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6267 <scientific_name>Escherichia coli (strain K12)</scientific_name>
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6272 <id provider="uniprot">83334</id>
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6273 <code>ECO57</code>
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6274 <scientific_name>Escherichia coli O157:H7</scientific_name>
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6280 <id provider="uniprot">623</id>
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6281 <code>SHIFL</code>
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6282 <scientific_name>Shigella flexneri</scientific_name>
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6283 <rank>species</rank>
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6289 <id provider="uniprot">90371</id>
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6290 <code>SALTY</code>
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6291 <scientific_name>Salmonella typhimurium</scientific_name>
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6298 <code>YERPE</code>
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6299 <scientific_name>Yersinia pestis</scientific_name>
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6300 <rank>species</rank>
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6306 <id provider="uniprot">29488</id>
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6307 <code>PHOLU</code>
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6308 <scientific_name>Photorhabdus luminescens</scientific_name>
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6309 <synonym>Xenorhabdus luminescens</synonym>
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6310 <rank>species</rank>
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6319 <id provider="uniprot">641</id>
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6320 <scientific_name>Vibrionaceae</scientific_name>
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6321 <rank>family</rank>
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6325 <id provider="uniprot">74109</id>
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6326 <code>PHOPR</code>
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6327 <scientific_name>Photobacterium profundum</scientific_name>
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6328 <synonym>Photobacterium sp. (strain SS9)</synonym>
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6329 <rank>species</rank>
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6334 <id provider="uniprot">666</id>
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6335 <code>VIBCH</code>
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6336 <scientific_name>Vibrio cholerae</scientific_name>
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6337 <rank>species</rank>
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6343 <id provider="uniprot">318161</id>
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6344 <code>SHEDO</code>
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6345 <scientific_name>Shewanella denitrificans (strain OS217 / ATCC BAA-1090 / DSM 15013)</scientific_name>
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6355 <id provider="uniprot">286</id>
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6356 <scientific_name>Pseudomonas</scientific_name>
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6357 <rank>genus</rank>
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6363 <id provider="uniprot">220664</id>
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6364 <code>PSEF5</code>
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6365 <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf-5 / ATCC BAA-477)</scientific_name>
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6370 <id provider="uniprot">205922</id>
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6371 <code>PSEPF</code>
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6372 <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf0-1)</scientific_name>
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6379 <code>PSEAE</code>
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6380 <scientific_name>Pseudomonas aeruginosa</scientific_name>
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6381 <rank>species</rank>
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6388 <code>CHRSD</code>
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6389 <scientific_name>Chromohalobacter salexigens (strain DSM 3043 / ATCC BAA-138 / NCIMB 13768)</scientific_name>
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6398 <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>
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6399 <rank>class</rank>
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6404 <code>DECAR</code>
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6405 <scientific_name>Dechloromonas aromatica (strain RCB)</scientific_name>
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6411 <code>RALME</code>
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6412 <scientific_name>Ralstonia metallidurans (strain CH34 / ATCC 43123 / DSM 2839)</scientific_name>
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6424 <id provider="uniprot">28216</id>
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6425 <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>
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6426 <rank>class</rank>
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6431 <id provider="uniprot">206379</id>
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6432 <scientific_name>Nitrosomonadaceae</scientific_name>
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6433 <rank>family</rank>
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6437 <id provider="uniprot">915</id>
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6438 <code>NITEU</code>
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6439 <scientific_name>Nitrosomonas europaea</scientific_name>
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6440 <rank>species</rank>
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6445 <id provider="uniprot">323848</id>
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6446 <code>NITMU</code>
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6447 <scientific_name>Nitrosospira multiformis (strain ATCC 25196 / NCIMB 11849)</scientific_name>
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6453 <id provider="uniprot">36861</id>
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6454 <code>THIDE</code>
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6455 <scientific_name>Thiobacillus denitrificans</scientific_name>
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6456 <rank>species</rank>
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6464 <scientific_name>Chromatiales</scientific_name>
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6471 <scientific_name>Ectothiorhodospiraceae</scientific_name>
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6478 <code>ALHEH</code>
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6479 <scientific_name>Alkalilimnicola ehrlichei (strain MLHE-1)</scientific_name>
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6484 <id provider="uniprot">349124</id>
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6485 <code>HALHL</code>
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6486 <scientific_name>Halorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</scientific_name>
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6487 <synonym>Ectothiorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</synonym>
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6493 <id provider="uniprot">323261</id>
