FollowerColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import jalview.analysis.Conservation;
  24 import jalview.datamodel.ProfilesI;
  25
  26 /**
  27  * Colourscheme that takes its colours from some other colourscheme
  28  *
  29  * @author jimp
  30  *
  31  */
  32 public class FollowerColourScheme extends ResidueColourScheme
  33 {
  34
  35   protected ColourSchemeI colourScheme;
  36
  37   public ColourSchemeI getBaseColour()
  38   {
  39     return colourScheme;
  40   }
  41
  42   @Override
  43   public void setConsensus(ProfilesI consensus)
  44   {
  45     if (colourScheme != null)
  46     {
  47       colourScheme.setConsensus(consensus);
  48     }
  49   }
  50
  51   @Override
  52   public void setConservation(Conservation cons)
  53   {
  54     if (colourScheme != null)
  55     {
  56       colourScheme.setConservation(cons);
  57     }
  58   }
  59
  60   @Override
  61   public void setConservationInc(int i)
  62   {
  63     if (colourScheme != null)
  64     {
  65       colourScheme.setConservationInc(i);
  66     }
  67   }
  68
  69 }