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1980 <desc>Caenorhabditis phylogeny predicts convergence of hermaphroditism and extensive intron loss</desc>
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3178 <name>Agaricomycetidae & Gloeophyllum & Aphyllophorales</name>
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3340 <desc>The phylogenetic distribution of resupinate forms across the major clades of mushroom-forming fungi (Homobasidiomycetes)</desc>
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5698 <name>PYRFU & PYRKO</name>
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6374 <code>AGRT5</code>
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6375 <scientific_name>Agrobacterium tumefaciens (strain C58 / ATCC 33970)</scientific_name>
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6381 <code>RHIEC</code>
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6382 <scientific_name>Rhizobium etli (strain CFN 42 / ATCC 51251)</scientific_name>
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7122 <scientific_name>Bacteroidetes</scientific_name>
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7146 <code>GRAFK</code>
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