examples/plantfdx.features

   1 HELIX   d4d189
   2 MOD_RES 47e459
   3 TRANSIT 6f949b
   4 TURN    1d1e2d
   5 METAL   70686e
   6 SIGNAL  92c7dd
   7 VARIANT 60beac
   8 Pfam    dc206a
   9 CONFLICT        c46c6e
  10 STRAND  25c54c
  11
  12 STARTGROUP      uniprot
  13 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAA       -1      39      39      METAL
  14 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAA       -1      44      44      METAL
  15 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAA       -1      47      47      METAL
  16 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAA       -1      77      77      METAL
  17 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 8_83</a></html>        FER_CAPAA       -1      8       83      Pfam
  18 Chloroplast     FER_CAPAN       -1      1       47      TRANSIT
  19 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAN       -1      86      86      METAL
  20 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAN       -1      91      91      METAL
  21 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAN       -1      94      94      METAL
  22 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_CAPAN       -1      124     124     METAL
  23 Phosphothreonine        FER_CAPAN       -1      136     136     MOD_RES
  24 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 55_130</a></html>      FER_CAPAN       -1      55      130     Pfam
  25 Chloroplast     FER1_SOLLC      -1      1       47      TRANSIT
  26 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SOLLC      -1      86      86      METAL
  27 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SOLLC      -1      91      91      METAL
  28 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SOLLC      -1      94      94      METAL
  29 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SOLLC      -1      124     124     METAL
  30 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 55_130</a></html>      FER1_SOLLC      -1      55      130     Pfam
  31 Evidence: EI4   Q93XJ9_SOLTU    -1      1       48      SIGNAL
  32 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 55_130</a></html>      Q93XJ9_SOLTU    -1      55      130     Pfam
  33 Chloroplast     FER1_PEA        -1      1       52      TRANSIT
  34 L -> I (in strain: cv. Onward)  FER1_PEA        -1      59      59      VARIANT
  35 I -> L (in strain: cv. Onward)  FER1_PEA        -1      85      85      VARIANT
  36 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_PEA        -1      91      91      METAL
  37 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_PEA        -1      96      96      METAL
  38 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_PEA        -1      99      99      METAL
  39 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_PEA        -1      129     129     METAL
  40 YPTS -> PPPA (in Ref. 2)        FER1_PEA        -1      132     135     CONFLICT
  41 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 60_135</a></html>      FER1_PEA        -1      60      135     Pfam
  42 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 63_138</a></html>      Q7XA98_TRIPR    -1      63      138     Pfam
  43 Chloroplast     FER1_MESCR      -1      1       51      TRANSIT
  44 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MESCR      -1      90      90      METAL
  45 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MESCR      -1      95      95      METAL
  46 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MESCR      -1      98      98      METAL
  47 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MESCR      -1      128     128     METAL
  48 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 59_134</a></html>      FER1_MESCR      -1      59      134     Pfam
  49 Chloroplast     FER1_SPIOL      -1      1       50      TRANSIT
  50 STRAND  FER1_SPIOL      -1      52      59      STRAND
  51 TURN    FER1_SPIOL      -1      60      61      TURN
  52 STRAND  FER1_SPIOL      -1      62      69      STRAND
  53 TURN    FER1_SPIOL      -1      70      71      TURN
  54 HELIX   FER1_SPIOL      -1      74      80      HELIX
  55 TURN    FER1_SPIOL      -1      81      82      TURN
  56 STRAND  FER1_SPIOL      -1      88      92      STRAND
  57 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SPIOL      -1      89      89      METAL
  58 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SPIOL      -1      94      94      METAL
  59 TURN    FER1_SPIOL      -1      96      97      TURN
  60 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SPIOL      -1      97      97      METAL
  61 STRAND  FER1_SPIOL      -1      98      104     STRAND
  62 TURN    FER1_SPIOL      -1      109     110     TURN
