JAL-2375 JAL-2376 First commit of implementation for Phyre2 result browsing, template...
[jalview.git] / examples / testdata / phyre2results / 56da5616b4559c93 / assembler.pssm
1 M   -6  -6  -7  -8  -6  -5  -7  -8  -6   2  -2  -6  11  -5  -7  -6  -5  -6  -6  -4
2 A    3   0  -1   6  -6   3   1  -4  -1  -6  -6   1  -5  -6  -5  -2  -3  -7  -5  -5
3 S    4  -3  -3   0  -4  -2  -1   0  -1  -1  -1  -3  -1  -2   2   2   1  -5  -2  -1
4 V    3  -4  -5  -4   0  -3  -5  -3  -5   1   1  -4   2  -3   1  -1   1  -5  -4   4
5 S   -1   3  -1   1  -3   1   2   1   0  -3  -2   2  -1  -3  -3   0   0  -4   0  -2
6 A    3   2   0   0  -3  -1   0   0  -4  -3  -3  -1  -4  -4  -2   1   3  -6  -4  -3
7 T    2  -1  -3  -3  -3   1   0   0   6  -2   0  -3   1  -5  -4   0   2  -5  -1  -1
8 M    1  -6  -7  -7  -2  -6  -7  -7  -7   1   5  -6  -1   0  -7  -4  -3  -1  -3   3
9 I   -1   1  -3  -4  -6   0  -1  -4   0  -1  -1   0   0   1  -3  -3  -2  -1   7  -1
10 S    2  -2  -1  -1   4  -1   1  -2  -4  -1  -1  -2   0  -1  -2   0   0  -5  -2   2
11 T    0   0  -5  -8  10  -5  -5  -5  -2  -3   1  -4   0  -4  -7  -1  -3   1  -4  -4
12 S   -3  -5  -1  -3  -3  -5  -5   7  -7  -9  -9  -3  -8  -9  -5  -2  -4  -8  -9  -9
13 F   -2  -7  -7  -7  -7  -7  -7  -6  -4   0  -1  -6   0   2   7  -3  -3   0  -3   3
14 M    2  -1  -2   2  -6   0   1   0  -1  -2  -4  -2  -1  -6   4   0   0  -6  -5  -3
15 P    2   1  -3   0  -3  -1   0   3  -5  -3  -3  -1   2  -6   4  -1  -2  -6  -6  -3
16 R   -1  -2  -3   0  -5  -2   1  -2  -1  -3   1  -2   6   4  -1  -1  -2  -5   0  -3
17 K   -2   3   1  -2  -4   2  -4  -5   0   2   2  -1   6  -2  -5  -3  -3  -6  -2  -1
18 P   -1   0  -1   3  -3   1   1  -3  -2   4  -1  -1  -3  -1  -3  -1  -1  -5   0   1
19 A    3   1  -3  -2  -3  -2  -2  -3   7  -6  -3   0   0   0  -5  -1  -2   1  -1  -4
20 V    1  -1  -3  -5   0   0  -2  -3  -2   1   0  -2   0   2  -3  -2   0  -2   0   4
21 T   -1   2  -5  -2  -4   0   6  -6  -4  -5  -2  -2  -1  -7  -4  -2  -1  -4  -4  -4
22 S    2   3   0  -1  -3   1   0  -2   0  -2   0   0  -2  -3  -2   2  -1  -5  -1  -2
23 L    2  -2  -2  -4  -1  -4  -3   0   2  -1  -1  -6  -1   7  -4  -2  -2  -2   1  -1
24 K    2   0  -2  -2   2  -2  -3   2   0  -2   0  -2  -1  -2  -4   0   1   5   0   0
25 P    3   0  -2  -1  -4   0   0  -1  -2  -2  -2   0  -3  -2   3   1   0  -5  -4   0
26 I    3   0  -1   1  -2   0   0   1   1  -2  -1   0  -2  -4   1   1   0  -2  -4  -2
27 P    1   1  -1   0  -3   1   0  -1   0  -2   0   0  -1  -2   1   1   0   4  -2  -1
