examples/testdata/simplegff3.gff

   1 ##gff-version 2
   2 ##source-version exonerate:protein2genome:local 2.2.0
   3 ##date 2015-01-16
   4 ##type DNA
   5 #
   6 #
   7 # seqname source feature start end score strand frame attributes
   8 #
   9 seq1    exonerate:protein2genome:local  gene    8       11      3652    -       .       gene_id 0 ; sequence seq2 ; gene_orientation .
  10 seq1    exonerate:protein2genome:local  cds     9       11      .       -       .
  11 seq1    exonerate:protein2genome:local  exon    9       11      .       -       .       insertions 3 ; deletions 6
  12 seq1    exonerate:protein2genome:local  similarity      8       11      3652    -       .       alignment_id 0 ; Query seq2 ; Align 11 1 3
  13 ##FASTA
  14 >seq1
  15 ACTACGACACGACGACGACGACG
  16 >seq2
  17 CDEQEATGTQDAQEQAQC
  18
  19