forester/archive/RIO/others/hmmer/tutorial/7LES_DROME

   1 ID   7LES_DROME     STANDARD;      PRT;  2554 AA.
   2 AC   P13368;
   3 DT   01-JAN-1990 (REL. 13, CREATED)
   4 DT   01-JAN-1990 (REL. 13, LAST SEQUENCE UPDATE)
   5 DT   01-NOV-1995 (REL. 32, LAST ANNOTATION UPDATE)
   6 DE   SEVENLESS PROTEIN (EC 2.7.1.112).
   7 GN   SEV.
   8 OS   DROSOPHILA MELANOGASTER (FRUIT FLY).
   9 OC   EUKARYOTA; METAZOA; ARTHROPODA; INSECTA; DIPTERA.
  10 RN   [1]
  11 RP   SEQUENCE FROM N.A.
  12 RC   STRAIN=CANTON-S;
  13 RX   MEDLINE; 88282538.
  14 RA   BASLER K., HAFEN E.;
  15 RL   CELL 54:299-311(1988).
  16 RN   [2]
  17 RP   SEQUENCE FROM N.A.
  18 RC   STRAIN=OREGON-R;
  19 RX   MEDLINE; 88329706.
  20 RA   BOWTELL D.L.L., SIMON M.A., RUBIN G.M.;
  21 RL   GENES DEV. 2:620-634(1988).
  22 RN   [3]
  23 RP   IDENTIFICATION OF FN-III REPEATS.
  24 RX   MEDLINE; 90199889.
  25 RA   NORTON P.A., HYNES R.O., RESS D.J.G.;
  26 RL   CELL 61:15-16(1990).
  27 CC   -!- FUNCTION: RECEPTOR FOR AN EXTRACELLULAR SIGNAL REQUIRED TO
  28 CC       INSTRUCT A CELL TO DIFFERENTIATE INTO A R7 PHOTORECEPTOR. THE
  29 CC       LIGAND FOR SEV IS THE BOSS (BRIDE OF SEVENLESS) PROTEIN ON THE
  30 CC       SURFACE OF THE NEIGHBORING R8 CELL.
  31 CC   -!- CATALYTIC ACTIVITY: ATP + A PROTEIN TYROSINE = ADP +
  32 CC       PROTEIN TYROSINE PHOSPHATE.
  33 CC   -!- SUBUNIT: MAY FORM A COMPLEX WITH DRK AND SOS.
  34 CC   -!- SIMILARITY: BELONGS TO THE INSULIN RECEPTOR FAMILY OF TYROSINE-
  35 CC       PROTEIN KINASES.
  36 CC   -!- SIMILARITY: CONTAINS SEVEN FIBRONECTIN TYPE III-LIKE DOMAINS.
  37 CC   -!- CAUTION: UNCLEAR WHETHER THE POTENTIAL MEMBRANE SPANNING REGION
  38 CC       NEAR THE N-TERMINUS IS PRESENT AS A TRANSMEMBRANE DOMAIN IN THE
  39 CC       NATIVE PROTEIN OR SERVES AS A CLEAVED SIGNAL SEQUENCE.
  40 DR   EMBL; X13666; G8579; ALT_INIT.
  41 DR   EMBL; J03158; G158419; -.
  42 DR   PIR; A28912; TVFF7L.
  43 DR   FLYBASE; FBGN0003366; SEV.
  44 DR   PROSITE; PS00107; PROTEIN_KINASE_ATP.
  45 DR   PROSITE; PS00109; PROTEIN_KINASE_TYR.
  46 DR   PROSITE; PS00239; RECEPTOR_TYR_KIN_II.
  47 DR   PROSITE; PS50011; PROTEIN_KINASE_DOM.
  48 KW   TRANSFERASE; TYROSINE-PROTEIN KINASE; TRANSMEMBRANE; ATP-BINDING;
  49 KW   PHOSPHORYLATION; RECEPTOR; VISION; REPEAT.
  50 FT   DOMAIN        1   2123       EXTRACELLULAR (POTENTIAL).
  51 FT   TRANSMEM    102    122       POTENTIAL.
  52 FT   TRANSMEM   2124   2147       POTENTIAL.
  53 FT   DOMAIN     2148   2554       CYTOPLASMIC (POTENTIAL).
  54 FT   DOMAIN      311    431       FIBRONECTIN TYPE-III.
  55 FT   DOMAIN      436    528       FIBRONECTIN TYPE-III.
