246     ) {\r
 247         return _nsURI;\r
 248     }\r
 249 \r
 250     /**\r
 251      * Method getValidator.\r
 252      * \r
 253      * @return a specific validator for the class described by this\r
 254      * ClassDescriptor.\r
 255      */\r
 256     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 257     ) {\r
 258         return this;\r
 259     }\r
 260 \r
 261     /**\r
 262      * Method getXMLName.\r
 263      * \r
 264      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 265      */\r
 266     public java.lang.String getXMLName(\r
 267     ) {\r
 268         return _xmlName;\r
 269     }\r
 270 \r
 271     /**\r
 272      * Method isElementDefinition.\r
 273      * \r
 274      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 275      * of a global\r
 276      * element or element with anonymous type definition.\r
 277      */\r
 278     public boolean isElementDefinition(\r
 279     ) {\r
 280         return _elementDefinition;\r
 281     }\r
 282 \r
 283 }\r