28 N    1   1   0   0  -3   0  -1   3   0  -3  -2   0  -2  -2   2   0  -1  -3  -2  -1
29 V    0   0  -2   0  -1   0   0  -1   0   0   1  -1   0   0   1   0   0   3  -1   1
30 G    1   0   0   0  -3  -1  -1   1   4  -3  -2  -1  -3  -2   4   0  -1  -4  -3  -1
31 E    1   1  -1   0  -2   0   1  -1   0  -1  -1   0  -2   1   1   0   1  -2  -1  -1
32 A    1   1  -2   0  -2   0   3  -2  -1  -1   0   0  -1  -3  -1   1   0  -4  -2   1
33 L    0   2  -1  -1  -2   1   0  -2   5  -2   0  -1   0  -1   1   0   0  -2  -1  -1
34 F    0  -1  -1  -2   0   0   0  -1   1   0   0  -2   0   3   1  -1  -1  -3   0   1
35 G    0   0  -1  -1  -1   1   3   0   4  -2  -2  -1  -2  -2   1   0   0  -2  -2  -1
36 L    1   1  -1   0  -3   0   0  -1   1  -1  -1   0  -1   1   1   0   0  -1   1   0
37 K    1   0  -1   0  -2   0   2  -1  -1  -2  -2   0  -2   3   1   0  -1  -3  -1  -2
38 S    2   0  -1   0  -1   0   0   0   0  -3  -2  -1  -2   1   1   2   0  -4  -1  -1
39 A    3   0  -1  -1  -4  -1  -1   0  -3  -2  -2  -1  -3   2   2   0   1  -4  -2  -1
40 N    2   1   0   0  -2  -1   0   0   0  -2  -2  -1  -3  -3   3   1   0   0  -2  -1
41 G    2   0   0   0  -2   0   0   0  -1  -1  -2   0  -1  -1   2   1   1  -4  -2   0
42 G    2   0  -1  -1  -2  -1   1   1  -1  -2  -2  -1  -3  -4   2   2   0  -2  -4  -1
43 K    1   1   0   1  -3   0   1   0   0  -2  -1   0  -1  -3   2   0  -1  -4  -3   0
44 V    1   0  -1   1  -3   0   1  -1  -1   0  -1  -1  -1  -1   1   0   1  -1  -2   1
45 T    1   0  -1   0  -3  -1   0   1  -1  -2  -2   0  -2  -2   2   1   2  -4  -3   0
46 C    1  -1  -2   2  -1  -1   1   1  -1  -2  -2  -1  -2  -3   3   0   0  -3  -4  -1
47 M    1  -2  -1   2  -4  -1   0   1  -1  -2  -2  -2   4  -3   1  -1   0  -5  -3   0
48 A    1   0  -1   1  -3   2   2   0  -2  -3  -3   0  -2  -2   1   0   1  -4  -3  -1
49 S    1  -1   0  -1  -3  -1   1   1  -2  -3  -3   0  -1  -3   3   2   3  -5  -3  -1
50 Y    1  -1  -3  -2   1  -1  -2  -1   4  -1  -2  -1  -2   5  -2  -3  -3  -1   4   0
51 K   -1   2   0   0  -4   2   2  -4  -1  -3  -3   3  -2  -4  -2   0   3  -2  -3  -2
52 V   -1  -7  -7  -7  -2  -7  -7  -6  -4   4   0  -7  -2   0  -4  -5  -4  -7  -4   6
53 K   -2   2  -1  -3  -3   0   1  -6  -2  -3  -3   1  -3  -4  -4   0   5  -7  -3   0
54 L   -4  -8  -8  -5  -2  -7  -6  -8  -3   5   3  -8  -1   4  -6  -7  -6  -7  -5   4
55 I    1   1   0  -1  -2   1   0  -3   3   1  -1   1  -1  -2  -3   0   1  -2  -1   0
56 T   -2   1   1  -1  -2  -1  -2  -2   0   1   0   0  -1   3   1  -1   0  -1   0   0
57 P   -1   0   1   3  -5   1   1  -1  -1  -4  -1  -1  -2  -3   1   3   1  -5  -3  -3