  56 FT   DOMAIN      822    921       FIBRONECTIN TYPE-III.
  57 FT   DOMAIN     1298   1392       FIBRONECTIN TYPE-III.
  58 FT   DOMAIN     1680   1794       FIBRONECTIN TYPE-III.
  59 FT   DOMAIN     1797   1897       FIBRONECTIN TYPE-III.
  60 FT   DOMAIN     1898   1988       FIBRONECTIN TYPE-III.
  61 FT   DOMAIN     2038   2046       POLY-ARG.
  62 FT   DOMAIN     2209   2485       PROTEIN KINASE.
  63 FT   NP_BIND    2215   2223       ATP (BY SIMILARITY).
  64 FT   BINDING    2242   2242       ATP (BY SIMILARITY).
  65 FT   MUTAGEN    2242   2242       K->M: INACTIVATES THE PROTEIN.
  66 FT   MOD_RES    2380   2380       PHOSPHORYLATION (AUTO-) (BY SIMILARITY).
  67 FT   CARBOHYD     30     30       POTENTIAL.
  68 FT   CARBOHYD    129    129       POTENTIAL.
  69 FT   CARBOHYD    481    481       POTENTIAL.
  70 FT   CARBOHYD    505    505       POTENTIAL.
  71 FT   CARBOHYD    617    617       POTENTIAL.
  72 FT   CARBOHYD    647    647       POTENTIAL.
  73 FT   CARBOHYD    966    966       POTENTIAL.
  74 FT   CARBOHYD   1228   1228       POTENTIAL.
  75 FT   CARBOHYD   1313   1313       POTENTIAL.
  76 FT   CARBOHYD   1353   1353       POTENTIAL.
  77 FT   CARBOHYD   1550   1550       POTENTIAL.
  78 FT   CARBOHYD   1557   1557       POTENTIAL.
  79 FT   CARBOHYD   1639   1639       POTENTIAL.
  80 FT   CARBOHYD   1725   1725       POTENTIAL.
  81 FT   CARBOHYD   1756   1756       POTENTIAL.
  82 FT   CARBOHYD   1804   1804       POTENTIAL.
  83 FT   CARBOHYD   1889   1889       POTENTIAL.
  84 FT   CARBOHYD   1947   1947       POTENTIAL.
  85 FT   CARBOHYD   2073   2073       POTENTIAL.
  86 FT   VARIANT     392    392       M -> V.
  87 FT   VARIANT    1668   1668       A -> V.
  88 FT   VARIANT    1703   1703       N -> H.
  89 FT   VARIANT    1730   1730       R -> K.
  90 FT   VARIANT    1731   1731       G -> E.
  91 FT   VARIANT    1741   1741       V -> M.
  92 FT   VARIANT    2271   2271       R -> C.
  93 FT   CONFLICT   1823   1823       E -> Q (IN REF. 2).
  94 SQ   SEQUENCE   2554 AA;  287107 MW;  1143D891 CRC32;
  95      MTMFWQQNVD HQSDEQDKQA KGAAPTKRLN ISFNVKIAVN VNTKMTTTHI NQQAPGTSSS
  96      SSNSQNASPS KIVVRQQSSS FDLRQQLARL GRQLASGQDG HGGISTILII NLLLLILLSI
  97      CCDVCRSHNY TVHQSPEPVS KDQMRLLRPK LDSDVVEKVA IWHKHAAAAP PSIVEGIAIS
  98      SRPQSTMAHH PDDRDRDRDP SEEQHGVDER MVLERVTRDC VQRCIVEEDL FLDEFGIQCE
  99      KADNGEKCYK TRCTKGCAQW YRALKELESC QEACLSLQFY PYDMPCIGAC EMAQRDYWHL
 100      QRLAISHLVE RTQPQLERAP RADGQSTPLT IRWAMHFPEH YLASRPFNIQ YQFVDHHGEE
 101      LDLEQEDQDA SGETGSSAWF NLADYDCDEY YMCEILEALI PYTQYRFRFE LPFGENRDEV
 102      LYSPATPAYQ TPPEGAPISA PVIEHLMGLD DSHLAVHWHP GRFTNGPIEG YRLRLSSSEG
