examples/testdata/test_fts_data_columns.conf

   1 uniprot_data_columns
   2 #
   3 _group.id
   4 _group.name
   5 _group.sort_order
   6 g1;Quality Measures;3
   7 g2;Cross References;2
   8 g3;Names & Taxonomy;1
   9 g4;Procedures & Softwares;4
  10 g5;Date Of;5
  11 g6;Miscellenous;6
  12 g7;Sequences;7
  13 g8;Function;8
  14 g9;Interaction;9
  15 g10;Expression;10
  16 g11;Gene Ontology;11
  17 g12;Pathology & Biotech;12
  18 g13;Subcellular location;13
  19 g14;PTM / Processing;14
  20 g15;Structure;15
  21 g16;Publications;16
  22 g17;Date of;17
  23 g18;Family & Domain;18
  24 #
  25 _data_column.primary_key;entry name
  26 _data_column.default_response_page_size;100
  27 #
  28 _data_column.name
  29 _data_column.code
  30 _data_column.group_id
  31 _data_column.data_type
  32 _data_column.min_col_width
  33 _data_column.max_col_width
  34 _data_column.preferred_col_width
  35 _data_column.is_shown_by_default
  36 _data_column.is_searchable
  37 Entry Name;entry name;String;g3;80;100;85;true;true
  38 Protein names;protein names;String;g3;300;1500;500;true;true
  39 Gene Names;genes;String;g3;50;1000;95;true;true
  40 Organism;organism;String;g3;50;1000;95;true;true
  41 Organism ID;organism-id;int;g3;60;100;80;false;true
  42 Proteomes;proteome;String;g3;50;1000;95;false;true
  43 Taxonomic lineage (ALL);lineage(ALL);String;g3;50;400;95;false;false
  44 Virus hosts;virus hosts;String;g3;50;1000;95;false;true
  45 Fragment;fragment;String;g7;50;1000;95;false;true
  46 Gene encoded by;encodedon;String;g7;50;1000;95;false;true
  47 Alternative products (isoforms);comment(ALTERNATIVE PRODUCTS);String;g7;50;1000;95;false;false
  48 Erroneous gene model prediction;comment(ERRONEOUS GENE MODEL PREDICTION);String;g7;50;1000;95;false;false
  49 Erroneous initiation;comment(ERRONEOUS INITIATION);String;g7;50;1000;95;false;false
  50 Erroneous translation;comment(ERRONEOUS TRANSLATION);String;g7;50;1000;95;false;false
  51 Frameshift;comment(FRAMESHIFT);String;g7;50;1000;95;false;false
  52 Mass spectrometry;comment(MASS SPECTROMETRY);String;g7;50;1000;95;false;false
  53 Polymorphism;comment(POLYMORPHISM);String;g7;50;1000;95;false;false
  54 RNA editing;comment(RNA EDITING);String;g7;50;1000;95;false;false
  55 Sequence caution;comment(SEQUENCE CAUTION);String;g7;50;1000;95;false;false
  56 Length;length;int;g7;50;100;95;false;true
  57 Mass;mass;String;g7;50;100;80;false;true
  58 Sequence;sequence;String;g7;50;1000;95;false;true
  59 Alternative sequence;feature(ALTERNATIVE SEQUENCE);String;g7;50;1000;95;false;false
  60 Natural variant;feature(NATURAL VARIANT);String;g7;50;1000;95;false;false
  61 Non-adjacent residues;feature(NON ADJACENT RESIDUES);String;g7;50;1000;95;false;false
  62 Non-standard residue;feature(NON STANDARD RESIDUE);String;g7;50;1000;95;false;false
  63 Non-terminal residue;feature(NON TERMINAL RESIDUE);String;g7;50;1000;95;false;false
  64 Sequence conflict;feature(SEQUENCE CONFLICT);String;g7;50;1000;95;false;false
  65 Sequence uncertainty;feature(SEQUENCE UNCERTAINTY);String;g7;50;1000;95;false;false
  66 Version (Sequence);version(sequence);String;g7;50;1000;95;false;false
