1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
\r
2 <phyloxml xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.phyloxml.org http://www.phyloxml.org/1.10/phyloxml.xsd" xmlns="http://www.phyloxml.org">
\r
3 <phylogeny rooted="true" rerootable="false">
\r
5 <name>cellular organisms</name>
\r
8 <scientific_name>Neomura</scientific_name>
\r
12 <id provider="uniprot">2759</id>
\r
13 <scientific_name>Eukaryota</scientific_name>
\r
14 <rank>superkingdom</rank>
\r
17 <name>Unikonta</name>
\r
20 <id provider="uniprot">33154</id>
\r
21 <scientific_name>Opisthokonta</scientific_name>
\r
22 <common_name>Fungi/Metazoa group</common_name>
\r
26 <scientific_name>Holozoa</scientific_name>
\r
29 <name>Choanoflagellatea & Metazoa</name>
\r
32 <id provider="uniprot">33208</id>
\r
33 <scientific_name>Metazoa</scientific_name>
\r
34 <rank>kingdom</rank>
\r
37 <name>Eumetazoa</name>
\r
38 <reference doi="10.1038/nature06614">
\r
41 <name>Bilateria & Cnidaria</name>
\r
43 <name>Bilateria</name>
\r
45 <name>Deuterostomia</name>
\r
46 <reference doi="10.1038/nature04336">
\r
50 <id provider="uniprot">7711</id>
\r
51 <scientific_name>Chordata</scientific_name>
\r
55 <name>Urochordata & Vertebrata</name>
\r
58 <id provider="uniprot">7742</id>
\r
59 <scientific_name>Vertebrata</scientific_name>
\r
63 <id provider="uniprot">7776</id>
\r
64 <scientific_name>Gnathostomata</scientific_name>
\r
65 <common_name>jawed vertebrates</common_name>
\r
66 <rank>superclass</rank>
\r
70 <id provider="uniprot">117571</id>
\r
71 <scientific_name>Euteleostomi</scientific_name>
\r
72 <common_name>bony vertebrates</common_name>
\r
76 <id provider="uniprot">8287</id>
\r
77 <scientific_name>Sarcopterygii</scientific_name>
\r
78 <common_name>lobe-finned fish</common_name>
\r
81 <name>Tetrapoda</name>
\r
83 <name>Amniota</name>
\r
86 <id provider="uniprot">40674</id>
\r
87 <scientific_name>Mammalia</scientific_name>
\r
94 <id provider="uniprot">9347</id>
\r
95 <scientific_name>Eutheria</scientific_name>
\r
96 <common_name>Placental mammals</common_name>
\r
98 <reference doi="10.1002/bies.200900053">
\r
99 <desc>The new framework for understanding placental mammal evolution</desc>
\r
103 <scientific_name>Boreoeutheria</scientific_name>
\r
104 <synonym>Boreotheria</synonym>
\r
108 <id provider="uniprot">314146</id>
\r
109 <scientific_name>Euarchontoglires</scientific_name>
\r
110 <rank>superorder</rank>
\r
114 <scientific_name>Euarchonta</scientific_name>
\r
118 <id provider="uniprot">9443</id>
\r
119 <scientific_name>Primates</scientific_name>
\r
124 <id provider="uniprot">376913</id>
\r
125 <scientific_name>Haplorrhini</scientific_name>
\r
126 <rank>suborder</rank>
\r
130 <id provider="uniprot">314293</id>
\r
131 <scientific_name>Simiiformes</scientific_name>
\r
132 <rank>infraorder</rank>
\r
136 <id provider="uniprot">9526</id>
\r
137 <scientific_name>Catarrhini</scientific_name>
\r
141 <id provider="uniprot">314295</id>
\r
142 <scientific_name>Hominoidea</scientific_name>
\r
143 <common_name>Apes</common_name>
\r
144 <rank>superfamily</rank>
\r
148 <id provider="uniprot">9604</id>
\r
149 <scientific_name>Hominidae</scientific_name>
\r
150 <common_name>Great apes</common_name>
\r
151 <rank>family</rank>
\r
155 <id provider="uniprot">207598</id>
\r
156 <scientific_name>Homininae</scientific_name>
\r
157 <rank>subfamily</rank>
\r
161 <scientific_name>Hominini</scientific_name>
\r
166 <id provider="uniprot">9606</id>
\r
168 <scientific_name>Homo sapiens</scientific_name>
\r
169 <common_name>Human</common_name>
\r
170 <rank>species</rank>
\r
171 <uri>http://www.thehindu.com/multimedia/dynamic/00029/IN05_DARWIN_29896f.jpg</uri>
\r
176 <id provider="uniprot">9598</id>
\r
178 <scientific_name>Pan troglodytes</scientific_name>
\r
179 <common_name>Chimpanzee</common_name>
\r
180 <rank>species</rank>
\r
181 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8b/Schimpanse_zoo-leipig.jpg/800px-Schimpanse_zoo-leipig.jpg</uri>
\r
187 <id provider="uniprot">9595</id>
\r
189 <scientific_name>Gorilla gorilla gorilla</scientific_name>
\r
190 <common_name>Western lowland gorilla</common_name>
\r
191 <rank>subspecies</rank>
\r
192 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c7/Stavenn_Gorilla_gorilla_00.jpg</uri>
\r
198 <id provider="uniprot">9601</id>
\r
200 <scientific_name>Pongo abelii</scientific_name>
\r
201 <common_name>Sumatran orangutan</common_name>
\r
202 <synonym>Pongo pygmaeus abelii</synonym>
\r
203 <rank>species</rank>
\r
204 <uri>http://www.ism.ac.jp/~hasegawa/photos/animal3b.jpg</uri>
\r
210 <id provider="uniprot">61853</id>
\r
212 <scientific_name>Nomascus leucogenys</scientific_name>
\r
213 <common_name>Northern white-cheeked gibbon</common_name>
\r
214 <synonym>Hylobates leucogenys</synonym>
\r
215 <synonym>Hylobates concolor leucogenys</synonym>
\r
216 <rank>species</rank>
\r
217 <uri>http://uswest.ensembl.org/img/species/pic_Nomascus_leucogenys.png</uri>
\r
218 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1b/Hylobates_concolor2.jpg/450px-Hylobates_concolor2.jpg</uri>
\r
224 <id provider="uniprot">9528</id>
\r
225 <scientific_name>Cercopithecinae</scientific_name>
\r
226 <rank>subfamily</rank>
\r
230 <id provider="uniprot">9544</id>
\r
232 <scientific_name>Macaca mulatta</scientific_name>
\r
233 <common_name>Rhesus macaque</common_name>
\r
234 <rank>species</rank>
\r
235 <uri>http://www.our-pets.net/images/rhesus1.jpg</uri>
\r
240 <id provider="uniprot">9557</id>
\r
242 <scientific_name>Papio hamadryas</scientific_name>
\r
243 <common_name>Hamadryas baboon</common_name>
\r
244 <rank>species</rank>
\r
245 <uri>http://pin.primate.wisc.edu/fs/sheets/images/227lg.jpg</uri>
\r
252 <id provider="uniprot">9483</id>
\r
254 <scientific_name>Callithrix jacchus</scientific_name>
\r
255 <common_name>White-tufted-ear marmoset</common_name>
\r
256 <synonym>Callithrix jacchus jacchus</synonym>
\r
257 <rank>species</rank>
\r
258 <uri>http://www.arthurgrosset.com/mammals/photos/caljac28086.jpg</uri>
\r
264 <id provider="uniprot">9478</id>
\r
266 <scientific_name>Tarsius syrichta</scientific_name>
\r
267 <common_name>Philippine tarsier</common_name>
\r
268 <rank>species</rank>
\r
269 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0408/1425.jpeg</uri>
\r
275 <id provider="uniprot">376911</id>
\r
276 <scientific_name>Strepsirrhini</scientific_name>
\r
277 <rank>suborder</rank>
\r
281 <id provider="uniprot">30608</id>
\r
283 <scientific_name>Microcebus murinus</scientific_name>
\r
284 <common_name>Lesser mouse lemur</common_name>
\r
285 <rank>species</rank>
\r
286 <uri>http://daniel.montagnon.pagesperso-orange.fr/images/MicrocbusMurinus.jpg</uri>
\r
291 <id provider="uniprot">30611</id>
\r
293 <scientific_name>Otolemur garnettii</scientific_name>
\r
294 <common_name>Garnett's greater bushbaby</common_name>
\r
295 <synonym>Galago garnetti</synonym>
\r
296 <synonym>Small-eared galago</synonym>
\r
297 <synonym>Garnett's greater bushbaby</synonym>
\r
298 <rank>species</rank>
\r
299 <uri>http://www.mbweni.com/images/Mbweni%20Images/naturetrail/small-earedgalago.jpg</uri>
\r
306 <id provider="uniprot">37347</id>
\r
308 <scientific_name>Tupaia belangeri</scientific_name>
\r
309 <common_name>Common tree shrew</common_name>
\r
310 <synonym>Tupaia glis belangeri</synonym>
\r
311 <rank>species</rank>
\r
312 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/44/Tupaia_belangeri.JPG/800px-Tupaia_belangeri.JPG</uri>
\r
318 <id provider="uniprot">314147</id>
\r
319 <scientific_name>Glires</scientific_name>
\r
320 <common_name>Rodents and rabbits</common_name>
\r
324 <id provider="uniprot">9989</id>
\r
325 <scientific_name>Rodentia</scientific_name>
\r
329 <name>Ctenohystrica & Mouse-related clade</name>
\r
330 <reference doi="10.1186/1471-2148-9-71">
\r
331 <desc>Rodent phylogeny revised: analysis of six nuclear genes from all major rodent clades.</desc>
\r
335 <common_name>Mouse-related clade</common_name>
\r
339 <id provider="uniprot">337687</id>
\r
340 <scientific_name>Muroidea</scientific_name>
\r
344 <id provider="uniprot">39107</id>
\r
345 <scientific_name>Murinae</scientific_name>
\r
346 <rank>subfamily</rank>
\r
350 <id provider="uniprot">10090</id>
\r
352 <scientific_name>Mus musculus</scientific_name>
\r
353 <common_name>Mouse</common_name>
\r
354 <rank>species</rank>
\r
355 <uri>http://www.nsrl.ttu.edu/tmot1/images/mus_musc.jpg</uri>
\r
360 <id provider="uniprot">10116</id>
\r
362 <scientific_name>Rattus norvegicus</scientific_name>
\r
363 <common_name>Rat</common_name>
\r
364 <rank>species</rank>
\r
365 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/0/01/Rattus_norvegicus_1.jpg</uri>
\r
371 <id provider="uniprot">10036</id>
\r
373 <scientific_name>Mesocricetus auratus</scientific_name>
\r
374 <common_name>Golden hamster</common_name>
\r
375 <rank>species</rank>
\r
376 <uri>http://www.dicts.info/img/ud/syrian_hamster.jpg</uri>
\r
382 <id provider="uniprot">10020</id>
\r
384 <scientific_name>Dipodomys ordii</scientific_name>
\r
385 <common_name>Ord's kangaroo rat</common_name>
\r
386 <rank>species</rank>
\r
387 <uri>http://www.nsrl.ttu.edu/tmot1/images/dipoordi.jpg</uri>
\r
393 <id provider="uniprot">10141</id>
\r
395 <scientific_name>Cavia porcellus</scientific_name>
\r
396 <common_name>Guinea pig</common_name>
\r
397 <rank>species</rank>
\r
398 <uri>http://archive.vetknowledge.com/files/images/guinea-pig---tan.jpg</uri>
\r
404 <id provider="uniprot">43179</id>
\r
406 <scientific_name>Spermophilus tridecemlineatus</scientific_name>
\r
407 <common_name>Thirteen-lined ground squirrel</common_name>
\r
408 <synonym>Ictidomys tridecemlineatus</synonym>
\r
409 <rank>species</rank>
\r
410 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/phil_myers/ADW_mammals/Rodentia/Spermophilus4345.jpg/medium.jpg</uri>
\r
416 <id provider="uniprot">9975</id>
\r
417 <scientific_name>Lagomorpha</scientific_name>
\r
418 <common_name>Rabbits, hares, pikas</common_name>
\r
423 <id provider="uniprot">9978</id>
\r
425 <scientific_name>Ochotona princeps</scientific_name>
\r
426 <common_name>Southern American pika</common_name>
\r
427 <rank>species</rank>
\r
428 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/3/3b/Ochotona_princeps.jpg</uri>
\r
433 <id provider="uniprot">9986</id>
\r
435 <scientific_name>Oryctolagus cuniculus</scientific_name>
\r
436 <common_name>Rabbit</common_name>
\r
437 <rank>species</rank>
\r
438 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3b/Rabbit_in_montana.jpg/675px-Rabbit_in_montana.jpg</uri>
\r
446 <id provider="uniprot">314145</id>
\r
447 <scientific_name>Laurasiatheria</scientific_name>
\r
448 <rank>superorder</rank>
\r
452 <scientific_name>Scrotifera</scientific_name>
\r
455 <name>Perissodactyla & Cetartiodactyla & Chiroptera</name>
\r
457 <name>Perissodactyla & Cetartiodactyla</name>
\r
460 <id provider="uniprot">91561</id>
\r
461 <scientific_name>Cetartiodactyla</scientific_name>
\r
462 <common_name>Even-toed ungulates</common_name>
\r
465 <name>Cetruminantia & Suina</name>
\r
468 <scientific_name>Cetruminantia</scientific_name>
\r
472 <id provider="uniprot">9895</id>
\r
473 <scientific_name>Bovidae</scientific_name>
\r
474 <rank>family</rank>
\r
478 <id provider="uniprot">9913</id>
\r
480 <scientific_name>Bos taurus</scientific_name>
\r
481 <common_name>Bovine</common_name>
\r
482 <synonym>Bos bovis</synonym>
\r
483 <rank>species</rank>
\r
484 <uri>http://bioweb.uwlax.edu/bio203/s2007/hayes_katy/images/DSC01638.JPG</uri>
\r
489 <id provider="uniprot">9940</id>
\r
491 <scientific_name>Ovis aries</scientific_name>
\r
492 <common_name>Sheep</common_name>
\r
493 <rank>species</rank>
\r
494 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/james_dowlinghealey/blacksheep.jpg/medium.jpg</uri>
\r
500 <id provider="uniprot">9721</id>
\r
501 <scientific_name>Cetacea</scientific_name>
\r
502 <common_name>Whales</common_name>
\r
507 <id provider="uniprot">9771</id>
\r
509 <scientific_name>Balaenoptera musculus</scientific_name>
\r
510 <common_name>Blue whale</common_name>
\r
511 <rank>species</rank>
\r
512 <uri>http://2.bp.blogspot.com/_W90V87w3sr8/TT63uRT_U9I/AAAAAAAAAo8/to9O8zEeo7k/s1600/bluewhale.jpg</uri>
\r
517 <id provider="uniprot">9739</id>
\r
519 <scientific_name>Tursiops truncatus</scientific_name>
\r
520 <common_name>Atlantic bottle-nosed dolphin</common_name>
\r
521 <synonym>Delphinus truncatus</synonym>
\r
522 <rank>species</rank>
\r
523 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a6/Bottlenose_Dolphin_KSC04pd0178.jpg/800px-Bottlenose_Dolphin_KSC04pd0178.jpg</uri>
\r
530 <id provider="uniprot">9823</id>
\r
532 <scientific_name>Sus scrofa</scientific_name>
\r
533 <common_name>Pig</common_name>
\r
534 <rank>species</rank>
\r
535 <uri>http://www.batraciens-reptiles.com/sus%20scrofa2.jpg</uri>
\r
541 <id provider="uniprot">30538</id>
\r
543 <scientific_name>Lama guanicoe pacos</scientific_name>
\r
544 <common_name>Alpaca</common_name>
\r
545 <synonym>Lama pacos</synonym>
\r
546 <rank>species</rank>
\r
547 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/1206/0658.jpeg</uri>
\r
553 <id provider="uniprot">9796</id>
\r
555 <scientific_name>Equus caballus</scientific_name>
\r
556 <common_name>Horse</common_name>
\r
557 <rank>species</rank>
\r
558 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0801/0088.jpeg</uri>
\r
564 <id provider="uniprot">9397</id>
\r
565 <scientific_name>Chiroptera</scientific_name>
\r
566 <common_name>Bats</common_name>
\r
571 <id provider="uniprot">59463</id>
\r
573 <scientific_name>Myotis lucifugus</scientific_name>
\r
574 <common_name>Little brown bat</common_name>
\r
575 <rank>species</rank>
\r
576 <uri>http://biology.lakeheadu.ca/uploads/Nature_photography/brown_bat.jpg</uri>
\r
581 <id provider="uniprot">132908</id>
\r
583 <scientific_name>Pteropus vampyrus</scientific_name>
\r
584 <common_name>Large flying fox</common_name>
\r
585 <rank>species</rank>
\r
586 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/Pteropus_vampyrus1.jpg/412px-Pteropus_vampyrus1.jpg</uri>
\r
592 <name>Carnivora</name>
\r
594 <id provider="uniprot">33554</id>
\r
595 <scientific_name>Carnivora</scientific_name>
\r
600 <id provider="uniprot">379584</id>
\r
601 <scientific_name>Caniformia</scientific_name>
\r
602 <rank>suborder</rank>
\r
606 <id provider="uniprot">9646</id>
\r
608 <scientific_name>Ailuropoda melanoleuca</scientific_name>
\r
609 <common_name>Giant panda</common_name>
\r
610 <rank>species</rank>
\r
611 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3c/Giant_Panda_2004-03-2.jpg/800px-Giant_Panda_2004-03-2.jpg</uri>
\r
616 <id provider="uniprot">9615</id>
\r
618 <scientific_name>Canis familiaris</scientific_name>
\r
619 <common_name>Dog</common_name>
\r
620 <synonym>Canis lupus familiaris</synonym>
\r
621 <rank>subspecies</rank>
\r
622 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/ab/Wikilabrador_jardin.JPG</uri>
\r
628 <id provider="uniprot">9685</id>
\r
630 <scientific_name>Felis catus</scientific_name>
\r
631 <common_name>Cat</common_name>
\r
632 <synonym>Felis silvestris catus</synonym>
\r
633 <rank>species</rank>
\r
634 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9b/Domestic_cat_cropped.jpg/755px-Domestic_cat_cropped.jpg</uri>
\r
641 <id provider="uniprot">9362</id>
\r
642 <scientific_name>Insectivora</scientific_name>
\r
643 <common_name>hedgehogs, shrews, moles and others</common_name>
\r
648 <id provider="uniprot">9365</id>
\r
650 <scientific_name>Erinaceus europaeus</scientific_name>
\r
651 <common_name>Western European hedgehog</common_name>
\r
652 <rank>species</rank>
\r
653 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d4/Igel01.jpg</uri>
\r
658 <id provider="uniprot">42254</id>
\r
660 <scientific_name>Sorex araneus</scientific_name>
\r
661 <common_name>Eurasian common shrew</common_name>
\r
662 <synonym>European shrew</synonym>
\r
663 <rank>species</rank>
\r
664 <uri>http://www.batraciens-reptiles.com/musaraigne2.jpg</uri>
\r
672 <scientific_name>Atlantogenata</scientific_name>
\r
676 <id provider="uniprot">311790</id>
\r
677 <scientific_name>Afrotheria</scientific_name>
\r
678 <rank>superorder</rank>
\r
682 <scientific_name>Paenungulata</scientific_name>
\r
686 <id provider="uniprot">9785</id>
\r
688 <scientific_name>Loxodonta africana</scientific_name>
\r
689 <common_name>African savanna elephant</common_name>
\r
690 <rank>species</rank>
\r
691 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/susan_hoffman/elephants.jpg</uri>
\r
696 <id provider="uniprot">9813</id>
\r
698 <scientific_name>Procavia capensis</scientific_name>
\r
699 <common_name>Cape hyrax</common_name>
\r
700 <synonym>Rock dassie</synonym>
\r
701 <rank>species</rank>
\r
702 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/1206/0460.jpeg</uri>
\r
708 <id provider="uniprot">9371</id>
\r
710 <scientific_name>Echinops telfairi</scientific_name>
\r
711 <common_name>Lesser hedgehog tenrec</common_name>
\r
712 <rank>species</rank>
\r
713 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/david_kupitz/etelfairi.jpg</uri>
\r
719 <id provider="uniprot">9348</id>
\r
720 <scientific_name>Xenarthra</scientific_name>
\r
721 <synonym>Edentata</synonym>
\r
722 <rank>superorder</rank>
\r
726 <id provider="uniprot">9358</id>
\r
728 <scientific_name>Choloepus hoffmanni</scientific_name>
\r
729 <common_name>Hoffmann's two-fingered sloth</common_name>
\r
730 <rank>species</rank>
\r
731 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/89/Sloth8.jpg/800px-Sloth8.jpg</uri>
\r
736 <id provider="uniprot">9361</id>
\r
738 <scientific_name>Dasypus novemcinctus</scientific_name>
\r
739 <common_name>Nine-banded armadillo</common_name>
\r
740 <rank>species</rank>
\r
741 <uri>http://anthropometaphors.files.wordpress.com/2008/11/nine-banded-armadillo41.jpg</uri>
\r
749 <id provider="uniprot">9263</id>
\r
750 <scientific_name>Metatheria</scientific_name>
\r
751 <common_name>Marsupials</common_name>
\r
753 <reference doi="10.1016/j.ympev.2004.05.004">
\r
754 <desc>First combined cladistic analysis of marsupial mammal interrelationships</desc>
\r
760 <scientific_name>Eometatheria</scientific_name>
\r
764 <id provider="uniprot">9315</id>
\r
766 <scientific_name>Macropus eugenii</scientific_name>
\r
767 <common_name>Tammar wallaby</common_name>
\r
768 <rank>species</rank>
\r
769 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/de/Macropus_eugenii.jpg</uri>
\r
774 <id provider="uniprot">9305</id>
\r
776 <scientific_name>Sarcophilus harrisii</scientific_name>
\r
777 <common_name>Tasmanian devil</common_name>
\r
778 <synonym>Sarcophilus laniarius</synonym>
\r
779 <rank>species</rank>
\r
780 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3b/Sarcophilus_harrisii_-Healesville_Sanctuary-8a.jpg/727px-Sarcophilus_harrisii_-Healesville_Sanctuary-8a.jpg</uri>
\r
786 <id provider="uniprot">13616</id>
\r
788 <scientific_name>Monodelphis domestica</scientific_name>
\r
789 <common_name>Short-tailed gray opossum</common_name>
\r
790 <rank>species</rank>
\r
791 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/phil_myers/classic/monodelphis.jpg/medium.jpg</uri>
\r
798 <id provider="uniprot">9258</id>
\r
800 <scientific_name>Ornithorhynchus anatinus</scientific_name>
\r
801 <common_name>Duckbill platypus</common_name>
\r
802 <rank>species</rank>
\r
803 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/12/Platypus_BrokenRiver_QLD_Australia2.png</uri>
\r
809 <id provider="uniprot">8457</id>
\r
810 <scientific_name>Sauropsida</scientific_name>
\r
813 <name>Archosauria & Testudines</name>
\r
814 <reference doi="10.1038/ng.2615">
\r
815 <desc>The draft genomes of soft-shell turtle and green sea turtle yield insights into the development and evolution of the turtle-specific body plan</desc>
\r
823 <id provider="uniprot">8492</id>
\r
824 <scientific_name>Archosauria</scientific_name>
\r
827 <name>Neognathae</name>
\r
829 <id provider="uniprot">8825</id>
\r
830 <scientific_name>Neognathae</scientific_name>
\r
831 <rank>superorder</rank>
\r
834 <name>Phasianidae & Anatidae (waterfowl)</name>
\r
837 <id provider="uniprot">9005</id>
\r
838 <scientific_name>Phasianidae</scientific_name>
\r
839 <rank>family</rank>
\r
843 <id provider="uniprot">9031</id>
\r
845 <scientific_name>Gallus gallus</scientific_name>
\r
846 <common_name>Chicken</common_name>
\r
847 <synonym>Gallus domesticus</synonym>
\r
848 <rank>species</rank>
\r
849 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/Rooster04_adjusted.jpg/800px-Rooster04_adjusted.jpg</uri>
\r
854 <id provider="uniprot">9103</id>
