JAL-2759 Keep numColumns up to date
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1 Command line: [exonerate --model protein2genome Input_Sequences63/dcsA.fas NewSequencedGenome/A_Ellipt_clc_pe_contigs.fa --bestn 1 --showtargetgff]
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14          ||||||!:!! !|||   !.!  !  !  !!.!  !! !!.!|||!!:||||||:!!|||
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18    163 : ProAspIleSerLeuAlaGluMetGluGluLysMetArgGlnHisLysValTyrGlnGlu :   182
19          ||||||!!:!!!! !!.!|||!!:||||||||||||||||||||||||!.!:!!!  |||
20          ProAspMetThrProGlyGluIleGluGluLysMetArgGlnHisLysAlaHisLeuGlu
21  11211 : CCCGACATGACGCCCGGCGAGATCGAGGAGAAGATGCGCCAGCACAAGGCGCACCTCGAG : 11152
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23    183 : GlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnGlnLysGlnLysAspLysGluLeuSer :   202
24                      ..!|||:!!.....!..!:!!!  |||:!!|||..!:!!  !! !  !
25          ------------MetGlnLysSerSerSerGluLeuLysLysLysSerGlnMetGlnLeu
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28    203 : SerGlnLysLysLysProSerSerMetGlnLeuSerLysLysLysHisValAlaLysGlu :   222
29          !.!||| ! :!!:!!  !..!..!:!:     !!.!|||   :::   :!!  !:!!!!:
30          LysGlnAspGlnGlnLysGlnGlnValValAlaLysLysProArgSerIleLeuGlnAsp
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33    223 : AspSerGluThrLeuGluThrIleIleGlyGluGluLysLysGluValValPheGluVal :   242
34          |||! !||||||! !||||||:!!.!!!.!||||||:::|||||||||||||||||||||
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39          :::|||||||||||||||:!!|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
40          ArgProTyrPheSerHisSerIleLeuGlnAlaThrMetAlaValPheLeuIleTrpAsn
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45          IlePheTyrPheAlaTyrArgMetGlyTrpThrMetAsnThrGlnAsnGlyValTyrVal
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49          .!!!!!||||||:!:||||||:!!||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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59          ||||||:::|||||||||     !||||||||||||||||||:!!|||||||||||||||
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84          |||||||||..!:::||||||!.!!!!||||||||||||:!!||||||||||||||||||
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94           !!..!||||||||||||  !!!!|||:!!! !||||||!!:|||||||||||| !!|||
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119          !::|||!!::!:|||:!!|||||||||||||||||||||||| !!     !||| !!:!!
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199          :!!|||!:!!  ||||||||||||:!!|||:::|||:!!|||||||||||||||||||||
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204          ||||||||||||||||||||||||||||||!!:|||!.!||||||||||||:!!  !|||
205          HisLysLeuAlaMetTrpAsnTrpLysArgGluPheAlaLysLysProValIleValGlu
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209            !!:!||||||:!!|||||||||:!!.!.  !!!:   .!!:!!|||  !!.!|||  !
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211   8946 : CGCTACCGCCAGTCGAAGCTGGTGCACCACGCCGAG---ACCGAGGAGCACAAGGGCCCG :  8890
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214          !.!|||||||||||||||||||||:!!|||||||||||||||||||||||||||||||||
215          ArgLysAlaGluGlnSerPheArgSerSerAsnLysGluSerAspThrIleLysAsnSer
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219          |||||||||  !||||||:!!|||:!!|||! !!.!||||||||||||!!::!!  !.!!
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224          :!!|||  !||||||||||||!  |||||||||||||||:!!:!!|||||||||||||||
225          LeuLeuSerPheAsnCysPheLeuAsnAspMetTrpLeuMetIleValValAlaGlyPhe
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229          :!!|||||||||! !|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
230          AlaPheSerThrCysTrpHisLeuTrpSerPheIleProMetAlaLeuArgGlnSerGlu
231   8709 : GCCTTCTCCACGTGCTGGCATCTCTGGTCGTTCATCCCTATGGCCCTCAGACAGTCCGAG :  8650
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234          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:!!:!!||||||:!!|||
235          LysGlnTrpProTyrAlaSerSerTyrHisAlaHisAsnIleLeuIlePheLeuIleLeu
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260 #
261 -- completed exonerate analysis