  67 EC number;ec;String;g8;50;1000;95;false;true
  68 Absorption;comment(ABSORPTION);String;g8;50;1000;95;false;false
  69 Catalytic activity;comment(CATALYTIC ACTIVITY);String;g8;50;1000;95;false;false
  70 Cofactor;comment(COFACTOR);String;g8;50;1000;95;false;false
  71 Enzyme regulation;comment(ENZYME REGULATION);String;g8;50;1000;95;false;false
  72 Function [CC];comment(FUNCTION);String;g8;50;1000;95;false;false
  73 Kinetics;comment(KINETICS);String;g8;50;1000;95;false;false
  74 Pathway;comment(PATHWAY);String;g8;50;1000;95;false;false
  75 Redox potential;comment(REDOX POTENTIAL);String;g8;50;1000;95;false;false
  76 Temperature dependence;comment(TEMPERATURE DEPENDENCE);String;g8;50;1000;95;false;false
  77 pH dependence;comment(PH DEPENDENCE);String;g8;50;1000;95;false;false
  78 Active site;feature(ACTIVE SITE);String;g8;50;1000;95;false;false
  79 Binding site;feature(BINDING SITE);String;g8;50;1000;95;false;false
  80 DNA binding;feature(DNA BINDING);String;g8;50;1000;95;false;false
  81 Metal binding;feature(METAL BINDING);String;g8;50;1000;95;false;false
  82 Nucleotide binding;feature(NP BIND);String;g8;50;1000;95;false;false
  83 Site;feature(SITE);String;g8;50;1000;95;false;false
  84 Annotation;annotation score;String;g6;50;1000;95;false;true
  85 Features;features;String;g6;50;1000;95;false;true
  86 Caution;comment(CAUTION);String;g6;50;1000;95;false;false
  87 Miscellaneous [CC];comment(GENERAL);String;g6;50;1000;95;false;false
  88 Keywords;keywords;String;g6;50;1000;95;false;true
  89 Protein existence;existence;String;g6;50;1000;95;false;true
  90 Status;reviewed;String;g6;50;1000;95;false;true
  91 ALL;entry name;String;g7;50;1000;95;false;true;
  92 Subunit structure [CC];comment(SUBUNIT);String;g9;50;1000;95;false;false
  93 Interacts with;interactor;String;g9;50;1000;95;false;true
  94 Developmental stage;comment(DEVELOPMENTAL STAGE);String;g10;50;1000;95;false;false
  95 Induction;comment(INDUCTION);String;g10;50;1000;95;false;false
  96 Tissue specificity;comment(TISSUE SPECIFICITY);String;g10;50;1000;95;false;false
  97 Gene ontology (GO);go;String;g11;50;1000;95;false;true
  98 Gene ontology (biological process);go(biological process);String;g11;50;1000;95;false;false
  99 Gene ontology (molecular function);go(molecular function);String;g11;50;1000;95;false;false
 100 Gene ontology (cellular component);go(cellular component);String;g11;50;1000;95;false;false
 101 Gene ontology IDs;go-id;String;g11;50;1000;95;false;true
 102 Allergenic properties;comment(ALLERGEN);String;g12;50;1000;95;false;false
 103 Biotechnological use;comment(BIOTECHNOLOGY);String;g12;50;1000;95;false;false
 104 Disruption phenotype;comment(DISRUPTION PHENOTYPE);String;g12;50;1000;95;false;false
 105 Involvement in disease;comment(DISEASE);String;g12;50;1000;95;false;false
 106 Pharmaceutical use;comment(PHARMACEUTICAL);String;g12;50;1000;95;false;false
 107 Toxic dose;comment(TOXIC DOSE);String;g12;50;1000;95;false;false
 108 Subcellular location [CC];comment(SUBCELLULAR LOCATION);String;g13;50;1000;95;false;false
 109 Intramembrane;feature(INTRAMEMBRANE);String;g13;50;1000;95;false;false