\r
856 <scientific_name>Meleagris gallopavo</scientific_name>
\r
857 <common_name>Common turkey</common_name>
\r
858 <rank>species</rank>
\r
859 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0205/0858.jpeg</uri>
\r
865 <id provider="uniprot">8839</id>
\r
867 <scientific_name>Anas platyrhynchos</scientific_name>
\r
868 <common_name>Domestic duck</common_name>
\r
869 <synonym>Anas boschas</synonym>
\r
870 <rank>species</rank>
\r
871 <uri>http://content.ornith.cornell.edu/UEWebApp/images/MPR_070302_100009_L.jpg</uri>
\r
877 <id provider="uniprot">59729</id>
\r
879 <scientific_name>Taeniopygia guttata</scientific_name>
\r
880 <common_name>Zebra finch</common_name>
\r
881 <synonym>Poephila guttata</synonym>
\r
882 <rank>species</rank>
\r
883 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/84/Taeniopygia_guttata_-_front_view_-_dundee_wildlife_park.jpg/355px-Taeniopygia_guttata_-_front_view_-_dundee_wildlife_park.jpg</uri>
\r
889 <id provider="uniprot">8496</id>
\r
891 <scientific_name>Alligator mississippiensis</scientific_name>
\r
892 <common_name>American alligator</common_name>
\r
893 <rank>species</rank>
\r
894 <uri>http://www.herpcenter.com/reptile-caresheets/images/american_alligator.jpg</uri>
\r
900 <id provider="uniprot">13735</id>
\r
902 <scientific_name>Pelodiscus sinensis</scientific_name>
\r
903 <authority>(Wiegmann, 1835) Cox et al. 1998</authority>
\r
904 <common_name>Chinese softshell turtle</common_name>
\r
905 <synonym>Trionyx sinensis</synonym>
\r
906 <rank>species</rank>
\r
907 <uri>http://www.chelonia.org/PsinensisTR1.jpg</uri>
\r
913 <id provider="uniprot">28377</id>
\r
915 <scientific_name>Anolis carolinensis</scientific_name>
\r
916 <authority>Voigt, 1832</authority>
\r
917 <common_name>Green anole</common_name>
\r
918 <synonym>American chameleon</synonym>
\r
919 <rank>species</rank>
\r
920 <uri>http://content61.eol.org/content/2009/09/20/01/05528_580_360.jpg</uri>
\r
921 <uri>http://content61.eol.org/content/2008/10/08/13/66818_580_360.jpg</uri>
\r
922 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5a/Anolis_carolinensis.jpg/800px-Anolis_carolinensis.jpg</uri>
\r
929 <id provider="uniprot">8353</id>
\r
930 <scientific_name>Xenopus</scientific_name>
\r
935 <id provider="uniprot">8355</id>
\r
937 <scientific_name>Xenopus laevis</scientific_name>
\r
938 <authority>Daudin, 1802</authority>
\r
939 <common_name>African clawed frog</common_name>
\r
940 <synonym>Bufo laevis</synonym>
\r
941 <rank>species</rank>
\r
942 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e3/Xenopus_laevis.jpg</uri>
\r
947 <id provider="uniprot">8364</id>
\r
949 <scientific_name>Xenopus tropicalis</scientific_name>
\r
950 <common_name>Western clawed frog</common_name>
\r
951 <synonym>Silurana tropicalis</synonym>
\r
952 <rank>species</rank>
\r
953 <uri>http://genoweb.univ-rennes1.fr/OGP/xenopus%20tropicalis.jpg</uri>
\r
960 <id provider="uniprot">7897</id>
\r
962 <scientific_name>Latimeria chalumnae</scientific_name>
\r
963 <common_name>West Indian ocean coelacanth</common_name>
\r
964 <rank>species</rank>
\r
965 <uri>http://marinebio.org/upload/Latimeria-chalumnae/1.jpg</uri>
\r
966 <uri>http://images.nationalgeographic.com/wpf/media-live/photos/000/005/cache/coelacanth_501_600x450.jpg</uri>
\r
971 <name>Teleostei</name>
\r
973 <id provider="uniprot">32443</id>
\r
974 <scientific_name>Teleostei</scientific_name>
\r
978 <id provider="uniprot">123368</id>
\r
979 <scientific_name>Acanthomorpha</scientific_name>
\r
983 <id provider="uniprot">32485</id>
\r
984 <scientific_name>Percomorpha</scientific_name>
\r
988 <id provider="uniprot">129949</id>
\r
989 <scientific_name>Smegmamorpha</scientific_name>
\r
993 <id provider="uniprot">32456</id>
\r
994 <scientific_name>Atherinomorpha</scientific_name>
\r
998 <id provider="uniprot">8090</id>
\r
1000 <scientific_name>Oryzias latipes</scientific_name>
\r
1001 <common_name>Medaka fish</common_name>
\r
1002 <synonym>Japanese ricefish</synonym>
\r
1003 <rank>species</rank>
\r
1004 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/49/Nihonmedaka.jpg</uri>
\r
1009 <id provider="uniprot">8083</id>
\r
1010 <code>XIPMA</code>
\r
1011 <scientific_name>Xiphophorus maculatus</scientific_name>
\r
1012 <authority>Guenther, 1866</authority>
\r
1013 <common_name>Southern platyfish</common_name>
\r
1014 <synonym>Platypoecilus maculatus</synonym>
\r
1015 <rank>species</rank>
\r
1016 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/6b/Poissons_06.jpg</uri>
\r
1022 <id provider="uniprot">69293</id>
\r
1023 <code>GASAC</code>
\r
1024 <scientific_name>Gasterosteus aculeatus</scientific_name>
\r
1025 <common_name>Three-spined stickleback</common_name>
\r
1026 <rank>species</rank>
\r
1027 <uri>http://www.jjphoto.dk/fish_archive/freshwater/gasterosteus_aculeatus.jpg</uri>
\r
1033 <id provider="uniprot">31031</id>
\r
1034 <scientific_name>Tetraodontidae</scientific_name>
\r
1035 <common_name>puffers</common_name>
\r
1036 <rank>family</rank>
\r
1040 <id provider="uniprot">31033</id>
\r
1041 <code>TAKRU</code>
\r
1042 <scientific_name>Takifugu rubripes</scientific_name>
\r
1043 <common_name>Japanese pufferfish</common_name>
\r
1044 <synonym>Fugu rubripes</synonym>
\r
1045 <rank>species</rank>
\r
1046 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/25/Fugu_in_Tank.jpg/800px-Fugu_in_Tank.jpg</uri>
\r
1051 <id provider="uniprot">99883</id>
\r
1052 <code>TETNG</code>
\r
1053 <scientific_name>Tetraodon nigroviridis</scientific_name>
\r
1054 <common_name>Green puffer</common_name>
\r
1055 <synonym>Chelonodon nigroviridis</synonym>
\r
1056 <rank>species</rank>
\r
1057 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b6/Tetraodon_nigroviridis_1.jpg/800px-Tetraodon_nigroviridis_1.jpg</uri>
\r
1063 <id provider="uniprot">8128</id>
\r
1064 <code>ORENI</code>
\r
1065 <scientific_name>Tilapia nilotica</scientific_name>
\r
1066 <authority>Linnaeus, 1758</authority>
\r
1067 <common_name>Nile tilapia</common_name>
\r
1068 <synonym>Tilapia nilotica</synonym>
\r
1069 <rank>species</rank>
\r
1070 <uri>http://www.jjphoto.dk/fish_archive/warm_freshwater/oreochromis_niloticus_niloticus.jpg</uri>
\r
1076 <id provider="uniprot">8049</id>
\r
1077 <code>GADMO</code>
\r
1078 <scientific_name>Gadus morhua</scientific_name>
\r
1079 <common_name>Atlantic cod</common_name>
\r
1080 <rank>species</rank>
\r
1081 <uri>http://www.marinbi.com/g-morhua.jpg</uri>
\r
1087 <id provider="uniprot">7955</id>
\r
1088 <code>DANRE</code>
\r
1089 <scientific_name>Danio rerio</scientific_name>
\r
1090 <common_name>Zebrafish</common_name>
\r
1091 <synonym>Brachydanio rerio</synonym>
\r
1092 <rank>species</rank>
\r
1093 <uri>http://fishbase.org.cn/images/species/Darer_m0.jpg</uri>
\r
1100 <id provider="uniprot">7868</id>
\r
1101 <code>CALMI</code>
\r
1102 <scientific_name>Callorhynchus milii</scientific_name>
\r
1103 <common_name>Australian ghost shark</common_name>
\r
1104 <synonym>Australian ghost shark</synonym>
\r
1105 <rank>species</rank>
\r
1106 <uri>http://www.tudiscovery.com/tiburones/que_es/popup_que/asset/07914907646434433_elephant_shark_380x290.jpg</uri>
\r
1112 <id provider="uniprot">7757</id>
\r
1113 <code>PETMA</code>
\r
1114 <scientific_name>Petromyzon marinus</scientific_name>
\r
1115 <common_name>Sea lamprey</common_name>
\r
1116 <rank>species</rank>
\r
1117 <uri>http://www.uk-fish.info/pics/sealampray01.jpg</uri>
\r
1122 <name>Urochordata</name>
\r
1124 <id provider="uniprot">7712</id>
\r
1125 <scientific_name>Urochordata</scientific_name>
\r
1126 <rank>subphylum</rank>
\r
1130 <id provider="uniprot">7718</id>
\r
1131 <scientific_name>Ciona</scientific_name>
\r
1132 <rank>genus</rank>
\r
1136 <id provider="uniprot">7719</id>
\r
1137 <code>CIOIN</code>
\r
1138 <scientific_name>Ciona intestinalis</scientific_name>
\r
1139 <common_name>Transparent sea squirt</common_name>
\r
1140 <synonym>Ascidia intestinalis</synonym>
\r
1141 <rank>species</rank>
\r
1142 <uri>http://adl.brs.gov.au/marinepests/images/Ciona_intestinalis2.jpg</uri>
\r
1147 <id provider="uniprot">51511</id>
\r
1148 <code>CIOSA</code>
\r
1149 <scientific_name>Ciona savignyi</scientific_name>
\r
1150 <common_name>Pacific transparent sea squirt</common_name>
\r
1151 <rank>species</rank>
\r
1152 <uri>http://www.pnwscuba.com/invasives/photos/ciona4.jpg</uri>
\r
1158 <id provider="ncbi">34765</id>
\r
1159 <code>OIKDI</code>
\r
1160 <scientific_name>Oikopleura dioica</scientific_name>
\r
1161 <common_name>Tunicate</common_name>
\r
1162 <rank>species</rank>
\r
1163 <uri>http://jellieszone.com/images/oikopleura.jpg</uri>
\r
1170 <id provider="uniprot">7739</id>
\r
1171 <code>BRAFL</code>
\r
1172 <scientific_name>Branchiostoma floridae</scientific_name>
\r
1173 <common_name>Florida lancelet</common_name>
\r
1174 <synonym>Amphioxus</synonym>
\r
1175 <rank>species</rank>
\r
1176 <uri>http://www.nicerweb.com/sketches/video/PBS-ShapeOfLife/4.8_BonesBrawnBrains/Branchiostoma_floridae.jpg</uri>
\r
1181 <name>Hemichordata & Echinodermata</name>
\r
1184 <id provider="uniprot">10224</id>
\r
1185 <code>SACKO</code>
\r
1186 <scientific_name>Saccoglossus kowalevskii</scientific_name>
\r
1187 <authority>Agassiz, 1873</authority>
\r
1188 <common_name>Acorn worm</common_name>
\r
1189 <rank>species</rank>
\r
1190 <uri>http://faculty.washington.edu/bjswalla/Hemichordata/Enteropneusta/SkowAK.jpg</uri>
\r
1195 <id provider="uniprot">7668</id>
\r
1196 <code>STRPU</code>
\r
1197 <scientific_name>Strongylocentrotus purpuratus</scientific_name>
\r
1198 <common_name>Purple sea urchin</common_name>
\r
1199 <rank>species</rank>
\r
1200 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f4/Strongylocentrotus_purpuratus_1.jpg/724px-Strongylocentrotus_purpuratus_1.jpg</uri>
\r
1206 <name>Protostomia</name>
\r
1208 <name>Ecdysozoa</name>
\r
1211 <id provider="uniprot">6656</id>
\r
1212 <scientific_name>Arthropoda</scientific_name>
\r
1213 <rank>phylum</rank>
\r
1217 <id provider="uniprot">197563</id>
\r
1218 <scientific_name>Mandibulata</scientific_name>
\r
1221 <name>Pancrustacea</name>
\r
1224 <id provider="uniprot">33340</id>
\r
1225 <scientific_name>Neoptera</scientific_name>
\r
1226 <rank>subclass</rank>
\r
1230 <id provider="uniprot">33392</id>
\r
1231 <scientific_name>Endopterygota</scientific_name>
\r
1232 <rank>infraclass</rank>
\r
1235 <name>Hymenoptera & Lepidoptera & Diptera</name>
\r
1237 <name>Lepidoptera & Diptera</name>
\r
1240 <id provider="uniprot">7147</id>
\r
1241 <scientific_name>Diptera</scientific_name>
\r
1242 <rank>order</rank>
\r
1246 <id provider="uniprot">7215</id>
\r
1247 <scientific_name>Drosophila</scientific_name>
\r
1248 <common_name>fruit flies</common_name>
\r
1249 <rank>genus</rank>
\r
1251 <reference doi="10.1534/genetics.111.126540">
\r
1252 <desc>The 19 Genomes of Drosophila: A BAC Library Resource for Genus-Wide and Genome-Scale Comparative Evolutionary Research</desc>
\r
1256 <id provider="uniprot">32341</id>
\r
1257 <scientific_name>Sophophora</scientific_name>
\r
1258 <rank>subgenus</rank>
\r
1261 <name>melanogaster & pseudoobscura subgroups</name>
\r
1264 <id provider="uniprot">32346</id>
\r
1265 <scientific_name>melanogaster group</scientific_name>
\r
1269 <id provider="uniprot">32351</id>
\r
1270 <scientific_name>melanogaster subgroup</scientific_name>
\r
1273 <name>DROSE & DROSI & DROME & DROYA</name>
\r
1275 <name>DROSE & DROSI & DROME</name>
\r
1277 <name>DROSE & DROSI</name>
\r
1280 <id provider="uniprot">7238</id>
\r
1281 <code>DROSE</code>
\r
1282 <scientific_name>Drosophila sechellia</scientific_name>
\r
1283 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1284 <rank>species</rank>
\r
1289 <id provider="uniprot">7240</id>
\r
1290 <code>DROSI</code>
\r
1291 <scientific_name>Drosophila simulans</scientific_name>
\r
1292 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1293 <rank>species</rank>
\r
1299 <id provider="uniprot">7227</id>
\r
1300 <code>DROME</code>
\r
1301 <scientific_name>Drosophila melanogaster</scientific_name>
\r
1302 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1303 <rank>species</rank>
\r
1304 <uri>http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/images/dro-mal1.jpg</uri>
\r
1310 <id provider="uniprot">7245</id>
\r
1311 <code>DROYA</code>
\r
1312 <scientific_name>Drosophila yakuba</scientific_name>
\r
1313 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1314 <rank>species</rank>
\r
1320 <id provider="uniprot">7220</id>
\r
1321 <code>DROER</code>
\r
1322 <scientific_name>Drosophila erecta</scientific_name>
\r
1323 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1324 <rank>species</rank>
\r
1330 <id provider="uniprot">7217</id>
\r
1331 <code>DROAN</code>
\r
1332 <scientific_name>Drosophila ananassae</scientific_name>
\r
1333 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1334 <rank>species</rank>
\r
1340 <id provider="uniprot">32358</id>
\r
1341 <scientific_name>pseudoobscura subgroup</scientific_name>
\r
1345 <id provider="uniprot">7234</id>
\r
1346 <code>DROPE</code>
\r
1347 <scientific_name>Drosophila persimilis</scientific_name>
\r
1348 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1349 <rank>species</rank>
\r
1354 <id provider="uniprot">46245</id>
\r
1355 <code>DROPS</code>
\r
1356 <scientific_name>Drosophila pseudoobscura pseudoobscura</scientific_name>
\r
1357 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1358 <rank>subspecies</rank>
\r
1359 <uri>http://www.naylorgallery.com/wp-content/uploads/fly4stack01small.jpg</uri>
\r
1366 <id provider="uniprot">7260</id>
\r
1367 <code>DROWI</code>
\r
1368 <scientific_name>Drosophila willistoni</scientific_name>
\r
1369 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1370 <rank>species</rank>
\r
1375 <name>Drosophila subgenus & Hawaiian Drosophila</name>
\r
1378 <scientific_name>Drosophila</scientific_name>
\r
1379 <rank>subgenus</rank>
\r
1383 <id provider="uniprot">7230</id>
\r
1384 <code>DROMO</code>
\r
1385 <scientific_name>Drosophila mojavensis</scientific_name>
\r
1386 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1387 <rank>species</rank>
\r
1392 <id provider="uniprot">7244</id>
\r
1393 <code>DROVI</code>
\r
1394 <scientific_name>Drosophila virilis</scientific_name>
\r
1395 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1396 <rank>species</rank>
\r
1402 <id provider="uniprot">7222</id>
\r
1403 <code>DROGR</code>
\r
1404 <scientific_name>Drosophila grimshawi</scientific_name>
\r
1405 <common_name>Fruit fly</common_name>
\r
1406 <synonym>Idiomyia grimshawi</synonym>
\r
1407 <rank>species</rank>
\r
1408 <uri>http://www.pacificislandbooks.com/fruitf~1.jpg</uri>
\r
1415 <id provider="uniprot">7157</id>
\r
1416 <scientific_name>Culicidae</scientific_name>
\r
1417 <common_name>mosquitos</common_name>
\r
1418 <rank>family</rank>
\r
1422 <id provider="uniprot">7159</id>
\r
1423 <code>AEDAE</code>
\r
1424 <scientific_name>Aedes aegypti</scientific_name>
\r
1425 <common_name>Yellowfever mosquito</common_name>
\r
1426 <synonym>Culex aegypti</synonym>
\r
1427 <rank>species</rank>
\r
1428 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/48/Aedes_aegypti_biting_human.jpg/757px-Aedes_aegypti_biting_human.jpg</uri>
\r
1433 <id provider="uniprot">7165</id>
\r
1434 <code>ANOGA</code>
\r
1435 <scientific_name>Anopheles gambiae</scientific_name>
\r
1436 <common_name>African malaria mosquito</common_name>
\r
1437 <rank>species</rank>
\r
1438 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e9/Anopheles_gambiae_Mosquito.jpg</uri>
\r
1443 <id provider="uniprot">7175</id>
\r
1444 <code>CULPI</code>
\r
1445 <scientific_name>Culex pipiens</scientific_name>
\r
1446 <common_name>House mosquito</common_name>
\r
1447 <rank>species</rank>
\r
1448 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/Culex_pipiens_2007-1.jpg/628px-Culex_pipiens_2007-1.jpg</uri>
\r
1455 <id provider="uniprot">7091</id>
\r
1456 <code>BOMMO</code>
\r
1457 <scientific_name>Bombyx mori</scientific_name>
\r
1458 <common_name>Silk moth</common_name>
\r
1459 <rank>species</rank>
\r
1460 <uri>http://lepidoptera.butterflyhouse.com.au/bomb/mori5.jpg</uri>
\r
1466 <id provider="uniprot">7400</id>
\r
1467 <scientific_name>Apocrita</scientific_name>
\r
1468 <common_name>wasps, ants and bees</common_name>
\r
1472 <id provider="uniprot">7434</id>
\r
1473 <scientific_name>Aculeata</scientific_name>
\r
1474 <rank>suborder</rank>
\r
1478 <id provider="uniprot">7460</id>
\r
1479 <code>APIME</code>
\r
1480 <scientific_name>Apis mellifera</scientific_name>
\r
1481 <common_name>Honeybee</common_name>
\r
1482 <rank>species</rank>
\r
1483 <uri>http://www.floridanature.org/photos/Apis_mellifera_6b_&_Trifolium_sp.,_TBP,_Tallahassee,_20030323.jpg</uri>
\r
1488 <id provider="uniprot">12957</id>
\r
1489 <code>ATTCE</code>
\r
1490 <scientific_name>Atta cephalotes</scientific_name>
\r
1491 <authority>Linnaeus, 1758</authority>
\r
1492 <common_name>Leafcutter ant</common_name>
\r
1493 <rank>species</rank>
\r
1494 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4e/Leaf-cutting_ant.jpg</uri>
\r
1500 <id provider="uniprot">7425</id>
\r
1501 <code>NASVI</code>
\r
1502 <scientific_name>Nasonia vitripennis</scientific_name>
\r
1503 <common_name>Parasitic wasp</common_name>
\r
1504 <rank>species</rank>
\r
1505 <uri>http://www.freshpond.org/nasonia.jpg</uri>
\r
1512 <id provider="uniprot">7070</id>
\r
1513 <code>TRICA</code>
\r
1514 <scientific_name>Tribolium castaneum</scientific_name>
\r
1515 <common_name>Red flour beetle</common_name>
\r
1516 <rank>species</rank>
\r
1517 <uri>http://www.ars.usda.gov/sp2UserFiles/Place/54300530/proj/tribolium/rfb.jpg</uri>
\r
1523 <id provider="uniprot">33342</id>
\r
1524 <scientific_name>Paraneoptera</scientific_name>
\r
1525 <rank>infraclass</rank>
\r
1529 <id provider="uniprot">7524</id>
\r
1530 <scientific_name>Hemiptera</scientific_name>
\r
1531 <rank>order</rank>
\r
1535 <id provider="uniprot">7029</id>
\r
1536 <code>ACYPI</code>
\r
1537 <scientific_name>Acyrthosiphon pisum</scientific_name>
\r
1538 <common_name>Pea aphid</common_name>
\r
1539 <rank>species</rank>
\r
1540 <uri>http://www.agroatlas.ru/content/pests/Acyrthosiphon_pisum/Acyrthosiphon_pisum.jpg</uri>
\r
1545 <id provider="uniprot">13249</id>
\r
1546 <code>RHOPR</code>
\r
1547 <scientific_name>Rhodnius prolixus</scientific_name>
\r
1548 <common_name>Triatomid bug</common_name>
\r
1549 <rank>species</rank>
\r
1550 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b9/Rhodnius_prolixus.jpg</uri>
\r
1556 <id provider="uniprot">121224</id>
\r
1557 <code>PEDHC</code>
\r
1558 <scientific_name>Pediculus humanus subsp. corporis</scientific_name>
\r
1559 <common_name>Body louse</common_name>
\r
1560 <rank>subspecies</rank>
\r
1561 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/92/Body_lice.jpg/436px-Body_lice.jpg</uri>
\r
1568 <id provider="uniprot">6658</id>
\r
1569 <scientific_name>Branchiopoda</scientific_name>
\r
1570 <rank>class</rank>
\r
1574 <id provider="uniprot">6661</id>
\r
1575 <code>ARTSF</code>
\r
1576 <scientific_name>Artemia franciscana</scientific_name>
\r
1577 <common_name>Brine shrimp</common_name>
\r
1578 <synonym>Artemia sanfranciscana</synonym>
\r
1579 <rank>species</rank>
\r
1580 <uri>http://www.alireza-asem.ir/images/Artemia.jpg</uri>
\r
1585 <id provider="uniprot">6669</id>
\r
1586 <code>DAPPU</code>
\r
1587 <scientific_name>Daphnia pulex</scientific_name>
\r
1588 <common_name>Water flea</common_name>
\r
1589 <rank>species</rank>
\r
1590 <uri>http://www.microscopy-uk.org.uk/mag/imgjun99/daphni.jpg</uri>
\r
1597 <id provider="uniprot">61985</id>
\r
1598 <scientific_name>Myriapoda</scientific_name>
\r
1599 <rank>subphylum</rank>
\r
1603 <id provider="uniprot">7553</id>
\r
1604 <scientific_name>Diplopoda</scientific_name>
\r
1605 <common_name>millipedes</common_name>
\r
1606 <rank>class</rank>
\r
1610 <id provider="uniprot">118561</id>
\r
1611 <scientific_name>Helminthomorpha</scientific_name>
\r
1612 <rank>subclass</rank>
\r
1616 <id provider="uniprot">364406</id>
\r
1617 <scientific_name>Antrokoreana gracilipes</scientific_name>
\r
1618 <rank>species</rank>
\r
1619 <uri>http://www.gwbaekdu.com/data/2d/%EA%B3%A1%EC%84%9D%EA%B5%B4_4(%EB%93%B1%EC%A4%84%EA%B5%B4%EB%85%B8%EB%9E%98%EA%B8%B0).jpg</uri>
\r
1624 <id provider="uniprot">174156</id>
\r
1625 <code>NARAN</code>
\r
1626 <scientific_name>Narceus annularis</scientific_name>
\r
1627 <common_name>Millipede</common_name>
\r
1628 <rank>species</rank>
\r
1629 <uri>http://i.pbase.com/g4/59/68959/2/59864073.narceus0705062large.jpg</uri>
\r