58 D   -2   0   1   2  -6  -1  -2   5  -5  -4  -5  -1  -4  -4   1  -2  -3  -6  -4  -5
59 G   -1   2   0   0  -4   2   1   1   1  -2  -2   2  -2  -2  -2   0   0  -2  -1  -2
60 P   -1   0   1   1  -2   1   2   1   0  -1  -2   0  -2  -3  -1   0   1  -4  -2   0
61 I    0   1  -1  -2  -1   0  -1  -3   2   1   0   1   0   0  -2  -1   0  -1   2   1
62 E   -1   1  -2  -1  -1   1   3  -4   0  -1  -3  -2  -2  -3  -2   2   3  -5  -3   0
63 F   -2  -3  -6  -2  -1  -4  -5  -5  -5   3   1  -4  -1   5  -6  -4  -2   3   1   3
64 D    0   0  -1   2  -2   2   3  -3   1  -3  -2   0  -1  -2   1   0   1   0  -1  -1
65 C    2  -4  -2  -4   5  -4  -4  -2  -3   0  -1  -4   1  -1  -2  -2  -1   1  -2   4
66 P    0   1   1   2   0   0   1   0  -1  -3  -3   1  -2  -4   4   0  -1  -2  -2  -3
67 D    1   0  -1   1   1   0   2   0  -1  -3  -4   0  -2  -3   3   0  -1  -5  -3  -1
68 N   -2  -2   1   3  -6   0   1   5   0  -6  -5  -2  -2  -6  -3  -1  -1  -6  -2  -4
69 V   -1   1  -2   1  -1   3   4  -2  -1  -2  -2   1  -1  -3  -2  -1   2  -5  -2  -1
70 Y   -2   0   3   0  -1  -3  -2  -3  -1  -2  -3  -1  -2  -2   0   3   4  -1   2  -2
71 I   -2  -5  -6  -6  -4  -5  -2  -6  -6   4   4  -5   1   0  -6  -5  -4   3  -4   2
72 L   -2  -1  -5  -5   0  -1  -4  -3   0   0   5  -4   1   0  -5  -2  -1   1   0   0
73 D   -1   0   1   4  -4   1   3  -2   1  -2  -2   0  -1  -1  -3   0   0  -4  -1  -2
74 Q    3  -1  -1  -2   0   0  -1  -1   0   0  -1  -1   0  -1  -1   1  -1  -4   0   1
75 A    4  -7  -7  -7   1  -3  -4  -1  -7   0   3  -6   2  -2  -7  -1  -4  -7  -6   0
76 E   -1   3  -3  -2  -6   1   4  -4  -1   0   2   0   0  -3  -4  -3  -3  -1  -2  -2
77 E    1   4  -1   2  -6   1   3  -2   0  -4  -3   1  -2  -3  -4   0  -2  -2  -3  -4
78 A    4  -3   3  -3   0   3   0  -2   5  -4  -1  -2  -3  -4  -8   0  -3  -1  -4   0
79 G   -3  -1   1   0  -9  -2  -3   6   0  -9  -4  -1  -3  -3  -4  -4  -4  -9  -3  -5
80 H   -2  -3  -3  -3  -1  -4  -3  -4  -1   5   2  -5   0  -1  -1  -3  -4  -1   0   4
81 D    0   0   0   3  -1   1   1  -1   3  -2  -4  -1  -1  -1   3  -1  -1  -1   0  -2
82 L   -2  -3  -2  -4  -1  -3  -3  -8   1   4   3  -4   1   0   0  -3  -2   1  -2   3
83 P   -2   1   0   0   0  -2   1  -1   0  -3  -2  -1   1  -2   5  -2  -3   0   0  -3
84 Y    1  -2   0  -3   0  -2  -4  -3   4  -3  -4  -2  -1   2  -3   3  -1   2   5  -2
85 S    0   0   0   0   2   0   0  -1   1   0  -1   0   1   0   0   0   0  -2   1   0
86 C   -4  -6  -5  -5  11  -5   0   0  -5  -5  -5  -5  -5  -6  -5   0  -5  -5  -5  -5
