forester/archive/RIO/others/hmmer/squid/Formats/gcgdata.1

   1 >>>>104K_THEPA  8/92  ASCII  Len: 924
   2 P15711 theileria parva. 104 kd microneme-rhoptry antigen. 8/92
   3 MKFLILLFNILCLFPVLAADNHGVGPQGASGVDPITFDINSNQTGPAFLTAVEMAGVKYLQVQHGSNVNIHRLVEGNVVIWENASTPLYTGAIVTNNDGPYMAYVEVLGDPNLQFFIKSGDAWVTLSEHEYLAKLQEIRQAVHIESVFSLNMAFQLENNKYEVETHAKNGANMVTFIPRNGHICKMVYHKNVRIYKATGNDTVTSVVGFFRGLRLLLINVFSIDDNGMMSNRYFQHVDDKYVPISQKNYETGIVKLKDYKHAYHPVDLDIKDIDYTMFHLADATYHEPCFKIIPNTGFCITKLFDGDQVLYESFNPLIHCINEVHIYDRNNGSIICLHLNYSPPSYKAYLVLKDTGWEATTHPLLEEKIEELQDQRACELDVNFISDKDLYVAALTNADLNYTMVTPRPHRDVIRVSDGSEVLWYYEGLDNFLVCAWIYVSDGVASLVHLRIKDRIPANNDIYVLKGDLYWTRITKIQFTQEIKRLVKKSKKKLAPITEEDSDKHDEPPEGPGASGLPPKAPGDKEGSEGHKGPSKGSDSSKEGKKPGSGKKPGPAREHKPSKIPTLSKKPSGPKDPKHPRDPKEPRKSKSPRTASPTRRPSPKLPQLSKLPKSTSPRSPPPPTRPSSPERPEGTKIIKTSKPPSPKPPFDPSFKEKFYDDYSKAASRSKETKTTVVLDESFESILKETLPETPGTPFTTPRPVPPKRPRTPESPFEPPKDPDSPSTSPSEFFTPPESKRTRFHETPADTPLPDVTAELFKEPDVTAETKSPDEAMKRPRSPSEYEDTSPGDYPSLPMKRHRLERLRLTTTEMETDPGRMAKDASGKPVKLKRSKSFDDLTTVELAPEPKASRIVVDDEGTEADDEETHPPEERQKTEVRRRRPPKKPSKSPRPSKPKKPKKPDSAYIPSILAILVVSLIVGIL
   4 >>>>10KD_VIGUN  2/95  ASCII  Len: 75
   5 P18646 vigna unguiculata (cowpea). 10 kd protein precursor (clone psas10). 2/95
   6 MEKKSIAGLCFLFLVLFVAQEVVVQSEAKTCENLVDTYRGPCFTTGSCDDHCKNKEHLLSGRCRDDVRCWCTRNC
   7 >>>>110K_PLAKN  2/94  ASCII  Len: 296
   8 P13813 plasmodium knowlesi. 110 kd antigen (pk110) (fragment). 2/94
   9 FNSNMLRGSVCEEDVSLMTSIDNMIEEIDFYEKEIYKGSHSGGVIKGMDYDLEDDENDEDEMTEQMVEEVADHITQDMIDEVAHHVLDNITHDMAHMEEIVHGLSGDVTQIKEIVQKVNVAVEKVKHIVETEETQKTVEPEQIEETQNTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQNTVEPEQIEETQKTVEPEQTEEAQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQKTVEPEQTEETQNTVEPEPTQETQNTVEP
  10 >>>>11S3_HELAN  2/94  ASCII  Len: 493
  11 P19084 helianthus annuus (common sunflower). 11s globulin seed storage protein g3 precursor (helianthinin g3). 2/94
  12 MASKATLLLAFTLLFATCIARHQQRQQQQNQCQLQNIEALEPIEVIQAEAGVTEIWDAYDQQFQCAWSILFDTGFNLVAFSCLPTSTPLFWPSSREGVILPGCRRTYEYSQEQQFSGEGGRRGGGEGTFRTVIRKLENLKEGDVVAIPTGTAHWLHNDGNTELVVVFLDTQNHENQLDENQRRFFLAGNPQAQAQSQQQQQRQPRQQSPQRQRQRQRQGQGQNAGNIFNGFTPELIAQSFNVDQETAQKLQGQNDQRGHIVNVGQDLQIVRPPQDRRSPRQQQEQATSPRQQQEQQQGRRGGWSNGVEETICSMKFKVNIDNPSQADFVNPQAGSIANLNSFKFPILEHLRLSVERGELRPNAIQSPHWTINAHNLLYVTEGALRVQIVDNQGNSVFDNELREGQVVVIPQNFAVIKRANEQGSRWVSFKTNDNAMIANLAGRVSASAASPLTLWANRYQLSREEAQQLKFSQRETVLFAPSFSRGQGIRASR
  13 >>>>11SB_CUCMA  11/90  ASCII  Len: 480
  14 P13744 cucurbita maxima (pumpkin) (winter squash). 11s globulin beta subunit precursor. 11/90