1635 <id provider="uniprot">52428</id>
\r
1636 <scientific_name>Polyxenus lagurus</scientific_name>
\r
1637 <common_name>bristly millipede</common_name>
\r
1638 <rank>species</rank>
\r
1639 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/54/Polyxenus.lagurus.1.jpg</uri>
\r
1645 <id provider="uniprot">7540</id>
\r
1646 <scientific_name>Chilopoda</scientific_name>
\r
1647 <common_name>centipedes</common_name>
\r
1648 <rank>class</rank>
\r
1652 <id provider="uniprot">29022</id>
\r
1653 <code>SCUCO</code>
\r
1654 <scientific_name>Scutigera coleoptrata</scientific_name>
\r
1655 <common_name>House centipede</common_name>
\r
1656 <rank>species</rank>
\r
1657 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/14/Scutigera_coleoptrata.JPG</uri>
\r
1662 <id provider="uniprot">126957</id>
\r
1663 <scientific_name>Strigamia maritima</scientific_name>
\r
1664 <rank>species</rank>
\r
1665 <uri>http://images.marinespecies.org/resized/22703_strigamia-maritima-male-loch-linnhe-scotland.jpg</uri>
\r
1673 <id provider="uniprot">6945</id>
\r
1674 <code>IXOSC</code>
\r
1675 <scientific_name>Ixodes scapularis</scientific_name>
\r
1676 <common_name>Black-legged tick</common_name>
\r
1677 <synonym>Deer tick</synonym>
\r
1678 <rank>species</rank>
\r
1679 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/8/8c/Deertick.jpg</uri>
\r
1685 <id provider="uniprot">119089</id>
\r
1686 <scientific_name>Chromadorea</scientific_name>
\r
1687 <rank>class</rank>
\r
1689 <reference doi="10.1038/32160">
\r
1692 <name>nematode Clade V</name>
\r
1695 <id provider="uniprot">6237</id>
\r
1696 <scientific_name>Caenorhabditis</scientific_name>
\r
1697 <rank>genus</rank>
\r
1699 <reference doi="10.1073/pnas.0403094101">
\r
1700 <desc>Caenorhabditis phylogeny predicts convergence of hermaphroditism and extensive intron loss</desc>
\r
1703 <name>CAEBR & CAERE & CAEBE & CAEEL</name>
\r
1705 <name>CAEBR & CAERE & CAEBE</name>
\r
1707 <name>CAEBR & CAERE</name>
\r
1710 <id provider="uniprot">6238</id>
\r
1711 <code>CAEBR</code>
\r
1712 <scientific_name>Caenorhabditis briggsae</scientific_name>
\r
1713 <rank>species</rank>
\r
1714 <uri>http://www.life.umd.edu/biology/haag/briggsae_herm.jpg</uri>
\r
1719 <id provider="uniprot">31234</id>
\r
1720 <code>CAERE</code>
\r
1721 <scientific_name>Caenorhabditis remanei</scientific_name>
\r
1722 <synonym>Caenorhabditis vulgaris</synonym>
\r
1723 <rank>species</rank>
\r
1724 <uri>http://lemur.amu.edu.pl/share/php/mirnest/species_images/Caenorhabditis_remanei.jpg</uri>
\r
1730 <id provider="uniprot">135651</id>
\r
1731 <code>CAEBE</code>
\r
1732 <scientific_name>Caenorhabditis brenneri</scientific_name>
\r
1733 <common_name>Nematode worm</common_name>
\r
1734 <synonym>Caenorhabditis CB5161</synonym>
\r
1735 <rank>species</rank>
\r
1741 <id provider="uniprot">6239</id>
\r
1742 <code>CAEEL</code>
\r
1743 <scientific_name>Caenorhabditis elegans</scientific_name>
\r
1744 <rank>species</rank>
\r
1745 <uri>http://homepages.ed.ac.uk/mbx/C_elegans/N2_picture.gif</uri>
\r
1751 <id provider="uniprot">281687</id>
\r
1752 <code>CAEJA</code>
\r
1753 <scientific_name>Caenorhabditis japonica</scientific_name>
\r
1754 <rank>species</rank>
\r
1760 <id provider="uniprot">54126</id>
\r
1761 <code>PRIPA</code>
\r
1762 <scientific_name>Pristionchus pacificus</scientific_name>
\r
1763 <rank>species</rank>
\r
1764 <uri>http://smithlabdb.usc.edu/images/Pristionchus_pacificus.jpg</uri>
\r
1770 <id provider="uniprot">6279</id>
\r
1771 <code>BRUMA</code>
\r
1772 <scientific_name>Brugia malayi</scientific_name>
\r
1773 <common_name>Filarial nematode worm</common_name>
\r
1774 <rank>species</rank>
\r
1775 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4a/Brugia_malayi.JPG</uri>
\r
1781 <name>Lophotrochozoa</name>
\r
1783 <name>Annelida & Mollusca</name>
\r
1786 <id provider="uniprot">6447</id>
\r
1787 <scientific_name>Mollusca</scientific_name>
\r
1788 <rank>phylum</rank>
\r
1792 <id provider="uniprot">6448</id>
\r
1793 <scientific_name>Gastropoda</scientific_name>
\r
1794 <rank>class</rank>
\r
1798 <id provider="uniprot">6500</id>
\r
1799 <code>APLCA</code>
\r
1800 <scientific_name>Aplysia californica</scientific_name>
\r
1801 <common_name>California sea hare</common_name>
\r
1802 <rank>species</rank>
\r
1803 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/ef/Aplysia_californica.jpg</uri>
\r
1808 <id provider="uniprot">225164</id>
\r
1809 <code>LOTGI</code>
\r
1810 <scientific_name>Lottia gigantea</scientific_name>
\r
1811 <common_name>Owl limpet</common_name>
\r
1812 <rank>species</rank>
\r
1813 <uri>http://nathistoc.bio.uci.edu/Molluscs/OwlLimpet1.jpg</uri>
\r
1819 <id provider="uniprot">6545</id>
\r
1820 <scientific_name>Pteriomorphia</scientific_name>
\r
1821 <synonym>Pteriomorpha</synonym>
\r
1822 <rank>subclass</rank>
\r
1826 <id provider="uniprot">29159</id>
\r
1827 <code>CRAGI</code>
\r
1828 <scientific_name>Crassostrea gigas</scientific_name>
\r
1829 <authority>Thunberg, 1793</authority>
\r
1830 <common_name>Pacific oyster</common_name>
\r
1831 <synonym>Crassotrea gigas</synonym>
\r
1832 <synonym>Crassostrea angulata</synonym>
\r
1833 <synonym>Ostrea gigas</synonym>
\r
1834 <rank>species</rank>
\r
1835 <uri>http://www.marlin.ac.uk/imgs/o_cragig.jpg</uri>
\r
1840 <id provider="uniprot">50426</id>
\r
1841 <code>PINFU</code>
\r
1842 <scientific_name>Pinctada fucata</scientific_name>
\r
1843 <common_name>Pearl oyster</common_name>
\r
1844 <rank>species</rank>
\r
1845 <uri>http://www.elrincondelmalacologo.com/Web%20fotos%20marinos%20no%20gasteropodos/Fotos%20coleccion/Pteriidae/Pinctada%20fucata.jpg</uri>
\r
1852 <id provider="uniprot">6340</id>
\r
1853 <scientific_name>Annelida</scientific_name>
\r
1854 <rank>phylum</rank>
\r
1858 <id provider="uniprot">283909</id>
\r
1859 <code>CTEXX</code>
\r
1860 <scientific_name>Capitella teleta</scientific_name>
\r
1861 <authority>Blake, Grassle & Eckelbarger, 2009</authority>
\r
1862 <synonym>Capitella sp. I</synonym>
\r
1863 <rank>species</rank>
\r
1864 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Capca1/capitella.jpg</uri>
\r
1869 <id provider="uniprot">6412</id>
\r
1870 <code>HELRO</code>
\r
1871 <scientific_name>Helobdella robusta</scientific_name>
\r
1872 <common_name>Californian leech</common_name>
\r
1873 <rank>species</rank>
\r
1874 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Helro1/Helro_leech.jpg</uri>
\r
1881 <id provider="uniprot">6157</id>
\r
1882 <scientific_name>Platyhelminthes</scientific_name>
\r
1883 <rank>phylum</rank>
\r
1887 <id provider="uniprot">6183</id>
\r
1888 <code>SCHMA</code>
\r
1889 <scientific_name>Schistosoma mansoni</scientific_name>
\r
1890 <common_name>Blood fluke</common_name>
\r
1891 <rank>species</rank>
\r
1892 <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/Grzimek_inverts/Trematoda/Schistosoma_mansoni.jpg/medium.jpg</uri>
\r
1897 <id provider="uniprot">79327</id>
\r
1898 <code>SCHMD</code>
\r
1899 <scientific_name>Schmidtea mediterranea</scientific_name>
\r
1900 <common_name>Freshwater planarian flatworm</common_name>
\r
1901 <rank>species</rank>
\r
1902 <uri>http://www.astrobio.net/images/galleryimages_images/Gallery_Image_8136.jpg</uri>
\r
1910 <name>Cnidaria</name>
\r
1912 <id provider="uniprot">6073</id>
\r
1913 <scientific_name>Cnidaria</scientific_name>
\r
1914 <rank>phylum</rank>
\r
1918 <id provider="uniprot">6102</id>
\r
1919 <scientific_name>Hexacorallia</scientific_name>
\r
1920 <synonym>Ceriantipatharia</synonym>
\r
1921 <synonym>Zoantharia</synonym>
\r
1922 <rank>subclass</rank>
\r
1926 <id provider="uniprot">70779</id>
\r
1927 <code>ACRDI</code>
\r
1928 <scientific_name>Acropora digitifera</scientific_name>
\r
1929 <common_name>Staghorn coral</common_name>
\r
1930 <rank>species</rank>
\r
1931 <uri>http://www.botany.hawaii.edu/basch/uhnpscesu/htms/NPSAcorl/images/acropori/acrdigitif7.jpg</uri>
\r
1936 <id provider="uniprot">45351</id>
\r
1937 <code>NEMVE</code>
\r
1938 <scientific_name>Nematostella vectensis</scientific_name>
\r
1939 <common_name>Starlet sea anemone</common_name>
\r
1940 <rank>species</rank>
\r
1941 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Nemve1/Nematostellapolyp.jpg</uri>
\r
1947 <id provider="uniprot">6085</id>
\r
1948 <code>HMAXX</code>
\r
1949 <scientific_name>Hydra magnipapillata</scientific_name>
\r
1950 <authority>Ito, 1947</authority>
\r
1951 <rank>species</rank>
\r
1952 <uri>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/IMG/6085.gif</uri>
\r
1959 <id provider="uniprot">10228</id>
\r
1960 <code>TRIAD</code>
\r
1961 <scientific_name>Trichoplax adhaerens</scientific_name>
\r
1962 <synonym>Trichoplax reptans</synonym>
\r
1963 <rank>species</rank>
\r
1964 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Triad1/placozoan_signorovitch.jpg</uri>
\r
1966 <reference doi="10.1073/pnas.0602076103">
\r
1972 <id provider="uniprot">27923</id>
\r
1973 <code>MNELE</code>
\r
1974 <scientific_name>Mnemiopsis leidyi</scientific_name>
\r
1975 <authority>A. gassiz, 1865</authority>
\r
1976 <common_name>Sea walnut</common_name>
\r
1977 <rank>species</rank>
\r
1978 <uri>http://images.marinespecies.org/resized/12797_mnemiopsis-leidyi.jpg</uri>
\r
1979 <uri>http://i.livescience.com/images/i/000/014/544/original/mnemiopsis-leidyi-jellyfish-101014-02.jpg</uri>
\r
1984 <id provider="uniprot">400682</id>
\r
1985 <code>AMPQE</code>
\r
1986 <scientific_name>Amphimedon queenslandica</scientific_name>
\r
1987 <authority>Hooper & Van Soest, 2006</authority>
\r
1988 <common_name>Sponge</common_name>
\r
1989 <synonym>Reniera sp. JGI-2005</synonym>
\r
1990 <rank>species</rank>
\r
1991 <uri>http://images.marinespecies.org/resized/46694_amphimedon-queenslandica.jpg</uri>
\r
1997 <id provider="uniprot">81524</id>
\r
1998 <scientific_name>Codonosigidae</scientific_name>
\r
1999 <rank>family</rank>
\r
2003 <id provider="uniprot">81824</id>
\r
2004 <code>MONBE</code>
\r
2005 <scientific_name>Monosiga brevicollis</scientific_name>
\r
2006 <common_name>Choanoflagellate</common_name>
\r
2007 <rank>species</rank>
\r
2008 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Monbr1/Monosiga_1.jpg</uri>
\r
2013 <id provider="uniprot">946362</id>
\r
2014 <code>SALS5</code>
\r
2015 <scientific_name>Salpingoeca rosetta</scientific_name>
\r
2016 <synonym>Proterospongia sp. ATCC 50818</synonym>
\r
2017 <synonym>Salpingoeca sp. ATCC 50818</synonym>
\r
2018 <rank>species</rank>
\r
2019 <uri>http://cfb.unh.edu/phycokey/Choices/Amoebae_Flagellates_Ciliates/Choanoflagellates/SALPINGOECA/salpingoeca_02_300x240_Kalle%20Olli_botany.ut.ee.jpg</uri>
\r
2025 <name>Ichthyophonida & Filasterea</name>
\r
2028 <id provider="uniprot">198625</id>
\r
2029 <scientific_name>Ichthyophonida</scientific_name>
\r
2030 <rank>order</rank>
\r
2034 <id provider="uniprot">4881</id>
\r
2035 <code>AMOPA</code>
\r
2036 <scientific_name>Amoebidium parasiticum</scientific_name>
\r
2037 <rank>species</rank>
\r
2038 <uri>http://www.nhm.ku.edu/~fungi/Ilustgenera/amoebi.jpg</uri>
\r
2043 <id provider="uniprot">72019</id>
\r
2044 <code>SARXX</code>
\r
2045 <scientific_name>Sphaeroforma arctica</scientific_name>
\r
2046 <rank>species</rank>
\r
2047 <uri>http://www.sciencedirect.com/cache/MiamiImageURL/1-s2.0-S0168952507000236-gr2.jpg</uri>
\r
2053 <scientific_name>Filasterea</scientific_name>
\r
2055 <reference doi="10.1371/journal.pone.0002098">
\r
2061 <id provider="uniprot">595528</id>
\r
2062 <code>CAPO3</code>
\r
2063 <scientific_name>Capsaspora owczarzaki (strain ATCC 30864)</scientific_name>
\r
2064 <uri>http://www.berfrois.com/wp-content/uploads/2011/03/Capsaspora_owczarzaki.jpg</uri>
\r
2069 <id provider="uniprot">134558</id>
\r
2070 <scientific_name>Ministeria vibrans</scientific_name>
\r
2071 <rank>species</rank>
\r
2072 <uri>http://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S0959437X03001382-gr2.jpg</uri>
\r
2080 <scientific_name>Holomycota</scientific_name>
\r
2081 <synonym>Nucletmycea</synonym>
\r
2085 <id provider="uniprot">4751</id>
\r
2086 <scientific_name>Fungi</scientific_name>
\r
2087 <rank>kingdom</rank>
\r
2090 <name>Dikarya & Mucoromycotina & Kickxellomycotina & Blastocladiomycota & Chytridiomycota & Neocallimastigomycota</name>
\r
2092 <name>Dikarya & Mucoromycotina & Kickxellomycotina & Blastocladiomycota & Chytridiomycota</name>
\r
2094 <name>Dikarya & Mucoromycotina & Kickxellomycotina & Blastocladiomycota</name>
\r
2096 <name>Dikarya & Mucoromycotina & Kickxellomycotina</name>
\r
2098 <name>Dikarya & Mucoromycotina</name>
\r
2101 <id provider="uniprot">451864</id>
\r
2102 <scientific_name>Dikarya</scientific_name>
\r
2103 <rank>subkingdom</rank>
\r
2105 <reference doi="10.1038/nature05110">
\r
2111 <id provider="uniprot">4890</id>
\r
2112 <scientific_name>Ascomycota</scientific_name>
\r
2113 <rank>phylum</rank>
\r
2116 <name>Pezizomycotina & Saccharomycetales</name>
\r
2119 <id provider="uniprot">147538</id>
\r
2120 <scientific_name>Pezizomycotina</scientific_name>
\r
2121 <synonym>Euascomycota</synonym>
\r
2122 <rank>subphylum</rank>
\r
2124 <reference doi="0.3852/mycologia.98.6.1018">
\r
2125 <desc>A five-gene phylogeny of Pezizomycotina</desc>
\r
2131 <id provider="uniprot">716546</id>
\r
2132 <scientific_name>Leotiomyceta</scientific_name>
\r
2135 <name>Sordariomyceta & Dothideomycetes & Trichocomaceae & Lecanoromycetes</name>
\r
2137 <name>Sordariomyceta & Dothideomycetes & Lecanoromycetes</name>
\r
2139 <name>Sordariomyceta & Lecanoromycetes</name>
\r
2142 <id provider="uniprot">715989</id>
\r
2143 <scientific_name>Sordariomyceta</scientific_name>
\r
2147 <id provider="uniprot">147550</id>
\r
2148 <scientific_name>Sordariomycetes</scientific_name>
\r
2149 <rank>class</rank>
\r
2152 <name>Magnaporthales & Hypocreales</name>
\r
2155 <id provider="uniprot">5125</id>
\r
2156 <scientific_name>Hypocreales</scientific_name>
\r
2157 <rank>order</rank>
\r
2161 <id provider="uniprot">398408</id>
\r
2162 <code>AALXX</code>
\r
2163 <scientific_name>Acremonium alcalophilum</scientific_name>
\r
2164 <rank>species</rank>
\r
2165 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Acral1_c3a/Acral1.jpg</uri>
\r
2170 <id provider="uniprot">5518</id>
\r
2171 <code>GIBZE</code>
\r
2172 <scientific_name>Gibberella zeae</scientific_name>
\r
2173 <common_name>Wheat head blight fungus</common_name>
\r
2174 <synonym>Fusarium graminearum</synonym>
\r
2175 <rank>species</rank>
\r
2176 <uri>http://www.apsnet.org/publications/apsnetfeatures/PublishingImages/1999%20Features/Fusarium02sm.jpg</uri>
\r
2181 <id provider="uniprot">29875</id>
\r
2182 <code>HYPVI</code>
\r
2183 <scientific_name>Hypocrea virens</scientific_name>
\r
2184 <common_name>Gliocladium virens</common_name>
\r
2185 <synonym>Trichoderma virens</synonym>
\r
2186 <synonym>Gliocladium flavofuscum</synonym>
\r
2187 <rank>species</rank>
\r
2188 <uri>http://www.ars.usda.gov/images/docs/10920_11114/Stroma1.jpg</uri>
\r
2194 <id provider="uniprot">148305</id>
\r
2195 <code>MAGGR</code>
\r
2196 <scientific_name>Magnaporthe grisea</scientific_name>
\r
2197 <common_name>Rice blast fungus</common_name>
\r
2198 <synonym>Pyricularia grisea</synonym>
\r
2199 <rank>species</rank>
\r
2200 <uri>http://www.forestryimages.org/images/768x512/5369002.jpg</uri>
\r
2206 <id provider="uniprot">5139</id>
\r
2207 <scientific_name>Sordariales</scientific_name>
\r
2208 <rank>order</rank>
\r
2212 <id provider="uniprot">35718</id>
\r
2213 <scientific_name>Chaetomiaceae</scientific_name>
\r
2214 <rank>family</rank>
\r
2218 <id provider="uniprot">35719</id>
\r
2219 <scientific_name>Thielavia</scientific_name>
\r
2220 <rank>genus</rank>
\r
2224 <id provider="uniprot">573729</id>
\r
2225 <code>THIHA</code>
\r
2226 <scientific_name>Thielavia heterothallica (strain ATCC 42464 / BCRC 31852 / DSM 1799)</scientific_name>
\r
2227 <authority>(Apinis) Oorschot 1977</authority>
\r
2228 <synonym>Sporotrichum thermophilum</synonym>
\r
2229 <synonym>Myceliophthora thermophila</synonym>
\r
2230 <rank>species</rank>
\r
2231 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Spoth2/Spoth0.jpg</uri>
\r
2236 <id provider="uniprot">578455</id>
\r
2237 <code>THITE</code>
\r
2238 <scientific_name>Thielavia terrestris (strain ATCC 38088 / NRRL 8126)</scientific_name>
\r
2239 <synonym>Acremonium alabamense</synonym>
\r
2240 <synonym>Thielavia terrestris NRRL 8126</synonym>
\r
2241 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Thite2/Thite1.jpg</uri>
\r
2247 <id provider="eol">1029505</id>
\r
2248 <code>CHAGB</code>
\r
2249 <scientific_name>Chaetomium globosum</scientific_name>
\r
2250 <authority>Kunze 1817</authority>
\r
2251 <common_name>Soil fungus</common_name>
\r
2252 <rank>species</rank>
\r
2258 <id provider="uniprot">5141</id>
\r
2259 <code>NEUCR</code>
\r
2260 <scientific_name>Neurospora crassa</scientific_name>
\r
2261 <rank>species</rank>
\r
2268 <id provider="uniprot">147548</id>
\r
2269 <scientific_name>Leotiomycetes</scientific_name>
\r
2270 <rank>class</rank>
\r
2274 <id provider="uniprot">28983</id>
\r
2275 <scientific_name>Sclerotiniaceae</scientific_name>
\r
2276 <rank>family</rank>
\r
2280 <id provider="uniprot">40559</id>
\r
2281 <code>BOTFU</code>
\r
2282 <scientific_name>Botryotinia fuckeliana</scientific_name>
\r
2283 <common_name>Noble rot fungus</common_name>
\r
2284 <synonym>Botrytis cinerea</synonym>
\r
2285 <rank>species</rank>
\r
2290 <id provider="uniprot">5180</id>
\r
2291 <code>SCLSC</code>
\r
2292 <scientific_name>Sclerotinia sclerotiorum</scientific_name>
\r
2293 <common_name>White mold</common_name>
\r
2294 <synonym>Whetzelinia sclerotiorum</synonym>
\r
2295 <rank>species</rank>
\r
2301 <id provider="uniprot">78148</id>
\r
2302 <scientific_name>Oidiodendron maius</scientific_name>
\r
2303 <rank>species</rank>
\r
2310 <id provider="uniprot">388435</id>
\r
2311 <scientific_name>Lecanoromycetidae</scientific_name>
\r
2312 <rank>subclass</rank>
\r
2316 <id provider="uniprot">27339</id>
\r
2317 <scientific_name>Cladonia grayi</scientific_name>
\r
2318 <synonym>Cladonia grayi Merr</synonym>
\r
2319 <rank>species</rank>
\r
2320 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b6/Cladonia_grayi-11.jpg</uri>
\r
2325 <id provider="uniprot">107463</id>
\r
2326 <scientific_name>Xanthoria parietina</scientific_name>
\r
2327 <rank>species</rank>
\r
2328 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/70/Xanthoria_parietina_%2806_03_31%29.jpg/800px-Xanthoria_parietina_%2806_03_31%29.jpg</uri>
\r
2335 <id provider="uniprot">147541</id>
\r
2336 <scientific_name>Dothideomycetes</scientific_name>
\r
2337 <rank>class</rank>
\r
2339 <reference doi="10.3114/sim.2009.64.01">
\r
2340 <desc>A class-wide phylogenetic assessment of Dothideomycetes</desc>
\r
2344 <id provider="uniprot">134362</id>
\r
2345 <scientific_name>Capnodiales</scientific_name>
\r
2346 <rank>order</rank>
\r
2350 <id provider="uniprot">41254</id>
\r
2351 <scientific_name>Mycosphaerella</scientific_name>
\r
2352 <rank>genus</rank>
\r
2356 <id provider="uniprot">83344</id>
\r
2357 <scientific_name>Mycosphaerella fijiensis</scientific_name>
\r
2358 <rank>species</rank>
\r
2363 <id provider="uniprot">54734</id>
\r
2364 <code>MYCGR</code>
\r
2365 <scientific_name>Mycosphaerella graminicola</scientific_name>
\r
2366 <common_name>Speckled leaf blotch fungus</common_name>
\r
2367 <synonym>Septoria tritici</synonym>
\r
2368 <rank>species</rank>
\r
2373 <id provider="uniprot">64363</id>
\r
2374 <code>MYCPJ</code>
\r
2375 <scientific_name>Mycosphaerella pini</scientific_name>
\r
2376 <common_name>Red band needle blight disease fungus</common_name>
\r
2377 <synonym>Dothistroma septosporum</synonym>
\r
2378 <synonym>Dothistroma pini</synonym>
\r
2379 <rank>species</rank>
\r
2384 <id provider="uniprot">692275</id>
\r
2385 <code>MPSXX</code>
\r
2386 <scientific_name>Mycosphaerella populorum SO2202</scientific_name>
\r
2387 <synonym>Septoria musiva SO2202</synonym>
\r
2388 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Sepmu1/Septoria-musiva-colony-abundantly-sporulating-2.jpg</uri>
\r
2394 <id provider="uniprot">430998</id>
\r
2395 <code>BCOXX</code>
\r
2396 <scientific_name>Baudoinia compniacensis</scientific_name>
\r
2397 <rank>species</rank>
\r
2398 <uri>http://www.botanicalgarden.ubc.ca/potd/images/2011/baudoinia-compniacensis2.jpg</uri>
\r
2404 <id provider="uniprot">715340</id>
\r
2405 <scientific_name>Pleosporineae</scientific_name>
\r
2406 <rank>suborder</rank>
\r
2410 <id provider="uniprot">28556</id>
\r
2411 <scientific_name>Pleosporaceae</scientific_name>
\r
2412 <rank>family</rank>
\r
