forester/java/src/org/forester/archaeopteryx/AptxFrame.java

   1 package org.forester.archaeopteryx;
   2
   3
   4
   5 import java.awt.event.ActionEvent;
   6 import java.awt.event.ActionListener;
   7
   8 import org.forester.archaeopteryx.tools.InferenceManager;
   9 import org.forester.archaeopteryx.tools.ProcessPool;
  10
  11 public interface AptxFrame extends ActionListener {
  12
  13     NHFilter            nhfilter           = new NHFilter();
  14     NHXFilter           nhxfilter          = new NHXFilter();
  15     XMLFilter           xmlfilter          = new XMLFilter();
  16     TolFilter           tolfilter          = new TolFilter();
  17     NexusFilter         nexusfilter        = new NexusFilter();
  18     PdfFilter           pdffilter          = new PdfFilter();
  19     GraphicsFileFilter  graphicsfilefilter = new GraphicsFileFilter();
  20     MsaFileFilter       msafilter          = new MsaFileFilter();
  21     SequencesFileFilter seqsfilter         = new SequencesFileFilter();
  22     DefaultFilter       defaultfilter      = new DefaultFilter();
  23
  24     /**
  25      * Action performed.
  26      */
  27     void actionPerformed( ActionEvent e );
  28
  29     Configuration getConfiguration();
  30
  31     /**
  32      * This method returns the current external node data which
  33      * has been selected by the user by clicking the "Return ..."
  34      * menu item. This method is expected to be called from Javascript or
  35      * something like it.
  36      *
  37      * @return current external node data as String
  38      */
  39     String getCurrentExternalNodesDataBuffer();
  40
  41     int getCurrentExternalNodesDataBufferChangeCounter();
  42
  43     int getCurrentExternalNodesDataBufferLength();
  44
  45     InferenceManager getInferenceManager();
  46
  47     MainPanel getMainPanel();
  48
  49     Options getOptions();
  50
  51     ProcessPool getProcessPool();
  52
  53     void showTextFrame( String s, String title );
  54
  55     void showWhole();
  56
  57     void updateProcessMenu();
  58
  59     void activateSaveAllIfNeeded();
  60 }