  63 HELIX   FER1_SPIOL      -1      116     121     HELIX
  64 TURN    FER1_SPIOL      -1      122     122     TURN
  65 STRAND  FER1_SPIOL      -1      123     125     STRAND
  66 HELIX   FER1_SPIOL      -1      126     128     HELIX
  67 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_SPIOL      -1      127     127     METAL
  68 STRAND  FER1_SPIOL      -1      130     133     STRAND
  69 STRAND  FER1_SPIOL      -1      135     138     STRAND
  70 HELIX   FER1_SPIOL      -1      142     144     HELIX
  71 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 58_133</a></html>      FER1_SPIOL      -1      58      133     Pfam
  72 I -> V  FER3_RAPSA      -1      8       8       VARIANT
  73 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER3_RAPSA      -1      39      39      METAL
  74 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER3_RAPSA      -1      44      44      METAL
  75 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER3_RAPSA      -1      47      47      METAL
  76 S -> T  FER3_RAPSA      -1      55      55      VARIANT
  77 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER3_RAPSA      -1      77      77      METAL
  78 R -> K  FER3_RAPSA      -1      91      91      VARIANT
  79 M -> V  FER3_RAPSA      -1      95      95      VARIANT
  80 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 8_83</a></html>        FER3_RAPSA      -1      8       83      Pfam
  81 Chloroplast     FER1_ARATH      -1      1       52      TRANSIT
  82 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_ARATH      -1      91      91      METAL
  83 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_ARATH      -1      96      96      METAL
  84 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_ARATH      -1      99      99      METAL
  85 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_ARATH      -1      129     129     METAL
  86 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 60_135</a></html>      FER1_ARATH      -1      60      135     Pfam
  87 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_BRANA       -1      39      39      METAL
  88 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_BRANA       -1      44      44      METAL
  89 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_BRANA       -1      47      47      METAL
  90 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER_BRANA       -1      77      77      METAL
  91 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 8_83</a></html>        FER_BRANA       -1      8       83      Pfam
  92 Chloroplast     FER2_ARATH      -1      1       52      TRANSIT
  93 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER2_ARATH      -1      91      91      METAL
  94 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER2_ARATH      -1      96      96      METAL
  95 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER2_ARATH      -1      99      99      METAL
  96 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER2_ARATH      -1      129     129     METAL
  97 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 60_135</a></html>      FER2_ARATH      -1      60      135     Pfam
  98 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 60_118</a></html>      Q93Z60_ARATH    -1      60      118     Pfam
  99 Chloroplast     FER1_MAIZE      -1      1       52      TRANSIT
 100 STRAND  FER1_MAIZE      -1      57      59      STRAND
 101 STRAND  FER1_MAIZE      -1      72      74      STRAND
 102 HELIX   FER1_MAIZE      -1      76      80      HELIX
 103 TURN    FER1_MAIZE      -1      81      84      TURN
 104 STRAND  FER1_MAIZE      -1      90      97      STRAND
 105 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MAIZE      -1      91      91      METAL
 106 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MAIZE      -1      96      96      METAL
 107 TURN    FER1_MAIZE      -1      98      99      TURN
 108 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MAIZE      -1      99      99      METAL
 109 TURN    FER1_MAIZE      -1      118     119     TURN
 110 HELIX   FER1_MAIZE      -1      120     123     HELIX
 111 TURN    FER1_MAIZE      -1      128     129     TURN
 112 Iron-sulfur (2Fe-2S)    FER1_MAIZE      -1      129     129     METAL
 113 STRAND  FER1_MAIZE      -1      132     135     STRAND
 114 STRAND  FER1_MAIZE      -1      137     141     STRAND
 115 TURN    FER1_MAIZE      -1      142     142     TURN
 116 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 60_135</a></html>      FER1_MAIZE      -1      60      135     Pfam
 117 <html>Description: Fer2 Status: True Positive <a href="http://pfam.xfam.org/family/PF00111">Pfam 52_127</a></html>      O80429_MAIZE    -1      52      127     Pfam
 118 ENDGROUP        uniprot