87 R    1   4  -1  -2   1   0  -1   3   1  -4  -3   0  -1  -2  -4  -1  -1   2  -1  -3
88 A    1  -1   1  -1   2   0   0   3   0  -2  -3  -2   2  -4  -4   1  -1  -2  -3  -2
89 G   -2  -7  -3  -4  -7  -4  -5   7  -3  -2  -8  -4  -7  -1  -7  -3  -7   3  -7  -4
90 S    2  -1   0  -2   1  -1  -2   0  -1   1  -1  -2   0  -1  -4   1   2   3  -1   1
91 C   -7  -9  -8  -2  12  -8  -9  -8  -8  -7  -7  -8   2  -8  -8  -2  -7  -8  -2  -7
92 S    0   1  -2  -4   2  -1  -2   5   1  -3  -5  -2  -1  -4  -3   1  -1  -2  -4  -4
93 S    1  -1  -2  -3   0  -1   0   0  -3  -2  -2   0   0  -4  -5   2   4  -6  -3  -1
94 C   -6  -8  -8  -3  11  -1  -8  -8  -8  -7  -2  -8  -7  -8  -8  -1  -2  -8  -8  -7
95 A    0   2  -3  -2   0   1   0  -2   2   0   0   3   1  -1  -1  -1   0   1  -1   0
96 G    1  -2  -4  -5   4  -1  -2   0   0   1  -1  -2   1  -1  -5  -1   1  -5  -1   4
97 K   -2   3  -1  -1  -4   1   1  -1   1  -1  -2   2   1  -1   0  -1   0   3   0  -1
98 I   -2  -2  -5  -5   2  -2  -5  -3  -1   2   3   0   0  -1  -2  -4  -2   1  -1   4
99 A   -1   1  -2  -1  -1   0   0  -3  -1   2   2   0   0  -1  -2  -1   1  -1  -2   2
100 G    0  -2   0   2  -1   0   3   0   0  -5  -4   1  -4  -2  -2   3  -1  -1  -2  -3
101 G   -2  -3  -2  -2  -6  -2  -3   7  -6  -7  -5  -3  -6  -2  -3  -3  -2  -6  -3  -4
102 A    0   0   0   1  -1   1   4  -2  -1  -2  -3   1  -2  -3   0   0   1   0  -4  -2
103 V   -1  -5  -4  -3  -5  -2  -3  -4  -2   2  -2  -3  -1  -1   4  -2  -2  -2   0   5
104 D   -1   2   1   4  -2   0   2  -2   1  -2  -3   0  -4  -3  -1   0   1  -1  -2  -2
105 Q   -1  -1  -1   1  -1   2   0  -3   5  -3   0  -1   3  -2   0  -1  -1  -2   2  -2
106 T    0   3  -1   1  -4   0   1   0   1  -1  -1   0  -2  -3   1   1   0  -4  -2  -2
107 D   -1   0  -1   4  -3  -1   3   0   1  -3  -3   0  -1  -3   0   0  -1  -1  -2  -2
108 G    0   1   1   0  -1   1   0   0   1  -1  -1   0   1  -2   1   0   0   0   0  -1
109 N   -1   0   0   1  -1   1   1   0   0  -1  -2  -1   0   1   2   0   0  -3   1  -1
110 F    1  -1   0  -1   0  -1  -1   1   0   0   1  -1   0   1  -1  -1   0   0   0   0
111 L   -1  -2  -2  -2   0  -2  -2  -3  -1   1   4  -3   0   0  -2  -1   0   0  -2   0
112 D   -1   0  -1   2  -5  -1   3  -2  -1  -3  -3   1  -1  -3   0   2   2  -5  -2  -3
113 D    1   0  -1   3   0   0   3  -1  -1  -3  -3   0  -1  -5   2   0  -1  -1  -1  -2
114 D    1   0  -2   3  -1   0   4  -3   0  -1  -3   0  -2  -2  -1  -1  -1  -1  -1  -3
115 Q   -3   1  -3   3  -2   1   5   0   0  -3  -1   0   0  -2  -1  -4  -3  -1  -2  -4
