forester/java/src/org/forester/clade_analysis/Prefix.java

   1
   2 package org.forester.clade_analysis;
   3
   4 import java.math.BigDecimal;
   5
   6 final class Prefix {
   7
   8     private final String _prefix;
   9     private final BigDecimal _confidence;
  10     private final String _separator;
  11     private final String _first;
  12
  13     Prefix( final String prefix, final String confidence, final String separator ) {
  14         _prefix = prefix;
  15         _confidence = new BigDecimal( confidence);
  16         _separator = separator ;
  17         if ( _prefix.indexOf( _separator ) < 0) {
  18             _first = _prefix;
  19         }
  20         else {
  21         _first = _prefix.substring( 0, _prefix.indexOf(_separator ) );
  22         }
  23     }
  24
  25     Prefix( final String prefix, final double confidence , final String separator) {
  26         _prefix = prefix;
  27         _confidence = new BigDecimal( confidence);
  28         _separator = separator ;
  29         if ( _prefix.indexOf( _separator ) < 0) {
  30             _first = _prefix;
  31         }
  32         else {
  33             _first = _prefix.substring( 0, _prefix.indexOf(_separator ) );
  34             }
  35     }
  36
  37     String getPrefix() {
  38         return _prefix;
  39     }
  40
  41     String getPrefixFirstElement() {
  42        return _first;
  43     }
  44     double getConfidence() {
  45         return _confidence.doubleValue();
  46     }
  47
  48     @Override
  49     public String toString() {
  50      return getPrefix() + ": " + getConfidence();
  51     }
  52 }