2415 <name>Cochliobolus & Setosphaeria</name>
\r
2418 <id provider="uniprot">5015</id>
\r
2419 <scientific_name>Cochliobolus</scientific_name>
\r
2420 <rank>genus</rank>
\r
2424 <id provider="uniprot">5016</id>
\r
2425 <code>COCHE</code>
\r
2426 <scientific_name>Cochliobolus heterostrophus</scientific_name>
\r
2427 <synonym>Drechslera maydis</synonym>
\r
2428 <rank>species</rank>
\r
2433 <id provider="uniprot">45130</id>
\r
2434 <code>COCSA</code>
\r
2435 <scientific_name>Cochliobolus sativus</scientific_name>
\r
2436 <synonym>Bipolaris sorokiniana</synonym>
\r
2437 <rank>species</rank>
\r
2438 <uri>http://www.plantmanagementnetwork.org/pub/php/diagnosticguide/2003/rootrot/image/mathre6sm.jpg</uri>
\r
2444 <id provider="uniprot">93612</id>
\r
2445 <code>SETTU</code>
\r
2446 <scientific_name>Setosphaeria turcica</scientific_name>
\r
2447 <authority>(Luttr.) K.J. Leonard & Suggs, (1974)</authority>
\r
2448 <common_name>Northern corn leaf blight disease fungus</common_name>
\r
2449 <synonym>Exserohilum turcicum</synonym>
\r
2450 <synonym>Helminthosporium turcicum</synonym>
\r
2451 <rank>species</rank>
\r
2457 <id provider="uniprot">426418</id>
\r
2458 <code>PYRTR</code>
\r
2459 <scientific_name>Pyrenophora tritici-repentis (strain Pt-1C-BFP)</scientific_name>
\r
2460 <common_name>Wheat tan spot fungus</common_name>
\r
2461 <synonym>Drechslera tritici-repentis</synonym>
\r
2467 <id provider="uniprot">13684</id>
\r
2468 <code>PHANO</code>
\r
2469 <scientific_name>Phaeosphaeria nodorum</scientific_name>
\r
2470 <common_name>Glume blotch fungus</common_name>
\r
2471 <synonym>Septoria nodorum</synonym>
\r
2472 <rank>species</rank>
\r
2480 <id provider="uniprot">28568</id>
\r
2481 <scientific_name>Trichocomaceae</scientific_name>
\r
2482 <rank>family</rank>
\r
2486 <id provider="uniprot">5052</id>
\r
2487 <scientific_name>Aspergillus</scientific_name>
\r
2488 <rank>genus</rank>
\r
2492 <scientific_name>Aspergillus flavus</scientific_name>
\r
2496 <id provider="uniprot">5059</id>
\r
2497 <code>ASPFL</code>
\r
2498 <scientific_name>Aspergillus flavus</scientific_name>
\r
2499 <authority>Link 1809</authority>
\r
2500 <synonym>Petromyces flavus</synonym>
\r
2501 <rank>species</rank>
\r
2502 <uri>http://www.schoolproject2.ewebsite.com/img/original/21/aspergillus-flavus.jpg</uri>
\r
2507 <id provider="uniprot">332952</id>
\r
2508 <code>ASPFN</code>
\r
2509 <scientific_name>Aspergillus flavus (strain ATCC 200026 / FGSC A1120 / NRRL 3357 / JCM 12722 / SRRC 167)</scientific_name>
\r
2510 <synonym>Aspergillus flavus NRRL3357</synonym>
\r
2516 <id provider="uniprot">5061</id>
\r
2517 <code>ASPNG</code>
\r
2518 <scientific_name>Aspergillus niger</scientific_name>
\r
2519 <rank>species</rank>
\r
2524 <name>Neosartorya & Emericella</name>
\r
2527 <id provider="eol">195546</id>
\r
2528 <code>EMENI</code>
\r
2529 <scientific_name>Emericella nidulans</scientific_name>
\r
2530 <authority>Vuill. 1927</authority>
\r
2531 <synonym>Aspergillus nidulans</synonym>
\r
2532 <rank>species</rank>
\r
2537 <id provider="uniprot">331117</id>
\r
2538 <code>NEOFI</code>
\r
2539 <scientific_name>Neosartorya fischeri (strain ATCC 1020 / DSM 3700 / FGSC A1164 / NRRL 181)</scientific_name>
\r
2540 <synonym>Aspergillus fischerianus</synonym>
\r
2548 <id provider="uniprot">33183</id>
\r
2549 <scientific_name>Onygenales</scientific_name>
\r
2550 <rank>order</rank>
\r
2554 <id provider="uniprot">5501</id>
\r
2555 <code>COCIM</code>
\r
2556 <scientific_name>Coccidioides immitis</scientific_name>
\r
2557 <common_name>Valley fever fungus</common_name>
\r
2558 <rank>species</rank>
\r
2563 <id provider="uniprot">336963</id>
\r
2564 <code>UNCRE</code>
\r
2565 <scientific_name>Uncinocarpus reesii (strain UAMH 1704)</scientific_name>
\r
2572 <id provider="uniprot">656061</id>
\r
2573 <code>TUBMM</code>
\r
2574 <scientific_name>Tuber melanosporum (strain Mel28)</scientific_name>
\r
2575 <common_name>Perigord black truffle</common_name>
\r
2576 <synonym>Tuber melanosporum Mel28</synonym>
\r
2577 <uri>http://www.trufamania.com/trufas/Tuber%20melanosporum02.jpg</uri>
\r
2583 <id provider="uniprot">4892</id>
\r
2584 <scientific_name>Saccharomycetales</scientific_name>
\r
2585 <common_name>budding yeasts</common_name>
\r
2586 <rank>order</rank>
\r
2589 <name>Candida & Debaryomyces & Saccharomycetacea</name>
\r
2592 <id provider="uniprot">4893</id>
\r
2593 <scientific_name>Saccharomycetaceae</scientific_name>
\r
2594 <rank>family</rank>
\r
2597 <name>Saccharomyces_Pichia</name>
\r
2599 <name>Saccharomyces</name>
\r
2602 <id provider="uniprot">27288</id>
\r
2603 <code>SACCA</code>
\r
2604 <scientific_name>Saccharomyces castellii</scientific_name>
\r
2605 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2606 <synonym>Saccharomyces castellii</synonym>
\r
2607 <rank>species</rank>
\r
2612 <id provider="uniprot">4932</id>
\r
2613 <code>YEAST</code>
\r
2614 <scientific_name>Saccharomyces cerevisiae</scientific_name>
\r
2615 <common_name>Baker's yeast</common_name>
\r
2616 <rank>species</rank>
\r
2622 <id provider="uniprot">4905</id>
\r
2623 <code>PICAN</code>
\r
2624 <scientific_name>Pichia angusta</scientific_name>
\r
2625 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2626 <synonym>Hansenula polymorpha</synonym>
\r
2627 <rank>species</rank>
\r
2632 <name>Kluyveromyces & Ashbya</name>
\r
2634 <name>Kluyveromyces</name>
\r
2637 <id provider="uniprot">28985</id>
\r
2638 <code>KLULA</code>
\r
2639 <scientific_name>Kluyveromyces lactis</scientific_name>
\r
2640 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2641 <synonym>Candida sphaerica</synonym>
\r
2642 <rank>species</rank>
\r
2647 <id provider="uniprot">4914</id>
\r
2648 <code>KLUWA</code>
\r
2649 <scientific_name>Kluyveromyces waltii</scientific_name>
\r
2650 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2651 <rank>species</rank>
\r
2657 <id provider="uniprot">33169</id>
\r
2658 <code>ASHGO</code>
\r
2659 <scientific_name>Ashbya gossypii</scientific_name>
\r
2660 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2661 <synonym>Eremothecium gossypii</synonym>
\r
2662 <rank>species</rank>
\r
2668 <name>Candida & Debaryomyces</name>
\r
2671 <id provider="uniprot">5475</id>
\r
2672 <scientific_name>Candida</scientific_name>
\r
2673 <rank>genus</rank>
\r
2677 <id provider="uniprot">5476</id>
\r
2678 <code>CANAL</code>
\r
2679 <scientific_name>Candida albicans</scientific_name>
\r
2680 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2681 <rank>species</rank>
\r
2686 <id provider="uniprot">5482</id>
\r
2687 <code>CANTR</code>
\r
2688 <scientific_name>Candida tropicalis</scientific_name>
\r
2689 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2690 <rank>species</rank>
\r
2696 <id provider="uniprot">4959</id>
\r
2697 <code>DEBHA</code>
\r
2698 <scientific_name>Debaryomyces hansenii</scientific_name>
\r
2699 <common_name>Yeast</common_name>
\r
2700 <synonym>Torulaspora hansenii</synonym>
\r
2701 <rank>species</rank>
\r
2708 <id provider="uniprot">4952</id>
\r
2709 <code>YARLI</code>
\r
2710 <scientific_name>Yarrowia lipolytica</scientific_name>
\r
2711 <synonym>Candida lipolytica</synonym>
\r
2712 <rank>species</rank>
\r
2719 <id provider="uniprot">451866</id>
\r
2720 <scientific_name>Taphrinomycotina</scientific_name>
\r
2721 <rank>subphylum</rank>
\r
2724 <name>Pneumocystidomycetes & Schizosaccharomycetes</name>
\r
2727 <id provider="uniprot">4895</id>
\r
2728 <scientific_name>Schizosaccharomyces</scientific_name>
\r
2729 <rank>genus</rank>
\r
2733 <id provider="uniprot">4897</id>
\r
2734 <code>SCHJP</code>
\r
2735 <scientific_name>Schizosaccharomyces japonicus</scientific_name>
\r
2736 <common_name>Fission yeast</common_name>
\r
2737 <rank>species</rank>
\r
2742 <id provider="uniprot">4899</id>
\r
2743 <code>SCHOT</code>
\r
2744 <scientific_name>Schizosaccharomyces octosporus</scientific_name>
\r
2745 <common_name>Fission yeast</common_name>
\r
2746 <rank>species</rank>
\r
2747 <uri>http://www.dipbot.unict.it/sistematica/Immagini/12002.JPG</uri>
\r
2752 <id provider="uniprot">4896</id>
\r
2753 <code>SCHPO</code>
\r
2754 <scientific_name>Schizosaccharomyces pombe</scientific_name>
\r
2755 <common_name>Fission yeast</common_name>
\r
2756 <rank>species</rank>
\r
2762 <id provider="uniprot">4754</id>
\r
2763 <code>PNECA</code>
\r
2764 <scientific_name>Pneumocystis carinii</scientific_name>
\r
2765 <rank>species</rank>
\r
2771 <id provider="uniprot">5606</id>
\r
2772 <scientific_name>Saitoella complicata</scientific_name>
\r
2773 <rank>species</rank>
\r
2780 <id provider="uniprot">5204</id>
\r
2781 <scientific_name>Basidiomycota</scientific_name>
\r
2782 <rank>phylum</rank>
\r
2785 <name>Agaricomycotina & Ustilaginomycotina & Pucciniomycotina</name>
\r
2787 <name>Agaricomycotina & Ustilaginomycotina</name>
\r
2790 <id provider="uniprot">5302</id>
\r
2791 <scientific_name>Agaricomycotina</scientific_name>
\r
2795 <id provider="uniprot">155619</id>
\r
2796 <scientific_name>Homobasidiomycetes</scientific_name>
\r
2797 <rank>class</rank>
\r
2799 <reference doi="10.1098/rspb.2002.2123">
\r
2800 <desc>Evolution of complex fruiting–body morphologies in homobasidiomycetes</desc>
\r
2803 <name>Agaricomycetidae & Gloeophyllum & Aphyllophorales</name>
\r
2805 <name>Agaricomycetidae & Gloeophyllum</name>
\r
2808 <id provider="uniprot">452333</id>
\r
2809 <scientific_name>Agaricomycetidae</scientific_name>
\r
2810 <rank>subclass</rank>
\r
2813 <name>Agaricales & Boletales</name>
\r
2816 <id provider="uniprot">5338</id>
\r
2817 <scientific_name>Agaricales</scientific_name>
\r
2818 <rank>order</rank>
\r
2821 <name>Agaricus & Coprinopsis & Laccaria & Pleurotus</name>
\r
2823 <name>Agaricus & Coprinopsis & Laccaria</name>
\r
2825 <name>Agaricus & Coprinopsis</name>
\r
2828 <id provider="uniprot">597362</id>
\r
2829 <code>AGABU</code>
\r
2830 <scientific_name>Agaricus bisporus var. burnettii (strain JB137-S8 / ATCC MYA-4627 / FGSC 10392)</scientific_name>
\r
2831 <common_name>White button mushroom</common_name>
\r
2832 <synonym>Agaricus bisporus var. burnettii JB137-S8</synonym>
\r
2833 <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Agaricus_bisporus(fs-03).jpg</uri>
\r
2838 <id provider="uniprot">5346</id>
\r
2839 <code>COPCI</code>
\r
2840 <scientific_name>Coprinopsis cinerea</scientific_name>
\r
2841 <common_name>Inky cap fungus</common_name>
\r
2842 <synonym>Hormographiella aspergillata</synonym>
\r
2843 <rank>species</rank>
\r
2844 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e9/Coprinopsis.cinerea.-.lindsey.jpg</uri>
\r
2850 <id provider="uniprot">29883</id>
\r
2851 <code>LACBI</code>
\r
2852 <scientific_name>Laccaria bicolor</scientific_name>
\r
2853 <common_name>Bicoloured deceiver</common_name>
\r
2854 <synonym>Laccaria laccata var. bicolor</synonym>
\r
2855 <rank>species</rank>
\r
2856 <uri>http://botit.botany.wisc.edu/toms_fungi/images/L_bicolor_NM.JPG</uri>
\r
2862 <id provider="uniprot">206324</id>
\r
2863 <scientific_name>Gymnopus luxurians</scientific_name>
\r
2864 <rank>species</rank>
\r
2865 <uri>http://www.mushroomexpert.com/images/kuo3/gymnopus_luxurians_02.jpg</uri>
\r
2871 <id provider="uniprot">5322</id>
\r
2872 <code>PLEOS</code>
\r
2873 <scientific_name>Pleurotus ostreatus</scientific_name>
\r
2874 <common_name>Oyster mushroom</common_name>
\r
2875 <synonym>White-rot fungus</synonym>
\r
2876 <rank>species</rank>
\r
2877 <uri>http://botit.botany.wisc.edu/toms_fungi/images/post1.jpg</uri>
\r
2883 <id provider="uniprot">68889</id>
\r
2884 <scientific_name>Boletales</scientific_name>
\r
2885 <synonym>Melanogastrales</synonym>
\r
2886 <synonym>Sclerodermatales</synonym>
\r
2887 <rank>order</rank>
\r
2891 <id provider="uniprot">227334</id>
\r
2892 <scientific_name>Coniophorineae</scientific_name>
\r
2893 <rank>suborder</rank>
\r
2897 <id provider="uniprot">80637</id>
\r
2898 <code>CPUXX</code>
\r
2899 <scientific_name>Coniophora puteana</scientific_name>
\r
2900 <authority>Schum. ex Fries</authority>
\r
2901 <common_name>cellar fungus</common_name>
\r
2902 <rank>species</rank>
\r
2903 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Conpu1/P1240066_dp.jpg</uri>
\r
2908 <id provider="uniprot">578457</id>
\r
2909 <code>SERL9</code>
\r
2910 <scientific_name>Serpula lacrymans var. lacrymans (strain S7.9)</scientific_name>
\r
2911 <common_name>Dry rot fungus</common_name>
\r
2912 <uri>http://www.anbg.gov.au/fungi/images/0160.jpg</uri>
\r
2918 <id provider="uniprot">388859</id>
\r
2919 <scientific_name>Hydnomerulius pinastri</scientific_name>
\r
2920 <common_name>Spiny dry rot fungus</common_name>
\r
2921 <rank>species</rank>
\r
2922 <uri>http://genome.jgi.doe.gov/public/Hydpi1/Hydnomerulius_pinastri.jpg</uri>
\r
2929 <id provider="uniprot">202697</id>
\r
2930 <scientific_name>Jaapia argillacea</scientific_name>
\r
2931 <rank>species</rank>
\r
2932 <uri>http://mycor.nancy.inra.fr/blogGenomes/wp-content/uploads/2012/08/IMG_21261.jpg</uri>
\r
2938 <id provider="uniprot">104355</id>
\r
2939 <code>GLOTR</code>
\r
2940 <scientific_name>Gloeophyllum trabeum</scientific_name>
\r
2941 <common_name>Brown rot fungus</common_name>
\r
2942 <rank>species</rank>
\r
2943 <uri>http://www.commanster.eu/commanster/Mushrooms/Basidio/SpBasidio/Gloeophyllum.trabeum.jpg</uri>
\r
2949 <id provider="uniprot">5303</id>
\r
2950 <scientific_name>Aphyllophorales</scientific_name>
\r
2951 <authority>Gäum. (1926)</authority>
\r
2952 <common_name>Shelf Fungi</common_name>
\r
2953 <synonym>Polyporales</synonym>
\r
2954 <rank>order</rank>
\r
2958 <id provider="uniprot">83233</id>
\r
2959 <scientific_name>Coriolaceae</scientific_name>
\r
2960 <rank>family</rank>
\r
2962 <reference doi="10.1017/S1477200005001623">
\r
2963 <desc>The phylogenetic distribution of resupinate forms across the major clades of mushroom-forming fungi (Homobasidiomycetes)</desc>
\r
2970 <name>Postia & Fomitopsis & Wolfiporia & Trametes</name>
\r
2972 <name>Antrodia clade</name>
\r
2974 <common_name>Antrodia clade</common_name>
\r
2978 <id provider="uniprot">40483</id>
\r
2979 <code>FPIXX</code>
\r
2980 <scientific_name>Fomitopsis pinicola</scientific_name>
\r
2981 <authority>(Swartz) P. Karsten</authority>
\r
2982 <common_name>Red banded polypore</common_name>
\r
2983 <synonym>Fomes pinicola</synonym>
\r
2984 <synonym>Boletus pinicola</synonym>
\r
2985 <rank>species</rank>
\r
2986 <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Fomitopsis_pinicola(mgw-02).jpg</uri>
\r
2991 <id provider="uniprot">104341</id>
\r
2992 <code>PPLXX</code>
\r
2993 <scientific_name>Postia placenta</scientific_name>
\r
2994 <synonym>Rhodonia placenta</synonym>
\r
2995 <rank>species</rank>
\r
2996 <uri>http://www.commanster.eu/commanster/Mushrooms/Polypore/SuPolypore/Postia.placenta.jpg</uri>
\r
3001 <name>core polyporoid clade</name>
\r
3003 <common_name>core polyporoid clade</common_name>
\r
3007 <id provider="uniprot">5325</id>
\r
3008 <code>TRAVE</code>
\r
3009 <scientific_name>Trametes versicolor</scientific_name>
\r
3010 <authority>(L.) Lloyd 1921</authority>
\r
3011 <common_name>White-rot fungus</common_name>
\r
3012 <synonym>Coriolus versicolor</synonym>
\r
3013 <synonym>Bjerkandera versicolor</synonym>
\r
3014 <rank>species</rank>
\r
3015 <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(bab-1).jpg</uri>
\r
3016 <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(bab-2).jpg</uri>
\r
3017 <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(mgw-01).jpg</uri>
\r
3022 <id provider="uniprot">742152</id>
\r
3023 <code>WOLCO</code>
\r
3024 <scientific_name>Wolfiporia cocos (strain MD-104)</scientific_name>
\r
3025 <common_name>Brown rot fungus</common_name>
\r
3026 <synonym>Wolfiporia cocos MD-104 SS10</synonym>
\r
3027 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Wolco1/W_cocos_CA-b1.jpg</uri>
\r
3034 <id provider="uniprot">42742</id>
\r
3035 <code>CERSU</code>
\r
3036 <scientific_name>Ceriporiopsis subvermispora</scientific_name>
\r
3037 <rank>species</rank>
\r
3043 <id provider="uniprot">732165</id>
\r
3044 <code>DICSQ</code>
\r
3045 <scientific_name>Dichomitus squalens (strain LYAD-421)</scientific_name>
\r
3046 <common_name>Western red white-rot fungus</common_name>
\r
3047 <synonym>Dichomitus squalens LYAD-421 SS1</synonym>
\r
3048 <uri>http://www.fs.fed.us/r3/resources/health/field-guide/images/large/sds-f199-large.jpg</uri>
\r
3055 <id provider="uniprot">13563</id>
\r
3056 <code>HETAN</code>
\r
3057 <scientific_name>Heterobasidion annosum</scientific_name>
\r
3058 <common_name>Root rot fungus</common_name>
\r
3059 <rank>species</rank>
\r
3065 <id provider="uniprot">5215</id>
\r
3066 <scientific_name>Tremellaceae</scientific_name>
\r
3067 <rank>family</rank>
\r
3071 <id provider="uniprot">5207</id>
\r
3072 <code>CRYNE</code>
\r
3073 <scientific_name>Cryptococcus neoformans</scientific_name>
\r
3074 <synonym>Filobasidiella neoformans</synonym>
\r
3075 <rank>species</rank>
\r
3080 <id provider="eol">1029985</id>
\r
3081 <code>TREME</code>
\r
3082 <scientific_name>Tremella mesenterica</scientific_name>
\r
3083 <authority>Pers. 1800</authority>
\r
3084 <common_name>Jelly fungus</common_name>
\r
3085 <synonym>Yellow Brain</synonym>
\r
3086 <synonym>Tremella lutescens</synonym>
\r
3087 <rank>species</rank>
\r
3094 <id provider="uniprot">452284</id>
\r
3095 <scientific_name>Ustilaginomycotina</scientific_name>
\r
3096 <rank>subphylum</rank>
\r
3100 <id provider="uniprot">425265</id>
\r
3101 <code>MALGO</code>
\r
3102 <scientific_name>Malassezia globosa (strain ATCC MYA-4612 / CBS 7966)</scientific_name>
\r
3103 <common_name>Dandruff-associated fungus</common_name>
\r
3108 <id provider="uniprot">5270</id>
\r
3109 <code>USTMA</code>
\r
3110 <scientific_name>Ustilago maydis</scientific_name>
\r
3111 <common_name>Smut fungus</common_name>
\r
3112 <rank>species</rank>
\r
3119 <id provider="uniprot">29000</id>
\r
3120 <scientific_name>Pucciniomycotina</scientific_name>
\r
3121 <rank>subphylum</rank>
\r
3125 <id provider="uniprot">5258</id>
\r
3126 <scientific_name>Pucciniales</scientific_name>
\r
3127 <common_name>rusts</common_name>
\r
3128 <rank>order</rank>
\r
3132 <id provider="eol">156696</id>
\r
3133 <code>MELLP</code>
\r
3134 <scientific_name>Melampsora laricis-populina</scientific_name>
\r
3135 <authority>Kleb. 1902</authority>
\r
3136 <synonym>Melampsora larici-populina</synonym>
\r
3137 <synonym>Melampsora laricipopulina</synonym>
\r
3138 <rank>species</rank>
\r
3143 <id provider="eol">1029947</id>
\r
3144 <code>PUCGR</code>
\r
3145 <scientific_name>Puccinia graminis</scientific_name>
\r
3146 <authority>Pers. 1794</authority>
\r
3147 <common_name>Black stem rust fungus</common_name>
\r
3148 <synonym>Wheat rust</synonym>
\r
3149 <rank>species</rank>
\r
3155 <id provider="uniprot">89013</id>
\r
3156 <scientific_name>mitosporic Sporidiobolales</scientific_name>
\r
3160 <id provider="uniprot">29898</id>
\r
3161 <code>RHOGR</code>
\r
3162 <scientific_name>Rhodotorula graminis</scientific_name>
\r
3163 <common_name>Yeast</common_name>
\r
3164 <rank>species</rank>
\r
3169 <id provider="uniprot">40563</id>
\r
3170 <code>SPORO</code>
\r
3171 <scientific_name>Sporobolomyces roseus</scientific_name>
\r
3172 <authority>Kluyver & C. B. Niel 1924</authority>
\r
3173 <rank>species</rank>
\r
3181 <id provider="uniprot">148960</id>
\r
3182 <code>WALSE</code>
\r
3183 <scientific_name>Wallemia sebi</scientific_name>
\r
3184 <rank>species</rank>
\r
3191 <id provider="uniprot">451507</id>
\r
3192 <scientific_name>Mucoromycotina</scientific_name>
\r
3193 <rank>subphylum</rank>
\r
3197 <id provider="uniprot">34489</id>
\r
3198 <scientific_name>Mucoraceae</scientific_name>
\r
3199 <rank>family</rank>
\r
3203 <id provider="uniprot">36080</id>
\r
3204 <code>MUCCI</code>
\r
3205 <scientific_name>Mucor circinelloides</scientific_name>
\r
3206 <synonym>Mucor griseo-roseus</synonym>
\r
3207 <rank>species</rank>
\r
3212 <id provider="uniprot">4837</id>
\r
3213 <code>PHYBL</code>
\r
3214 <scientific_name>Phycomyces blakesleeanus</scientific_name>
\r
3215 <rank>species</rank>
\r
3220 <id provider="uniprot">64495</id>
\r
3221 <code>RHIOR</code>
\r
3222 <scientific_name>Rhizopus oryzae</scientific_name>
\r
3223 <synonym>Rhizopus delemar</synonym>
\r
3224 <rank>species</rank>
\r
3230 <id provider="uniprot">1069443</id>
\r
3231 <code>MVNXX</code>
\r
3232 <scientific_name>Mortierella verticillata NRRL 6337</scientific_name>
\r
3233 <rank>species</rank>
\r
3234 <uri>http://www.ual.es/GruposInv/myco-ual/galeria17/mortierella.jpg</uri>
\r