116 L    1   2  -1  -1  -2   0   0  -2   1   1   1   1   1  -1  -1  -2  -2  -1  -2   1
117 E    2   0  -1   2  -6   1   3  -1  -2  -3  -3   0  -3  -6   1   0   0  -6  -5  -3
118 E    1   0   2   2  -2   2   2  -1   0  -4  -4   1  -1  -3   1   0  -2  -6  -3  -4
119 G   -3   0   3   2  -6  -1  -2   5   0  -6  -6  -1  -6  -6  -3  -2  -1  -6  -2  -4
120 W   -3   0  -3  -3   1   0   1  -4   0   0  -1   0   1   1  -4   0  -1   4   5   0
121 V    0   5  -7  -8   1  -3  -5  -5  -3   4  -2  -4   3   0  -5  -5  -1  -8  -3   3
122 L   -3  -3  -4  -9   0  -1  -8  -9   0  -3   6  -5   4  -3  -5  -8  -2  -3  -3  -4
123 T    4  -6  -6  -7  -1  -6  -6  -1  -7   1   1  -6   1  -3   1   1   2  -7  -4  -2
124 C   -8 -10 -10  -3  12 -10 -10 -10 -10  -9  -9 -10  -9 -10 -10  -4  -8 -10 -10  -9
125 V   -3   0  -3  -5   6   6  -4  -5  -3   0  -4  -2   1  -4  -7  -1  -2  -8  -7   3
126 A    3  -4  -2  -7   5  -6  -5  -2  -2  -2  -3  -6  -1  -4  -7   4   3  -8  -3   0
127 Y   -1   5  -3  -5  -2   0  -2  -4   1  -1  -2   2  -2   0  -2  -2   1  -1   3   1
128 P    3  -8  -8  -8   1  -7  -6  -4  -8   0  -2  -7  -3  -4   6  -1  -4  -9  -8   3
129 Q    0   2  -1  -1   0   0   0  -3  -1  -1   1   2   0  -2  -3  -1   1  -3  -2   1
130 S   -2  -4  -2   0  -3  -2   1   3   0  -8  -8  -2  -3  -8  -4   5   2  -8  -7  -6
131 D   -2  -2   1   7  -8  -4   0   1  -1  -8  -9  -3  -8  -9   2  -2  -3  -9  -8  -8
132 V   -2  -4  -7  -7   4  -6  -5  -4  -7   3   4  -5   5  -3  -7  -5  -3  -6  -3   4
133 T   -3  -1  -3  -2  -6  -2   3  -5  -1   0  -3   0  -3  -6  -6  -1   3  -1  -3   4
134 I   -5  -7  -8  -8  -2  -7  -8  -6  -8   5   3  -6   0  -1  -7  -7  -4  -7  -6   5
135 E   -2   2  -2   4  -4   1   5  -6  -1  -5  -4   0  -6  -2  -6  -1  -2  -7  -2  -1
136 T    0  -4  -6  -6  -2  -5  -6  -6  -6   3   3  -5  -1   1  -3  -2   2  -2  -3   2
137 H   -2  -1  -1   1  -5   0   0  -1   3  -1  -1  -2  -4  -1   5  -1  -1  -5  -1  -3
138 K    0  -2  -1   2  -2   1   3  -2  -2  -3  -4   0  -4  -3   2   1   0  -5   2  -1
139 E    0   0  -1   2  -3   1   5  -3  -1  -3  -2  -1  -2  -1   0  -1  -2  -5   1  -3
140 A    0  -1  -2   4  -5  -1   3  -2  -1  -3  -5  -3  -5  -3   3   3  -2  -2  -5  -3
141 E    0   3  -2   2  -6  -1   6  -4  -4  -6  -3  -2  -2  -6  -4  -2  -2  -6  -3  -2
142 L   -4  -3  -6  -6  -4  -5  -3  -6  -5   3   4  -2   2   1  -5  -5  -3  -4  -1   3
143 V    2  -2  -3  -1  -3  -1  -2  -3  -1   2   2  -2  -1   2  -2  -1  -1   2  -2   2
144 G    0  -3  -2  -3  -4  -3  -3   5  -3  -5  -5  -3  -4  -5  -3   5  -2  -5  -4  -4