  15 MARSSLFTFLCLAVFINGCLSQIEQQSPWEFQGSEVWQQHRYQSPRACRLENLRAQDPVRRAEAEAIFTEVWDQDNDEFQCAGVNMIRHTIRPKGLLLPGFSNAPKLIFVAQGFGIRGIAIPGCAETYQTDLRRSQSAGSAFKDQHQKIRPFREGDLLVVPAGVSHWMYNRGQSDLVLIVFADTRNVANQIDPYLRKFYLAGRPEQVERGVEEWERSSRKGSSGEKSGNIFSGFADEFLEEAFQIDGGLVRKLKGEDDERDRIVQVDEDFEVLLPEKDEEERSRGRYIESESESENGLEETICTLRLKQNIGRSVRADVFNPRGGRISTANYHTLPILRQVRLSAERGVLYSNAMVAPHYTVNSHSVMYATRGNARVQVVDNFGQSVFDGEVREGQVLMIPQNFVVIKRASDRGFEWIAFKTNDNAITNLLAGRVSQMRMLPLGVLSNMYRISREEAQRLKYGQQEMRVLSPGRSQGRRE
  16 >>>>120K_RICRI  10/94  ASCII  Len: 1299
  17 P14914 rickettsia rickettsii. 120 kd surface-exposed protein. 10/94
  18 MVIQSANATGQVNFRHIVDVGADGTTAFKTAASKVTITQDSNFGNTDFGNLAAQIKVPNAITLTGNFTGDASNPGNTAGVITFDANGTLESASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELRLGNAGSIFKLADGTVINGKVNQTALVGGALAAGTITLDGSATITGDIGNAGGAAALQRITLANDAKKTLTLGGANIIGAGGGTIDLQANGGTIKLTSTQNNIVVDFDLAIATDQTGVVDASSLTNAQTLTINGKIGTIGANNKTLGQFNIGSSKTVLSNGNVAINELVIGNDGAVQFAHDTYLITRTTNAAGQGKIIFNPVVNNGTTLAAGTNLGSATNPLAEINFGSKGVNVDTVLNVGEGVNLYATNITTTDANVGSFVFNAGGTNIVSGTVGGQQGNKFNTVALENGTTVKFLGNATFNGNTTIAANSTLQIGGNYTADCVASADGTGIVEFVNTGPITVTLNKEAAPVNALKQITVSGPGNVVINEIGNAGNHHGAVTDTIAFENSSLGAVVFLPRGIPFNDAGNTMPLTIKSTVGNKTAKGFDVPSVVVLGVDSVIADGQVIVDQNNIVGLGLGSDNGIIVNATTLYAGISTLNNNQGTVTLSGGVPNTPGTVYGLGTGIGASKFKQVTFTTDYNNLGNIIATNATINDGVTVTTGGIAGIGFDGKITLGSVNGNGNVRFADGILSNSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIGDSDTPVASVRFTGSDSGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGIVNSNIILGGGTTAINGKIDLVTNTLTFASGTSTWGNNTSIETTLTLANGNIGHIVILEGAQVNTTTTGTTTIKVQDNANANFSGTQTYTLIQGGARFNGTLGSPNFAVTGSNRFVNYSLIRAANQDYVITRTNNAENVVTNDIANSPFGGAPGVDQNVTTFVNATNTAAYNNLLLAKNSANSANFVGAIVTDTSAAITNVQLDLAKDIQAQLGNRLGALRYLGTPETAEMADLKLEHIGSVAAGDEAIDNVAYGIWAKPFYTDAHQSKKGGLAGYKAKTTGVVIGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDVNGFSFSLYGAQQLVKNFFAQGSAIFSLNQVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGNLTVGYDYNAMQGVLVTPMAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKVAGSTMNRTDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTPCINQPDRTTKTSYNLGLSASIRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF
  19 >>>>128U_DROME  2/94  ASCII  Len: 368
  20 P32234 drosophila melanogaster (fruit fly). gtp-binding protein 128up. 2/94
  21 MITILEKISAIESEMARTQKNKATSAHLGLLKANVAKLRRELISPKGGGGGTGEAGFEVAKTGDARVGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGCIKYKGAKIQLLDLPGIIEGAKDGKGRGRQVIAVARTCNLIFMVLDCLKPLGHKKLLEHELEGFGIRLNKKPPNIYYKRKDKGGINLNSMVPQSELDTDLVKTILSEYKIHNADITLRYDATSDDLIDVIEGNRIYIPCIYLLNKIDQISIEELDVIYKIPHCVPISAHHHWNFDDLLELMWEYLRLQRIYTKPKGQLPDYNSPVVLHNERTSIEDFCNKLHRSIAKEFKYALVWGSSVKHQPQKVGIEHVLNDEDVVQIVKKV
  22 >>>>12AH_CLOS4  8/91  ASCII  Len: 29
  23 P21215 clostridium sp. (strain c 48-50). 12-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (ec 1.1.1.176) (fragment). 8/91