3235 <uri>http://www.diark.org/img/species_pict/Mortierella_verticillata</uri>
\r
3242 <id provider="uniprot">61392</id>
\r
3243 <scientific_name>Coemansia reversa</scientific_name>
\r
3244 <rank>species</rank>
\r
3250 <id provider="uniprot">28583</id>
\r
3251 <code>ALLMA</code>
\r
3252 <scientific_name>Allomyces macrogynus</scientific_name>
\r
3253 <rank>species</rank>
\r
3259 <id provider="uniprot">4761</id>
\r
3260 <scientific_name>Chytridiomycota</scientific_name>
\r
3261 <common_name>chytrids</common_name>
\r
3262 <synonym>Mastigomycotina</synonym>
\r
3263 <rank>phylum</rank>
\r
3267 <id provider="uniprot">451435</id>
\r
3268 <scientific_name>Chytridiomycetes</scientific_name>
\r
3269 <rank>class</rank>
\r
3273 <id provider="uniprot">109871</id>
\r
3274 <code>BATDE</code>
\r
3275 <scientific_name>Batrachochytrium dendrobatidis</scientific_name>
\r
3276 <common_name>Frog chytrid fungus</common_name>
\r
3277 <rank>species</rank>
\r
3282 <id provider="uniprot">109760</id>
\r
3283 <code>SPIPN</code>
\r
3284 <scientific_name>Spizellomyces punctatus</scientific_name>
\r
3285 <rank>species</rank>
\r
3291 <id provider="uniprot">1123529</id>
\r
3292 <code>GONPR</code>
\r
3293 <scientific_name>Gonapodya prolifera</scientific_name>
\r
3294 <authority>A. Fisch. 1892</authority>
\r
3295 <common_name>Aquatic fungus</common_name>
\r
3296 <rank>species</rank>
\r
3297 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Ganpr1/Picture5.jpg</uri>
\r
3304 <id provider="uniprot">73868</id>
\r
3305 <code>PIRSE</code>
\r
3306 <scientific_name>Piromyces sp. (strain E2)</scientific_name>
\r
3307 <rank>species</rank>
\r
3308 <uri>http://www.bsu.edu/classes/ruch/msa/barr/4-17.jpg</uri>
\r
3314 <id provider="uniprot">6033</id>
\r
3315 <scientific_name>Encephalitozoon</scientific_name>
\r
3316 <rank>genus</rank>
\r
3320 <id provider="uniprot">6035</id>
\r
3321 <code>ENCCU</code>
\r
3322 <scientific_name>Encephalitozoon cuniculi (strain GB-M1)</scientific_name>
\r
3323 <common_name>Microsporidian parasite</common_name>
\r
3324 <rank>species</rank>
\r
3325 <uri>http://www.nature.com/modpathol/journal/v15/n5/images/3880566f7.jpg</uri>
\r
3330 <id provider="uniprot">907965</id>
\r
3331 <code>ENCHA</code>
\r
3332 <scientific_name>Encephalitozoon hellem (strain ATCC 50504)</scientific_name>
\r
3333 <common_name>Microsporidian parasite</common_name>
\r
3334 <uri>http://ruby.fgcu.edu/courses/davidb/50249/web/Encephalitozoonhellem91.jpg</uri>
\r
3340 <name>Fonticula & Nucleariidae</name>
\r
3341 <reference doi="10.1093/molbev/msp185">
\r
3345 <id provider="uniprot">691883</id>
\r
3346 <scientific_name>Fonticula alba</scientific_name>
\r
3347 <synonym>Fonticula alba Worley, Raper & Hohl. 1979</synonym>
\r
3348 <rank>species</rank>
\r
3353 <id provider="uniprot">154970</id>
\r
3354 <scientific_name>Nuclearia simplex</scientific_name>
\r
3355 <rank>species</rank>
\r
3362 <name>Amoebozoa</name>
\r
3364 <id provider="uniprot">554915</id>
\r
3365 <scientific_name>Amoebozoa</scientific_name>
\r
3368 <name>Dictyostelium</name>
\r
3370 <id provider="uniprot">5782</id>
\r
3371 <scientific_name>Dictyostelium</scientific_name>
\r
3372 <rank>genus</rank>
\r
3376 <id provider="uniprot">44689</id>
\r
3377 <code>DICDI</code>
\r
3378 <scientific_name>Dictyostelium discoideum</scientific_name>
\r
3379 <common_name>Slime mold</common_name>
\r
3380 <rank>species</rank>
\r
3385 <id provider="uniprot">5786</id>
\r
3386 <code>DICPU</code>
\r
3387 <scientific_name>Dictyostelium purpureum</scientific_name>
\r
3388 <common_name>Slime mold</common_name>
\r
3389 <rank>species</rank>
\r
3395 <id provider="uniprot">5759</id>
\r
3396 <code>ENTHI</code>
\r
3397 <scientific_name>Entamoeba histolytica</scientific_name>
\r
3398 <rank>species</rank>
\r
3404 <name>Bikonta</name>
\r
3405 <reference doi="10.1099/ijs.0.63216-0">
\r
3408 <name>Plants+HC+SAR megagroup</name>
\r
3410 <name>Plants+HC</name>
\r
3412 <name>Archaeplastida</name>
\r
3415 <id provider="uniprot">33090</id>
\r
3416 <scientific_name>Viridiplantae</scientific_name>
\r
3417 <common_name>green plants</common_name>
\r
3418 <rank>kingdom</rank>
\r
3422 <id provider="uniprot">3193</id>
\r
3423 <scientific_name>Embryophyta</scientific_name>
\r
3427 <id provider="uniprot">58023</id>
\r
3428 <scientific_name>Tracheophyta</scientific_name>
\r
3432 <id provider="uniprot">3398</id>
\r
3433 <scientific_name>Magnoliophyta</scientific_name>
\r
3434 <common_name>flowering plants</common_name>
\r
3435 <synonym>Angiospermae</synonym>
\r
3439 <id provider="uniprot">71240</id>
\r
3440 <scientific_name>eudicotyledons</scientific_name>
\r
3444 <id provider="uniprot">91827</id>
\r
3445 <scientific_name>core eudicotyledons</scientific_name>
\r
3449 <id provider="uniprot">71275</id>
\r
3450 <scientific_name>rosids</scientific_name>
\r
3451 <rank>subclass</rank>
\r
3454 <name>fabids & malvids</name>
\r
3457 <id provider="uniprot">91835</id>
\r
3458 <scientific_name>fabids</scientific_name>
\r
3461 <name>Rosales & Cucurbitales & Fabales</name>
\r
3463 <name>Rosales & Cucurbitales</name>
\r
3466 <id provider="uniprot">3745</id>
\r
3467 <scientific_name>Rosaceae</scientific_name>
\r
3468 <rank>family</rank>
\r
3472 <id provider="uniprot">57918</id>
\r
3473 <code>FRAVE</code>
\r
3474 <scientific_name>Fragaria vesca</scientific_name>
\r
3475 <common_name>Woodland strawberry</common_name>
\r
3476 <synonym>Fragaria vesca L.</synonym>
\r
3477 <synonym>European strawberry</synonym>
\r
3478 <synonym>alpine strawberry</synonym>
\r
3479 <rank>species</rank>
\r
3480 <uri>http://www.boga.ruhr-uni-bochum.de/html/Fragaria.vesca.ja6.jpg</uri>
\r
3481 <uri>http://caliban.mpiz-koeln.mpg.de/thome/band3/tafel_092_small.jpg</uri>
\r
3486 <id provider="uniprot">3760</id>
\r
3487 <code>PRUPE</code>
\r
3488 <scientific_name>Prunus persica</scientific_name>
\r
3489 <common_name>Peach</common_name>
\r
3490 <synonym>Persica vulgaris</synonym>
\r
3491 <synonym>Amygdalus persica</synonym>
\r
3492 <rank>species</rank>
\r
3493 <uri>http://www.mezhenskyjv.narod.ru/foto_sortov/dokaz.jpg</uri>
\r
3499 <id provider="uniprot">3659</id>
\r
3500 <code>CUCSA</code>
\r
3501 <scientific_name>Cucumis sativus</scientific_name>
\r
3502 <common_name>Cucumber</common_name>
\r
3503 <rank>species</rank>
\r
3509 <id provider="uniprot">3814</id>
\r
3510 <scientific_name>Papilionoideae</scientific_name>
\r
3511 <rank>subfamily</rank>
\r
3515 <id provider="uniprot">3847</id>
\r
3516 <code>SOYBN</code>
\r
3517 <scientific_name>Glycine max</scientific_name>
\r
3518 <authority>cv. Wye</authority>
\r
3519 <common_name>Soybean</common_name>
\r
3520 <synonym>Glycine hispida</synonym>
\r
3521 <rank>species</rank>
\r
3526 <id provider="uniprot">3880</id>
\r
3527 <code>MEDTR</code>
\r
3528 <scientific_name>Medicago truncatula</scientific_name>
\r
3529 <common_name>Barrel medic</common_name>
\r
3530 <synonym>Medicago tribuloides</synonym>
\r
3531 <rank>species</rank>
\r
3532 <uri>http://crdp.ac-besancon.fr/flore/FABACEAE/photos/medicago_truncatula_30.jpg</uri>
\r
3539 <id provider="uniprot">3646</id>
\r
3540 <scientific_name>Malpighiales</scientific_name>
\r
3541 <rank>order</rank>
\r
3545 <id provider="uniprot">3977</id>
\r
3546 <scientific_name>Euphorbiaceae</scientific_name>
\r
3547 <rank>family</rank>
\r
3551 <id provider="uniprot">3983</id>
\r
3552 <code>MANES</code>
\r
3553 <scientific_name>Manihot esculenta</scientific_name>
\r
3554 <common_name>Tapioca</common_name>
\r
3555 <synonym>Jatropha manihot</synonym>
\r
3556 <rank>species</rank>
\r
3557 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/99/Iwata_kenichi_cassava.jpg</uri>
\r
3562 <id provider="uniprot">3988</id>
\r
3563 <code>RICCO</code>
\r
3564 <scientific_name>Ricinus communis</scientific_name>
\r
3565 <common_name>Castor bean</common_name>
\r
3566 <synonym>Ricinus sanguineus</synonym>
\r
3567 <rank>species</rank>
\r
3568 <uri>http://nmorganics.net/wp-content/uploads/2011/09/castor.jpg</uri>
\r
3574 <id provider="uniprot">3694</id>
\r
3575 <code>POPTR</code>
\r
3576 <scientific_name>Populus trichocarpa</scientific_name>
\r
3577 <common_name>Western balsam poplar</common_name>
\r
3578 <synonym>Populus balsamifera subsp. trichocarpa</synonym>
\r
3579 <rank>species</rank>
\r
3586 <id provider="uniprot">91836</id>
\r
3587 <scientific_name>malvids</scientific_name>
\r
3590 <name>Brassicales & Sapindales</name>
\r
3593 <id provider="uniprot">3699</id>
\r
3594 <scientific_name>Brassicales</scientific_name>
\r
3595 <rank>order</rank>
\r
3599 <id provider="uniprot">3700</id>
\r
3600 <scientific_name>Brassicaceae</scientific_name>
\r
3601 <rank>family</rank>
\r
3605 <id provider="uniprot">3701</id>
\r
3606 <scientific_name>Arabidopsis</scientific_name>
\r
3607 <rank>genus</rank>
\r
3611 <id provider="uniprot">59689</id>
\r
3612 <code>ARALY</code>
\r
3613 <scientific_name>Arabidopsis lyrata</scientific_name>
\r
3614 <common_name>Lyre-leaved rock-cress</common_name>
\r
3615 <rank>species</rank>
\r
3620 <id provider="uniprot">3702</id>
\r
3621 <code>ARATH</code>
\r
3622 <scientific_name>Arabidopsis thaliana</scientific_name>
\r
3623 <common_name>Mouse-ear cress</common_name>
\r
3624 <rank>species</rank>
\r
3630 <id provider="uniprot">98038</id>
\r
3631 <code>THEHA</code>
\r
3632 <scientific_name>Thellungiella halophila</scientific_name>
\r
3633 <common_name>Salt cress</common_name>
\r
3634 <rank>species</rank>
\r
3635 <uri>http://mplant.oxfordjournals.org/content/2/1/3/F1.large.jpg</uri>
\r
3641 <id provider="uniprot">3649</id>
\r
3642 <code>CARPA</code>
\r
3643 <scientific_name>Carica papaya</scientific_name>
\r
3644 <common_name>Papaya</common_name>
\r
3645 <rank>species</rank>
\r
3646 <uri>http://www.biopix.com/photos/jko-carica-papaya-00412.jpg</uri>
\r
3647 <uri>http://www.texasriviera.com/greenthumbs/papaya10.jpg</uri>
\r
3653 <id provider="uniprot">2706</id>
\r
3654 <scientific_name>Citrus</scientific_name>
\r
3655 <rank>genus</rank>
\r
3659 <id provider="uniprot">85681</id>
\r
3660 <scientific_name>Citrus clementina</scientific_name>
\r
3661 <synonym>Citrus clementina hort. ex Tanaka</synonym>
\r
3662 <rank>species</rank>
\r
3663 <uri>http://palmen-bolschetz.de/images/citrus%20clementine.jpg</uri>
\r
3668 <id provider="uniprot">2711</id>
\r
3669 <code>CITSI</code>
\r
3670 <scientific_name>Citrus sinensis</scientific_name>
\r
3671 <common_name>Sweet orange</common_name>
\r
3672 <synonym>Citrus x sinensis</synonym>
\r
3673 <synonym>Citrus aurantium var. sinensis</synonym>
\r
3674 <rank>species</rank>
\r
3675 <uri>http://www.west-crete.com/flowers/photos/citrus_sinensis-1.jpg</uri>
\r
3682 <id provider="uniprot">71139</id>
\r
3683 <code>EUCGR</code>
\r
3684 <scientific_name>Eucalyptus grandis</scientific_name>
\r
3685 <common_name>Flooded gum</common_name>
\r
3686 <rank>species</rank>
\r
3687 <uri>http://www.calflora.net/losangelesarboretum/images/eucalyptus_grandis.jpg</uri>
\r
3694 <id provider="eol">582304</id>
\r
3695 <code>VITVI</code>
\r
3696 <scientific_name>Vitis vinifera</scientific_name>
\r
3697 <common_name>Grape</common_name>
\r
3698 <rank>species</rank>
\r
3704 <id provider="uniprot">91888</id>
\r
3705 <scientific_name>lamiids</scientific_name>
\r
3709 <id provider="uniprot">4070</id>
\r
3710 <scientific_name>Solanaceae</scientific_name>
\r
3711 <rank>family</rank>
\r
3715 <id provider="uniprot">4107</id>
\r
3716 <scientific_name>Solanum</scientific_name>
\r
3717 <rank>genus</rank>
\r
3721 <id provider="uniprot">49274</id>
\r
3722 <scientific_name>Lycopersicon</scientific_name>
\r
3723 <rank>subgenus</rank>
\r
3727 <id provider="uniprot">4081</id>
\r
3728 <code>SOLLC</code>
\r
3729 <scientific_name>Solanum lycopersicum</scientific_name>
\r
3730 <common_name>Tomato</common_name>
\r
3731 <synonym>Lycopersicon esculentum</synonym>
\r
3732 <rank>species</rank>
\r
3733 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0905/1214.jpeg</uri>
\r
3738 <id provider="uniprot">4084</id>
\r
3739 <code>SOLPI</code>
\r
3740 <scientific_name>Solanum pimpinellifolium</scientific_name>
\r
3741 <common_name>Currant tomato</common_name>
\r
3742 <synonym>Lycopersicon pimpinellifolium</synonym>
\r
3743 <rank>species</rank>
\r
3744 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b8/Currant_tomato.jpg</uri>
\r
3750 <id provider="uniprot">4113</id>
\r
3751 <code>SOLTU</code>
\r
3752 <scientific_name>Solanum tuberosum</scientific_name>
\r
3753 <common_name>Potato</common_name>
\r
3754 <rank>species</rank>
\r
3755 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0508/0344.jpeg</uri>
\r
3761 <id provider="uniprot">4097</id>
\r
3762 <code>TOBAC</code>
\r
3763 <scientific_name>Nicotiana tabacum</scientific_name>
\r
3764 <common_name>Common tobacco</common_name>
\r
3765 <rank>species</rank>
\r
3766 <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0105/2073.jpeg</uri>
\r
3772 <id provider="uniprot">4155</id>
\r
3773 <code>MIMGU</code>
\r
3774 <scientific_name>Mimulus guttatus</scientific_name>
\r
3775 <common_name>Yellow monkey flower</common_name>
\r
3776 <synonym>Yellow monkey flower</synonym>
\r
3777 <rank>species</rank>
\r
3784 <id provider="uniprot">218851</id>
\r
3785 <code>AQUCA</code>
\r
3786 <scientific_name>Aquilegia caerulea</scientific_name>
\r
3787 <authority>E.James</authority>
\r
3788 <common_name>Rocky mountain columbine</common_name>
\r
3789 <synonym>Aquilegia coerulea</synonym>
\r
3790 <rank>species</rank>
\r
3791 <uri>http://www.wildflower.org/image_archive/320x240/PCD3618/PCD3618_IMG0033.JPG</uri>
\r
3797 <id provider="uniprot">4447</id>
\r
3798 <scientific_name>Liliopsida</scientific_name>
\r
3799 <common_name>monocots</common_name>
\r
3800 <synonym>Monocotyledoneae</synonym>
\r
3801 <rank>class</rank>
\r
3805 <id provider="uniprot">4479</id>
\r
3806 <scientific_name>Poaceae</scientific_name>
\r
3807 <common_name>grass family</common_name>
\r
3808 <synonym>Gramineae</synonym>
\r
3809 <rank>family</rank>
\r
3813 <id provider="uniprot">147369</id>
\r
3814 <scientific_name>Panicoideae</scientific_name>
\r
3815 <authority>Link, 1827</authority>
\r
3816 <synonym>Centothecoideae</synonym>
\r
3817 <rank>subfamily</rank>
\r
3821 <id provider="uniprot">147429</id>
\r
3822 <scientific_name>Andropogoneae</scientific_name>
\r
3823 <authority>Dumort., 1824</authority>
\r
3824 <rank>tribe</rank>
\r
3828 <id provider="uniprot">4558</id>
\r
3829 <code>SORBI</code>
\r
3830 <scientific_name>Sorghum bicolor</scientific_name>
\r
3831 <common_name>Sorghum</common_name>
\r
3832 <synonym>Sorghum vulgare</synonym>
\r
3833 <rank>species</rank>
\r
3838 <id provider="uniprot">4577</id>
\r
3839 <code>MAIZE</code>
\r
3840 <scientific_name>Zea mays</scientific_name>
\r
3841 <common_name>Maize</common_name>
\r
3842 <rank>species</rank>
\r
3848 <id provider="uniprot">147428</id>
\r
3849 <scientific_name>Paniceae</scientific_name>
\r
3850 <rank>tribe</rank>
\r
3854 <id provider="uniprot">38727</id>
\r
3855 <scientific_name>Panicum virgatum</scientific_name>
\r
3856 <common_name>switchgrass</common_name>
\r
3857 <rank>species</rank>
\r
3858 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/29/PanicumVirgatum.jpg/220px-PanicumVirgatum.jpg</uri>
\r
3863 <id provider="uniprot">4555</id>
\r
3864 <code>SETIT</code>
\r
3865 <scientific_name>Setaria italica</scientific_name>
\r
3866 <common_name>Foxtail millet</common_name>
\r
3867 <synonym>Panicum italicum</synonym>
\r
3868 <rank>species</rank>
\r
3869 <uri>http://en.academic.ru/pictures/enwiki/83/Setaria_italica0.jpg</uri>
\r
3876 <id provider="uniprot">359160</id>
\r
3877 <scientific_name>BEP clade</scientific_name>
\r
3881 <id provider="uniprot">4527</id>
\r
3882 <scientific_name>Oryza</scientific_name>
\r
3883 <rank>genus</rank>
\r
3887 <id provider="uniprot">4530</id>
\r
3888 <code>ORYSA</code>
\r
3889 <scientific_name>Oryza sativa</scientific_name>
\r
3890 <common_name>Rice</common_name>
\r
3891 <rank>species</rank>
\r
3896 <id provider="uniprot">39947</id>
\r
3897 <code>ORYSJ</code>
\r
3898 <scientific_name>Oryza sativa subsp. japonica</scientific_name>
\r
3899 <common_name>Rice</common_name>
\r
3905 <id provider="uniprot">15368</id>
\r
3906 <code>BRADI</code>
\r
3907 <scientific_name>Brachypodium distachyon</scientific_name>
\r
3908 <common_name>Purple false brome</common_name>
\r
3909 <synonym>Trachynia distachya</synonym>
\r
3910 <rank>species</rank>
\r
3911 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/0/01/Brachypodium_distachyon_Bd21-3.jpg</uri>
\r
3918 <id provider="uniprot">4641</id>
\r
3919 <code>MUSAC</code>
\r
3920 <scientific_name>Musa acuminata</scientific_name>
\r
3921 <common_name>Banana</common_name>
\r
3922 <synonym>Musa cavendishii</synonym>
\r
3923 <rank>species</rank>
\r
3924 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/fd/Musa_acuminata1.jpg</uri>
\r
3931 <id provider="uniprot">34167</id>
\r
3932 <code>SELMO</code>
\r
3933 <scientific_name>Selaginella mollis</scientific_name>
\r
3934 <common_name>Moss</common_name>
\r
3935 <rank>species</rank>
\r
3941 <id provider="uniprot">145481</id>
\r
3942 <code>PHYPA</code>
\r
3943 <scientific_name>Physcomitrella patens subsp. patens</scientific_name>
\r
3944 <common_name>Moss</common_name>
\r
3945 <rank>subspecies</rank>
\r
3951 <id provider="uniprot">3041</id>
\r
3952 <scientific_name>Chlorophyta</scientific_name>
\r
3953 <rank>phylum</rank>
\r
3957 <id provider="uniprot">13792</id>
\r
3958 <scientific_name>Mamiellales</scientific_name>
\r
3959 <rank>order</rank>
\r
3963 <id provider="uniprot">70447</id>
\r
3964 <scientific_name>Ostreococcus</scientific_name>
\r
3965 <rank>genus</rank>
\r
3969 <id provider="uniprot">436017</id>
\r
3970 <code>OSTLU</code>
\r
3971 <scientific_name>Ostreococcus lucimarinus (strain CCE9901)</scientific_name>
\r
3976 <id provider="uniprot">385169</id>
\r
3977 <scientific_name>Ostreococcus sp. RCC809</scientific_name>
\r
3978 <rank>species</rank>
\r
3983 <id provider="uniprot">70448</id>
\r
3984 <code>OSTTA</code>
\r
3985 <scientific_name>Ostreococcus tauri</scientific_name>
\r
3986 <rank>species</rank>
\r
3987 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Ost9901_3/Ostta.jpg</uri>
\r
3993 <id provider="uniprot">38832</id>
\r
3994 <scientific_name>Micromonas</scientific_name>
\r
3995 <rank>genus</rank>
\r
3999 <id provider="uniprot">564608</id>
\r
4000 <code>MICPC</code>
\r
4001 <scientific_name>Micromonas pusilla (strain CCMP1545)</scientific_name>
\r
4002 <common_name>Picoplanktonic green alga</common_name>
\r
4003 <uri>http://www.mansfield.ohio-state.edu/~sabedon/microfla.jpg</uri>
\r
4008 <id provider="uniprot">296587</id>
\r
4009 <code>MICSR</code>
\r
4010 <scientific_name>Micromonas sp. (strain RCC299 / NOUM17)</scientific_name>
\r
4011 <common_name>Picoplanktonic green alga</common_name>
\r
4012 <synonym>Micromonas sp. RCC299</synonym>
\r
4013 <rank>species</rank>
\r
4019 <name>Trebouxiophyceae & Chlorophyceae</name>
\r
4022 <id provider="uniprot">75966</id>
\r
4023 <scientific_name>Trebouxiophyceae</scientific_name>
\r
4024 <rank>class</rank>
\r
4028 <id provider="uniprot">763042</id>
\r
4029 <scientific_name>Asterochloris sp. Cgr/DA1pho</scientific_name>
\r
4030 <rank>species</rank>
\r
4031 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Astpho1/Figure_3.jpg</uri>
\r
4036 <id provider="uniprot">554065</id>
\r
4037 <scientific_name>Chlorella variabilis</scientific_name>
\r
4038 <synonym>Chlorella sp. NC64A</synonym>
\r
4039 <rank>species</rank>
\r
4044 <id provider="uniprot">574566</id>
\r
4045 <scientific_name>Coccomyxa sp. C-169</scientific_name>
\r
4046 <synonym>Chlorella vulgaris C-169</synonym>
\r
4047 <rank>species</rank>
\r
4053 <id provider="uniprot">3042</id>
\r
4054 <scientific_name>Chlamydomonadales</scientific_name>
\r
4055 <rank>order</rank>
\r
4059 <id provider="uniprot">3055</id>
\r
4060 <code>CHLRE</code>
\r
4061 <scientific_name>Chlamydomonas reinhardtii</scientific_name>
\r
4062 <synonym>Chlamydomonas smithii</synonym>
\r
4063 <rank>species</rank>
\r
4068 <id provider="uniprot">3067</id>
\r
4069 <code>VOLCA</code>
\r
4070 <scientific_name>Volvox carteri</scientific_name>
\r
4071 <common_name>Green alga</common_name>
\r
4072 <rank>species</rank>
\r
4073 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Volca1/Volvox.jpg</uri>
\r
4082 <id provider="uniprot">2763</id>
\r
4083 <scientific_name>Rhodophyta</scientific_name>
\r
4084 <common_name>red algae</common_name>
\r
4088 <id provider="uniprot">265316</id>
\r
4089 <scientific_name>Cyanidiaceae</scientific_name>
\r
4090 <rank>family</rank>
\r
4094 <id provider="uniprot">45157</id>
\r
4095 <code>CYAME</code>
