JAL-653 refactored exonerate full output to separate text file, leaving gffv2 fragmen...
[jalview.git] / examples / testdata / exonerateoutput.gff
1 ##gff-version 2
2 ##source-version exonerate:protein2genome:local 2.2.0
3 ##date 2015-01-16
4 ##type DNA
5 #
6 #
7 # seqname source feature start end score strand frame attributes
8 #
9 contig_1146     exonerate:protein2genome:local  gene    8534    11269   3652    -       .       gene_id 0 ; sequence DDB_G0269124 ; gene_orientation .
10 contig_1146     exonerate:protein2genome:local  cds     8534    11269   .       -       .       
11 contig_1146     exonerate:protein2genome:local  exon    8534    11269   .       -       .       insertions 3 ; deletions 6
12 contig_1146     exonerate:protein2genome:local  similarity      8534    11269   3652    -       .       alignment_id 0 ; Query DDB_G0269124 ; Align 11270 143 120 ; Align 11150 187 282 ; Align 10865 281 888 ; Align 9977 578 1068 ; Align 8909 935 375
13 # --- END OF GFF DUMP ---