moved methods for opening a stored session document in a new vamsas session into...
authorjprocter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Fri, 14 Sep 2007 13:48:09 +0000 (13:48 +0000)
committerjprocter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Fri, 14 Sep 2007 13:48:09 +0000 (13:48 +0000)
git-svn-id: https://svn.lifesci.dundee.ac.uk/svn/repository/trunk@465 be28352e-c001-0410-b1a7-c7978e42abec

src/uk/ac/vamsas/client/simpleclient/SimpleClient.java

index d5dc880..43ec15d 100644 (file)
@@ -25,6 +25,7 @@ import uk.ac.vamsas.client.Events;
 import uk.ac.vamsas.client.IClient;
 import uk.ac.vamsas.client.IClientDocument;
 import uk.ac.vamsas.client.IObjectUpdate;
+import uk.ac.vamsas.client.InvalidSessionDocumentException;
 import uk.ac.vamsas.client.InvalidSessionUrnException;
 import uk.ac.vamsas.client.SessionHandle;
 import uk.ac.vamsas.client.UserHandle;
@@ -94,42 +95,23 @@ public class SimpleClient implements IClient {
       
   }
   /**
-   * construct new session by importing objects from an existing vamsas document
+   * construct new SimpleClientsession by importing objects from an existing vamsas document
    * @param user
    * @param client
    * @param sess
    * @param importingArchive
    * @throws Exception IOExceptions for Session IO problems, and general Exception if importing document is invalid.
-   */
   protected SimpleClient(UserHandle user, ClientHandle client, VamsasSession sess, File importingArchive) throws Exception {
     this(user, client, sess);
     if (log.isDebugEnabled())
     {
-      log.debug("Attempting to create a new session from file: "+importingArchive);
+      log.debug("Attempting to overwrite session document with file: "+importingArchive);
     }
-    initSessionDocFromFile(importingArchive);
-    // TODO: write provenance entry for new session indicating the import.
+  // TODO: write provenance entry for new session indicating the import.
+    
   }
+   */
   
-  private void initSessionDocFromFile(File importingArchive) throws Exception {
-    VamsasArchive sessdoc = _session.getVamsasDocument();
-    try {
-      VamsasArchiveReader odoc = new VamsasArchiveReader(importingArchive);
-      SimpleDocument sdoc = new SimpleDocument(makeVorbaIdFactory());
-      VamsasDocument doc = sdoc.getVamsasDocument(odoc);
-      sessdoc.putVamsasDocument(doc, sdoc.vorba);
-      sessdoc.closeArchive();
-      log.debug("Imported new vamsas data from "+importingArchive);
-      
-    } catch (Exception e) {
-      sessdoc.cancelArchive();
-      // TODO: check that new session is really writeable if the imported document was invalid ? or is removed
-      _session.slog.info("Exception when importing document data from "+importingArchive);
-      log.warn("While importing session data from existing archive in "+importingArchive, e);      
-      throw new Exception("Failed to import data from "+importingArchive, e);
-    }
-  }
-
   /*
    * (non-Javadoc)
    * LATER: check that build substitution variables are correct