\r
4096 <scientific_name>Cyanidioschyzon merolae</scientific_name>
\r
4097 <common_name>Red alga</common_name>
\r
4098 <rank>species</rank>
\r
4099 <uri>http://www.shigen.nig.ac.jp/algae_tree/CyanidiophyceaeIMG.jpg</uri>
\r
4104 <id provider="uniprot">130081</id>
\r
4105 <code>GALSU</code>
\r
4106 <scientific_name>Galdieria sulphuraria</scientific_name>
\r
4107 <common_name>Red alga</common_name>
\r
4108 <rank>species</rank>
\r
4109 <uri>http://phenomena.nationalgeographic.com/files/2013/03/Alga.jpg</uri>
\r
4115 <id provider="uniprot">2769</id>
\r
4116 <code>CHOCR</code>
\r
4117 <scientific_name>Chondrus crispus</scientific_name>
\r
4118 <common_name>Carragheen moss</common_name>
\r
4119 <rank>species</rank>
\r
4120 <uri>http://www.seaweed.ie/_images/MG3_0485.png</uri>
\r
4126 <id provider="uniprot">38254</id>
\r
4127 <scientific_name>Glaucocystophyceae</scientific_name>
\r
4128 <synonym>Glaucophyta</synonym>
\r
4129 <rank>class</rank>
\r
4133 <id provider="uniprot">2762</id>
\r
4134 <code>CYAPA</code>
\r
4135 <scientific_name>Cyanophora paradoxa</scientific_name>
\r
4136 <rank>species</rank>
\r
4137 <uri>http://www.people.vcu.edu/~rfisher/paradoxa.jpg</uri>
\r
4142 <id provider="uniprot">38271</id>
\r
4143 <scientific_name>Glaucocystis nostochinearum</scientific_name>
\r
4144 <rank>species</rank>
\r
4145 <uri>http://protist.i.hosei.ac.jp/pdb/images/Others/Glaucocystis/sp_02.jpg</uri>
\r
4151 <name>Hacrobia (Cryptophyta & Haptophyceae & Centroheliozoa)</name>
\r
4154 <id provider="uniprot">2903</id>
\r
4155 <code>EMIHU</code>
\r
4156 <scientific_name>Emiliania huxleyi</scientific_name>
\r
4157 <rank>species</rank>
\r
4158 <uri>http://research.kahaku.go.jp/zoology/kaisei/hp-2/images/hapto.jpg</uri>
\r
4163 <id provider="uniprot">55529</id>
\r
4164 <code>GUITH</code>
\r
4165 <scientific_name>Guillardia theta</scientific_name>
\r
4166 <synonym>Cryptomonas phi</synonym>
\r
4167 <rank>species</rank>
\r
4168 <uri>http://genome.jgi.doe.gov/public/Guith1/Gtheta_SEM.jpg</uri>
\r
4170 <reference doi="10.1016/j.cub.2007.03.069">
\r
4171 <desc>Multiple Gene Phylogenies Support the Monophyly of Cryptomonad and Haptophyte Host Lineages</desc>
\r
4179 <name>Stramenopiles & Alveolata & Rhizaria</name>
\r
4182 <reference doi="10.1186/1471-2148-10-377">
\r
4183 <desc>Evolution of Rhizaria: new insights from phylogenomic analysis of uncultivated protists</desc>
\r
4188 <name>Stramenopiles & Alveolata</name>
\r
4191 <id provider="uniprot">33630</id>
\r
4192 <scientific_name>Alveolata</scientific_name>
\r
4193 <rank>superphylum</rank>
\r
4196 <name>Apicomplexa & Dinophyceae</name>
\r
4199 <id provider="uniprot">5794</id>
\r
4200 <scientific_name>Apicomplexa</scientific_name>
\r
4201 <rank>phylum</rank>
\r
4205 <id provider="uniprot">422676</id>
\r
4206 <scientific_name>Aconoidasida</scientific_name>
\r
4207 <rank>class</rank>
\r
4211 <id provider="uniprot">5820</id>
\r
4212 <scientific_name>Plasmodium</scientific_name>
\r
4213 <rank>genus</rank>
\r
4217 <id provider="uniprot">5825</id>
\r
4218 <code>PLACH</code>
\r
4219 <scientific_name>Plasmodium chabaudi</scientific_name>
\r
4220 <rank>species</rank>
\r
4225 <id provider="uniprot">5833</id>
\r
4226 <code>PLAFA</code>
\r
4227 <scientific_name>Plasmodium falciparum</scientific_name>
\r
4228 <rank>species</rank>
\r
4233 <id provider="uniprot">73239</id>
\r
4234 <code>PLAYO</code>
\r
4235 <scientific_name>Plasmodium yoelii yoelii</scientific_name>
\r
4236 <rank>subspecies</rank>
\r
4241 <name>Theileria</name>
\r
4243 <id provider="uniprot">5873</id>
\r
4244 <scientific_name>Theileria</scientific_name>
\r
4245 <rank>genus</rank>
\r
4249 <id provider="uniprot">5874</id>
\r
4250 <code>THEAN</code>
\r
4251 <scientific_name>Theileria annulata</scientific_name>
\r
4252 <rank>species</rank>
\r
4257 <id provider="uniprot">5875</id>
\r
4258 <code>THEPA</code>
\r
4259 <scientific_name>Theileria parva</scientific_name>
\r
4260 <rank>species</rank>
\r
4266 <id provider="uniprot">5865</id>
\r
4267 <code>BABBO</code>
\r
4268 <scientific_name>Babesia bovis</scientific_name>
\r
4269 <rank>species</rank>
\r
4270 <uri>http://www.perulactea.com/wp-content/uploads/2012/03/Babesia_bovis.jpg</uri>
\r
4276 <id provider="uniprot">423054</id>
\r
4277 <scientific_name>Eimeriorina</scientific_name>
\r
4278 <rank>suborder</rank>
\r
4282 <id provider="uniprot">5806</id>
\r
4283 <scientific_name>Cryptosporidium</scientific_name>
\r
4284 <rank>genus</rank>
\r
4288 <id provider="uniprot">237895</id>
\r
4289 <code>CRYHO</code>
\r
4290 <scientific_name>Cryptosporidium hominis</scientific_name>
\r
4291 <rank>species</rank>
\r
4296 <id provider="uniprot">5807</id>
\r
4297 <code>CRYPV</code>
\r
4298 <scientific_name>Cryptosporidium parvum</scientific_name>
\r
4299 <rank>species</rank>
\r
4304 <name>Eimeria & Toxoplasma</name>
\r
4305 <reference doi="10.1093/molbev/msn213">
\r
4306 <desc>The Apicomplexan Whole-Genome Phylogeny: An Analysis of Incongruence among Gene Trees</desc>
\r
4312 <id provider="uniprot">5802</id>
\r
4313 <code>EIMTE</code>
\r
4314 <scientific_name>Eimeria tenella</scientific_name>
\r
4315 <common_name>Coccidian parasite</common_name>
\r
4316 <rank>species</rank>
\r
4317 <uri>http://www.k-state.edu/parasitology/625tutorials/FIGtenella.jpg</uri>
\r
4322 <id provider="uniprot">5811</id>
\r
4323 <code>TOXGO</code>
\r
4324 <scientific_name>Toxoplasma gondii</scientific_name>
\r
4325 <rank>species</rank>
\r
4333 <id provider="uniprot">2864</id>
\r
4334 <scientific_name>Dinophyceae</scientific_name>
\r
4335 <authority>Fritsch, 1927</authority>
\r
4336 <common_name>dinoflagellates</common_name>
\r
4337 <synonym>Chromophyta</synonym>
\r
4338 <synonym>Dinoflagellata</synonym>
\r
4339 <synonym>Pyrrophyta</synonym>
\r
4340 <rank>class</rank>
\r
4344 <id provider="uniprot">2866</id>
\r
4345 <code>CRYCO</code>
\r
4346 <scientific_name>Crypthecodinium cohnii</scientific_name>
\r
4347 <common_name>Dinoflagellate</common_name>
\r
4348 <rank>species</rank>
\r
4349 <uri>http://www.lamolina.net/image/DHAcell.jpg</uri>
\r
4354 <id provider="uniprot">2923</id>
\r
4355 <code>THOHE</code>
\r
4356 <scientific_name>Thoracosphaera heimii</scientific_name>
\r
4357 <common_name>Dinoflagellate</common_name>
\r
4358 <rank>species</rank>
\r
4359 <uri>http://planktonnet.awi.de/repository/rawdata-PlanktonNet2/viewable/fjouenne_21806a_20080123172436_small.jpg</uri>
\r
4366 <id provider="uniprot">5878</id>
\r
4367 <scientific_name>Ciliophora</scientific_name>
\r
4368 <common_name>ciliates</common_name>
\r
4369 <rank>phylum</rank>
\r
4373 <id provider="uniprot">431838</id>
\r
4374 <scientific_name>Intramacronucleata</scientific_name>
\r
4375 <rank>subphylum</rank>
\r
4379 <id provider="uniprot">6020</id>
\r
4380 <scientific_name>Oligohymenophorea</scientific_name>
\r
4381 <rank>class</rank>
\r
4385 <id provider="uniprot">5888</id>
\r
4386 <code>PARTE</code>
\r
4387 <scientific_name>Paramecium tetraurelia</scientific_name>
\r
4388 <rank>species</rank>
\r
4389 <uri>http://research.plattsburgh.edu/ciliates/images/jdopics208.jpg</uri>
\r
4394 <id provider="uniprot">5911</id>
\r
4395 <code>TETTH</code>
\r
4396 <scientific_name>Tetrahymena thermophila</scientific_name>
\r
4397 <rank>species</rank>
\r
4398 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/08/Tetrahymena_thermophila.png/220px-Tetrahymena_thermophila.png</uri>
\r
4404 <id provider="uniprot">1172189</id>
\r
4405 <scientific_name>Oxytricha trifallax</scientific_name>
\r
4406 <authority>Stein, 1859</authority>
\r
4407 <rank>species</rank>
\r
4408 <uri>http://centexnaturalist.com/foldermainmenus/sfprotists/folderprotozoans/oxytricha04.gif</uri>
\r
4414 <id provider="uniprot">5961</id>
\r
4415 <code>BLEJA</code>
\r
4416 <scientific_name>Blepharisma japonicum</scientific_name>
\r
4417 <rank>species</rank>
\r
4418 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/23/Mikrofoto.de-Blepharisma_japonicum_15.jpg</uri>
\r
4419 <uri>http://protist.i.hosei.ac.jp/PDB/PCD0473/C/016.jpg</uri>
\r
4426 <id provider="uniprot">33634</id>
\r
4427 <scientific_name>Stramenopiles</scientific_name>
\r
4428 <authority>Patterson 1989, emend. Adl et al. 2005</authority>
\r
4429 <synonym>Chromophyta</synonym>
\r
4430 <synonym>heterokonts</synonym>
\r
4433 <name>Pelagophyceae & Bacillariophyta & Oomycetes</name>
\r
4434 <reference doi="10.1016/j.protis.2008.11.004">
\r
4435 <desc>Seven Gene Phylogeny of Heterokonts</desc>
\r
4440 <name>Pelagophyceae & Bacillariophyta</name>
\r
4443 <id provider="uniprot">2836</id>
\r
4444 <scientific_name>Bacillariophyta</scientific_name>
\r
4445 <common_name>diatoms</common_name>
\r
4446 <rank>phylum</rank>
\r
4450 <id provider="uniprot">33850</id>
\r
4451 <scientific_name>Bacillariophycidae</scientific_name>
\r
4455 <id provider="uniprot">186039</id>
\r
4456 <code>FRACY</code>
\r
4457 <scientific_name>Fragilariopsis cylindrus</scientific_name>
\r
4458 <authority>Krieger</authority>
\r
4459 <synonym>Nitzschia cylindrus</synonym>
\r
4460 <rank>species</rank>
\r
4461 <uri>http://www.awi.de/fileadmin/user_upload/News/Press_Releases/2012/1._Quartal/000_Fragilariposis_Chloroplasten_GDieckmann_w.jpg</uri>
\r
4466 <id provider="uniprot">2850</id>
\r
4467 <code>PHATR</code>
\r
4468 <scientific_name>Phaeodactylum tricornutum</scientific_name>
\r
4469 <authority>Bohlin</authority>
\r
4470 <rank>species</rank>
\r
4471 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/Phaeodactylum_tricornutum.png/637px-Phaeodactylum_tricornutum.png</uri>
\r
4477 <id provider="uniprot">35128</id>
\r
4478 <code>THAPS</code>
\r
4479 <scientific_name>Thalassiosira pseudonana</scientific_name>
\r
4480 <authority>Hasle & Heimdal</authority>
\r
4481 <common_name>Marine diatom</common_name>
\r
4482 <synonym>Cyclotella nana</synonym>
\r
4483 <rank>species</rank>
\r
4484 <uri>http://www.genomenewsnetwork.org/gnn_images/sequenced_genomes/thalassiosira_pseudonana.jpg</uri>
\r
4490 <id provider="uniprot">44056</id>
\r
4491 <code>AURAN</code>
\r
4492 <scientific_name>Aureococcus anophagefferens</scientific_name>
\r
4493 <authority>Hargraves & Sieburth</authority>
\r
4494 <common_name>Harmful bloom alga</common_name>
\r
4495 <rank>species</rank>
\r
4496 <uri>http://www.dec.ny.gov/images/fish_marine_images/alex1.jpg</uri>
\r
4502 <id provider="uniprot">4783</id>
\r
4503 <scientific_name>Phytophthora</scientific_name>
\r
4504 <rank>genus</rank>
\r
4508 <id provider="uniprot">4787</id>
\r
4509 <code>PHYIN</code>
\r
4510 <scientific_name>Phytophthora infestans</scientific_name>
\r
4511 <authority>(Mont.) de Bary 1876</authority>
\r
4512 <common_name>Potato late blight fungus</common_name>
\r
4513 <rank>species</rank>
\r
4514 <uri>http://bioweb.uwlax.edu/bio203/s2007/benrud_jaco/index_files/image4901.jpg</uri>
\r
4519 <id provider="uniprot">164328</id>
\r
4520 <code>PHYRM</code>
\r
4521 <scientific_name>Phytophthora ramorum</scientific_name>
\r
4522 <common_name>Sudden oak death agent</common_name>
\r
4523 <rank>species</rank>
\r
4524 <uri>http://genome.jgi-psf.org/Phyra1_1/pramorum.jpg</uri>
\r
4529 <id provider="uniprot">67593</id>
\r
4530 <code>PHYSO</code>
\r
4531 <scientific_name>Phytophthora sojae</scientific_name>
\r
4532 <common_name>Soybean stem and root rot agent</common_name>
\r
4533 <synonym>Phytophthora megasperma f. sp. glycines</synonym>
\r
4534 <rank>species</rank>
\r
4535 <uri>http://www.apsnet.org/publications/imageresources/PublishingImages/2003/IW000025b.jpg</uri>
\r
4540 <id provider="uniprot">4785</id>
\r
4541 <code>PHYCI</code>
\r
4542 <scientific_name>Phytophthora cinnamomi</scientific_name>
\r
4543 <common_name>Cinnamon fungus</common_name>
\r
4544 <uri>http://genome.jgi.doe.gov/public/Phyci1/Pcinnamomi_hyphae_and_chlamydospores.jpg</uri>
\r
4551 <id provider="uniprot">33674</id>
\r
4552 <scientific_name>Thraustochytriaceae</scientific_name>
\r
4553 <synonym>Thraustochytriales</synonym>
\r
4554 <rank>family</rank>
\r
4558 <id provider="uniprot">702273</id>
\r
4559 <code>AKEXX</code>
\r
4560 <scientific_name>Aplanochytrium kerguelense PBS07</scientific_name>
\r
4561 <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/91/Aplanolm.jpg/120px-Aplanolm.jpg</uri>
\r
4566 <id provider="uniprot">876976</id>
\r
4567 <code>SAGXX</code>
\r
4568 <scientific_name>Schizochytrium aggregatum ATCC 28209</scientific_name>
\r
4569 <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Schag1/120124-ATCC28209-22.JPG</uri>
\r
4577 <id provider="uniprot">543769</id>
\r
4578 <scientific_name>Rhizaria</scientific_name>
\r
4582 <id provider="uniprot">71427</id>
\r
4583 <scientific_name>Allogromia laticollaris</scientific_name>
\r
4584 <rank>species</rank>
\r
4585 <uri>http://forambarcoding.unige.ch/system/pictures/424/s600/A.laticollaris1.jpg</uri>
\r
4590 <id provider="uniprot">227086</id>
\r
4591 <code>BIGNA</code>
\r
4592 <scientific_name>Bigelowiella natans</scientific_name>
\r
4593 <synonym>Chlorarachnion sp. (strain CCMP621)</synonym>
\r
4594 <synonym>Pedinomonas minutissima</synonym>
\r
4595 <rank>species</rank>
\r
4596 <uri>http://genome.jgi.doe.gov/Bigna1/Bigna1.jpg</uri>
\r
4603 <name>Excavata</name>
\r
4604 <reference doi="10.1038/nature04546">
\r
4607 <name>Kinetoplastida & Heterolobosea</name>
\r
4610 <id provider="uniprot">5654</id>
\r
4611 <scientific_name>Trypanosomatidae</scientific_name>
\r
4612 <rank>family</rank>
\r
4616 <id provider="uniprot">5664</id>
\r
4617 <code>LEIMA</code>
\r
4618 <scientific_name>Leishmania major</scientific_name>
\r
4619 <rank>species</rank>
\r
4624 <id provider="uniprot">5702</id>
\r
4625 <code>TRYBB</code>
\r
4626 <scientific_name>Trypanosoma brucei brucei</scientific_name>
\r
4627 <rank>subspecies</rank>
\r
4633 <id provider="uniprot">5762</id>
\r
4634 <code>NAEGR</code>
\r
4635 <scientific_name>Naegleria gruberi</scientific_name>
\r
4636 <common_name>Amoeba</common_name>
\r
4637 <rank>species</rank>
\r
4638 <uri>http://media.npr.org/assets/news/2010/03/05/amoeba_custom-a24a7e20b8d9f1b681cf6a25d0d046d84f238349-s3.jpg</uri>
\r
4643 <name>Metamonada</name>
\r
4646 <id provider="uniprot">5741</id>
\r
4647 <code>GIALA</code>
\r
4648 <scientific_name>Giardia lamblia</scientific_name>
\r
4649 <synonym>Giardia intestinalis</synonym>
\r
4650 <synonym>Giardia lamblia</synonym>
\r
4651 <rank>species</rank>
\r
4656 <id provider="uniprot">5722</id>
\r
4657 <code>TRIVA</code>
\r
4658 <scientific_name>Trichomonas vaginalis</scientific_name>
\r
4659 <rank>species</rank>
\r
4666 <id provider="uniprot">554296</id>
\r
4667 <scientific_name>Apusozoa</scientific_name>
\r
4669 <reference doi="10.1016/j.protis.2008.06.002">
\r
4670 <desc>Planomonadida ord. nov. (Apusozoa): Ultrastructural Affinity with Micronuclearia podoventralis and Deep Divergences within Planomonas gen. nov</desc>
\r
4674 <id provider="uniprot">554453</id>
\r
4675 <scientific_name>Planomonas micra</scientific_name>
\r
4676 <authority>(Cavalier-Smith, 2008) Heiss, Walker & Simpson 2010</authority>
\r
4677 <synonym>Apusomonadidae sp. micra</synonym>
\r
4678 <rank>species</rank>
\r
4683 <id provider="uniprot">529818</id>
\r
4684 <code>TTRXX</code>
\r
4685 <scientific_name>Thecamonas trahens</scientific_name>
\r
4686 <authority>Larsen & Patterson 1990</authority>
\r
4687 <synonym>Amastigomonas trahens</synonym>
\r
4688 <rank>species</rank>
\r
4689 <uri>http://bioinformatica.upf.edu/2011/projectes11/Cx/images/pro_t_tra.jpg</uri>
\r
4696 <name>Archaea</name>
\r
4698 <id provider="uniprot">2157</id>
\r
4699 <scientific_name>Archaea</scientific_name>
\r
4700 <rank>superkingdom</rank>
\r
4708 <id provider="uniprot">28890</id>
\r
4709 <scientific_name>Euryarchaeota</scientific_name>
\r
4710 <rank>phylum</rank>
\r
4720 <id provider="uniprot">224756</id>
\r
4721 <scientific_name>Methanomicrobia</scientific_name>
\r
4722 <rank>class</rank>
\r
4730 <id provider="uniprot">2206</id>
\r
4731 <scientific_name>Methanosarcinaceae</scientific_name>
\r
4732 <rank>family</rank>
\r
4736 <id provider="uniprot">2207</id>
\r
4737 <scientific_name>Methanosarcina</scientific_name>
\r
4738 <rank>genus</rank>
\r
4744 <id provider="uniprot">2214</id>
\r
4745 <code>METAC</code>
\r
4746 <scientific_name>Methanosarcina acetivorans</scientific_name>
\r
4747 <rank>species</rank>
\r
4752 <id provider="uniprot">269797</id>
\r
4753 <code>METBF</code>
\r
4754 <scientific_name>Methanosarcina barkeri (strain Fusaro / DSM 804)</scientific_name>
\r
4760 <id provider="uniprot">2209</id>
\r
4761 <code>METMA</code>
\r
4762 <scientific_name>Methanosarcina mazei</scientific_name>
\r
4763 <synonym>Methanosarcina frisia</synonym>
\r
4764 <rank>species</rank>
\r
4770 <id provider="uniprot">259564</id>
\r
4771 <code>METBU</code>
\r
4772 <scientific_name>Methanococcoides burtonii (strain DSM 6242)</scientific_name>
\r
4779 <id provider="uniprot">2191</id>
\r
4780 <scientific_name>Methanomicrobiales</scientific_name>
\r
4781 <rank>order</rank>
\r
4787 <id provider="uniprot">456442</id>
\r
4788 <code>METB6</code>
\r
4789 <scientific_name>Methanoregula boonei (strain 6A8)</scientific_name>
\r
4794 <id provider="uniprot">2203</id>
\r
4795 <code>METHU</code>
\r
4796 <scientific_name>Methanospirillum hungatei</scientific_name>
\r
4797 <rank>species</rank>
\r
4803 <id provider="uniprot">368407</id>
\r
4804 <code>METMJ</code>
\r
4805 <scientific_name>Methanoculleus marisnigri (strain ATCC 35101 / DSM 1498 / JR1)</scientific_name>
\r
4812 <id provider="uniprot">410358</id>
\r
4813 <code>METLZ</code>
\r
4814 <scientific_name>Methanocorpusculum labreanum (strain ATCC 43576 / DSM 4855 / Z)</scientific_name>
\r
4820 <id provider="uniprot">349307</id>
\r
4821 <code>METTP</code>
\r
4822 <scientific_name>Methanosaeta thermophila (strain DSM 6194 / PT)</scientific_name>
\r
4823 <synonym>Methanothrix thermophila (strain DSM 6194 / PT)</synonym>
\r
4830 <id provider="uniprot">2236</id>
\r
4831 <scientific_name>Halobacteriaceae</scientific_name>
\r
4832 <rank>family</rank>
\r
4840 <id provider="uniprot">2238</id>
\r
4841 <code>HALMA</code>
\r
4842 <scientific_name>Haloarcula marismortui</scientific_name>
\r
4843 <synonym>Halobacterium marismortui</synonym>
\r
4844 <rank>species</rank>
\r
4849 <id provider="uniprot">2257</id>
\r
4850 <code>NATPH</code>
\r
4851 <scientific_name>Natronomonas pharaonis</scientific_name>
\r
4852 <common_name>Natronobacterium pharaonis</common_name>
\r
4853 <rank>species</rank>
\r
4860 <id provider="uniprot">2239</id>
\r
4861 <scientific_name>Halobacterium</scientific_name>
\r
4862 <rank>genus</rank>
\r
4866 <id provider="uniprot">478009</id>
\r
4867 <code>HALS3</code>
\r
4868 <scientific_name>Halobacterium salinarum (strain ATCC 29341 / DSM 671 / R1)</scientific_name>
\r
4873 <id provider="uniprot">2243</id>
\r
4874 <code>HALSP</code>
\r
4875 <scientific_name>Halobacterium sp.</scientific_name>
\r
4876 <rank>species</rank>
\r
4883 <id provider="uniprot">362976</id>
\r
4884 <code>HALWD</code>
\r
4885 <scientific_name>Haloquadratum walsbyi (strain DSM 16790)</scientific_name>
\r
4892 <id provider="uniprot">2234</id>
\r
4893 <code>ARCFU</code>
\r
4894 <scientific_name>Archaeoglobus fulgidus</scientific_name>
\r
4895 <rank>species</rank>
\r
4906 <id provider="uniprot">2182</id>
\r
4907 <scientific_name>Methanococcales</scientific_name>
\r
4908 <rank>order</rank>
\r
4914 <id provider="uniprot">2190</id>
\r
4915 <code>METJA</code>
\r
4916 <scientific_name>Methanocaldococcus jannaschii</scientific_name>
\r
4917 <synonym>Methanococcus jannaschii</synonym>
\r
4918 <rank>species</rank>
\r
4923 <id provider="uniprot">419665</id>
\r
4924 <code>META3</code>
\r
4925 <scientific_name>Methanococcus aeolicus (strain Nankai-3 / ATCC BAA-1280)</scientific_name>
\r
4932 <id provider="uniprot">2184</id>
\r
4933 <scientific_name>Methanococcus</scientific_name>
\r
4934 <rank>genus</rank>
\r
4938 <id provider="uniprot">39152</id>
\r
4939 <code>METMP</code>
\r
4940 <scientific_name>Methanococcus maripaludis</scientific_name>
\r
4941 <synonym>Methanococcus deltae</synonym>
\r
4942 <rank>species</rank>
\r
4947 <id provider="uniprot">406327</id>
\r
4948 <code>METVS</code>
\r
4949 <scientific_name>Methanococcus vannielii (strain SB / ATCC 35089 / DSM 1224)</scientific_name>
\r
4957 <id provider="uniprot">2159</id>
\r
4958 <scientific_name>Methanobacteriaceae</scientific_name>
\r
4959 <rank>family</rank>
\r
4965 <id provider="uniprot">420247</id>
\r
4966 <code>METS3</code>
\r
4967 <scientific_name>Methanobrevibacter smithii (strain PS / ATCC 35061 / DSM 861)</scientific_name>
\r
4972 <id provider="uniprot">339860</id>
\r
4973 <code>METST</code>
\r