  24 MIFDGKVAIITGGGKAKSIGYGIAVAYAK
  25 >>>>12KD_MYCLE  2/95  ASCII  Len: 156
  26 P15878 mycobacterium leprae. 12 kd protein. 2/95
  27 MNDIIALKFHISLNATTWIGRIGMVILPLLVYFITYRWCIGLQRSDRAVLEHGIETGIIKRLPHGAYIELHQPLGPVDDHGHPIPLEYQGTAVPKRMNKLGSAGSPSSGSFLFADPVSEDAALREATHVAEQRALTALREHQDSIASSPNGERGKH
  28 >>>>12S1_ARATH  4/90  ASCII  Len: 472
  29 P15455 arabidopsis thaliana (mouse-ear cress). 12s seed storage protein. 4/90
  30 MARVSSLLSFCLTLLILFHGYAAQQGQQGQQFPNECQLDQLNALEPSHVLKSEAGRIEVWDHHAPQLRCSGVSFARYIIESKGLYLPSFFNTAKLSFVAKGRGLMGKVIPGCAETFQDSSEFQPRFEGQGQSQRFRDMHQKVEHIRSGDTIATTPGVAQWFYNDGQQPLVIVSVFDLASHQNQLDRNPRPFYLAGNNPQGQVWLQGREQQPQKNIFNGFGPEVIAQALKIDLQTAQQLQNQDDNRGNIVRVQGPFGVIRPPLRGQRPQEEEEEEGRHGRHGNGLEETICSARCTDNLDDPSRADVYKPQLGYISTLNSYDLPILRFIRLSALRGSIRQNAMVLPQWNANANAILYETDGEAQIQIVNDNGNRVFDGQVSQGQLIAVPQGFSVVKRATSNRFQWVEFKTNANAQINTLAGRTSVLRGLPLEVITNGFQISPEEARRVKFNTLETTLTHSSGPASYGRPRVAAA
  31 >>>>12S2_ARATH  4/90  ASCII  Len: 455
  32 P15456 arabidopsis thaliana (mouse-ear cress). 12s seed storage protein. 4/90
  33 MGRVSSIISFSLTLLILFNGYTAQQWPNECQLDQLNALEPSQIIKSEGGRIEVWDHHAPQLRCSGFAFERFVIEPQGLFLPTFLNAGKLTFVVHGRGLMGRVIPGCAETFMESPVFGEGQGQGQSQGFRDMHQKVEHLRCGDTIATPSGVAQWFYNNGNEPLILVAAADLASNQNQLDRNLRPFLIAGNNPQGQEWLQGRKQQKQNNIFNGFAPEILAQAFKINVETAQQLQNQQDNRGNIVKVNGPFGVIRPPLRRGEGGQQPHEIANGLEETLCTMRCTENLDDPSDADVYKPSLGYISTLNSYNLPILRLLRLSALRGSIRKNAMVLPQWNVNANAALYVTNGKAHIQMVNDNGERVFDQEISSGQLLVVPQGFSVMKHRIGEQFEWIEFKTNENAQVNTLAGRTSVMRGLPLEVITNGYQISPEEAKRVKFSTIETTLTHSSPMSYGRPRA
  34 >>>>1433_DROME  12/92  ASCII  Len: 248
  35 P29310 drosophila melanogaster (fruit fly). 14-3-3-like protein. 12/92
  36 MSTVDKEELVQKAKLAEQSERYDDMAQAMKSVTETGVELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTEASARKQQLAREYRERVEKELREICYEVLGLLDKYLIPKASNPESKVFYLKMKGDYYRYLAEVATGDARNTVVDDSQTAYQDAFDISKGKMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDKACQLAKQAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEPQEGGDN
  37 >>>>1433_HORVU  2/94  ASCII  Len: 262
  38 P29305 hordeum vulgare (barley). 14-3-3-like protein. 2/94
  39 MSTAEATREENVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAKTADVGELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNEAYVASIKEYRTRIETELSKICDGILKLLDSHLVPSATAAESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKAGAERKEAAENTLVAYKSAQDIALADLPTTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDSLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDNAEEGGDEIKEAASKPEGEGHS
  40 >>>>1433_MAIZE  6/94  ASCII  Len: 61
  41 P29306 zea mays (maize). 14-3-3-like protein (fragment). 6/94
  42 ILNSPDRACNLAKQAFDEAISELDSLGEESYKDSTLIMQLLXDNLTLWTSDTNEDGGDEIK
  43 >>>>1433_OENHO  12/92  ASCII  Len: 260