 110 Topological domain;feature(TOPOLOGICAL DOMAIN);String;g13;50;1000;95;false;false
 111 Transmembrane;feature(TRANSMEMBRANE);String;g13;50;1000;95;false;false
 112 Post-translational modification;comment(PTM);String;g14;50;1000;95;false;false
 113 Chain;feature(CHAIN);String;g14;50;1000;95;false;false
 114 Cross-link;feature(CROSS LINK);String;g14;50;1000;95;false;false
 115 Disulfide bond;feature(DISULFIDE BOND);String;g14;50;1000;95;false;false
 116 Glycosylation;feature(GLYCOSYLATION);String;g14;50;1000;95;false;false
 117 Initiator methionine;feature(INITIATOR METHIONINE);String;g14;50;1000;95;false;false
 118 Lipidation;feature(LIPIDATION);String;g14;50;1000;95;false;false
 119 Modified residue;feature(MODIFIED RESIDUE);String;g14;50;1000;95;false;false
 120 Peptide;feature(PEPTIDE);String;g14;50;1000;95;false;false
 121 Propeptide;feature(PROPEPTIDE);String;g14;50;1000;95;false;false
 122 Signal peptide;feature(SIGNAL);String;g14;50;1000;95;false;false
 123 Transit peptide;feature(TRANSIT);String;g14;50;1000;95;false;false
 124 3D;3d;String;g15;50;1000;95;false;false
 125 Beta strand;feature(BETA STRAND);String;g15;50;1000;95;false;false
 126 Helix;feature(HELIX);String;g15;50;1000;95;false;false
 127 Turn;feature(TURN);String;g15;50;1000;95;false;false
 128 PubMed ID;citation;String;g16;50;1000;95;false;true
 129 Date of creation;created;String;g17;80;150;100;true;true
 130 Date of last modification;last-modified;String;g17;80;150;100;true;true
 131 Date of last sequence modification;sequence-modified;String;g17;80;150;100;false;true
 132 Version (entry);version(entry);int;g17;80;100;80;false;false
 133 Domain [CC];comment(DOMAIN);String;g18;80;1000;95;false;false
 134 Sequence similarities;comment(SIMILARITY);String;g18;50;1000;95;false;false
 135 Protein families;families;String;g18;50;1000;95;false;true
 136 Coiled coil;feature(COILED COIL);String;g18;50;1000;95;false;false
 137 Compositional bias;feature(COMPOSITIONAL BIAS);String;g18;50;1000;95;false;false
 138 Domain [FT];feature(DOMAIN EXTENT);String;g18;50;1000;95;false;false
 139 Motif;feature(MOTIF);String;g18;50;1000;95;false;false
 140 Region;feature(REGION);String;g18;50;1000;95;false;false
 141 Repeat;feature(REPEAT);String;g18;50;1000;95;false;false
 142 Zinc finger;feature(ZINC FINGER);String;g18;50;1000;95;false;false
 143 Cross-reference (EMBL);database(EMBL);String;g2;50;1000;95;false;false
 144 Cross-reference (PDB);database(PDB);String;g2;50;1000;95;false;false
 145 Cross-reference (ENSEMBL);database(ENSEMBL);String;g2;50;1000;95;false;false
 146 Cross-reference (PFAM);database(PFAM);String;g2;50;1000;95;false;false
 147 Cross-reference (RFAM);database(RFAM);String;g2;50;1000;95;false;false
 148 Cross-reference (CATH);database(CATH);String;g2;50;1000;95;false;false
 149 Cross-reference (SCOPE);database(SCOPE);String;g2;50;1000;95;false;false
 150 Cross-reference (GO);database(GO);String;g2;50;1000;95;false;false
 151 Cross-reference (INTERPRO);database(INTERPRO);String;g2;50;1000;95;false;false
 152 Mapped PubMed ID;citationmapping;String;g16;50;1000;95;false;true
 153 #