forester/archive/RIO/others/hmmer/squid/gki.h

   1 /*****************************************************************
   2  * HMMER - Biological sequence analysis with profile HMMs
   3  * Copyright (C) 1992-1999 Washington University School of Medicine
   4  * All Rights Reserved
   5  *
   6  *     This source code is distributed under the terms of the
   7  *     GNU General Public License. See the files COPYING and LICENSE
   8  *     for details.
   9  *****************************************************************/
  10
  11 #ifndef SQUID_GKI_INCLUDED
  12 #define SQUID_GKI_INCLUDED
  13
  14 /* gki.h
  15  * SRE, Sat May  1 15:07:22 1999
  16  *
  17  * Declarations of structures, functions for generic key index
  18  * module: emulation of Perl hashes. See gki.c.
  19  *
  20  * RCS $Id: gki.h,v 1.1.1.1 2005/03/22 08:34:18 cmzmasek Exp $
  21  */
  22
  23 /* gki_elem:
  24  *    key, array index pairs are kept in linked list structures.
  25  */
  26 struct gki_elem {
  27   char            *key;
  28   int              idx;
  29   struct gki_elem *nxt;
  30 };
  31
  32 /* gki:
  33  *    a dynamically resized hash structure;
  34  *    contains a hash table and associated data
  35  */
  36 typedef struct {
  37   struct gki_elem **table;
  38
  39   int primelevel;
  40   int nhash;
  41   int nkeys;
  42 } GKI;
  43
  44 GKI *GKIInit(void);
  45 void GKIFree(GKI *hash);
  46 int  GKIHashValue(GKI *hash, char *key);
  47 int  GKIStoreKey(GKI *hash, char *key);
  48 int  GKIKeyIndex(GKI *hash, char *key);
  49 void GKIStatus(GKI *hash);
  50
  51 #endif /* SQUID_GKI_INCLUDED */