src/uk/ac/vamsas/objects/core/descriptors/DataSetDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import uk.ac.vamsas.objects.core.DataSet;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class DataSetDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class DataSetDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48     /**\r
  49      * Field _identity.\r
  50      */\r
  51     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor _identity;\r
  52 \r
  53 \r
  54       //----------------/\r
  55      //- Constructors -/\r
  56     //----------------/\r
  57 \r
  58     public DataSetDescriptor() {\r
  59         super();\r
  60         _nsURI = "http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes";\r
  61         _xmlName = "DataSet";\r
  62         _elementDefinition = true;\r
  63         \r
  64         //-- set grouping compositor\r
  65         setCompositorAsSequence();\r
  66         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  67         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  68         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  69         //-- initialize attribute descriptors\r
  70         \r
  71         //-- _id\r
  72         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  73         this._identity = desc;\r
  74         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  75             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  76                 throws IllegalStateException\r
  77             {\r
  78                 DataSet target = (DataSet) object;\r
  79                 return target.getId();\r
  80             }\r
  81             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  82                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  83             {\r
  84                 try {\r
  85                     DataSet target = (DataSet) object;\r
  86                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
  87                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  88                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  89                 }\r
  90             }\r
  91             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  92                 return new java.lang.String();\r
  93             }\r
  94         };\r
  95         desc.setHandler(handler);\r
  96         desc.setMultivalued(false);\r
  97         addFieldDescriptor(desc);\r
  98         \r
  99         //-- validation code for: _id\r
 100         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 101         { //-- local scope\r
 102             org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator typeValidator;\r
 103             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator();\r
 104             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 105         }\r
 106         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 107         //-- initialize element descriptors\r
 108         \r
 109         //-- _sequenceList\r
 110         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Sequence.class, "_sequenceList", "Sequence", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 111         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 113                 throws IllegalStateException\r
 114             {\r
 115                 DataSet target = (DataSet) object;\r
 116                 return target.getSequence();\r
 117             }\r
 118             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 119                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 120             {\r
 121                 try {\r
 122                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 123                     target.addSequence( (uk.ac.vamsas.objects.core.Sequence) value);\r
 124                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 125                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 126                 }\r
 127             }\r
 128             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 129                 try {\r
 130                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 131                     target.removeAllSequence();\r
 132                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 133                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 134                 }\r
 135             }\r
 136             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 137                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Sequence();\r
 138             }\r
 139         };\r
 140         desc.setHandler(handler);\r
 141         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 142         desc.setRequired(true);\r
 143         desc.setMultivalued(true);\r
 144         addFieldDescriptor(desc);\r
 145         \r
 146         //-- validation code for: _sequenceList\r
 147         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 148         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 149         { //-- local scope\r
 150         }\r
 151         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 152         //-- _dataSetAnnotationsList\r
 153         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations.class, "_dataSetAnnotationsList", "DataSetAnnotations", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 154         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 155             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 156                 throws IllegalStateException\r
 157             {\r
 158                 DataSet target = (DataSet) object;\r
 159                 return target.getDataSetAnnotations();\r
 160             }\r
 161             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 162                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 163             {\r
 164                 try {\r
 165                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 166                     target.addDataSetAnnotations( (uk.ac.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations) value);\r
 167                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 168                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 169                 }\r
 170             }\r
 171             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 172                 try {\r
 173                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 174                     target.removeAllDataSetAnnotations();\r
 175                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 176                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 177                 }\r
 178             }\r
 179             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 180                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations();\r
 181             }\r
 182         };\r
 183         desc.setHandler(handler);\r
 184         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 185         desc.setMultivalued(true);\r
 186         addFieldDescriptor(desc);\r
 187         \r
 188         //-- validation code for: _dataSetAnnotationsList\r
 189         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 190         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 191         { //-- local scope\r
 192         }\r
 193         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 194         //-- _alignmentList\r
 195         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Alignment.class, "_alignmentList", "Alignment", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 196         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 197             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 198                 throws IllegalStateException\r
 199             {\r
 200                 DataSet target = (DataSet) object;\r
 201                 return target.getAlignment();\r
 202             }\r