  44 P29307 oenothera hookeri (hooker's evening primrose). 14-3-3-like protein. 12/92
  45 MATAPSPREENVYLAKLAEQAERYEEMVEFMEKVCAAADSEELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVSTIRDYRSKIETELSNICGGILKLLDSRLIPSAASGDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAERKEAAESTLSAYKAAQDIANAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLANEAFDEAIAELDTLEEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDNQDDGGDEIKEAAPKPDEQY
  46 >>>>1433_ORYSA  6/94  ASCII  Len: 260
  47 Q06967 oryza sativa (rice). 14-3-3-like protein s94. 6/94
  48 MSPAEASREENVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAKTTDVGELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNEAYVASIKEYRSRIETELSKICDGILKLLDSHLVPSATAAESNVFYLKMKGDYHRYLAEFKSGAERKEAAENTLVAYKSAQDIALADLPTTHPIRLGLALNLSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDDAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDNAEDGGDEIKEAAKPEGEGH
  49 >>>>1433_SPIOL  12/92  ASCII  Len: 220
  50 P29308 spinacia oleracea (spinach). 14-3-3-like protein (fragment). 12/92
  51 RNLLSVAYKNVVGARRASWRIISSIEQKEESRGNEDHVSVIRDYRSRIEKELSDNCDGILKLLDTKLVPAASSGDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAQRKEAAESTLTAYKAAQDIANAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFVEAIAELDTLGEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQDEAADEITEEAAKQQKAVNNNKIAY
  52 >>>>1433_XENLA  12/92  ASCII  Len: 235
  53 P29309 xenopus laevis (african clawed frog). 14-3-3-like protein (fragment). 12/92
  54 AKLSEQAERYDDMAASMKAVTELGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTEGNDKRQQMAREYREKVETELQDICKDVLDLLDRFLVPNATPPESKVFYLKMKGDYYRYLSEVASGDSKQETVASSQQAYQEAFEISKSEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKSAFDEAIRELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGEEADNVEGDN
  55 >>>>1434_ARATH  2/94  ASCII  Len: 259
  56 Q01525 arabidopsis thaliana (mouse-ear cress). 14-3-3-like protein gf14. 2/94
  57 MASGREELVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVSAAVDGDELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVTAIREYRSKIETELSGICDGILKLLDSRLIPAAASGDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGQERKDAAEHTLAAYKSAQDIANAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQDDAADEIKEAAAPKPTEEQQ
  58 >>>>1434_MAIZE  6/94  ASCII  Len: 248
  59 Q01526 zea mays (maize). 14-3-3-like protein gf14-12. 6/94
  60 MAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAKTVDSEELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEEGRGNEDRVTLIKDYRGKIETELTKICDGILKLLESHLVPSSTAPESKVFYLKMKGDYYRYLAEFKTGAERKDAAENTMVAYKAAQDIALAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACSLAKQAFDEAISELDTLSEESYKDSTLIMQLLHDNLTLWTSDISEDPAEEIREAPKHDLSEGQ