forester/archive/RIO/others/hmmer/testsuite/trace_test.hmm

   1 HMMER2.0
   2 NAME  trace_test
   3 DESC
   4 LENG  10
   5 ALPH  Amino
   6 RF    no
   7 CS    no
   8 COM   ./hmmbuild -F trace_test.hmm trace_test.slx
   9 NSEQ  7
  10 DATE  Mon Feb  2 09:14:31 1998
  11 XT      -8455     -4  -1000  -1000  -8455     -4  -8455     -4
  12 NULT      -4  -8455
  13 NULE     595  -1558     85    338   -294    453  -1158    197    249    902  -1085   -142    -21   -313     45    531    201    384  -1998   -644
  14 HMM        A      C      D      E      F      G      H      I      K      L      M      N      P      Q      R      S      T      V      W      Y
  15          m->m   m->i   m->d   i->m   i->i   d->m   d->d   b->m   m->e
  16          -585      *  -1585
  17      1   2806   -444  -1270  -1265  -1732   -744  -1182  -1034  -1212  -1545  -1010   -869  -1380  -1102  -1325   -156   -259   -640  -2039  -1721
  18      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  19      -   -111  -6123  -7165   -894  -1115   -701  -1378   -585      *
  20      2   -608   5196  -2368  -2362  -1635  -1253  -1702   -987  -2034  -1540  -1191  -1745  -1831  -1953  -1922   -934   -927   -770  -1855  -1692
  21      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  22      -   -115  -6127  -7169   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  23      3  -1130  -2063   3441    243  -2502  -1157   -662  -2514   -843  -2578  -2029    -96  -1658   -421  -1434   -970  -1239  -2138  -2388  -1915
  24      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  25      -   -120  -6132  -7174   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  26      4   -988  -1921    379   3052  -2309  -1196   -495  -2108   -350  -2194  -1612   -103  -1621   -210   -770   -862  -1042  -1799  -2207  -1742
  27      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  28      -   -126  -6138  -7180   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  29      5  -1602  -1340  -2512  -2455   3740  -2315   -379   -478  -2225   -175   -190  -1874  -2503  -1781  -2079  -1892  -1647   -683    210   1257
  30      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  31      -   -132  -6144  -7186   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  32      6   -759  -1104  -1314  -1488  -2461   3330  -1563  -2503  -1721  -2645  -2082  -1325  -1776  -1591  -1791   -959  -1094  -1922  -2199  -2280
  33      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  34      -   -140  -6152  -7194   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  35      7  -1192  -1547   -812   -781   -520  -1557   4586  -1881   -457  -1789  -1357   -866  -1913   -669   -600  -1231  -1258  -1678   -918    -90
  36      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  37      -   -148  -6160  -7202   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  38      8  -1016   -805  -2637  -2367   -591  -2470  -1853   3039  -2040    329    346  -2180  -2589  -1943  -2070  -1879  -1051   1184  -1698  -1261
  39      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  40      -   -158  -6170  -7212   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  41      9  -1028  -1686   -800   -442  -2171  -1521   -263  -1873   3103  -1859  -1251   -547  -1750     74    599  -1004   -972  -1620  -1812  -1528
  42      -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249
  43      -   -170  -6182  -7224   -894  -1115   -701  -1378      *      *
  44     10  -1369  -1199  -2542  -2295   -129  -2453  -1603    488  -1867   2607    742  -2168  -2539  -1724  -1835  -1992  -1384    130  -1284   -897
  45      -      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *
  46      -      *      *      *      *      *      *      *      *      0
  47 //