forester/archive/RIO/IMPORTANT_NOTICE

   1 RIO - Phylogenomic Protein Function Analysis
   2 ----------------------------------------------------------------
   3
   4
   5 RIO contains modified versions of programs written by others:
   6
   7 1. TREE-PUZZLE
   8    (Strimmer, K., and A. von Haeseler. 1996. Quartet puzzling: A quartet maximum
   9     likelihood method for reconstructing tree topologies. Mol. Biol. Evol. 13: 964-969.)
  10
  11
  12 2. PHYLIP
  13    (Felsenstein, J. 1993. PHYLIP (Phylogeny Inference Package) version 3.5c.
  14     Distributed by the author.
  15     Department of Genetics, University of Washington, Seattle.)
  16
  17
  18 Please note:
  19 ------------
  20
  21 1.  RIO uses modifications of these programs, the original versions were
  22     written by others:
  23
  24     TREE-PUZZLE: Heiko A. Schmidt, Korbinian Strimmer, Martin Vingron, Arndt von Haeseler
  25
  26     PHYLIP: Joseph Felsenstein, see also http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/credits.html
  27
  28
  29 2.  The programs in the RIO distribution have been modified specifically
  30     to work within RIO and cannot be used for any other purpose.
  31
  32
  33 3.  I am responsible for any accidentally introduced errors.
  34
  35
  36 4.  The original can be downloaded from the following sites:
  37     TREE-PUZZLE: http://www.tree-puzzle.de/
  38     PHYLIP: http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html
  39
  40
  41 RIO also contains hmmer (version 2.2g).
  42 hmmer can be downloaded at: http://hmmer.wustl.edu/
  43
  44
  45
  46 Christian Zmasek, 03/09/02
  47
  48