 103      NATSEQLVPA GRGSYIFSQL QAGTNYTLAL SMINKQGEGP VAKGFVQTHS ARNEKPAKDL
 104      TESVLLVGRR AVMWQSLEPA GENSMIYQSQ EELADIAWSK REQQLWLLNV HGELRSLKFE
 105      SGQMVSPAQQ LKLDLGNISS GRWVPRRLSF DWLHHRLYFA MESPERNQSS FQIISTDLLG
 106      ESAQKVGESF DLPVEQLEVD ALNGWIFWRN EESLWRQDLH GRMIHRLLRI RQPGWFLVQP
 107      QHFIIHLMLP QEGKFLEISY DGGFKHPLPL PPPSNGAGNG PASSHWQSFA LLGRSLLLPD
 108      SGQLILVEQQ GQAASPSASW PLKNLPDCWA VILLVPESQP LTSAGGKPHS LKALLGAQAA
 109      KISWKEPERN PYQSADAARS WSYELEVLDV ASQSAFSIRN IRGPIFGLQR LQPDNLYQLR
 110      VRAINVDGEP GEWTEPLAAR TWPLGPHRLR WASRQGSVIH TNELGEGLEV QQEQLERLPG
 111      PMTMVNESVG YYVTGDGLLH CINLVHSQWG CPISEPLQHV GSVTYDWRGG RVYWTDLARN
 112      CVVRMDPWSG SRELLPVFEA NFLALDPRQG HLYYATSSQL SRHGSTPDEA VTYYRVNGLE
 113      GSIASFVLDT QQDQLFWLVK GSGALRLYRA PLTAGGDSLQ MIQQIKGVFQ AVPDSLQLLR
 114      PLGALLWLER SGRRARLVRL AAPLDVMELP TPDQASPASA LQLLDPQPLP PRDEGVIPMT
 115      VLPDSVRLDD GHWDDFHVRW QPSTSGGNHS VSYRLLLEFG QRLQTLDLST PFARLTQLPQ
 116      AQLQLKISIT PRTAWRSGDT TRVQLTTPPV APSQPRRLRV FVERLATALQ EANVSAVLRW
 117      DAPEQGQEAP MQALEYHISC WVGSELHEEL RLNQSALEAR VEHLQPDQTY HFQVEARVAA
 118      TGAAAGAASH ALHVAPEVQA VPRVLYANAE FIGELDLDTR NRRRLVHTAS PVEHLVGIEG
 119      EQRLLWVNEH VELLTHVPGS APAKLARMRA EVLALAVDWI QRIVYWAELD ATAPQAAIIY
 120      RLDLCNFEGK ILQGERVWST PRGRLLKDLV ALPQAQSLIW LEYEQGSPRN GSLRGRNLTD
 121      GSELEWATVQ PLIRLHAGSL EPGSETLNLV DNQGKLCVYD VARQLCTASA LRAQLNLLGE
 122      DSIAGQLAQD SGYLYAVKNW SIRAYGRRRQ QLEYTVELEP EEVRLLQAHN YQAYPPKNCL
 123      LLPSSGGSLL KATDCEEQRC LLNLPMITAS EDCPLPIPGV RYQLNLTLAR GPGSEEHDHG
 124      VEPLGQWLLG AGESLNLTDL LPFTRYRVSG ILSSFYQKKL ALPTLVLAPL ELLTASATPS
 125      PPRNFSVRVL SPRELEVSWL PPEQLRSESV YYTLHWQQEL DGENVQDRRE WEAHERRLET
 126      AGTHRLTGIK PGSGYSLWVQ AHATPTKSNS SERLHVRSFA ELPELQLLEL GPYSLSLTWA
 127      GTPDPLGSLQ LECRSSAEQL RRNVAGNHTK MVVEPLQPRT RYQCRLLLGY AATPGAPLYH
 128      GTAEVYETLG DAPSQPGKPQ LEHIAEEVFR VTWTAARGNG APIALYNLEA LQARSDIRRR
 129      RRRRRRNSGG SLEQLPWAEE PVVVEDQWLD FCNTTELSCI VKSLHSSRLL LFRVRARSLE
 130      HGWGPYSEES ERVAEPFVSP EKRGSLVLAI IAPAAIVSSC VLALVLVRKV QKRRLRAKKL
 131      LQQSRPSIWS NLSTLQTQQQ LMAVRNRAFS TTLSDADIAL LPQINWSQLK LLRFLGSGAF
 132      GEVYEGQLKT EDSEEPQRVA IKSLRKGASE FAELLQEAQL MSNFKHENIV RLVGICFDTE
 133      SISLIMEHME AGDLLSYLRA ARATSTQEPQ PTAGLSLSEL LAMCIDVANG CSYLEDMHFV
 134      HRDLACRNCL VTESTGSTDR RRTVKIGDFG LARDIYKSDY YRKEGEGLLP VRWMSPESLV
 135      DGLFTTQSDV WAFGVLCWEI LTLGQQPYAA RNNFEVLAHV KEGGRLQQPP MCTEKLYSLL
 136      LLCWRTDPWE RPSFRRCYNT LHAISTDLRR TQMASATADT VVSCSRPEFK VRFDGQPLEE
 137      HREHNERPED ENLTLREVPL KDKQLYANEG VSRL
 138 //