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6494 <code>NITOC</code>
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6495 <scientific_name>Nitrosococcus oceani (strain ATCC 19707 / NCIMB 11848)</scientific_name>
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6503 <code>THICR</code>
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6504 <scientific_name>Thiomicrospira crunogena (strain XCL-2)</scientific_name>
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6512 <id provider="uniprot">1236</id>
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6513 <scientific_name>Gammaproteobacteria</scientific_name>
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6514 <rank>class</rank>
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6520 <id provider="uniprot">135577</id>
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6521 <code>IDILO</code>
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6522 <scientific_name>Idiomarina loihiensis</scientific_name>
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6523 <rank>species</rank>
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6528 <id provider="uniprot">446</id>
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6529 <code>LEGPN</code>
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6530 <scientific_name>Legionella pneumophila</scientific_name>
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6531 <rank>species</rank>
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6539 <scientific_name>Xanthomonadaceae</scientific_name>
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6545 <code>XANAC</code>
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6546 <scientific_name>Xanthomonas axonopodis pv. citri (strain 306)</scientific_name>
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6547 <synonym>Xanthomonas citri pv. citri str. 306</synonym>
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6552 <id provider="uniprot">183190</id>
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6553 <code>XYLFT</code>
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6554 <scientific_name>Xylella fastidiosa (strain Temecula1 / ATCC 700964)</scientific_name>
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6564 <scientific_name>Alphaproteobacteria</scientific_name>
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6582 <scientific_name>Rhizobium/Agrobacterium group</scientific_name>
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6595 <scientific_name>Rhizobium etli (strain CFN 42 / ATCC 51251)</scientific_name>
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6604 <rank>family</rank>
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6611 <rank>species</rank>
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6633 <code>RHOS1</code>
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6634 <scientific_name>Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17029 / ATH 2.4.9)</scientific_name>
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6640 <code>ROSDO</code>
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6642 <common_name>Erythrobacter sp. (strain OCh 114)</common_name>
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6643 <synonym>Roseobacter denitrificans</synonym>
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6651 <code>CAUCR</code>
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6652 <scientific_name>Caulobacter crescentus</scientific_name>
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6653 <synonym>Caulobacter vibrioides</synonym>
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6654 <rank>species</rank>
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6662 <scientific_name>Rhodospirillales</scientific_name>
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6676 <code>RHORU</code>
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6678 <rank>species</rank>
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6711 <code>PASMU</code>
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6713 <rank>species</rank>
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6720 <code>NEIME</code>
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6721 <scientific_name>Neisseria meningitidis</scientific_name>
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6722 <rank>species</rank>
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6731 <rank>species</rank>
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6742 <scientific_name>Deltaproteobacteria</scientific_name>
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6743 <rank>class</rank>
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6751 <id provider="uniprot">84980</id>
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6752 <code>DESPS</code>
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6753 <scientific_name>Desulfotalea psychrophila</scientific_name>
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6754 <rank>species</rank>
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6759 <id provider="uniprot">876</id>
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6760 <code>DESDE</code>
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6761 <scientific_name>Desulfovibrio desulfuricans</scientific_name>
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6762 <rank>species</rank>
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6768 <id provider="uniprot">56780</id>
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6769 <code>SYNAS</code>
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6770 <scientific_name>Syntrophus aciditrophicus (strain SB)</scientific_name>
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6778 <scientific_name>Geobacter</scientific_name>
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6786 <rank>species</rank>
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6792 <code>GEOSL</code>
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6794 <rank>species</rank>
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6800 <name>b_102</name>
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6806 <id provider="uniprot">31</id>
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6807 <scientific_name>Myxococcaceae</scientific_name>
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6808 <rank>family</rank>
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6813 <code>ANADE</code>
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6814 <scientific_name>Anaeromyxobacter dehalogenans (strain 2CP-C)</scientific_name>
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6820 <code>MYXXA</code>
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6836 <code>KORVE</code>
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6845 <code>SOLUS</code>
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6847 <rank>species</rank>
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6864 <name>b_193</name>
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6866 <name>b_163</name>
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6870 <name>Chloroflexi & Actinobacteria</name>
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6874 <scientific_name>Actinobacteria</scientific_name>
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6895 <code>KOCRD</code>
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6896 <scientific_name>Kocuria rhizophila (strain ATCC 9341 / DSM 348 / NBRC 103217 / DC2201)</scientific_name>
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6903 <scientific_name>Microlunatus phosphovorus (strain ATCC 700054 / DSM 10555 / JCM 9379 / NBRC 101784 / NCIMB 13414 / VKM Ac-1990 / NM-1)</scientific_name>
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6904 <common_name>Microlunatus phosphovorus NM-1</common_name>