 203             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 204                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 205             {\r
 206                 try {\r
 207                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 208                     target.addAlignment( (uk.ac.vamsas.objects.core.Alignment) value);\r
 209                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 210                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 211                 }\r
 212             }\r
 213             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 214                 try {\r
 215                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 216                     target.removeAllAlignment();\r
 217                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 218                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 219                 }\r
 220             }\r
 221             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 222                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Alignment();\r
 223             }\r
 224         };\r
 225         desc.setHandler(handler);\r
 226         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 227         desc.setMultivalued(true);\r
 228         addFieldDescriptor(desc);\r
 229         \r
 230         //-- validation code for: _alignmentList\r
 231         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 232         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 233         { //-- local scope\r
 234         }\r
 235         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 236         //-- _treeList\r
 237         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Tree.class, "_treeList", "Tree", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 238         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 239             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 240                 throws IllegalStateException\r
 241             {\r
 242                 DataSet target = (DataSet) object;\r
 243                 return target.getTree();\r
 244             }\r
 245             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 246                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 247             {\r
 248                 try {\r
 249                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 250                     target.addTree( (uk.ac.vamsas.objects.core.Tree) value);\r
 251                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 252                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 253                 }\r
 254             }\r
 255             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 256                 try {\r
 257                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 258                     target.removeAllTree();\r
 259                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 260                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 261                 }\r
 262             }\r
 263             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 264                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Tree();\r
 265             }\r
 266         };\r
 267         desc.setHandler(handler);\r
 268         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 269         desc.setMultivalued(true);\r
 270         addFieldDescriptor(desc);\r
 271         \r
 272         //-- validation code for: _treeList\r
 273         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 274         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 275         { //-- local scope\r
 276         }\r
 277         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 278         //-- _provenance\r
 279         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 280         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 281             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 282                 throws IllegalStateException\r
 283             {\r
 284                 DataSet target = (DataSet) object;\r
 285                 return target.getProvenance();\r
 286             }\r
 287             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 288                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 289             {\r
 290                 try {\r
 291                     DataSet target = (DataSet) object;\r
 292                     target.setProvenance( (uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
 293                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 294                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 295                 }\r
 296             }\r
 297             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 298                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance();\r
 299             }\r
 300         };\r
 301         desc.setHandler(handler);\r
 302         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 303         desc.setRequired(true);\r
 304         desc.setMultivalued(false);\r
 305         addFieldDescriptor(desc);\r
 306         \r
 307         //-- validation code for: _provenance\r
 308         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 309         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 310         { //-- local scope\r
 311         }\r
 312         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 313     }\r
 314 \r
 315 \r
 316       //-----------/\r
 317      //- Methods -/\r
 318     //-----------/\r
 319 \r
 320     /**\r
 321      * Method getAccessMode.\r
 322      * \r
 323      * @return the access mode specified for this class.\r
 324      */\r
 325     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 326     ) {\r
 327         return null;\r
 328     }\r
 329 \r
 330     /**\r
 331      * Method getIdentity.\r
 332      * \r
 333      * @return the identity field, null if this class has no\r
 334      * identity.\r
 335      */\r
 336     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 337     ) {\r
 338         return _identity;\r
 339     }\r
 340 \r
 341     /**\r
 342      * Method getJavaClass.\r
 343      * \r
 344      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 345      */\r
 346     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 347     ) {\r
 348         return uk.ac.vamsas.objects.core.DataSet.class;\r
 349     }\r
 350 \r
 351     /**\r
 352      * Method getNameSpacePrefix.\r
 353      * \r
 354      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 355      */\r
 356     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 357     ) {\r
 358         return _nsPrefix;\r
 359     }\r
 360 \r
 361     /**\r
 362      * Method getNameSpaceURI.\r
 363      * \r
 364      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 365      * unmarshaling as XML.\r
 366      */\r
 367     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 368     ) {\r
 369         return _nsURI;\r
 370     }\r
 371 \r
 372     /**\r
 373      * Method getValidator.\r
 374      * \r
 375      * @return a specific validator for the class described by this\r
 376      * ClassDescriptor.\r
 377      */\r
 378     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 379     ) {\r
 380         return this;\r
 381     }\r
 382 \r
 383     /**\r
 384      * Method getXMLName.\r
 385      * \r
 386      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 387      */\r
 388     public java.lang.String getXMLName(\r
 389     ) {\r
 390         return _xmlName;\r
 391     }\r
 392 \r
 393     /**\r
 394      * Method isElementDefinition.\r
 395      * \r
 396      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 397      * of a global\r
 398      * element or element with anonymous type definition.\r
 399      */\r
 400     public boolean isElementDefinition(\r
 401     ) {\r
 402         return _elementDefinition;\r
 403     }\r
 404 \r
 405 }\r