4974 <scientific_name>Methanosphaera stadtmanae (strain DSM 3091)</scientific_name>
\r
4980 <id provider="uniprot">187420</id>
\r
4981 <code>METTH</code>
\r
4982 <scientific_name>Methanobacterium thermoautotrophicum</scientific_name>
\r
4989 <id provider="uniprot">2320</id>
\r
4990 <code>METKA</code>
\r
4991 <scientific_name>Methanopyrus kandleri</scientific_name>
\r
4992 <rank>species</rank>
\r
5000 <id provider="uniprot">2259</id>
\r
5001 <scientific_name>Thermococcaceae</scientific_name>
\r
5002 <rank>family</rank>
\r
5008 <id provider="uniprot">2261</id>
\r
5009 <code>PYRFU</code>
\r
5010 <scientific_name>Pyrococcus furiosus</scientific_name>
\r
5011 <rank>species</rank>
\r
5016 <id provider="uniprot">69014</id>
\r
5017 <code>PYRKO</code>
\r
5018 <scientific_name>Pyrococcus kodakaraensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1)</scientific_name>
\r
5019 <synonym>Thermococcus kodakaraensis (strain KOD1)</synonym>
\r
5026 <id provider="uniprot">2260</id>
\r
5027 <scientific_name>Pyrococcus</scientific_name>
\r
5028 <rank>genus</rank>
\r
5032 <id provider="uniprot">29292</id>
\r
5033 <code>PYRAB</code>
\r
5034 <scientific_name>Pyrococcus abyssi</scientific_name>
\r
5035 <rank>species</rank>
\r
5040 <id provider="uniprot">53953</id>
\r
5041 <code>PYRHO</code>
\r
5042 <scientific_name>Pyrococcus horikoshii</scientific_name>
\r
5043 <rank>species</rank>
\r
5053 <id provider="uniprot">228908</id>
\r
5054 <code>NANEQ</code>
\r
5055 <scientific_name>Nanoarchaeum equitans (strain Kin4-M)</scientific_name>
\r
5060 <id provider="uniprot">436308</id>
\r
5061 <code>NITMS</code>
\r
5062 <scientific_name>Nitrosopumilus maritimus (strain SCM1)</scientific_name>
\r
5069 <id provider="uniprot">2301</id>
\r
5070 <scientific_name>Thermoplasmatales</scientific_name>
\r
5071 <rank>order</rank>
\r
5076 <id provider="uniprot">2302</id>
\r
5077 <scientific_name>Thermoplasma</scientific_name>
\r
5078 <rank>genus</rank>
\r
5082 <id provider="uniprot">273075</id>
\r
5083 <code>THEAC</code>
\r
5084 <scientific_name>Thermoplasma acidophilum (strain ATCC 25905 / DSM 1728 / JCM 9062 / NBRC 15155 / AMRC-C165)</scientific_name>
\r
5089 <id provider="uniprot">273116</id>
\r
5090 <code>THEVO</code>
\r
5091 <scientific_name>Thermoplasma volcanium (strain ATCC 51530 / DSM 4299 / IFO 15438 / JCM 9571 / GSS1)</scientific_name>
\r
5097 <id provider="uniprot">263820</id>
\r
5098 <code>PICTO</code>
\r
5099 <scientific_name>Picrophilus torridus (strain ATCC 700027 / DSM 9790 / JCM 10055 / NBRC 100828)</scientific_name>
\r
5108 <id provider="uniprot">183924</id>
\r
5109 <scientific_name>Thermoprotei</scientific_name>
\r
5110 <rank>class</rank>
\r
5119 <id provider="uniprot">2267</id>
\r
5120 <scientific_name>Thermoproteaceae</scientific_name>
\r
5121 <rank>family</rank>
\r
5128 <id provider="uniprot">2276</id>
\r
5129 <scientific_name>Pyrobaculum</scientific_name>
\r
5130 <rank>genus</rank>
\r
5136 <id provider="uniprot">340102</id>
\r
5137 <code>PYRAR</code>
\r
5138 <scientific_name>Pyrobaculum arsenaticum (strain DSM 13514 / JCM 11321)</scientific_name>
\r
5143 <id provider="uniprot">410359</id>
\r
5144 <code>PYRCJ</code>
\r
5145 <scientific_name>Pyrobaculum calidifontis (strain JCM 11548 / VA1)</scientific_name>
\r
5151 <id provider="uniprot">13773</id>
\r
5152 <code>PYRAE</code>
\r
5153 <scientific_name>Pyrobaculum aerophilum</scientific_name>
\r
5154 <rank>species</rank>
\r
5162 <id provider="uniprot">384616</id>
\r
5163 <code>PYRIL</code>
\r
5164 <scientific_name>Pyrobaculum islandicum (strain DSM 4184 / JCM 9189)</scientific_name>
\r
5169 <id provider="uniprot">444157</id>
\r
5170 <code>THENV</code>
\r
5171 <scientific_name>Thermoproteus neutrophilus (strain DSM 2338 / JCM 9278 / V24Sta)</scientific_name>
\r
5178 <id provider="uniprot">397948</id>
\r
5179 <code>CALMQ</code>
\r
5180 <scientific_name>Caldivirga maquilingensis (strain ATCC 700844 / DSMZ 13496 / JCM 10307 / IC-167)</scientific_name>
\r
5187 <id provider="uniprot">118883</id>
\r
5188 <scientific_name>Sulfolobaceae</scientific_name>
\r
5189 <rank>family</rank>
\r
5194 <id provider="uniprot">2284</id>
\r
5195 <scientific_name>Sulfolobus</scientific_name>
\r
5196 <rank>genus</rank>
\r
5202 <id provider="uniprot">2285</id>
\r
5203 <code>SULAC</code>
\r
5204 <scientific_name>Sulfolobus acidocaldarius</scientific_name>
\r
5205 <rank>species</rank>
\r
5210 <id provider="uniprot">273063</id>
\r
5211 <code>SULTO</code>
\r
5212 <scientific_name>Sulfolobus tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7)</scientific_name>
\r
5218 <id provider="uniprot">2287</id>
\r
5219 <code>SULSO</code>
\r
5220 <scientific_name>Sulfolobus solfataricus</scientific_name>
\r
5221 <rank>species</rank>
\r
5227 <id provider="uniprot">399549</id>
\r
5228 <code>METS5</code>
\r
5229 <scientific_name>Metallosphaera sedula (strain ATCC 51363 / DSM 5348)</scientific_name>
\r
5236 <id provider="uniprot">56636</id>
\r
5237 <code>AERPE</code>
\r
5238 <scientific_name>Aeropyrum pernix</scientific_name>
\r
5239 <rank>species</rank>
\r
5251 <id provider="uniprot">399550</id>
\r
5252 <code>STAMF</code>
\r
5253 <scientific_name>Staphylothermus marinus (strain ATCC 43588 / DSM 3639 / F1)</scientific_name>
\r
5258 <id provider="uniprot">368408</id>
\r
5259 <code>THEPD</code>
\r
5260 <scientific_name>Thermofilum pendens (strain Hrk 5)</scientific_name>
\r
5266 <id provider="uniprot">415426</id>
\r
5267 <code>HYPBU</code>
\r
5268 <scientific_name>Hyperthermus butylicus (strain DSM 5456 / JCM 9403)</scientific_name>
\r
5274 <id provider="uniprot">453591</id>
\r
5275 <code>IGNH4</code>
\r
5276 <scientific_name>Ignicoccus hospitalis (strain KIN4/I / DSM 18386 / JCM 14125)</scientific_name>
\r
5283 <id provider="uniprot">374847</id>
\r
5284 <code>KORCO</code>
\r
5285 <scientific_name>Korarchaeum cryptofilum (strain OPF8)</scientific_name>
\r
5293 <id provider="uniprot">2</id>
\r
5294 <scientific_name>Bacteria</scientific_name>
\r
5295 <rank>superkingdom</rank>
\r
5298 <name>b_278</name>
\r
5300 <name>b_268</name>
\r
5302 <name>b_226</name>
\r
5304 <name>b_200</name>
\r
5306 <name>b_194</name>
\r
5308 <name>b_104</name>
\r
5313 <id provider="uniprot">1224</id>
\r
5314 <scientific_name>Proteobacteria</scientific_name>
\r
5315 <rank>phylum</rank>
\r
5326 <id provider="uniprot">1236</id>
\r
5327 <scientific_name>Gammaproteobacteria</scientific_name>
\r
5328 <rank>class</rank>
\r
5335 <id provider="uniprot">543</id>
\r
5336 <scientific_name>Enterobacteriaceae</scientific_name>
\r
5337 <rank>family</rank>
\r
5348 <id provider="uniprot">561</id>
\r
5349 <scientific_name>Escherichia</scientific_name>
\r
5350 <rank>genus</rank>
\r
5354 <id provider="uniprot">83333</id>
\r
5355 <code>ECOLI</code>
\r
5356 <scientific_name>Escherichia coli (strain K12)</scientific_name>
\r
5361 <id provider="uniprot">83334</id>
\r
5362 <code>ECO57</code>
\r
5363 <scientific_name>Escherichia coli O157:H7</scientific_name>
\r
5369 <id provider="uniprot">623</id>
\r
5370 <code>SHIFL</code>
\r
5371 <scientific_name>Shigella flexneri</scientific_name>
\r
5372 <rank>species</rank>
\r
5378 <id provider="uniprot">90371</id>
\r
5379 <code>SALTY</code>
\r
5380 <scientific_name>Salmonella typhimurium</scientific_name>
\r
5386 <id provider="uniprot">632</id>
\r
5387 <code>YERPE</code>
\r
5388 <scientific_name>Yersinia pestis</scientific_name>
\r
5389 <rank>species</rank>
\r
5395 <id provider="uniprot">29488</id>
\r
5396 <code>PHOLU</code>
\r
5397 <scientific_name>Photorhabdus luminescens</scientific_name>
\r
5398 <synonym>Xenorhabdus luminescens</synonym>
\r
5399 <rank>species</rank>
\r
5408 <id provider="uniprot">641</id>
\r
5409 <scientific_name>Vibrionaceae</scientific_name>
\r
5410 <rank>family</rank>
\r
5414 <id provider="uniprot">74109</id>
\r
5415 <code>PHOPR</code>
\r
5416 <scientific_name>Photobacterium profundum</scientific_name>
\r
5417 <synonym>Photobacterium sp. (strain SS9)</synonym>
\r
5418 <rank>species</rank>
\r
5423 <id provider="uniprot">666</id>
\r
5424 <code>VIBCH</code>
\r
5425 <scientific_name>Vibrio cholerae</scientific_name>
\r
5426 <rank>species</rank>
\r
5432 <id provider="uniprot">318161</id>
\r
5433 <code>SHEDO</code>
\r
5434 <scientific_name>Shewanella denitrificans (strain OS217 / ATCC BAA-1090 / DSM 15013)</scientific_name>
\r
5444 <id provider="uniprot">286</id>
\r
5445 <scientific_name>Pseudomonas</scientific_name>
\r
5446 <rank>genus</rank>
\r
5452 <id provider="uniprot">220664</id>
\r
5453 <code>PSEF5</code>
\r
5454 <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf-5 / ATCC BAA-477)</scientific_name>
\r
5459 <id provider="uniprot">205922</id>
\r
5460 <code>PSEPF</code>
\r
5461 <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf0-1)</scientific_name>
\r
5467 <id provider="uniprot">287</id>
\r
5468 <code>PSEAE</code>
\r
5469 <scientific_name>Pseudomonas aeruginosa</scientific_name>
\r
5470 <rank>species</rank>
\r
5476 <id provider="uniprot">290398</id>
\r
5477 <code>CHRSD</code>
\r
5478 <scientific_name>Chromohalobacter salexigens (strain DSM 3043 / ATCC BAA-138 / NCIMB 13768)</scientific_name>
\r
5486 <id provider="uniprot">28216</id>
\r
5487 <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>
\r
5488 <rank>class</rank>
\r
5492 <id provider="uniprot">159087</id>
\r
5493 <code>DECAR</code>
\r
5494 <scientific_name>Dechloromonas aromatica (strain RCB)</scientific_name>
\r
5499 <id provider="uniprot">266264</id>
\r
5500 <code>RALME</code>
\r
5501 <scientific_name>Ralstonia metallidurans (strain CH34 / ATCC 43123 / DSM 2839)</scientific_name>
\r
5513 <id provider="uniprot">28216</id>
\r
5514 <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>
\r
5515 <rank>class</rank>
\r
5520 <id provider="uniprot">206379</id>
\r
5521 <scientific_name>Nitrosomonadaceae</scientific_name>
\r
5522 <rank>family</rank>
\r
5526 <id provider="uniprot">915</id>
\r
5527 <code>NITEU</code>
\r
5528 <scientific_name>Nitrosomonas europaea</scientific_name>
\r
5529 <rank>species</rank>
\r
5534 <id provider="uniprot">323848</id>
\r
5535 <code>NITMU</code>
\r
5536 <scientific_name>Nitrosospira multiformis (strain ATCC 25196 / NCIMB 11849)</scientific_name>
\r
5542 <id provider="uniprot">36861</id>
\r
5543 <code>THIDE</code>
\r
5544 <scientific_name>Thiobacillus denitrificans</scientific_name>
\r
5545 <rank>species</rank>
\r
5552 <id provider="uniprot">135613</id>
\r
5553 <scientific_name>Chromatiales</scientific_name>
\r
5554 <rank>order</rank>
\r
5559 <id provider="uniprot">72276</id>
\r
5560 <scientific_name>Ectothiorhodospiraceae</scientific_name>
\r
5561 <common_name>purple sulfur bacteria</common_name>
\r
5562 <rank>family</rank>
\r
5566 <id provider="uniprot">187272</id>
\r
5567 <code>ALHEH</code>
\r
5568 <scientific_name>Alkalilimnicola ehrlichei (strain MLHE-1)</scientific_name>
\r
5573 <id provider="uniprot">349124</id>
\r
5574 <code>HALHL</code>
\r
5575 <scientific_name>Halorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</scientific_name>
\r
5576 <synonym>Ectothiorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</synonym>
\r
5582 <id provider="uniprot">323261</id>
\r
5583 <code>NITOC</code>
\r
5584 <scientific_name>Nitrosococcus oceani (strain ATCC 19707 / NCIMB 11848)</scientific_name>
\r
5591 <id provider="uniprot">317025</id>
\r
5592 <code>THICR</code>
\r
5593 <scientific_name>Thiomicrospira crunogena (strain XCL-2)</scientific_name>
\r
5601 <id provider="uniprot">1236</id>
\r
5602 <scientific_name>Gammaproteobacteria</scientific_name>
\r
5603 <rank>class</rank>
\r
5609 <id provider="uniprot">135577</id>
\r
5610 <code>IDILO</code>
\r
5611 <scientific_name>Idiomarina loihiensis</scientific_name>
\r
5612 <rank>species</rank>
\r
5617 <id provider="uniprot">446</id>
\r
5618 <code>LEGPN</code>
\r
5619 <scientific_name>Legionella pneumophila</scientific_name>
\r
5620 <rank>species</rank>
\r
5627 <id provider="uniprot">32033</id>
\r
5628 <scientific_name>Xanthomonadaceae</scientific_name>
\r
5629 <rank>family</rank>
\r
5633 <id provider="uniprot">92829</id>
\r
5634 <code>XANAC</code>
\r
5635 <scientific_name>Xanthomonas axonopodis pv. citri</scientific_name>
\r
5636 <common_name>Citrus canker</common_name>
\r
5641 <id provider="uniprot">183190</id>
\r
5642 <code>XYLFT</code>
\r
5643 <scientific_name>Xylella fastidiosa (strain Temecula1 / ATCC 700964)</scientific_name>
\r
5652 <id provider="uniprot">28211</id>
\r
5653 <scientific_name>Alphaproteobacteria</scientific_name>
\r
5654 <rank>class</rank>
\r
5663 <id provider="uniprot">356</id>
\r
5664 <scientific_name>Rhizobiales</scientific_name>
\r
5665 <rank>order</rank>
\r
5670 <id provider="uniprot">227290</id>
\r
5671 <scientific_name>Rhizobium/Agrobacterium group</scientific_name>
\r
5675 <id provider="uniprot">176299</id>
\r
5676 <code>AGRT5</code>
\r
5677 <scientific_name>Agrobacterium tumefaciens (strain C58 / ATCC 33970)</scientific_name>
\r
5682 <id provider="uniprot">347834</id>
\r
5683 <code>RHIEC</code>
\r
5684 <scientific_name>Rhizobium etli (strain CFN 42 / ATCC 51251)</scientific_name>
\r
5691 <id provider="uniprot">41294</id>
\r
5692 <scientific_name>Bradyrhizobiaceae</scientific_name>
\r
5693 <rank>family</rank>
\r
5697 <id provider="uniprot">375</id>
\r
5698 <code>BRAJA</code>
\r
5699 <scientific_name>Bradyrhizobium japonicum</scientific_name>
\r
5700 <rank>species</rank>
\r
5705 <id provider="uniprot">395960</id>
\r
5706 <code>RHOPT</code>
\r
5707 <scientific_name>Rhodopseudomonas palustris (strain TIE-1)</scientific_name>
\r
5715 <id provider="uniprot">31989</id>
\r
5716 <scientific_name>Rhodobacteraceae</scientific_name>
\r
5717 <rank>family</rank>
\r
5721 <id provider="uniprot">349101</id>
\r
5722 <code>RHOS1</code>
\r
5723 <scientific_name>Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17029 / ATH 2.4.9)</scientific_name>
\r
5728 <id provider="uniprot">375451</id>
\r
5729 <code>ROSDO</code>
\r
5730 <scientific_name>Roseobacter denitrificans (strain ATCC 33942 / OCh 114)</scientific_name>
\r
5731 <common_name>Erythrobacter sp. (strain OCh 114)</common_name>
\r
5732 <synonym>Roseobacter denitrificans</synonym>
\r
5739 <id provider="uniprot">155892</id>
\r
5740 <code>CAUCR</code>
\r
5741 <scientific_name>Caulobacter crescentus</scientific_name>
\r
5742 <synonym>Caulobacter vibrioides</synonym>
\r
5743 <rank>species</rank>
\r
5750 <id provider="uniprot">204441</id>
\r
5751 <scientific_name>Rhodospirillales</scientific_name>
\r
5752 <rank>order</rank>
\r
5756 <id provider="uniprot">524</id>
\r
5757 <code>ACICY</code>
\r
5758 <scientific_name>Acidiphilium cryptum</scientific_name>
\r
5759 <rank>species</rank>
\r
5764 <id provider="uniprot">1085</id>
\r
5765 <code>RHORU</code>
\r
5766 <scientific_name>Rhodospirillum rubrum</scientific_name>
\r
5767 <rank>species</rank>
\r
5778 <id provider="uniprot">1224</id>
\r
5779 <scientific_name>Proteobacteria</scientific_name>
\r
5780 <rank>phylum</rank>
\r
5785 <id provider="uniprot">712</id>
\r
5786 <scientific_name>Pasteurellaceae</scientific_name>
\r
5787 <rank>family</rank>
\r
5791 <id provider="uniprot">727</id>
\r
5792 <code>HAEIN</code>
\r
5793 <scientific_name>Haemophilus influenzae</scientific_name>
\r
5794 <rank>species</rank>
\r
5799 <id provider="uniprot">747</id>
\r
5800 <code>PASMU</code>
\r
5801 <scientific_name>Pasteurella multocida</scientific_name>
\r
5802 <rank>species</rank>
\r
5808 <id provider="uniprot">487</id>
\r
5809 <code>NEIME</code>
\r
5810 <scientific_name>Neisseria meningitidis</scientific_name>
\r
5811 <rank>species</rank>
\r
5817 <id provider="uniprot">905</id>
\r
5818 <code>ACIFE</code>
\r
5819 <scientific_name>Acidaminococcus fermentans</scientific_name>
\r
5820 <rank>species</rank>
\r
5826 <name>b_103</name>
\r
5830 <id provider="uniprot">28221</id>
\r
5831 <scientific_name>Deltaproteobacteria</scientific_name>
\r
5832 <rank>class</rank>
\r
5840 <id provider="uniprot">84980</id>
\r
5841 <code>DESPS</code>
\r
5842 <scientific_name>Desulfotalea psychrophila</scientific_name>
\r
5843 <rank>species</rank>
\r
5848 <id provider="uniprot">876</id>
\r
5849 <code>DESDE</code>
\r
5850 <scientific_name>Desulfovibrio desulfuricans</scientific_name>
\r
5851 <rank>species</rank>
\r
5857 <id provider="uniprot">56780</id>
\r
5858 <code>SYNAS</code>
\r
5859 <scientific_name>Syntrophus aciditrophicus (strain SB)</scientific_name>
\r
5866 <id provider="uniprot">28231</id>
\r
5867 <scientific_name>Geobacter</scientific_name>
\r
5868 <rank>genus</rank>
\r
5872 <id provider="uniprot">28232</id>
\r
5873 <code>GEOME</code>
\r
5874 <scientific_name>Geobacter metallireducens</scientific_name>
\r
5875 <rank>species</rank>
\r
5880 <id provider="uniprot">35554</id>
\r
5881 <code>GEOSL</code>
\r
5882 <scientific_name>Geobacter sulfurreducens</scientific_name>
\r
5883 <rank>species</rank>
\r
5889 <name>b_102</name>
\r
5895 <id provider="uniprot">31</id>
\r
5896 <scientific_name>Myxococcaceae</scientific_name>
\r
5897 <rank>family</rank>
\r
5901 <id provider="uniprot">290397</id>
\r
5902 <code>ANADE</code>
\r
5903 <scientific_name>Anaeromyxobacter dehalogenans (strain 2CP-C)</scientific_name>
\r
5908 <id provider="uniprot">34</id>
\r
5909 <code>MYXXA</code>
\r
5910 <scientific_name>Myxococcus xanthus</scientific_name>
\r
5911 <rank>species</rank>
\r
5918 <id provider="uniprot">57723</id>
\r
5919 <scientific_name>Acidobacteria</scientific_name>
\r
5920 <rank>phylum</rank>
\r
5924 <id provider="uniprot">204669</id>
\r
5925 <code>ACIBL</code>
\r
5926 <scientific_name>Acidobacteria bacterium (strain Ellin345)</scientific_name>
\r
5931 <id provider="uniprot">332163</id>
\r
5932 <code>SOLUS</code>
\r
5933 <scientific_name>Solibacter usitatus</scientific_name>
\r
5934 <rank>species</rank>
\r
5941 <id provider="uniprot">265606</id>
\r
5942 <code>RHOBA</code>
\r
5943 <scientific_name>Rhodopirellula baltica</scientific_name>
\r
5944 <rank>species</rank>
\r
5951 <name>b_193</name>
\r
5953 <name>b_163</name>
\r
5955 <name>b_133</name>
\r
5957 <name>Chloroflexi & Actinobacteria</name>
\r
5960 <id provider="uniprot">201174</id>
\r
5961 <scientific_name>Actinobacteria</scientific_name>
\r
5962 <rank>phylum</rank>
\r
5966 <id provider="uniprot">2037</id>
\r
5967 <scientific_name>Actinomycetales</scientific_name>
\r
5968 <rank>order</rank>
\r
5971 <name>b_115</name>
\r
5974 <id provider="uniprot">266940</id>
\r
5975 <code>KINRD</code>
\r
5976 <scientific_name>Kineococcus radiotolerans (strain ATCC BAA-149 / DSM 14245 / SRS30216)</scientific_name>
\r
5981 <id provider="uniprot">378753</id>
\r
5982 <code>KOCRD</code>
\r
5983 <scientific_name>Kocuria rhizophila (strain ATCC 9341 / DSM 348 / NBRC 103217 / DC2201)</scientific_name>
\r
5988 <id provider="uniprot">1032480</id>
\r
5989 <code>MICPN</code>
\r
5990 <scientific_name>Microlunatus phosphovorus (strain ATCC 700054 / DSM 10555 / JCM 9379 / NBRC 101784 / NCIMB 13414 / VKM Ac-1990 / NM-1)</scientific_name>
\r
5991 <common_name>Microlunatus phosphovorus NM-1</common_name>
\r
5992 <rank>strain</rank>
\r
5997 <id provider="uniprot">1902</id>
\r
5998 <code>STRCO</code>
\r
5999 <scientific_name>Streptomyces coelicolor</scientific_name>
\r
6000 <rank>species</rank>
\r
6005 <id provider="uniprot">269800</id>
\r
6006 <code>THEFY</code>
\r
6007 <scientific_name>Thermobifida fusca (strain YX)</scientific_name>
\r
6013 <id provider="uniprot">85007</id>
\r
6014 <scientific_name>Corynebacterineae</scientific_name>
\r
6015 <rank>suborder</rank>
\r
6019 <id provider="uniprot">1763</id>
\r
6020 <scientific_name>Mycobacterium</scientific_name>
\r
6021 <rank>genus</rank>
\r
6025 <id provider="uniprot">1769</id>
\r
6026 <code>MYCLE</code>
\r
6027 <scientific_name>Mycobacterium leprae</scientific_name>
\r
6028 <rank>species</rank>
\r
6033 <id provider="uniprot">1773</id>
\r
6034 <code>MYCTU</code>
\r
6035 <scientific_name>Mycobacterium tuberculosis</scientific_name>
\r
6036 <rank>species</rank>
\r
6042 <id provider="uniprot">306537</id>
\r
6043 <code>CORJK</code>
\r
6044 <scientific_name>Corynebacterium jeikeium (strain K411)</scientific_name>
\r
6049 <id provider="uniprot">632772</id>
\r
6050 <code>RHOOB</code>
\r
6051 <scientific_name>Rhodococcus opacus (strain B4)</scientific_name>
\r
6052 <rank>strain</rank>
\r
6059 <id provider="uniprot">266117</id>
\r
6060 <code>RUBXD</code>
\r
6061 <scientific_name>Rubrobacter xylanophilus (strain DSM 9941 / NBRC 16129)</scientific_name>
\r
6067 <id provider="uniprot">200795</id>
\r
6068 <scientific_name>Chloroflexi</scientific_name>
\r
6069 <common_name>GNS bacteria</common_name>
\r
6070 <synonym>Thermomicrobia</synonym>