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6905 <rank>strain</rank>
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6911 <code>STRCO</code>
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6912 <scientific_name>Streptomyces coelicolor</scientific_name>
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6920 <scientific_name>Thermobifida fusca (strain YX)</scientific_name>
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6927 <scientific_name>Corynebacterineae</scientific_name>
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6933 <scientific_name>Mycobacterium</scientific_name>
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6934 <rank>genus</rank>
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6948 <scientific_name>Mycobacterium tuberculosis</scientific_name>
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6949 <rank>species</rank>
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6956 <code>CORJK</code>
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6957 <scientific_name>Corynebacterium jeikeium (strain K411)</scientific_name>
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6962 <id provider="uniprot">632772</id>
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6963 <code>RHOOB</code>
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6964 <scientific_name>Rhodococcus opacus (strain B4)</scientific_name>
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6972 <id provider="uniprot">266117</id>
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6974 <scientific_name>Rubrobacter xylanophilus (strain DSM 9941 / NBRC 16129)</scientific_name>
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6980 <id provider="uniprot">200795</id>
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6981 <scientific_name>Chloroflexi</scientific_name>
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6982 <common_name>GNS bacteria</common_name>
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6983 <synonym>Thermomicrobia</synonym>
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6984 <rank>phylum</rank>
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6988 <id provider="uniprot">32061</id>
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6989 <scientific_name>Chloroflexi (class)</scientific_name>
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6990 <synonym>Chloroflecales</synonym>
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6991 <synonym>Chloroflexus/Deinococcus group</synonym>
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6992 <rank>class</rank>
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6996 <id provider="uniprot">1106</id>
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6997 <scientific_name>Chloroflexaceae</scientific_name>
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6998 <common_name>filamentous anoxygenic phototrophic bacteria</common_name>
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6999 <rank>family</rank>
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7003 <id provider="uniprot">1108</id>
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7004 <code>CHLAU</code>
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7005 <scientific_name>Chloroflexus aurantiacus</scientific_name>
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7006 <rank>species</rank>
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7012 <code>ROSCS</code>
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7013 <scientific_name>Roseiflexus castenholzii (strain DSM 13941 / HLO8)</scientific_name>
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7014 <rank>species</rank>
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7020 <id provider="uniprot">65</id>
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7021 <code>HERAU</code>
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7022 <scientific_name>Herpetosiphon aurantiacus</scientific_name>
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7023 <synonym>Herpetosiphon giganteus</synonym>
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7024 <rank>species</rank>
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7030 <id provider="uniprot">479434</id>
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7031 <code>SPHTD</code>
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7032 <scientific_name>Sphaerobacter thermophilus (strain DSM 20745 / S 6022)</scientific_name>
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7033 <rank>strain</rank>
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7039 <name>b_132</name>
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7041 <id provider="uniprot">188787</id>
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7042 <scientific_name>Deinococci</scientific_name>
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7043 <rank>class</rank>
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7048 <scientific_name>Deinococcus</scientific_name>
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7049 <rank>genus</rank>
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7053 <id provider="uniprot">319795</id>
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7054 <code>DEIGD</code>
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7801 <rank>species</rank>
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7806 <id provider="uniprot">198252</id>
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7807 <code>PELUB</code>
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7808 <scientific_name>Pelagibacter ubique</scientific_name>
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7821 <code>RICB8</code>
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7822 <scientific_name>Rickettsia bellii (strain OSU 85-389)</scientific_name>
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7828 <code>RICRO</code>
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7829 <scientific_name>Rickettsia rickettsii (strain Iowa)</scientific_name>
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7839 <code>FRATU</code>
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7840 <scientific_name>Francisella tularensis</scientific_name>
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7841 <rank>species</rank>
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7848 <name>b_260</name>
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7860 <scientific_name>Streptococcaceae</scientific_name>
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7866 <id provider="uniprot">1301</id>
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7882 <scientific_name>Streptococcus pyogenes</scientific_name>
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7890 <code>LACLA</code>
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7891 <scientific_name>Lactococcus lactis subsp. lactis</scientific_name>
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7892 <synonym>Streptococcus lactis</synonym>
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7901 <scientific_name>Lactobacillus acidophilus</scientific_name>
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7910 <scientific_name>Bifidobacterium longum</scientific_name>
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7911 <rank>species</rank>
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7919 <scientific_name>Fusobacterium nucleatum</scientific_name>
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7935 <code>DEHE1</code>
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7962 <code>NITSB</code>
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8004 <code>AQUAE</code>
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8005 <scientific_name>Aquifex aeolicus (strain VF5)</scientific_name>
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8006 <rank>strain</rank>
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