doc/building.html

   1 <html>
   2 <head>
   3 <title>Building Jalview from Source</title>
   4 </head>
   5 <body>
   6 <h1>Building Jalview from Source</h1>
   7 <P>
   8 <p>
   9 You will need the following (hopefully):<br>
  10 <ul>
  11 <li>Java development kit (we used JDK1.4SE but JDK1.5 will work too,
  12 and maybe even jikes).
  13 <li>Ant (we think 1.5.4 is quite sufficient to use the simple build
  14 file supplied).
  15 </ul>
  16 With any luck, after setting your paths and JAVA_HOME correctly, you
  17 just need to change to the Jalview directory and run ant (this works
  18 from JBuilder and eclipse too).
  19 <pre>
  20    ant
  21 </pre>
  22
  23 </p>
  24 <p><strong>Building a webstart version of jalview</strong></p>
  25 Jalview depends on several libraries contained in the libs directory
  26 of the distribution.  In order to access them, they must all be signed
  27 jars - using the same jarsigner key as jalview itself. There is a
  28 build target in ant to make the signed jar files in a directory called
  29 dist. But first you need to make your own key:
  30 <p><strong>Making your own key</strong></p>
  31
  32 <p>The ant 'makefulldist' target assumes that a keystore exists in a
  33 directory 'keys'. To make a key accessible using the default settings
  34 in the build.xml file then make the keys directory and add the
  35 jarsigner key with the following :
  36 </p>
  37 <pre>
  38 mkdir keys
  39 keytool -genkey -keystore keys/.keystore -keypass alignmentisfun
  40 -storepass alignmentisfun -alias jalview
  41  (you will have to answer some personal questions here)
  42 ant makejars
  43  (should eventually generate a Jalview.jnlp file
  44   in ./dist along with a set of signed jars using the jalview
  45   key)
  46 </pre>
  47
  48 <p>
  49
  50 <p>
  51 <address>
  52 <a href="mailto:help@jalview.org">Jalview development team</a>
  53 </address>
  54 </body>
  55 </html>