\r
6071 <rank>phylum</rank>
\r
6075 <id provider="uniprot">32061</id>
\r
6076 <scientific_name>Chloroflexi (class)</scientific_name>
\r
6077 <synonym>Chloroflecales</synonym>
\r
6078 <synonym>Chloroflexus/Deinococcus group</synonym>
\r
6079 <rank>class</rank>
\r
6082 <name>b_122</name>
\r
6084 <id provider="uniprot">1106</id>
\r
6085 <scientific_name>Chloroflexaceae</scientific_name>
\r
6086 <common_name>filamentous anoxygenic phototrophic bacteria</common_name>
\r
6087 <rank>family</rank>
\r
6091 <id provider="uniprot">1108</id>
\r
6092 <code>CHLAU</code>
\r
6093 <scientific_name>Chloroflexus aurantiacus</scientific_name>
\r
6094 <rank>species</rank>
\r
6099 <id provider="uniprot">383372</id>
\r
6100 <code>ROSCS</code>
\r
6101 <scientific_name>Roseiflexus castenholzii (strain DSM 13941 / HLO8)</scientific_name>
\r
6102 <rank>species</rank>
\r
6108 <id provider="uniprot">65</id>
\r
6109 <code>HERAU</code>
\r
6110 <scientific_name>Herpetosiphon aurantiacus</scientific_name>
\r
6111 <synonym>Herpetosiphon giganteus</synonym>
\r
6112 <rank>species</rank>
\r
6118 <id provider="uniprot">479434</id>
\r
6119 <code>SPHTD</code>
\r
6120 <scientific_name>Sphaerobacter thermophilus (strain DSM 20745 / S 6022)</scientific_name>
\r
6121 <rank>strain</rank>
\r
6127 <name>b_132</name>
\r
6129 <id provider="uniprot">188787</id>
\r
6130 <scientific_name>Deinococci</scientific_name>
\r
6131 <rank>class</rank>
\r
6134 <name>b_130</name>
\r
6136 <id provider="uniprot">1298</id>
\r
6137 <scientific_name>Deinococcus</scientific_name>
\r
6138 <rank>genus</rank>
\r
6142 <id provider="uniprot">319795</id>
\r
6143 <code>DEIGD</code>
\r
6144 <scientific_name>Deinococcus geothermalis (strain DSM 11300)</scientific_name>
\r
6149 <id provider="uniprot">1299</id>
\r
6150 <code>DEIRA</code>
\r
6151 <scientific_name>Deinococcus radiodurans</scientific_name>
\r
6152 <rank>species</rank>
\r
6158 <id provider="uniprot">274</id>
\r
6159 <code>THETH</code>
\r
6160 <scientific_name>Thermus thermophilus</scientific_name>
\r
6161 <rank>species</rank>
\r
6167 <name>b_162</name>
\r
6169 <id provider="uniprot">1117</id>
\r
6170 <scientific_name>Cyanobacteria</scientific_name>
\r
6171 <rank>phylum</rank>
\r
6174 <name>b_154</name>
\r
6176 <name>b_152</name>
\r
6178 <name>b_146</name>
\r
6180 <name>b_144</name>
\r
6182 <name>b_142</name>
\r
6184 <name>b_138</name>
\r
6186 <id provider="uniprot">1162</id>
\r
6187 <scientific_name>Nostocaceae</scientific_name>
\r
6188 <rank>family</rank>
\r
6191 <name>b_136</name>
\r
6194 <id provider="uniprot">1172</id>
\r
6195 <code>ANAVA</code>
\r
6196 <scientific_name>Anabaena variabilis</scientific_name>
\r
6197 <rank>species</rank>
\r
6202 <id provider="uniprot">28072</id>
\r
6203 <code>NOSS7</code>
\r
6204 <scientific_name>Nostoc sp. (strain PCC 7524)</scientific_name>
\r
6205 <rank>species</rank>
\r
6211 <id provider="uniprot">63737</id>
\r
6212 <code>NOSP7</code>
\r
6213 <scientific_name>Nostoc punctiforme (strain ATCC 29133 / PCC 73102)</scientific_name>
\r
6219 <id provider="uniprot">155978</id>
\r
6220 <code>ACAMR</code>
\r
6221 <scientific_name>Acaryochloris marina</scientific_name>
\r
6222 <rank>species</rank>
\r
6228 <id provider="uniprot">449447</id>
\r
6229 <code>MICAN</code>
\r
6230 <scientific_name>Microcystis aeruginosa (strain NIES-843)</scientific_name>
\r
6236 <id provider="uniprot">1206</id>
\r
6237 <code>TRIER</code>
\r
6238 <scientific_name>Trichodesmium erythraeum</scientific_name>
\r
6239 <rank>species</rank>
\r
6244 <name>b_149</name>
\r
6246 <id provider="uniprot">1118</id>
\r
6247 <scientific_name>Chroococcales</scientific_name>
\r
6248 <rank>order</rank>
\r
6252 <id provider="uniprot">32046</id>
\r
6253 <code>SYNEL</code>
\r
6254 <scientific_name>Synechococcus elongatus</scientific_name>
\r
6255 <rank>species</rank>
\r
6260 <id provider="uniprot">1148</id>
\r
6261 <code>SYNY3</code>
\r
6262 <scientific_name>Synechocystis sp. (strain PCC 6803)</scientific_name>
\r
6263 <rank>species</rank>
\r
6270 <id provider="uniprot">33072</id>
\r
6271 <code>GLOVI</code>
\r
6272 <scientific_name>Gloeobacter violaceus</scientific_name>
\r
6273 <rank>species</rank>
\r
6278 <name>b_161</name>
\r
6280 <name>b_159</name>
\r
6282 <id provider="uniprot">1218</id>
\r
6283 <scientific_name>Prochlorococcus</scientific_name>
\r
6284 <rank>genus</rank>
\r
6287 <name>b_157</name>
\r
6290 <id provider="uniprot">1219</id>
\r
6291 <code>PROMA</code>
\r
6292 <scientific_name>Prochlorococcus marinus</scientific_name>
\r
6293 <rank>species</rank>
\r
6298 <id provider="uniprot">59919</id>
\r
6299 <code>PROMP</code>
\r
6300 <scientific_name>Prochlorococcus marinus subsp. pastoris (strain CCMP1986 / MED4)</scientific_name>
\r
6306 <id provider="uniprot">74547</id>
\r
6307 <code>PROMM</code>
\r
6308 <scientific_name>Prochlorococcus marinus (strain MIT 9313)</scientific_name>
\r
6314 <id provider="uniprot">64471</id>
\r
6315 <code>SYNS3</code>
\r
6316 <scientific_name>Synechococcus sp. (strain CC9311)</scientific_name>
\r
6317 <rank>species</rank>
\r
6324 <name>b_192</name>
\r
6326 <name>b_190</name>
\r
6328 <name>b_178</name>
\r
6330 <name>b_176</name>
\r
6332 <id provider="uniprot">191412</id>
\r
6333 <scientific_name>Chlorobiaceae</scientific_name>
\r
6334 <rank>family</rank>
\r
6337 <name>b_170</name>
\r
6339 <name>b_166</name>
\r
6342 <id provider="uniprot">331678</id>
\r
6343 <code>CHLPB</code>
\r
6344 <scientific_name>Chlorobium phaeobacteroides (strain BS1)</scientific_name>
\r
6349 <id provider="uniprot">1102</id>
\r
6350 <code>PROAE</code>
\r
6351 <scientific_name>Prosthecochloris aestuarii</scientific_name>
\r
6352 <rank>species</rank>
\r
6357 <name>b_169</name>
\r
6359 <id provider="uniprot">274493</id>
\r
6360 <scientific_name>Chlorobium/Pelodictyon group</scientific_name>
\r
6364 <id provider="uniprot">1100</id>
\r
6365 <code>PELLU</code>
\r
6366 <scientific_name>Pelodictyon luteolum</scientific_name>
\r
6367 <rank>species</rank>
\r
6372 <id provider="uniprot">290318</id>
\r
6373 <code>PROVI</code>
\r
6374 <scientific_name>Prosthecochloris vibrioformis (strain DSM 265)</scientific_name>
\r
6375 <common_name>Chlorobium vibrioforme subsp. thiosulfatophilum (strain DSM 265)</common_name>
\r
6376 <synonym>Chlorobium phaeovibrioides (strain DSM 265)</synonym>
\r
6382 <name>b_175</name>
\r
6384 <name>b_173</name>
\r
6386 <id provider="uniprot">256319</id>
\r
6387 <scientific_name>Chlorobaculum</scientific_name>
\r
6388 <rank>genus</rank>
\r
6392 <id provider="uniprot">517417</id>
\r
6393 <code>CHLP8</code>
\r
6394 <scientific_name>Chlorobaculum parvum (strain NCIB 8327)</scientific_name>
\r
6395 <synonym>Chlorobium vibrioforme subsp. thiosulfatophilum (strain DSM 263 / NCIB 8327)</synonym>
\r
6400 <id provider="uniprot">1097</id>
\r
6401 <code>CHLTE</code>
\r
6402 <scientific_name>Chlorobium tepidum</scientific_name>
\r
6403 <rank>species</rank>
\r
6409 <id provider="uniprot">340177</id>
\r
6410 <code>CHLCH</code>
\r
6411 <scientific_name>Chlorobium chlorochromatii (strain CaD3)</scientific_name>
\r
6418 <id provider="uniprot">315277</id>
\r
6419 <code>CHLTA</code>
\r
6420 <scientific_name>Chlamydia trachomatis serovar A (strain HAR-13 / ATCC VR-571B)</scientific_name>
\r
6425 <name>b_189</name>
\r
6427 <id provider="uniprot">976</id>
\r
6428 <scientific_name>Bacteroidetes</scientific_name>
\r
6429 <rank>phylum</rank>
\r
6432 <name>b_183</name>
\r
6434 <name>b_181</name>
\r
6436 <id provider="uniprot">49546</id>
\r
6437 <scientific_name>Flavobacteriaceae</scientific_name>
\r
6438 <rank>family</rank>
\r
6442 <id provider="uniprot">986</id>
\r
6443 <code>FLAJO</code>
\r
6444 <scientific_name>Flavobacterium johnsoniae</scientific_name>
\r
6445 <synonym>Cytophaga johnsonae</synonym>
\r
6446 <rank>species</rank>
\r
6451 <id provider="uniprot">411154</id>
\r
6452 <code>GRAFK</code>
\r
6453 <scientific_name>Gramella forsetii (strain KT0803)</scientific_name>
\r
6459 <id provider="uniprot">269798</id>
\r
6460 <code>CYTH3</code>
\r
6461 <scientific_name>Cytophaga hutchinsonii (strain ATCC 33406 / NCIMB 9469)</scientific_name>
\r
6466 <name>b_188</name>
\r
6468 <id provider="uniprot">171549</id>
\r
6469 <scientific_name>Bacteroidales</scientific_name>
\r
6470 <rank>order</rank>
\r
6473 <name>b_186</name>
\r
6475 <id provider="uniprot">816</id>
\r
6476 <scientific_name>Bacteroides</scientific_name>
\r
6477 <rank>genus</rank>
\r
6481 <id provider="uniprot">817</id>
\r
6482 <code>BACFR</code>
\r
6483 <scientific_name>Bacteroides fragilis</scientific_name>
\r
6484 <rank>species</rank>
\r
6489 <id provider="uniprot">818</id>
\r
6490 <code>BACTN</code>
\r
6491 <scientific_name>Bacteroides thetaiotaomicron</scientific_name>
\r
6492 <rank>species</rank>
\r
6498 <id provider="uniprot">837</id>
\r
6499 <code>PORGI</code>
\r
6500 <scientific_name>Porphyromonas gingivalis</scientific_name>
\r
6501 <synonym>Bacteroides gingivalis</synonym>
\r
6502 <rank>species</rank>
\r
6510 <id provider="uniprot">309807</id>
\r
6511 <code>SALRD</code>
\r
6512 <scientific_name>Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31)</scientific_name>
\r
6519 <name>b_199</name>
\r
6521 <name>b_197</name>
\r
6523 <scientific_name>Verrucomicrobia</scientific_name>
\r
6527 <id provider="uniprot">349741</id>
\r
6528 <code>AKKM8</code>
\r
6529 <scientific_name>Akkermansia muciniphila (strain ATCC BAA-835)</scientific_name>
\r
6534 <id provider="uniprot">481448</id>
\r
6535 <code>METI4</code>
\r
6536 <scientific_name>Methylacidiphilum infernorum (isolate V4)</scientific_name>
\r
6537 <synonym>Methylokorus infernorum (strain V4)</synonym>
\r
6543 <id provider="uniprot">44275</id>
\r
6544 <code>LEPIC</code>
\r
6545 <scientific_name>Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni</scientific_name>
\r
6551 <name>b_225</name>
\r
6553 <name>b_219</name>
\r
6555 <id provider="uniprot">1239</id>
\r
6556 <scientific_name>Firmicutes</scientific_name>
\r
6557 <rank>phylum</rank>
\r
6560 <name>b_213</name>
\r
6563 <id provider="uniprot">1385</id>
\r
6564 <scientific_name>Bacillales</scientific_name>
\r
6565 <rank>order</rank>
\r
6569 <id provider="uniprot">186817</id>
\r
6570 <scientific_name>Bacillaceae</scientific_name>
\r
6571 <rank>family</rank>
\r
6575 <id provider="uniprot">1386</id>
\r
6576 <scientific_name>Bacillus</scientific_name>
\r
6577 <rank>genus</rank>
\r
6581 <id provider="uniprot">86661</id>
\r
6582 <scientific_name>Bacillus cereus group</scientific_name>
\r
6586 <id provider="uniprot">1392</id>
\r
6587 <code>BACAN</code>
\r
6588 <scientific_name>Bacillus anthracis</scientific_name>
\r
6589 <rank>species</rank>
\r
6594 <id provider="uniprot">572264</id>
\r
6595 <code>BACC3</code>
\r
6596 <scientific_name>Bacillus cereus (strain 03BB102)</scientific_name>
\r
6597 <rank>strain</rank>
\r
6603 <id provider="uniprot">1423</id>
\r
6604 <code>BACSU</code>
\r
6605 <scientific_name>Bacillus subtilis</scientific_name>
\r
6606 <rank>species</rank>
\r
6611 <name>b_206</name>
\r
6614 <id provider="uniprot">86665</id>
\r
6615 <code>BACHD</code>
\r
6616 <scientific_name>Bacillus halodurans</scientific_name>
\r
6617 <rank>species</rank>
\r
6622 <id provider="uniprot">1462</id>
\r
6623 <code>GEOKA</code>
\r
6624 <scientific_name>Geobacillus kaustophilus</scientific_name>
\r
6625 <rank>species</rank>
\r
6631 <name>b_210</name>
\r
6634 <id provider="uniprot">1639</id>
\r
6635 <code>LISMO</code>
\r
6636 <scientific_name>Listeria monocytogenes</scientific_name>
\r
6637 <rank>species</rank>
\r
6642 <id provider="uniprot">1280</id>
\r
6643 <code>STAAU</code>
\r
6644 <scientific_name>Staphylococcus aureus</scientific_name>
\r
6645 <rank>species</rank>
\r
6652 <id provider="uniprot">195103</id>
\r
6653 <code>CLOP1</code>
\r
6654 <scientific_name>Clostridium perfringens (strain ATCC 13124 / NCTC 8237 / Type A)</scientific_name>
\r
6659 <name>Clostridia</name>
\r
6661 <id provider="uniprot">186801</id>
\r
6662 <scientific_name>Clostridia</scientific_name>
\r
6663 <rank>class</rank>
\r
6666 <name>b_218</name>
\r
6668 <name>b_216</name>
\r
6670 <id provider="uniprot">186814</id>
\r
6671 <scientific_name>Thermoanaerobacteriaceae</scientific_name>
\r
6672 <rank>family</rank>
\r
6676 <id provider="uniprot">246194</id>
\r
6677 <code>CARHZ</code>
\r
6678 <scientific_name>Carboxydothermus hydrogenoformans (strain Z-2901 / DSM 6008)</scientific_name>
\r
6683 <id provider="uniprot">119072</id>
\r
6684 <code>THETN</code>
\r
6685 <scientific_name>Thermoanaerobacter tengcongensis</scientific_name>
\r
6686 <rank>species</rank>
\r
6692 <id provider="uniprot">49338</id>
\r
6693 <code>DESHA</code>
\r
6694 <scientific_name>Desulfitobacterium hafniense</scientific_name>
\r
6695 <synonym>Desulfitobacterium frappieri</synonym>
\r
6696 <rank>species</rank>
\r
6702 <id provider="uniprot">515619</id>
\r
6703 <code>EUBR3</code>
\r
6704 <scientific_name>Eubacterium rectale (strain ATCC 33656 / VPI 0990)</scientific_name>
\r
6710 <name>b_224</name>
\r
6712 <id provider="uniprot">188709</id>
\r
6713 <scientific_name>Thermotogaceae</scientific_name>
\r
6714 <rank>family</rank>
\r
6717 <name>b_222</name>
\r
6720 <id provider="uniprot">381764</id>
\r
6721 <code>FERNB</code>
\r
6722 <scientific_name>Fervidobacterium nodosum (strain ATCC 35602 / DSM 5306 / Rt17-B1)</scientific_name>
\r
6727 <id provider="uniprot">416591</id>
\r
6728 <code>THELT</code>
\r
6729 <scientific_name>Thermotoga lettingae (strain ATCC BAA-301 / DSM 14385 / TMO)</scientific_name>
\r
6735 <id provider="uniprot">2336</id>
\r
6736 <code>THEMA</code>
\r
6737 <scientific_name>Thermotoga maritima</scientific_name>
\r
6738 <rank>species</rank>
\r
6745 <name>b_267</name>
\r
6747 <name>b_263</name>
\r
6749 <name>b_251</name>
\r
6751 <name>b_249</name>
\r
6753 <name>b_245</name>
\r
6755 <name>b_237</name>
\r
6757 <name>b_233</name>
\r
6759 <id provider="uniprot">31969</id>
\r
6760 <scientific_name>Mollicutes</scientific_name>
\r
6761 <rank>class</rank>
\r
6764 <name>b_231</name>
\r
6766 <name>b_229</name>
\r
6768 <scientific_name>Mycoplasma</scientific_name>
\r
6772 <id provider="uniprot">2097</id>
\r
6773 <code>MYCGE</code>
\r
6774 <scientific_name>Mycoplasma genitalium</scientific_name>
\r
6775 <rank>species</rank>
\r
6780 <id provider="uniprot">2104</id>
\r
6781 <code>MYCPN</code>
\r
6782 <scientific_name>Mycoplasma pneumoniae</scientific_name>
\r
6783 <rank>species</rank>
\r
6789 <id provider="uniprot">2151</id>
\r
6790 <code>MESFL</code>
\r
6791 <scientific_name>Mesoplasma florum</scientific_name>
\r
6792 <synonym>Acholeplasma florum</synonym>
\r
6793 <rank>species</rank>
\r
6799 <id provider="uniprot">134821</id>
\r
6800 <code>UREPA</code>
\r
6801 <scientific_name>Ureaplasma parvum</scientific_name>
\r
6802 <synonym>Ureaplasma urealyticum biotype 1</synonym>
\r
6803 <rank>species</rank>
\r
6808 <name>b_236</name>
\r
6810 <id provider="uniprot">137</id>
\r
6811 <scientific_name>Spirochaetaceae</scientific_name>
\r
6812 <rank>family</rank>
\r
6816 <id provider="uniprot">139</id>
\r
6817 <code>BORBU</code>
\r
6818 <scientific_name>Borrelia burgdorferi</scientific_name>
\r
6819 <common_name>Lyme disease spirochete</common_name>
\r
6820 <rank>species</rank>
\r
6825 <id provider="uniprot">160</id>
\r
6826 <code>TREPA</code>
\r
6827 <scientific_name>Treponema pallidum</scientific_name>
\r
6828 <rank>species</rank>
\r
6834 <name>b_244</name>
\r
6836 <name>b_242</name>
\r
6838 <id provider="uniprot">1113537</id>
\r
6839 <scientific_name>Chlamydia/Chlamydophila group</scientific_name>
\r
6842 <name>b_240</name>
\r
6845 <id provider="uniprot">83558</id>
\r
6846 <code>CHLPN</code>
\r
6847 <scientific_name>Chlamydia pneumoniae</scientific_name>
\r
6848 <synonym>Chlamydophila pneumoniae</synonym>
\r
6849 <rank>species</rank>
\r
6854 <id provider="uniprot">264202</id>
\r
6855 <code>CHLFF</code>
\r
6856 <scientific_name>Chlamydophila felis (strain Fe/C-56)</scientific_name>
\r
6862 <id provider="uniprot">83560</id>
\r
6863 <code>CHLMU</code>
\r
6864 <scientific_name>Chlamydia muridarum</scientific_name>
\r
6865 <rank>species</rank>
\r
6871 <id provider="uniprot">785</id>
\r
6872 <code>RICTY</code>
\r
6873 <scientific_name>Rickettsia typhi</scientific_name>
\r
6874 <rank>species</rank>
\r
6881 <id provider="uniprot">28211</id>
\r
6882 <scientific_name>Alphaproteobacteria</scientific_name>
\r
6883 <rank>class</rank>
\r
6887 <id provider="uniprot">38323</id>
\r
6888 <code>BARHE</code>
\r
6889 <scientific_name>Bartonella henselae</scientific_name>
\r
6890 <synonym>Rochalimaea henselae</synonym>
\r
6891 <rank>species</rank>
\r
6896 <id provider="uniprot">198252</id>
\r
6897 <code>PELUB</code>
\r
6898 <scientific_name>Pelagibacter ubique</scientific_name>
\r
6899 <rank>species</rank>
\r
6904 <id provider="uniprot">780</id>
\r
6905 <scientific_name>Rickettsia</scientific_name>
\r
6906 <rank>genus</rank>
\r
6910 <id provider="uniprot">391896</id>
\r
6911 <code>RICB8</code>
\r
6912 <scientific_name>Rickettsia bellii (strain OSU 85-389)</scientific_name>
\r
6917 <id provider="uniprot">452659</id>
\r
6918 <code>RICRO</code>
\r
6919 <scientific_name>Rickettsia rickettsii (strain Iowa)</scientific_name>
\r
6920 <rank>strain</rank>
\r
6928 <id provider="uniprot">263</id>
\r
6929 <code>FRATU</code>
\r
6930 <scientific_name>Francisella tularensis</scientific_name>
\r
6931 <rank>species</rank>
\r
6936 <name>b_262</name>
\r
6938 <name>b_260</name>
\r
6940 <name>b_258</name>
\r
6942 <id provider="uniprot">186826</id>
\r
6943 <scientific_name>Lactobacillales</scientific_name>
\r
6944 <rank>order</rank>
\r
6947 <name>b_256</name>
\r
6949 <id provider="uniprot">1300</id>
\r
6950 <scientific_name>Streptococcaceae</scientific_name>
\r
6951 <rank>family</rank>
\r
6954 <name>b_254</name>
\r
6956 <id provider="uniprot">1301</id>
\r
6957 <scientific_name>Streptococcus</scientific_name>
\r
6958 <rank>genus</rank>
\r
6962 <id provider="uniprot">1313</id>
\r
6963 <code>STRPN</code>
\r
6964 <scientific_name>Streptococcus pneumoniae</scientific_name>
\r
6965 <rank>species</rank>
\r
6970 <id provider="uniprot">1314</id>
\r
6971 <code>STRPY</code>
\r
6972 <scientific_name>Streptococcus pyogenes</scientific_name>
\r
6973 <rank>species</rank>
\r
6979 <id provider="uniprot">1360</id>
\r
6980 <code>LACLA</code>
\r
6981 <scientific_name>Lactococcus lactis subsp. lactis</scientific_name>
\r
6982 <synonym>Streptococcus lactis</synonym>
\r
6983 <rank>subspecies</rank>
\r
6989 <id provider="uniprot">1579</id>
\r
6990 <code>LACAC</code>
\r
6991 <scientific_name>Lactobacillus acidophilus</scientific_name>
\r
6992 <rank>species</rank>
\r
6998 <id provider="uniprot">216816</id>
\r
6999 <code>BIFLO</code>
\r
7000 <scientific_name>Bifidobacterium longum</scientific_name>
\r
7001 <rank>species</rank>
\r
7007 <id provider="uniprot">851</id>
\r
7008 <code>FUSNU</code>
\r
7009 <scientific_name>Fusobacterium nucleatum</scientific_name>
\r
7010 <rank>species</rank>
\r
7016 <name>b_266</name>
\r
7018 <id provider="uniprot">61434</id>
\r
7019 <scientific_name>Dehalococcoides</scientific_name>
\r
7020 <rank>genus</rank>
\r
7024 <id provider="uniprot">243164</id>
\r
7025 <code>DEHE1</code>
\r
7026 <scientific_name>Dehalococcoides ethenogenes (strain 195)</scientific_name>
\r
7031 <id provider="uniprot">216389</id>
\r
7032 <code>DEHSB</code>
\r
7033 <scientific_name>Dehalococcoides sp. (strain BAV1)</scientific_name>
\r
7034 <rank>species</rank>
\r
7041 <name>b_277</name>
\r
7043 <id provider="uniprot">29547</id>
\r
7044 <scientific_name>Epsilonproteobacteria</scientific_name>
\r
7045 <rank>class</rank>
\r
7048 <name>b_273</name>
\r
7051 <id provider="uniprot">387092</id>
\r
7052 <code>NITSB</code>
\r
7053 <scientific_name>Nitratiruptor sp. (strain SB155-2)</scientific_name>
\r
7054 <rank>species</rank>
\r
7059 <id provider="uniprot">387093</id>
\r
7060 <code>SULNB</code>
\r
7061 <scientific_name>Sulfurovum sp. (strain NBC37-1)</scientific_name>
\r
7062 <rank>species</rank>
\r
7067 <name>b_276</name>
\r
7069 <id provider="uniprot">213849</id>
\r
7070 <scientific_name>Campylobacterales</scientific_name>
\r
7071 <rank>order</rank>
\r
7075 <id provider="uniprot">197</id>
\r
7076 <code>CAMJE</code>
\r
7077 <scientific_name>Campylobacter jejuni</scientific_name>
\r
7078 <rank>species</rank>
\r
7083 <id provider="uniprot">357544</id>
\r
7084 <code>HELPH</code>
\r
7085 <scientific_name>Helicobacter pylori (strain HPAG1)</scientific_name>
\r
7093 <id provider="uniprot">63363</id>
\r
7094 <code>AQUAE</code>
\r
7095 <scientific_name>Aquifex aeolicus</scientific_name>
\r
7096 <rank>species</rank>
\r